در این مقاله، اثر نفوذپذیری به منزلة مشخصه ای از محیط متخلخل و پخشیدگی مولکولی به منزلة خصوصیتی از املاح بر جریان همرفتی در محیط های متخلخل درز و شکاف دار، با استفاده از مدل سازی های عددی مطالعه شده است. مدل مفهومی به صورت محیطی متخلخل دارای درز و شکاف های منظم عمودی و افقی در نظر گرفته شده است. چهار سناریوی مدل سازی با مقادیر متفاوت نفوذپذیری ماتریکس متخلخل و ضریب پخشندگی  مولکولی در نظر گرفته...

هدف از انجام این رساله، مطالعه برهمکنش داروهای پیشنهادی با ماکرومولکول¬ها و طراحی پپتیدهایی بر اساس سطح تماس آنتی¬ژن-آنتی-بادی (اپی¬توپ-پاراتوپ) می¬باشد. در بخش اول رساله، فعالیت مهارکنندگی ترکیباتی با ساختار پایه پیرازول وتیازول برای گیرنده اکتیوین شبه¬کینازی (alk5) مورد بررسی قرار گرفت. ابتدا با استفاده از شبیه¬سازی دینامیک مولکولی، ساختار سه بعدی گیرنده alk5 در محیط آب پیش¬بینی شد و نتایج ...

گرافین یکی از گونه های اتم کربن است که در سال های اخیر توجه پژوهشگران زیادی را در سراسر دنیا به خود جلب کرده است. گرافین بلوری دوبعدی به ضخامت یک اتم کربن است و در آن اتم های کربن در یک شبکه لانه زنبوری شش-گوشی به سختی با همدیگر پیوند دارند. ویژگی های چند منظوره گرافین تاکنون از رشد تصاعدی برخوردار بوده اند و باعث شده اند که این ماده به عنوان نامزدی مناسب برای محدوده وسیعی از کاربردها در علوم و...

فتوپروتئینها گروهی از پروتئین های بیولومینسانس می باشند که دارای اهمیت و کاربردهای فراوانی در علوم مختلف هستند. از این رو تحقیقات گسترده ای برای درک مکانیسم این پروتئینها جهت بهینه کردن فعالیت آنها در حال انجام است. در این تحقیق، جهت شناخت بیشتر عملکرد فتوپروتئین نمیوپسین دو جهش leu36his و phe186his انتخاب شدند. از این گروه می توان به کلنترات، کتنفور و شعاعیان اشاره کرد که دارای تشابهات ساختاری...

اثر جهش های ‏y279c‏ و ‏‎ t468mمرتبط با‎ ‎سندرم لئوپارد بر ساختار ‏shp-2‎ سندرم لئوپارد یک ناهنجاری غالب آتوزوم است که دارای نشان ویژگی‏هایی شامل، لکه‏های ‏پوستی، الکتروکاردیوگرام غیر طبیعی، ‏فاصله زیاد بین چشم‏ها، تنگی مجاری تنفسی، دستگاه ‏تناسلی غیر طبیعی، عقب ماندگی در رشد و ناشنوایی می‏باشد. سندرم ‏لئوپارد به وسیله جهش ‏تغییر دهنده معنا در ژن ‏ptpn11‎، که پروتئین تیروزین فسفاتاز ‏shp-2‎‏ را...

در این پروژه با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی و بسته نرم افزاری 2-dl-poly جذب فیزیکی ملکول هیدروژن در نانولوله کربنی خالص و نانولوله کربنی با آلائیدگی فلز واسطه نیکل با درصدهای مختلف مورد بررسی قرار می گیرد. برای این منظور به عنوان نمونه از نانولوله کربنی تک دیواره(0و19)استفاده می شود. ابتدا بعد از انتخاب شرایط محیطی مناسب با توجه به پایداری بیشتر سیستم(ترموستات نوز-هوور و گام زمانی 00...

یکی از روش های مفید بررسی عبور حلال ها از نانوکانال ها شبیه سازی دینامیک مولکولی می باشد.. این شبیه سازی به منظور مطالعه مکانیسم عبور حلال ها و امکان جداسازی آلاینده های آلی از آب انجام شد. این آلاینده ها که عمدتا به صورت حلال استفاده می شوند مانند دی متیل سولفوکسید و استون و مخلوطی از هر دو ابتدا به صورت خالص و سپس به صورت مخلوط با آب مطالعه و شبیه سازی شد.

مطالعات تجربی و تئوری های زیادی بر روی انتقال حرارت و رفتار جریان های نانوسیالات انجام گرفته و نتایج نشان می دهد که نانوسیالات بطور قابل توجهی انتقال حرارت را افزایش می دهند. با وجود این، هنوز فهم دقیقی از تأثیر مکانیسم های مختلف بر انتقال حرارت نانوسیالات وجود ندارد. شبیه سازی های کامپیوترییک ابزار مناسب برای توصیف مکانیسم های فیزیکی در بسیاری از فرآیندها هستند. در این مطالعه، برای بررسی اثر ع...

آلزایمر شایع ترین نوع بیماری زوال عقل در افراد بالای 65 سال می باشد که علت اصلی و روش درمان قطعی آن تاکنون به درستی مشخص نشده است. مطالعات آسیب شناختی، تشکیل پلاک های فیبری و توده های تجمع یافته پروتئین آمیلوئید بتا در سیستم اعصاب مرکزی را به عنوان یکی از دلایل بیماری آلزایمر پیشنهاد و مهار این فرایند را به عنوان روش درمان مؤثر برای این نوع بیماری معرفی کرده اند. ناحیه والین10-اسیدگلوتامیک22 از...

دراین کار پژوهشی از روش شبیه سازی دینامیک مولکولی استفاده کردیم. از تابع پتانسیل کوانتوم ساتن-چن استفاده کردیم.برای ثابت نگه داشتن تعداد ذرات ازشرایط مرزی دوره ای استفاده کردیم.نتایج حاصل از شبیه سازی نشان می دهد که خواص مکانیکی نانوسیمpdcu با آلیاژpdcu متفاوت است و با تغییر ابعاد نمونه تغییر کرده و در نهایت به یک مقدار ثابت با توجه به ابعاد ماکروسکوپیک نمونه میل می کندکه این تغییرات خواص مکانی...