در این پژوهش با استفاده از روش تابع گرین غیر تعادلی و فرمول بندی لانداور- بوتیکر، خواص ترابرد وابسته به اسپین از طریق مولکول dna متصل شده به دو الکترود فرومغناطیسی با سطح مقطع محدود، بصورت عددی بررسی می شود. با مطالعه ترابرد همدوس وابسته به اسپین از طریق مولکول dna نشان می دهیم که مقاومت مغناطیسی تونلی(tmr) در ساختار fm/dna/fm وابسته به ولتاژ خارجی است. همچنین نتایج بدست آمده نشان می دهد که ولت...

به دنبال سنتز مصنوعی dna سه رشته ای (تریپلکس) در سال 1957 و مدتی بی توجهی به آن، دوباره و بطور مشخص از سال 1987 به بعد اهمیت ساختاری و عملکردی آن در سیستم های حیاتی و کاربردهای پزشکی آن به طور جدی مورد توجه قرار گرفته است. ایجاد پیوندهای هیدروژنی بین جفت بازهای dna و باز سوم و تشکیل تریپلت ها، امکان تشکیل dna سه رشته ای را فراهم آورده است. تریپلکس ها را برحسب اینکه رشته سوم نسبت به رشته مشابهش ...

شبیه سازی دینامیک مولکولی روی ساختار B-DNA با توالی d(CGCGAATTCGCG) و در محیطی با غلظت یک مولار از نمک سدیم کلرید انجام شد. مطالعه در هفت دمای مختلف از 280 تا 400 کلوین با فاصله دمایی 20 کلوین با زمان شبیه سازی 50 نانو ثانیه برای هر دما انجام گرفت. در هر دما تابع توزیع شعاعی برای مولکول‌های آب و کاتیون‌های سدیم در اطراف اتم‌های مختلفی از مولکول دی ان ای محاسبه شد. محاسبات نشان داد در طی فرآیند ...

مقدمه: مولکول DNA به­علت داشتن خواص منحصر­به­فرد و بدیع می­تواند در زمینه­های تحقیقاتی مختلفی از­جمله       نانو­الکترونیک نوری[1] مورد استفاده قرار گیرد. امروزه، نانوساختارهای مبتنی­بر DNA با کیفیت تشخیص مولکولی توسعه فراوانی یافته­است اما بااین­حال مفهوم نانوالکترونیک مولکولی مبتنی­بر DNA موضوعی است که هنوز با چالش­هایی روبه­رو است و مطالعات فراوانی بر­روی آن در حال شکل­گیری است. با این توصیف...

مولکول dna نه تنها از دیدگاه زیست شناسان دارای اهمیت فراوان زیستی است بلکه مورد جالبی برای مطالعه فیزیکدان ها نیز می باشد. حالت های باز ( open state: حالتی که در آن پایه های دو رشته از یکدیگر جدا شده و باعث باز شدن بخشی از دو رشته از هم می شوند.) در مارپیچ دوتایی مولکول dnaقابل مدلسازی با سالیتون های توپولوژیک هستند. از آنجایی که این مولکول دارای طول بسیار بلند (در حدود متر) و عرض بسیار کوچک (د...

داده های جهت دار، به طور مکرّر در علوم فیزیکی و طبیعی چون زیست شناسی، پزشکی، محیط زیست، زمین شناسی و غیره‎ به کار می روند. به طور مثال، زیست شناسان در مطالعه مهاجرت پرندگان، جهت پرواز پرندگان را که به تنهایی رها می شوند، ثبت می کنند. یک مجموعه از چنین مشاهداتی روی جهات به عنوان داده های جهت دار منسوب می شوند. از آن جایی که یک جهت دارای مقدار و اندازه نیست، می توان به راحتی به صورت نقاطی روی محیط...

تلاش برای کشف مشخصه های گوناگون سیستم های زیستی مهم ترین محرک توسعۀ تحقیقات در زمینۀ علوم پزشکی و زیست مولکولی به حساب می آید. آنالیز سریع، حساس، دقیق و مقرون به صرفۀ مولکول های زیستی اهمیت ویژه ای در تشخیص و درمان های بالینی دارند. پیشرفت های اخیر در تکنولوژی توالی سنجی dna سبب تحول گسترده ای در علوم و تحقیقات زیستی- پزشکی شده است. با پیدایش و توسعۀ نانو مواد، استفاده از این ساختارها در آشکارس...

توالی های تک رشته DNA یا RNA که تحت عنوان آپتامر شناخته می شوند قادرند مولکول هدف را با اختصاصیتی در حد آنتی بادی های مونوکلونال ردیابی نمایند. با این وجود قرار گیری مایکوتوکسین ها در گروه مولکول های کوچک و تفاوت بالای وزن مولکولی آنها با توالی های آپتامری تبدیل به چالشی جدی در معرفی پروب های آپتامری برای آنها شده است. در بررسی حاضر با هدف دستیابی به توالی آپتامری جدید و کوتاه تر برای آفلاتوکسی...

تعیین ساختار dna در برهم کنش با پروتئین ها می تواند به شناخت ساز و کارهای حیاتی در سیستم های سلولی که شامل dna هستند، کمک کند. در این بر هم کنش ها و تنش هایی که به مولکول ِdna وارد می شود، مولکول تغییر شکل می یابد. شکل کلی dna تغییر شکل یافته را می توان با یک مدل کشسانی مناسب توصیف کرد. در این پایان نامه می خواهیم با در نظر گرفتن خواص کشسانی و هندسی مولکول dna، ساختار آن را در شرایط مختلف و تح...

در این پروژه هدف طراحی و ساخت fluorescence detection systemجهت آشکارسازی مولکول های dna می باشد. در روش pcr، طی چندین چرخه دمایی، مولکول های dna کپی می شوند و سپس با استفاده از روش fluorescence detection، مولکول های بر انگیخته شده dna آشکارسازی می شوند. پس از آشکارسازی می توان به کپی و یا عدم کپی dnaها پی برد.می توان برای جداسازی مولکول های dna بر اساس طولشان، از روش gel electrophoresis استفاده...