این سوال مطرح است که آیا حضور پیوندهای دی سولفید، نقشی در سازش آنزیم ها برای حفظ فعالیت در دماهای مختلف دارد؟ برای این منظور مطالعات مقایسه ای خواص دینامیکی این آنزیمها انجام شد. نتایج ما در هر دو مقایسه (ahaباbaa وaha با (ppaنشان داد نوسانات ساختار، فواصل باقیمانده های عملکردی و همبستگی حرکتی بین اسیدآمینه های مهم در عملکرد، الگوی پیوند هیدروژنی و توزیع نیرو های وان دروالس و الکترواستاتیک در م...

مطالعات تجربی نشان می دهند کلرید سزیم دارای یک انتقال فاز bcc به fcc در دمای 472 کلوین است. از آنجا که مبحث انتقالات فازی کاربرد گسترده ای در تعیین خواص ترکیبات دارد، در این پایان نامه انتقالات فازی این ترکیب در بازه ی دمایی گسترده ای توسط روش های شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفته است. همچنین با توجه به اهمیت به دست آوردن نقطه ذوب از روشهای دینامیک مولکولی، ارائه بهبود روش های مو...

سولفورهگزافلورید،دارای ساختاراکتاهدرال،غیرقابل انفجار و غیرقابل اشتعال می باشد.در حالت خالص غیرسمی است.بسیار پایدارو به شدت الکترونگاتیو وجاذب الکترون است. یکی از سنگین ترین گازهای شناخته شده وگازی بی رنگ و بی بو است. ویژگی دی الکتریکی فوق-العاده آن نتیجه ی خصلت الکترونگاتیوی مولکول های آن می باشد که تمایل مشخصی به گرفتن الکترون های آزاد دارد و به تشکیل یون های سنگین با تحرک کم می انجامد. قدرت ...

در این تحقیق، نانوکامپوزیت های پلی آمید-6،6 + نانولوله ی کربنی به وسیله ی شبیه سازی دینامیک مولکولی مطالعه شده اند. جهت بررسی اثر انحنای سطح روی خواص پلیمر، سه سیستم حاوی نانولوله های (6،0)، (10،0) و (17،0) با قطر های به ترتیب 237/0، 393/0 و 666/0 نانومتر شبیه سازی شده اند. نتایج شبیه سازی تشکیل لایه های منظم پلیمر در کنار سطح نانولوله را نشان می دهند. نتایج نشان می دهد که با افزایش قطر نانولول...

هدف اصلی از این پژوهش بررسی پارامترهای موثر بر پخش نانو قطره نقره بر روی سطح مس با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی است. ا ین شبیه سازی در هنگرد کانونیک (npt) انجام شده است. در این شبیه سازی از پتانسیل مورس و پتانسیل ساتن-چن کوانتومی استفاده شده است و برای حل معادلات دیفرانسیل جفت شده بین ذرات و محاسبه مسیرهای فاز از روش سرعت ورله استفاده کرده ایم. با تغییر تعداد اتم های نانو قطره نقره، اثر شعاع د...

چکیده کلادریبین و فینگولیمود از جمله جدیدترین داروهایی هستند که برای درمان بیماری ام اس موثرند. این دو دارو می توانند به صورت نادر سرطان ایجاد کنند که ازجمله آنها می توان به سرطان پوست اشاره کرد. به علت وجود حلقه آروماتیک، به نظر می رسد این داروها به شیار کوچک dna متصل و با تغییر شکل ساختار و یا ایجاد ممانعت برای عوامل رونویسی موجبات ایجاد سرطان را فراهم آورند. راه انداز ژن p53 یکی از مهم ترین...

با توجه به دقت و اعتبار روش های مبتنی بر رفتار اتمی مانند شبیه سازی دینامیک مولکولی (md)، امروزه این روش ها نقش بسیار مهمی در زمینه مدل سازی ورقه های تک لایه گرافن ایفا می کنند. با این حال، استفاده از این روش ها به دلیل هزینه های محاسباتی بالا تنها محدود به سیستم های با اندازه کوچک می باشد. علاوه بر این، با توجه به طبیعت گسسته گرافن، از روش های مبتنی بر مکانیک محیط پیوسته نمی توان برای مطالعه و...

در این تحقیق، ذخیره سازی گازهای نجیب روی نانولوله های کربنی با استفاده از روش دینامیک مولکولی بررسی شده است. مقدار جذب گازهای زنون، آرگون، نئون و هلیم روی نانولوله های کربنی در دمای ثابت و فشارهای مختلف محاسبه شده است. مجموعه نانولوله های کربنی شامل نانولوله های (8،8)، (9،9)، (10،10)، (11،11) و (12،12) در نظر گرفته شده است. اثر قطر نانولوله های کربنی بر میزان جذب در شرایط اشباع نیز مطالعه شده ا...

کاتالیز آنزیمی در یک ساختار ثابت انجام نمی شود و واکنش شیمیایی در مجموعه ای از حالت های ساختاری به هم پیوسته از مولکول آنزیم رخ می دهد. دینامیک درونی آنزیم برای تبدیل این ساختارها و در نتیجه عملکرد زیستی آنزیم لازم و ضروری می باشد. با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی، اطلاعات ارزشمندی از حرکت ها و ساختارهای لحظه ای مولکول آنزیم بدست می آید که برای درک ارتباط بین ساختار و عملکرد آنزیم کاربرد...

اهمیت روزافزون کاربردهای مکانیک سیالات مایکرو و نانو در حوزه های مهندسی و تکنولوژی، نگاه محققین را به روش هایی معطوف کرده است که از کارآیی بالایی در تحلیل پدیده های جریان های سیال در ابعاد ریز برخوردار باشند. در حالی که در ابعاد مایکرو نانو، روش های پیوستار غالباً در پیش بینی با شکست مواجهه می شوند، روش دینامیک مولکولی از جمله روش های موفق در این ابعاد می باشد. در این روش با استفاده از مکانیک آم...