پروتئین هومئودومن غنی از پرولین proline-rich homeodomain (prh) یک پروتئین تنظیمی است که با اتصال به توالی خاصی از dna فرایند رونویسی را کنترل می کند. در این تحقیق، برهمکنش پروتئین prh و dna در سطح اتمی با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی در مقیاس نانو بررسی شده است. در بخش اول این رساله، ابتدا کمپلکس prh-dna مدل سازی شده و تغییرات ایجاد شده در پروتئین prh و ساختار dna در طی اتصال به یکدیگر...

مقدمه: این مطالعه با طراحی یک سامانه انتقالی بر مبنای فسفاتیدیل‌کولین غشایی، یک مدل شبه ویروسی کاملاً ایمن و کارآمد برای انتقال ژن و تولید واکسنهای DNA معرفی می‌کند که قابل استفاده در بسیاری از حیطه‌های علوم پزشکی خواهد بود. مواد و روشها: به منظور ایجاد یک سامانه شبه سلولی در برگیرنده DNA، طی دو مرحله آبگیری و آب‌دهی پی‌در‌پی از لیپیدهای DMPC و کلسترول، DNA پلاسمیدی در یک ساختار بسته به خواهد ...

در این پروژه هدف طراحی و ساخت fluorescence detection systemجهت آشکارسازی مولکول های dna می باشد. در روش pcr، طی چندین چرخه دمایی، مولکول های dna کپی می شوند و سپس با استفاده از روش fluorescence detection، مولکول های بر انگیخته شده dna آشکارسازی می شوند. پس از آشکارسازی می توان به کپی و یا عدم کپی dnaها پی برد.می توان برای جداسازی مولکول های dna بر اساس طولشان، از روش gel electrophoresis استفاده...

پروتئین p53، یک مهار‏کننده‏ی تومور کلیدی در سلول است که به هنگام آسیب به dna فعال می‏شود و مهمترین عملکرد خود که توقف چرخه‏ی سلولی و آپاپتوز است را انجام می‏دهد. پروتئین p53 در بیش از 50% سرطان‏ها جهش می‏یابد و 99% این جهش‏ها در دمین اتصالی به dna رخ می‏دهد. موقعیت اکثر این جهش‏ها (بیش از 90%) در لوپ‏‏های سطحی پروتئین (لوپ‏های l3 و l2) و موتیف lsh (loop sheet helix) جای گرفته است. لوپ‏های سطحی ...

مقدمه : با توجه به ویژگی های قطعات کوچک نوکلئوتید(الیگونوکلئوتیدهای تک زنجیره ای) از جمله تــوانائی آن ها در استفاده ابزاری برای تشخیص بعضی از مولکول های کلیدی تصمیم گرفته شد تا تجربیاتی در رابطه با به دست آوردن یک قطعه DNA که تمایل زیادی در اتصال به مولکول مورفین دارد، حاصل گردد. مواد، روش ها و یافته های پژوهش: برای این منظور ابتدا یک کتابخانه الیگونوکلئوتیدی که شامل دو توالی مشخص 21 و 19 نوک...

تکنولوژی DNA نوترکیب یک تکنیک مولکولی in vitro جهت جداسازی و دستکاری قطعات DNA می‌باشد. با استفاده از این تکنیک ساخت مولکول‌های کایمریک به نام مولکول DNA نوترکیب، سپس واردکردن این مولکول نوترکیب به سلول‌های زنده، همانندسازی و تکثیر آنها در سلول امکان پذیر شد. امروزه تکنولوژی فیوژن پروتئین یک استراتژی برای دسترسی سریع، ارزان و پربازده بیان پروتئین هاست. توالی نوکلئوتیدی ژن اپسیلون کلستریدیوم پرف...

در مقاله حاضر خصوصیات مختلف محلول آب و یون های فلزی مانند سرعت یونها، نحوه آرایش مولکولهای آب حول یون فلزی و زمان شرکت مولکول های آب در لایه تشکیل شده حول یون فلزی به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی بررسی گردید. نتایج این تحقیق تشکیل یک آرایش پوسته مانند از مولکول های آب در اطراف یون های فلزی و تشکیل کمپلکس m(h2o) را نشان می دهد. تعداد مولکول های آب در این آرایش پوسته ای برای یونهای سرب، نیکل و ک...

مقدمه: تحقیق حاضر با هدف طراحی و ساخت آپتاسنسور بر پایه نانو ذرات کروی شکل طلا به منظور تشخیص tnt به صورت کالریمتریک صورت گرفته است. مواد و روش ها: نانو ذرات کروی شکل طلا با دارا بودن خواص پلاسمونیک ویژه و بسیار حساس کاربردهای زیادی در طراحی زیست حس گرها دارا می باشند. در تحقیق حاضر با طراحی و ساخت آپتاسنسور بر پایه نانو ذرات کروی شکل طلا به شناسایی مولکول tnt پرداخته شده است. پس از سنتز نانو ذ...

چکیده روش محاسبه مولکولی یا محاسبه dna اولین بار توسط ادلمن در سال 1994 بیان شد. وی به کمک مولکول dna و تکنیک های مولکولی توانست یک راه حل جدید برای مسائل np کامل طراحی نماید. ارائه چنین روشی یک ایده جدید و جالب بود چرا که حل چنین مسائلی به وسیله کامپیوتر های پیشرفته امروزی بسیار وقت گیر است. همچنین محاسبه با dna یک علم جدید میان رشته ای است که زیست شناسی مولکولی، ریاضی، شیمی و علوم کامپیوتر ...

مولکول های dna بازهای نیتروژنی دارند که ویژگی هایی شبیه فلورفورها نشان می دهند. با این حال اسیدهای هسته ای از نوع dna، ویژگی فلورسانسی بسیار ضعیفی دارند. از این رو شناسایی لیگاندهای متصل شونده به dna که در حالت؛ نشر فلورسانس هستند و تنها بر اثر اتصال به مولکول های dna نشر فلورسانس می یابد، بسیار کاربردی است. در این مقاله اثر یون های فلزی سدیم و پتاسیم بر القای ساختار چهاررشته ای) در الیگومری با...