ساختارهای دوم اسیدهای نوکلئوتید کلاس خاصی از ساختارهای وقوع هستند. اهمیت زیاد مولکولهای rna به دلیل شبه گره ها و ویژگی های ساختاری است که با تعریف قدیمی ساختارهای دوم که فاقد شبه گره هستند، متفاوت است. در اینجا ساختارهای دوم عمومی را با شبه گره های غیر متداخل یکی می گیریم که به آن ساختارهای دوم-دوبخشی می گوییم و اندازه ای را برای پیچیدگی ساختارهای وقوع در خواص گراف مطرح می کنیم. نتایج محاسبه شد...

تاج خروس (آمارانت) یکی از گیاهان علوفه‌ای جدید است که تحقیقات کمی در مورد آن در ایران انجام شده است. به‌ همین منظور آزمایشی به‏‌صورت فاکتوریل در قالب طرح بلوک‏های کامل تصادفی با سه تکرار در تابستان 1396 در ایستگاه تحقیقات کشاورزی گرگان اجرا شد. فاکتور اول ارقام تاج خروس شامل Cim، Loura و Kharkovski و فاکتور دوم فاصله بوته روی خط در سه سطح 5، 10 و 15 سانتی‌متر در نظر گرفته شد. نتایج تجزیه واریان...

چکیده زمینه و هدف: پروتیین فعال کننده ی نوتروفیل درهلیکوباکترپیلوری (hp-nap) از مهم ترین فاکتورهای بیماری زای این باکتری است که از اهمیت به سزایی در ایجاد ایمنی حفاظتی برعلیه این پاتوژن برخوردار است. این آنتی ژن کاندیدای بسیار مطرحی به عنوان بخشی از واکسن های چند قسمتی برعلیه این باکتری در مطالعات کلینیکی می باشد. به دلیل اهمیت پروتیین hp-nap، در این مطالعه از آن به عنوان الگویی برای بهینه کردن...

تحلیل آماری شکل شاخه جدیدی از آمار است که در مورد تجزیه و تحلیل آماری اشکال هندسی بحث می نماید. وجه مهم آمار شکل که برای بسیاری از علوم کاربردی حیاتی می باشد حفظ ساختار هندسی اشکال پس از حذف اثرات انتقال، مقیاس و دوران از اشکال مورد مطالعه می باشد. از طرف دیگر انطباق ساختار پروتئین زمینه تحقیقاتی جدیدی است که توجه محقیقن علاقه مند به ویژگی های هندسی پروتئین را به خود جلب کرده است. سنگ بنای اصلی...

مطابق نظریه ی آمیلویید، علّت آسیب دیدن سلول های عصبی سیستم اعصاب مرکزی در بیماران آلزایمری، تجمّع و تشکیل توده های پروتیین آمیلوییدبتا است. بدین منوال، تجزیه ی صفحه های بتا در مرحله ی ابتدایی این فرایند به عنوان یک روش درمان مناسب برای این بیماری پیشنهاد می شود. دارویی که درین تحقیق مطابق همین هدف استفاده شده، پنج پپتید جداشده از پایانه ی کربوکسیل آمیلوییدبتا با توالی گلیسین، لوسین، متیونین، والی...

  سابقه و هدف: فعال‌سازی حافظه‌های تثبیت شده، موج دوم تحکیم حافظه موسوم به بازتثبیت حافظه را فعال می‌کند. اخیراً، فرایند تثبیت تاخیری حافظه نیز پیشنهاد شده است که حاکی از وجود یک دوره تاخیری تثبیت حافظه بعد از یادگیری است. این فرایند به تولید پروتیین در مغز، به‌ویژه در هیپوکمپ وابسته است. هدف این مطالعه بررسی وجود فرایند احتمالی بازتثبیت تاخیری وابسته بعد از فعال‌سازی یک حافظه تثبیت شده و و...

این مطالعه به منظور تعیین ساختارهای مولکولی پروتئین و کربوهیدرات انواع غلات (جو، ذرت و سورگوم) با استفاده از روش طیف سنجی مولکولی ft/ir و ارتباط آنها با فراسنجه های متابولیکی پروتئین تخمین زده شده در تغذیه گاوهای شیرده با استفاده از مدلهای dve/oeb و nrc انجام شد. غلات استفاده شده در این مطالعه شامل: 6 رقم جو: (رقم های سرد، معتدل و خشک)، 4 رقم ذرت: (دیررس و زودرس) و 4 رقم سورگوم: (قدیم و جدید) ب...

در این پایان نامه اثر دما روی پروتیین پلاستوسیانین توسط شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد مطالعه قرار گرفت. در مورد دماهای مورد مطالعه تنها تغییرات معنی دار مربوط به منحنی rmsd و rg در دمای 453k مشاهده شد. در این دما, met 92 پایداری کمتری نسبت به سایر باقیمانده ها دارد.نواحی با انعطاف پذیری زیاد مربوط به باقیمانده های 40-56 می باشد. سه حالت شامل حالت طبیعی , واسطه و حالت غیر طبیعی شده و همچنین 2 ح...

در این مطالعه، تأثیر ساختار دوم پروتئین بر روی قدرت اسیدی سه ساختار مختلف رندوم، مارپیچ آلفا و صفحات بتای اسیدهای آمینه باردار مثبت لیزین و هیستیدین در زنجیره پلی پپتیدی 8 گلایسین، بررسی شده است. برای این منظور، از نرم افزار محاسباتی گوسین 9 با روش های آغازین hf و نظریه تابعی چگالی b3lyp برای فاز گازی و از مدل حلال پوشی cpcm/uff برای فاز محلول و مجموعه پایه 6-31g(d)استفاده شده است. دو چرخه ترمو...