برنج یکی از ارزشمندترین محصولات کشاورزی است. یکی از تأثیرگذارترین عوامل محدود کننده این محصول استراتژیک تنش خشکی می‌باشد. نظر به چند ژنی بودن تحمل به خشکی، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی مربوطه در برنج با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه بوده است. به همین منظور با استفاده از نرم‌افزار تحت وب Genevestigator تمامی ژن‌های دارای تغییر بیان بالاتر و مساوی 5/2 ...

در این پایان نامه روش کنترلیکه اخیراً برایکنترل غلظت مقدارmrna و پروتئین ها در شبکه های تنظیم ژنی تکه ای نمواً خطی ارائه شده است، با در نظر گرفتن تغییر ونامعینی درمقدار آستانه کلیدزنیو نرخ های کاهش و تولیدو نیزتأخیر در ورودی وخروجی سامانه، گسترش داده شده است. در این راستا یک قانون کنترلی جدید برایهدایتحالت های سامانه در حضور نامعینی و تأخیر با تغییر دادن ورودی هاییکه بر نرخ های تولید و کاهش مدل p...

روش­های ژنومیکس کارکردی نظیر تجزیه و تحلیل توالی­های est، امکان شناسایی، بررسی بیان و مطالعه رونوشت­های ژنی درگیر در شبکه­های تنظیمی و متابولیکی را فرآهم آورده­اند. در این پژوهش به منظور شناسایی جهت گیری کارکردی ژنوم و تعیین شبکه ژنی درگیر در تکامل کلاله زعفران، 6202 توالی est مربوط به کتابخانه­ی کلاله بالغ زعفران مورد بررسی و تحلیل قرار گرفتند. پس از پیرایش اولیه توالی­ها، دسته بندی و هم گذاری...

چکیده در این پایان نامه به طراحی فیلتر مقاوم برای شبکه های تنظیم ژنی در دو حالت فیلتر غیر وابسته به تأخیر زمانی و فیلتر وابسته به تأخیر زمانی پرداخته ایم. برای این کار ابتدا شبکه های تنظیم ژنی و ساز و کار آن ها را مورد مطالعه قرار داده ایم. سپس با کامل کردن یک مدل شناخته شده به طراحی دو نوع تخمین گر حالت پرداخته ایم. وظیفه این فیلترها تخمین غلظت پروتئین ها و mrna ها با وجود تمام محدودیت ها و پ...

روش های استنباط متعددی برای شبکه های ژنی وجود دارد، ولی در همه آن ها تنها از اطلاعات نمونه استفاده می شود و کمتر مواردی وجود دارد که از اطلاعات گذشته یا اطلاعات موازی استفاده شده باشد. در این پژوهش به استنباط بیزی شبکه های ژنی پرداخته می شود. تلاش می شود از اطلاعات موجود در قالب یک الگوی بیزی استفاده شود. بدیهی است با به کارگیری توزیع پیشین مناسب و توجه به عدم استقلال پارامترهای موجود در شبکه ه...

سابقه و هدف: با توجه به اهمیت تنش خشکی و نظر به اینکه تحمل به تنش خشکی صفتی چند ژنی می­باشد، هدف پژوهش حاضر بازسازی شبکه ژنی درگیر و شناسایی ژن‌های کلیدی دخیل در تنش خشکی درگیاه جو با استفاده از تجزیه و تحلیل داده‌های ریزآرایه و همچنین شناسایی فرایندهای موثر بوده است. مواد و روش­ها: تمامی ژن‌های دارای بیان افتراقی (≤ 5/2 و≥ 5/2-) در بین تمامی آزمایشات ریزآرایه انجام شده ، با استفاده از نرم‌افزا...

توجه به وجود باقی‌مانده هورمون‌های محرک رشد در لاشه حیوانات کشتار شده در کشتارگاه به عنوان یک خطر بالقوه برای سلامت افراد جامعه ضروری می‌باشد. پژوهش حاضر با هدف شناسایی بیومارکرهایی جهت تشخیص استفاده غیرقانونی از محرک‌های رشد استروئیدی در کشتارگاها انجام شد. برای این منظور در ابتدا آنالیز بیان افتراقی ژن‌ها در یک پروفایل بیان ژنی موجود در پایگاه داده Arrayexpress با شماره دسترسی E-GEOD-12179، ش...

یکی از اهداف اصلی علم نوظهور بیوانفورماتیک، درک فرایند تنظیم ژن در موجودات مختلف است که در چند سال اخیر مساله مهندسی معکوس در مدلسازی و شناسایی شبکه های تنظیم کننده ژنی با استفاده از داده های بیان ژن محور بسیاری از پژوهش ها قرار گرفته است. از آن جا که فرآیند تنظیم ژن ها در سطح سلولی یک روند دینامیک و پویا است، بر این اساس شبکه های عصبی به دلیل قابلیت آموزش و تنظیم بر اساس داده های آموزشی و سیست...