اسینتوباکتر بومانی یک باکتری گرم منفی غیرمتحرک است که سبب عفونت های شدید در افراد مستعد می گردد. به علاوه ایزوله های کلینیکی اسینتوباکتر بومانی افزایش مقاومت قابل توجهی را نسبت به درمان های آنتی بیوتیکی موجود نشان می دهند که درمان عفونت های این باکتری را با مشکل رو به رو ساخته است. به عنوان یک مکانیسم دفاعی دسترسی آهن برای باکتری ها در میزبان محدود شده است. اولین مرحله در جذب اختصاصی آهن از طری...

مطالعات زیادی در زمینه اریبی کدون در موجودات مختلف صورت گرفته است، اما هنوز بحث های زیادی در مورد آن وجود دارد. در این مطالعه، با دید بیوانفورماتیکی به بررسی این پدیده در چرخه های متابولیکی مهم در گاو پرداخته شده است. اریبی کدون و پارامترهای مهمی مانند شاخص سازگاری کدون، میزان gc و غیره و نیز الگوهای کدونی بکار رفته در چرخه ها با نوشتن برنامه ای به زبان r مورد بررسی قرار گرفتند. با توجه به پیش ...

دست یابی به تکنولوژی های جدید در علوم زیستی و پزشکی، همچون توالی یابی نسل بعد، زمینه پیشرفت سریع تر از پیش مطالعات را فراهم نموده است. از این رو، حجم بسیار عظیمی از اطلاعات اولیه فراهم می گردد و همچنان نیز رو به افزایش است. طراحی سیستم های پیشرفت های که تلفیقی از محاسبات کامپیوتری، علم آمار، تکنولوژی اطلاعات وهوش مصنوعی باشند، جهت ذخیره، پردازش و تفسیر این اطلاعات روبه افزایش، الزامی است(1). عل...

ویروس پاپیلومای انسانی (hpv)، یک عامل بیماری زای مهم است که می تواند باعث ایجاد مشکلاتی در سلامتی گردد. hpv به خانواده پاپیلوماویریده تعلق دارد. این ویروس دارای ژنوم dna دو رشته ای می باشد که این ژنوم توسط پروتئین های کپسیدی حفاظت می شود. تا به حال، بیش از 200 تایپ hpv مختلف شناسایی شده است. hpvها به دو گروه جداگانه ی پرخطر و کم خطر دسته بندی می شوند. تایپ های کم خطر مانند hpv6 و hpv11 باعث ایج...

با توجه اهمیت و عملکردهای مهم mirnaها، شناسایی mirnaهای جدید و نقش آن ها ما را در درک بهتر فرایندهای داخل سلولی یاری می کند. بنابراین استفاده از روش هایی که قادر باشد ما را سریعتر به این مهم برساند ضروری است. رویکردهای کامپیوتری بر اساس ویژگی های ساختاری، حفظ شدگی در طول تکامل و همچنین میزان انرژی آزاد ساختارهای پیش بینی شده طراحی شده اند. در این رویکردها از چندین نرم افزار و سایت به موازات هم ...

listeria monocytogenes یک پاتوژن غذایی گرم مثبت، درون سلولی اختیاری و سریع الرشد فرصت طلب است که در بیماران مستعد از نظر ایمنی لیستریوزیس ایجاد می کند. میزان مرگ و میر لیستریوزیس بیش از 20% است. همچنین مننژیت، انسفالیت و مننگوانسفالیت و نیز سقط جنین در زنان باردار از عوارض عفونت با این باکتری است. acta و لیستریولیزین o (llo) دو فاکتور ویرولانس مهم این باکتری هستند. acta یکی از پروتئین های سطحی ...

سیستم ایمنی انسان شامل انواع متنوعی از سلول¬ها و مولکول¬ها می¬باشد که در ارتباط تنگاتنگ با سایر سیستم¬های بدن می¬باشند. مقادیر افزاینده¬ی داده¬های تولید شده در دوره¬ی پساژنومیک بررسی این سیستم را پیچیده¬تر گردانده است. بنابراین نیاز به استفاده از رویکردهای محاسباتی و کامپیوتری جهت پردازش و تفسیر داده¬ها محسوس¬تر می¬باشد. ایمونوانفورماتیک به عنوان زیرمجموعه¬ای از بیوانفورماتیک رویکردی جدید با ا...

آر.ان.ای­ های کوچک غیر کدکننده، نقش­ های مختلفی در رشد و توسعه گیاهان و حیوانات ایفا می­کنند. این آر.ان.ای‌های تنظیم­ گر، رشد و نمو را از طریق تنظیم سایر ژن­ها در سطوح رونویسی، پس از رونویسی و ترجمه هدایت می­کنند. فعالیت این ژن­ها از طریق تنظیم در سطح دی.ان.ای از طریق متیلاسیون، تبدیل یوکروماتین به هتروکروماتین و در سطوح دیگر از طریق برش آر.ان.ای­ های هدف، یا ممانعت از ترجمه آن­ها صورت می­ پذیر...

در پژوهش­های پیشین از بخش خالص شده پروتئوم باکتری xanthomonas campestris pv. campestris (xcc) که قابلیت محرک تولید اتیلن در گیاه آرابیدوپسیس را داشت، حدود 60 پروتئین مختلف شناسایی شدند که از بین آنها هشت پروتئین به عنوان پروتئین فرضی محافظت شده بودند. هدف از انجام این پژوهش توصیف این پروتئین­ها توسط ابزارهای بیوانفورماتیک مختلف می­باشد. همه پروتئین­های مورد بررسی دارای جرم مولکولی متوسطی بودند....

شیوع سیاه زخم طبیعی در انسان نادر است اما از آنجایی که این باکتری پتانسیل بالایی جهت استفاده به عنوان سلاح بیولوژیکی دارد تلاش ها برای تولید واکسن علیه این باکتری رو به افزایش است. ترکیب آنتی ژن ها با زیرواحد b کلرا توکسین ctb می تواند پاسخ آنتی بادی موکوزی قوی ایجاد نماید و به عنوان واکسن معرفی شود. در این مطالعه، ابتدا توالی های مربوطه از پایگاه داده ncbi اخذ و پس از بهینه سازی، از لینکری منا...