مقدمه: جهت لقاح، پروتئین سطحی اسپرم به نام "IZUMO” به عنوان لیگاند برای میانکنش با JUNO (یا رسپتور ایزومو(IZUMO1R)) ضروری است. میانکنش:IZUMO1R/JUNOIZOMO1 یک مرحله حیاتی چسبندگی بین اسپرم و اووسیت در اتصال و فیوژن غشای پلاسمائی است البته جهت فیوژن سلولی کافی نمی‌باشد و پذیرنده‌های دیگری نیز در این اتصال نقش دارند. در این تحقیق G protein-coupled receptor 15 (GPR15) به عنوان شریک دیگر میانکنش اسپر...

تصویر برداری زیستی یک روش قدرتمند است که در دهه گذشته به عنوان ابزاری برای تصویر برداری در سطح مولکولی از حیوانات کوچک آزمایشگاهی توسعه یافته است تا امکان مطالعه فرآیندهای زیستی را در موجودات زنده فراهم کند. این شکل از تصویر برداری نوری، غیرتهاجمی و کم هزینه است که آنالیزهای زمان واقعی فرآیندهای بیماریزا را در سطح مولکولی در موجودات زنده را تسهیل می کند. این تکنیک بسیار حساس بر پایه نور نشری در...

زمینه و هدف: دینامیک مولکولی، روشی برای شبیه سازی رفتار ترمودینامیکی مواد در سه فاز جامد، مایع و گاز با استفاده از نیرو، سرعت و مکان ذرات می باشد. دربین این عوامل، مهمترین عامل، نیرو است. در شبیه سازی دینامیک مولکولی کلاسیک، نیرو از پتانسیل کلاسیک به دست می آید. پتانسیل کلاسیکی، تابعی از مکان اتم ها یا هسته هاست و به موقعیت الکترون ها در اتم ها وابسته نیست. هدف از این کار، مطالعه و مقایسه ی انر...

در این پایان نامه، تلاش شده تا از روش های مدل سازی کامپیوتری جهت طراحی فاز ساکن، بهینه سازی پارامترهای جداسازی و بررسی مکانیسم بازداری استفاده شود. در مطالعه اول مدل سازی کامپیوتری از طریق روشهای کومفا، کومفا – تمرکز میدانی، و کومسیا بر روی یک سری از ترکیبات ضد سرطان انجام گرفت. قابلیت پیشگویی خارجی مدلهای ساخته شده، از طریق مجموعه آزمون مورد ارزیابی قرار گرفت. همچنین پارامترهای آماری م...

شیشه زیست فعال به دلیل توانایی پیوند بافت نرم و سخت در ترمیم، درمان و شکسته بندی استخوان و نیز به عنوان جایگزینی مناسب برای استخوانچه های گوش مورد توجه قرار گرفته است. در این مقاله از شبیه سازی دینامیک مولکولی با استفاده از نرم افزار گرومکس برای مطالعه ساختار شیشه زیست فعال شبیه سازی شده به روش سل-ژل استفاده شد. برای ایجاد گروه های هیدروکسیل، سیستم شیشه زیست فعال مورد نظر مدل سازی شد. سپس یک سی...

سولفورهگزافلورید،دارای ساختاراکتاهدرال،غیرقابل انفجار و غیرقابل اشتعال می باشد.در حالت خالص غیرسمی است.بسیار پایدارو به شدت الکترونگاتیو وجاذب الکترون است. یکی از سنگین ترین گازهای شناخته شده وگازی بی رنگ و بی بو است. ویژگی دی الکتریکی فوق-العاده آن نتیجه ی خصلت الکترونگاتیوی مولکول های آن می باشد که تمایل مشخصی به گرفتن الکترون های آزاد دارد و به تشکیل یون های سنگین با تحرک کم می انجامد. قدرت ...

در این تحقیق، نانوکامپوزیت های پلی آمید-6،6 + نانولوله ی کربنی به وسیله ی شبیه سازی دینامیک مولکولی مطالعه شده اند. جهت بررسی اثر انحنای سطح روی خواص پلیمر، سه سیستم حاوی نانولوله های (6،0)، (10،0) و (17،0) با قطر های به ترتیب 237/0، 393/0 و 666/0 نانومتر شبیه سازی شده اند. نتایج شبیه سازی تشکیل لایه های منظم پلیمر در کنار سطح نانولوله را نشان می دهند. نتایج نشان می دهد که با افزایش قطر نانولول...

هدف اصلی از این پژوهش بررسی پارامترهای موثر بر پخش نانو قطره نقره بر روی سطح مس با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی است. ا ین شبیه سازی در هنگرد کانونیک (npt) انجام شده است. در این شبیه سازی از پتانسیل مورس و پتانسیل ساتن-چن کوانتومی استفاده شده است و برای حل معادلات دیفرانسیل جفت شده بین ذرات و محاسبه مسیرهای فاز از روش سرعت ورله استفاده کرده ایم. با تغییر تعداد اتم های نانو قطره نقره، اثر شعاع د...

این سوال مطرح است که آیا حضور پیوندهای دی سولفید، نقشی در سازش آنزیم ها برای حفظ فعالیت در دماهای مختلف دارد؟ برای این منظور مطالعات مقایسه ای خواص دینامیکی این آنزیمها انجام شد. نتایج ما در هر دو مقایسه (ahaباbaa وaha با (ppaنشان داد نوسانات ساختار، فواصل باقیمانده های عملکردی و همبستگی حرکتی بین اسیدآمینه های مهم در عملکرد، الگوی پیوند هیدروژنی و توزیع نیرو های وان دروالس و الکترواستاتیک در م...