تبادل پروتون یکی از واکنشهای بنیادی شیمی بوده و روشی قدرتمند جهت مطالعه ساختار و دینامیک پپتیدها و پروتئینها محسوب می شود. بررسی مستقیم فرآیند تبادل در این ترکیبات ، به علت حجیم بودن ساختمان آنها دشوار می باشد. فلذا، در این تحقیق، انامینونها به عنوان مدلی جهت بررسی اثرات فضایی، پیوند هیدروژنی درون ملکولی و بین ملکولی، حلال، استخلاف ، در سرعت تبادل پروتون گروه nh کاتالیزه شده با اسید، انتخاب شده...

دراین پروژه ارتباط بین برجسته ترین خاصیت پیوند هیدروژنی درون مولکولی یعنی انرژی پیوند ، با پارامترهای متناسب با قدرت پیوند هیدروژنی بررسی شده است . چندین روش برای تخمین این انرژی همانندایزودسمیک ، بومه، روتامرهای وابسته و جابلونسکی پیشنهاد شده است. در این پروژه ما انرژی پیوند هیدروژنی n...h-n را با استفاده از مدل های تقریبی محاسبه کردیم و روابط بین این نتایج و توصیف کننده های گوناگون پیوند هیدر...

مطالعه ی تئوری تابعی چگال (dft) برای بررسی قدرت پیوند هیدروژنی درون مولکولی ?و ? - بیس [( ?- آمینو اتیل )آمینو بنزو [g]فتالازین 10و5 - دی ان تری هیدروکلرید] (bbr 2894) و ?و? - بیس [( ?- دی اتیل آمینو اتیل )آمینو بنزو [g] فتالازین 10و5 - دی ان ] (bbr 2853) و?و?- بیس [(?-آمینو اتیل) ] بنزو [g] کینوکسالین 10و5 -دی ان تری هیدروکلرید ] (a) انجام شد بهینه سازی کامل ، جابه جایی شیمیایی پروتون وطیف ا...

ساختار هندسی، پایداری¬های نسبی، طیف ارتعاشی و قدرت پیوند هیدروژنی درون مولکولی ترکیب¬های 4و4-دی¬متیل-1-فنیل¬پنتان¬دی¬اون (dmpd)، 1و1و1-تری¬فلوئورو-5و5-دی¬متیل-2و4-هگزان¬دی¬اون (tfdmhd)، 4و4-دی¬متیل-3-آمینو-1-فنیل¬پنتان¬دی¬اون (dmapd)، 1-(n-پیریدین) بوتان 1و3-دی¬اون (npbd) و همچنین ساختار، قدرت پیوند فلز- لیگاند و طیف ارتعاشی کمپلکس بیس(2و2و6و6-تترامیتل هپتان-3و5-دی اوناتو) مس(ii) cu(tmhd)2با اس...

چکیده بهینه سازی کامل ساختار مولکول دی هیدروکسی نفتازارین توسط نظریه ی تابعی چگالی در سطح نظری b3lyp و با استفاده از مجموعه های پایه 6-31g** و 6-311++g** انجام شد. همچنین محاسبات مربوط به hnmr نیز در همان سطح و با مجموعه پایه 6-311++g**، با استفاده روش giao انجام شد. محاسبات و انتساب فرکانس ترکیبات دوتره شده و دوتره نشده نیز در همین سطح محاسباتی انجام شد. در این مطالعه، مقایسه ای بین مجموعه پا...

در این پروژه ساختار تمامی هم صورت های ممکن مولکول ? -سلنو آمینو آکرولئین با روش های hf، b3lyp و mp2 و با توابع پایه6-311++g(d,p) و 6-311++g(3df,3pd) بهینه شده اند، سپس محاسبه فرکانس در سطوح ذکر شده برای تمامی هم صورت ها انجام گرفته و انرژی ارتعاشی نقطه صفر (zpve) آن ها محاسبه، و تصحیح مربوط به آن در تعیین ترتیب پایداری هم صورت ها اعمال شده است. نتایج محاسبات نظری نشان داد که ? -سلنو آمینو آک...

در این پروژه ساختار تمامی هم صورت های ممکن مولکول ? -تیو آمینو آکرولئین در روش های hf، b3lyp و mp2 و با توابع پایه6-31g(d,p) و 6-311++g(d,p) بهینه شده اند، سپس محاسبه فرکانس در روش ها و سطوح ذکر شده فوق برای تمامی هم صورت ها انجام گرفته و انرژی ارتعاشی نقطه صفر (zpve) آن ها محاسبه، و تصحیح مربوط به آن در تعیین ترتیب پایداری هم صورت ها اعمال شده است. همچنین برای رسیدن به مرتبه بالاتری از دقت، تم...

پپتید¬های حلقوی یک دسته رایج از ترکیبات¬اند که مشخصات ساختاری و بیولوژیکی ویژه دارند. این ترکیبات عملکرد¬های متفاوتی در اندام¬های زنده دارند. اغلب این ترکیبات از نظر بیولوژیکی فعال هستند. پپتید¬های حلقوی، با توجه به پیکربندی¬های منحصربه فرد خود به طور گسترده به عنوان مولکول¬های مدل برای پپتید¬های بزرگ تر در شیمی، بیوشیمی و شیمی دارویی استفاده می-شوند. ساختار این مولکول¬ها نشان دهنده عملکردشان ا...

مقدمه:باتوجه به رشد روزافزون جمعیت و صنعتی شدن سیرتکاملی حیات بشر، تشخیص سموم تولید شده در مواد غذائی با استفاده از روش‌های سنتی دشوار بوده چرا که از لحاظ زمانی، مدت بررسی کیفیت طولانی شده و مقرون به صرفه نبوده و حتی در بسیاری از موارد دقت روش‌های کاربردی همچون محیط کشت باکتریائی و غیره دارای خطای آزمایشگاهی می‌باشد، لذا با پیشرفت تکنولوژی نانو، طراحی سنسورهای انتخابی و هوشمند، تحولی بزرگ در صن...

چکیده : استفاده ازروشهای تئوری و محاسبات کامپیوتری درآنالیز صورت بندی ملکولها تاریخچه طولانی دارد. دراین پروژه با استفاده ازروشهای محاسباتی به بررسی کونفورماسیونهای مشتقات پیریدین دی کربوکسیلیک اسید می پردازیم. ابتدا ساختار ترکیبات را با استفاده ازروش am1 بهینه کردیم و بعد با استفاده از روش های b3lypوhf محاسبات را ادامه دادیم ودر تمام محاسبات از مجموعه پایه g*311-6استفاده شده است. محاسبات فرک...