سابقه و هدف: اسهال یک بیماری رایج میان گوساله ها بوده که سبب زیان اقتصادی چشمگیر در صنعت گاوهای شیری و گوشتی به علت افزایش میزان مرگ و میر، هزینه‌های درمان و کاهش نرخ رشد و افزایش سن اولین زایمان می‌گردد. روتاویروس گاوی یکی از عوامل اصلی ابتلا به اسهال در گوساله ها در سن یک تا دوهفتگی است. دو پروتئین vp4 و vp7 کپسید خارجی ویروس را ساخته و سبب تولید آنتی بادی و تحریک سیستم ایمنی می‌شوند. لاکتوفر...

مطابق نظریه ی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلول های عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل توده های پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیه ی صفحه های بتا در مرحله ی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد می شود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید جداشده از پایانه ی کربوکسیل آمیلوییدبتا با توالی گلیسین، لوسین، متیونین، والی...

هرچند دانسته های ما راجع به زیست شناسی سرطان پیشرفت زیادی داشته است، نه انتشار سرطان و نه نرخ مرگ ومیرهای ناشی از آن در 50 سال اخیر تغییری نکرده است. پروتئین کینازc ( pkc ) یکی از خانواده های پروتئین" serine/threonine " است که نقشی مرکزی در سیگنال های هدایتی بازی می کند.پلی فنول کورکومین، جزء اصلی "curcuma longa" یکی از عوامل ضدسرطان و تنظیم کننده " pkc " است.در تحقیق کنونی، شبیه سازی داکینگ مو...

سروتونین (5-هیدروکسی تیریپتامین) یکی از میانجی های عصبی منوآمینی است که در بدن توسط نورونهای دستگاه گوارشی و دستگاه عصبی مرکزی ترشح می شود. در این پژوهش برهمکنش سروتونین با آلبومین سرم انسانی (hsa) و آلبومین سرم گاوی (bsa) در بافر فسفات 10میلی مولار با ph 4/7 و در دمای محیط توسط طیف سنجی فلورسانس، روش های کمومتریک، روش های داکینگ مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفته است. ن...

در این کار پژوهشی، ابتدا خواص الکترونی و ساختاری ایزومرهای مختلف کورکومین و چند ساختار مشابه آن بطور محاسباتی با استفاده از تئوری تابعی چگالی مورد مطالعه قرار گرفت. سپس با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی، کمپلکس های تشکیل شده از این دارو با چند حامل مطالعه گردید. نتایج این مطالعات که شامل ساختار بهینه شده مولکول های مورد نظر، میزان فعالیت و واکنش پذیری آنها می باشد مورد بررسی قرار گرفته و ...

سیکلوسپورین a یکی از داروهای مهارکننده سیستم ایمنی است که به طور گسترده در عمل های پیوند اعضا بکار می رود. سیکلوسپورین a به پروتئین سیتوزولی سیکلوفیلین در سلول های لنفوسیت به خصوص لنفوسیت t اتصال می یابد. در این پایان نامه نحوه اتصال سیکلوسپورین به سیکلو فیلین با استفاده از داکینگ و شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار گرفت که برای محاسبات داکینگ از برنامه autodock 4 و برای شبیه سازی های د...

زمینه و هدف: تیروزیناز یک آنزیم کلیدی در تولید رنگ دانه است. اختلالات مربوط به افزایش رنگ دانه در نتیجه تولید بیش ازحد ملانین در پوست ایجاد می شود؛ بنابراین گسترش مهارکننده های این آنزیم در زمینه های پزشکی، آرایشی و کشاورزی حائز اهمیت است. هدف این پژوهش بررسی بیوانفورماتیکی مهار آنزیم تیروزیناز به وسیله ی تعدادی از مشتقات هیدروکسی نیترو دی فنیل اتر است. مواد و روش ها: این پژوهش به روش توصیفی –ت...

مقدمه: جهت لقاح، پروتئین سطحی اسپرم به نام "IZUMO” به عنوان لیگاند برای میانکنش با JUNO (یا رسپتور ایزومو(IZUMO1R)) ضروری است. میانکنش:IZUMO1R/JUNOIZOMO1 یک مرحله حیاتی چسبندگی بین اسپرم و اووسیت در اتصال و فیوژن غشای پلاسمائی است البته جهت فیوژن سلولی کافی نمی‌باشد و پذیرنده‌های دیگری نیز در این اتصال نقش دارند. در این تحقیق G protein-coupled receptor 15 (GPR15) به عنوان شریک دیگر میانکنش اسپر...

پارامترهای پیوندی در برهمکنش سرم آلبومین انسانی با سریم سولفات، سولفات آهن،سولفات مس، آسپرین و تئوفیلین با استفاده ازتئوریهای شبیه سازی و داکینگ مولکولی به دست آمده است. با تحلیل نتایج به دست آمده از این اتصالات، پارامترهایی مانند انرژی اتصال، ثابت بازدارندگی، انرژی بین مولکولیو پارامترهای پیوندی دیگر به دست آمد.مقایسه نتایج شبیه سازی با داده های تجربی گزارش شده، تطابق خوبی را بین نتایج تجربی و...

ساختارهای نانوپروتئینی می­توانند توسط توانایی ذاتی خودتجمعی مولکول­ها تشکیل شوند که این توانایی می تواند به­وسیله حدواسط­ها اصلاح گردد. در میان عوامل خودتجمعی ذاتی پروتئین ها، هیدروفوبیسیته مهمترین عامل است. مولکول­هایحدواسطی مانند گلوتارآلدئید می تواند باعث تجمع پروتئینی و تشکیل نانوذره گردند. در این پژوهش از نرم افزار Aggrescan 3D  برای بررسی پروتئین­هایی که خاصیت خودتجمعی دارند استفاده شد و ...