یافتن ژن ها در میان توالی های ژنومی و تحلیل و مقایسه ی آن ها جهت پیش بینی ساختار پروتئین یکی از مهمترین مباحث علم بیوانفورماتیک است. در این پایان نامه به تحلیل و مقایسه ی توالی های ژنومی و تشابه آمینواسیدها پرداخته شده است. برای این منظور فضای پلی نوکلئوتید فازی و برخی از ویژگی های ان معرفی شده است و سپس توای های ژنومی جهت پیدا کردن درجه تشابه و تفاوتشان تحلیل و مقایسه شده اند. سپس با استفاده ا...

چکیده زمینه و هدف: بتا تالاسمی یکی از شایع ترین بیماری های ژنتیکی در ایران است و بیش از دو میلیون حامل بتا تالاسمی در ایران وجود دارد. شناسایی جهش های ژن بتاگلوبین برای برنامه های تشخیصی و مدیریتی معین مانند تشخیص پیش از زایمان بیماری بتاتالاسمی ضروری است. در کشور ما روش pcr-arms(pcr-amplification refractory mutation system) بطور گسترده برای شناسایی جهش های ژن بتا گلوبین استفاده می شود. روش برر...

امروزه ابتلا به انواع مختلف سرطان از جمله مخاطرات اصلی حیات بشری به شمار می آید. یکی از انواع این بیماری سرطان کولورکتال (crc) است. در این مطالعه ارتباط ژنتیکی ژن سیتوکروم p450 به نام cyp1b1را با سرطان کولورکتال در نمونه های به دست آمده از تومورهای سرطانی منطقه سیستان و بلوچستان مورد ارزیابی قرارداده شده است. در این تحقیق با هدف یافتن پلی مورفیسم در ژن cyp1b1 در بیماران سرطان روده بزرگ، ابتدا ت...

کلیه خصوصیات و صفات موجودات زنده، از ماده ژنتیکی آن ها نشات می گیرد. لذا شناسایی و کشف ترتیب و نوع عناصر سازنده این ماده، اساس بسیاری از علوم را تشکیل می دهد. توالی دی ان ای موجودات با استفاده از چهار عنصر تعیین می شود. تفاوت در ترتیب قرارگیری این عناصر نسبت به هم، عامل بروز ویژگی های متفاوت در موجودات است. تکنولوژی هایی که به بررسی ژنوم موجودات پرداخته و سعی در شناسایی عناصر و ترتیب آن ها نس...

هدف: lipoid proteinosis یک بیماری نادر اتوزومی مغلوب است که از جهش در پروتئین ماتریکس خارج سلولی1 (ecm1) بوجود می آید. ژن ecm1 ، 10 اگزون دارد و در مطالعاتی که تا به امروز صورت گرفته، ثابت شده میزان جهش در 3 اگزون این ژن (6، 7 و8) از سایر اگزون های آن بیشتر بوده است. مطالعات قبلی در مورد این بیماری، بررسی جهش های 3 اگزون 6، 7 و 8 بوده است. مطالعه فعلی ما در مورد 7 اگزون (1، 2، 3، 4، 5، 9 و 10...

میتوکندری مسئول تولید 90 درصد از انرژی مورد نیاز سلول می باشد. مقداری از تفاوت ها در عملکرد رشد جوجه های گوشتی و بیان فنوتیپی راندمان غذایی ممکن است مربوط به اختلاف در راندمان عملکرد میتوکندری باشد. این پژوهش بمنظور همسانه سازی و تحلیل مرغان بومی خراسان با تاکید بر ژن nd2  به منظور بررسی جهش­های احتمالی است. بدین منظور از نمونه خون مرغ بومی خراسان، dna ژنومی استخراج گردید و با استفاده از آغازگر...

مطالعه دربارۀ مناطق هیبرید جانوری از‌نظر ژنومی طی دهۀ اخیر درحال انجام‌ است. بحث دربارۀ نفوذ (Introgression) ژنوم در فرایند تکامل بین دانشمندان چالش‌برانگیز است؛ هرچند کاهش‌یافتن ورود ژن در مناطق مختلف نشان‌دهندۀ درگیربودن ژن‌های گونه‌زایی است. در بررسی حاضر، عوامل جغرافیایی دخالت‌کننده در نفوذ ژن با شاخص هیبریداسیون (کلاین ژنومی) مقایسه شدند. در مطالعۀ حاضر، 127 توالی بررسی شدند که 82 توالی به...

در مقاله حاضر با توجه به استعداد پایین شتر در ابتلاء به فشار خون و مقاومت بالا در برابر سموم محیطی، برخی ژن ها از قبیل ژن های خانواده سیتوکروم p-450 که مسئول این ویژگی های منحصر به فرد در شتر هستند با توالی ژن های انسان مقایسه شدند. توالی ژنومی از پایگاه های داده بیوتکنولوژی بدست آمد. آنالیز بیوانفورماتیک به وسیله نرم افزارهای مجموعه laser gene، bio edit، mega و blastp انجام شد. نتایج هم ترازی ...

سیستم کمپلمان از اجزاء اصلی سیستم دفاعی بدن بسیاری از موجودات میباشد. وجود این سیستم در موجودات متعددی تایید شده است اما در مورد مکانیسم های تنظیم بیان آن در سطح ژنومی برخی از موجودات اطلاعاتی وجود ندارد. در این مطالعه به بررسی ناحیه بالادستی ژن C3 از ماهی قزل آلا پرداخته ایم. بافتهای مختلف ماهی تهیه و DNA با روش تغییر یافته فنل-کلروفرم استخراج شد. به کمک پرایمرهای دجنره طراحی شده برای ناحیه با...

استخراج dna به­صورت خالص، پایدار و با کمیت و کیفیت مناسب، گام مهمی در اجرای پژوهش­های بیولوژیکی می­باشد. در این پژوهش، dna مربوط به نمونه خون 600 بلدرچین ژاپنی با روش نمکی تغییر یافته با پودر رختشویی و بدون استفاده از آنزیم پروتئیناز k استخراج شد. نمونه­های dna به­دست آمده در مراحل آماده­سازی کتابخانه ژنومی، با نانودراپ، فلئورومتر، بیوآنالیزر، الکتروفورز، pcr، هضم با آنزیم­های آندونوکلئاز، اتصا...