زئولیت ها، ترکیبات معدنی عمدتاً آلومینوسیلیکاتی، با ساختار بلوری هستند که دارای حفره هایی هستند که اجازه عبور ملکولهای دیگر را به ساختار خود می دهند. به خاطر داشتن چنین ساختار غیر معمولی، از آنها به طور گسترده در فرایندهای شامل غربالگری ملکولی و تبادل یون استفاده می شود. در این پروژه از روش دینامیک ملکولی برای محاسبه انرژی جذب آلکانهای سبک مثل متان، اتان ، پروپان و بوتان در زئولیت zsm-5 استفاد...

با گسترش روزافزون صنعت داروسازی و ساخت داروهایی با عملکرد مشخص، انتقال آن به داخل سلول نیز از اهمیت بسیار بالایی برخوردار است. غشا سلول در برابر ترکیبات آب دوست غیر قابل نفوذ است و مکانیزم های انتقال اختصاصی برای نفوذ آن ها مورد نیاز است. بنابراین لزوم پیدا کردن راهی برای تسهیل عبور این داروها از غشا سلول مطرح است. در این بین پپتایدهای با قابلیت نفوذ به سلول نشان دادند که می توانند به عنوان حام...

5 نانوثانیه شبیه سازی دینامیک مولکولی بر روی زیرواحد های تک واحدی پروتئین ترانستیرتین وحشی و نوع جهش یافته y78f انجام شد. نتایج بدست آمده به هدف بررسی تاثیرات احتمالی این جهش بر ویژگی های دینامیکِ این مولکول که با تمایل بالای این جهش یافته به ایجاد رشته های آمیلوئید مرتبط می باشند مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. یافته اصلی ما، سازوکار جدیدی برای چگونگی افزایش میزان تمایل این مولکول به ایجاد رشته ه...

در این پایان نامه نانوپمپ چرخشی زیستی f0f1- atpase که وظیفه ی تولید گرادیان یونی در دو سمت غشا سلول را بر عهده دارد، مورد مطالعه و بررسی قرار داده شده است، سپس با ایده-گیری از قسمت f0 پمپ پروتئینی f0f1- atpase ، یک نانوپمپ چرخشی یونی، طراحی و مورد بررسی قرار گرفته شده است. چون نانوپمپ پیشنهادی در محیط افت و خیزدار آبی قرار دارد، بنابراین برای بررسی و مدل سازی نانوپمپ چرخشی از دینامیک مولکولی کل...

زئولیت ها جامداتی بلوری با حفره های بسیار ریز هستند که از آن ها به عنوان جاذب و کاتالیزور در صنعت پتروشیمی و سایر صنایع شیمیایی می توان استفاده کرد. لذا بررسی نفوذ و مهاجرت مولکول های مهمان در زئولیت ها حائز اهمیت می باشد. زئولیت- بتا به دلیل دارا بودن مقدار سیلسیم فراوان و همچنین حلقه های 12 عضوی یک زئولیت بسیار مناسب برای استفاده در صنعت پتروشیمی محسوب می شود. یکی از بهترین روش ها برای محاسبه...

در قسمت دوم تحقیق، شبیه سازی دینامیک مولکولی با هدف بررسی ویژگی های مولکولی کپسوله کردن داروی ضد سرطان مکلورتامین درون نانو لوله های تک جداره ی کربن و بور نیترید به کار گرفته شد. نمودارهای انرژی رسم و با استفاده از این نموارها پایداری سیستم ها تخمین زده شد. همچنین زاویه ی قرار گیری دارو درون نانو لوله ی بور نیترید محاسبه شد. علاوه بر این، بوسیله ی نمودارهای تابع توزیع شعاعی اتم- اتم حلال پوشی د...

تصحیحات کوانتومی با استفاده از روش فیمن- هیبس برای نئون جامد در نظر گرفته شده است. یک عبارت ساده و جدید با پتانسیل hfd-like بدون نیاز به محاسبات وقت گیر سه ذره ای به کار برده ایم. نتایج به دست آمده نشان می دهد که پتانسیل چند ذره ای و تصحیح یافته کوانتومی hfd-like پیش بینی نتایج دوذره ای کلاسیکی را بهبود می بخشد.

در این پایان نامه تاثیر تنش برخواص گرمایی نانوسیم مس با استفاده از تکنیک شبیه سازی دینامیک مولکولی که از بین روش های دیگر محاسباتی برگزیده شده انجام شده است.برای انجام این پروژه از زبان برنامه نویسی فرترن استفاده شده است.ساختار نانوسیم شبیه سازی شده وپتانسیل ساتن-چن کوانتومی به ذرات اعمال گردیده است.. پس از محاسبه خواص گرمایی نانوسیم آن را تحت تنش های کششی متفاوت قرار داده و اثرات آن را مورد بر...

این سوال مطرح است که آیا حضور پیوندهای دی سولفید، نقشی در سازش آنزیم ها برای حفظ فعالیت در دماهای مختلف دارد؟ برای این منظور مطالعات مقایسه ای خواص دینامیکی این آنزیمها انجام شد. نتایج ما در هر دو مقایسه (ahaباbaa وaha با (ppaنشان داد نوسانات ساختار، فواصل باقیمانده های عملکردی و همبستگی حرکتی بین اسیدآمینه های مهم در عملکرد، الگوی پیوند هیدروژنی و توزیع نیرو های وان دروالس و الکترواستاتیک در م...

مطالعات تجربی نشان می دهند کلرید سزیم دارای یک انتقال فاز bcc به fcc در دمای 472 کلوین است. از آنجا که مبحث انتقالات فازی کاربرد گسترده ای در تعیین خواص ترکیبات دارد، در این پایان نامه انتقالات فازی این ترکیب در بازه ی دمایی گسترده ای توسط روش های شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفته است. همچنین با توجه به اهمیت به دست آوردن نقطه ذوب از روشهای دینامیک مولکولی، ارائه بهبود روش های مو...