تمام صورت بندی های ممکن برای ترکیب 3- مرکاپتو- پروپن سلنال ( mcps ) در سطوح با b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و g2mp جهت تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون مولکولی مختلف در فاز گازی بهینه شده اند. همچنین، محاسبات برای تمام صورت بندی های mcps در سطح b3lyp و همان تابع پایه انجام شده است. افزایش نسبی مرتبه قدرت پیوند هیدروژنی برای سیستم های پیوند هیدروژنی نشان ...

در این پروژه توتومریسم و کنفورمرهای ممکن مولکول 2،1-سیکلو هگزان دی اون و مشتقات تک استخلافی و جفت استخلافی آمین آن، یعنی آمینو-کتون و ایمینوآمین، با استفاده از نظریه تابعی چگال تجزیه وتحلیل گردید. برای تعیین پایدارترین توتومر و کنفورمر، پس از بهینه سازی ساختارهای از نظر تئوری ممکن انرژی های الکترونی، نقطه صفر، انتالپی، و آزادگیبس با استفاده از سطوح محاسباتی ، b3lyp/6-31g(d,p) و b3lyp/6-311g(d,p...

در این پایان نامه پس از مروری بر روش های محاسباتی شیمی کوانتوم، 1. نتایج حاصل از بررسی نظری برهمکنش های بین مولکولی دیمرهای پروکسی فرمیک اسید در سطوح محاسباتی mp2 و m05-2x با مجموعه پایه aug-cc-pvdz گزارش شده است. در مجموع هجده دیمر کمینه در سطح محاسباتی m05-2x/aug-cc-pvdz و شانزده دیمر در سطح mp2/aug-cc-pvdz یافت شد. انرژی برهمکنش تصحیح شده bsse در یک رنج بین 9 تا kj mol-134 در سطح محاسباتی ...

محاسبات کوانتومی در سطح محاسباتی ump2/aug-cc-pvtz برای مطالعه کمپلکس های دوتایی و سه تایی مولکول h2s و رادیکال hs2 در محیط گازی انجام شده است. با یک نگاه ویژه به انرژی اثر تجمع پذیری و انرژی برهم کنش چند جسمی بدست آمده است. نتایج بیانگر پایداری بیشتر پیوند هیدروژنی بین h2s و hs2 در کمپلکس سه تایی می باشد و اثرات تقویتی را در کمپلکس ها را نشان می دهد. علاوه بر این از نظریه بدر«اتم در مولکولها» ب...

مطالعه ی نظریه تابعی چگالی (dft) ، برای بررسی قدرت پیوند هیدروژنی درون مولکولی میتوکسانترون (1و4-دی هیدروکسی-5و8-بیس (2-((2-هیدروکسی اتیل) آمینو)-اتیل آمینو)-9و10- آنتراسن دی اون) و آمتانترون (1و4-بیس (2-((2-هیدروکسی اتیل) آمینو) اتیل آمینو) - 9و10- آنتراسن دی اون)، انجام شد. بهینه سازی کامل ساختار مولکولی، تفاوت انرژی پیوند هیدروژنی و بدون آن، جابجایی شیمیایی پروتون و طیف ارتعاشی آن ها مورد بر...

پیوند هیدروژنی یاری شده توسط رزونانس برای مالون آلدهید و مشتقات آن در سطح تئوری mp2/6-311g(d,p) بررسی شده است. انرژی های پیوند هیدروژنی درون مولکولی با استفاده از روش های روتامرهای وابسته و شوستر محاسبه شده است. همچنین ویژگیهای مکان شناسی توزیع الکترون و انرژی پایدار سازی انتقال بار مربوط به پیوند هیدروژنی به ترتیب با استفاده از نظریه های اتم در مولکول (aim) و اوربیتال پیوندی طبیعی (nbo) به د...

پیوندهای هیدروژنی بین مولکولی در جفت بازهای اسید نوکلئیک یک نقش کلیدی در اختصاصی کردن ساختار آن ها بازی می کند. ساختار جفت باز a – t و ساختارهای مختلف پیش بینی شده مربوط به این جفت باز با استفاده از محاسبات ab- initio در سطح محاسباتی g** 31-6 hf/و در یک سری از سطوح نظریه تـابعی چگالی ، b3lyp/6-31g** و b3lyp/6-311++g**بهینه شد. پـارامترهای ساختـمانـی و انرژی های بهینه شده به دست آمد و بر روی پای...

در این پژوهش ساختار مولکولی و انرژی پیوند هیدروژنی درون مولکولی 26 صورت بندی 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) در سطوح محاسباتی b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و سطح g2mp2 به منظور تعیین مرتبه ی پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون-مولکولی مختلف بهینه شده است. نتایج محاسبات در فاز گاز و آب نشان می دهد که صورت بندی های 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) این ترکیب پایدارتر از بقیه هستند. ای...

تشکیل کمپلکس ها در نتیجه ی ایجاد پیوند هیدروژنی بین اوراسیل و نیتروزآمین و همچنین فرآیند انتقال پروتون بین آنها در روش های b3lyp، b3pw91، mp2 با چندین مجموعه ی پایه مورد بررسی قرار گرفته است. اوراسیل از چهار ناحیه به نیتروزآمین نزدیک شده و هشت کمپلکس حلقوی un1-8 را با دو پیوند هیدروژنی بین مولکولی n(c)- hu….o(n)na و hna….ou تشکیل داده است. پیوند هیدروژنی تقویت شده توسط رزنانس در همه ی کمپلکس ها...

مقدمه: جهت لقاح، پروتئین سطحی اسپرم به نام "IZUMO” به عنوان لیگاند برای میانکنش با JUNO (یا رسپتور ایزومو(IZUMO1R)) ضروری است. میانکنش:IZUMO1R/JUNOIZOMO1 یک مرحله حیاتی چسبندگی بین اسپرم و اووسیت در اتصال و فیوژن غشای پلاسمائی است البته جهت فیوژن سلولی کافی نمی‌باشد و پذیرنده‌های دیگری نیز در این اتصال نقش دارند. در این تحقیق G protein-coupled receptor 15 (GPR15) به عنوان شریک دیگر میانکنش اسپر...