زمینه و اهداف: استخراجRNA با کمیت و کیفیت مناسب جهتreverse transcriptas PCR ، هیبریدیزاسیون در نورترن بلاتینگ و آنالیز بیان ژن با Real Time PCR از اهمیت بسیاری برخوردار است. در بیوفیلم استرپتوکوکوس موتانس پلی ساکارید های خارج سلولی محلول و غیر محلول تولید شده مانع استخراج RNA می شوند. لذا، بدون کاربرد روش مناسب برای حذف این پلی ساکاریدها روش های مولکولی مبتنی بر RNA برای این باکتری ها مقدور ن...

سابقه و هدف: استخراج RNA‌ی با کمیت و کیفیت مطلوب از نیاز‌های بنیادی زیست شناسی مولکولی است. جداسازی RNA از بافت‌‌های گیاهان چوبی به علت حضور مقادیر زیادی از کربوهیدارات‌ها، تانن‌ها و ترکیبات پلی فنولی با مشکلاتی روبروست. بنابراین دستیابی به یک روش استخراج مناسب که بتواند RNA‌ی کیفی مطلوبی را تولید کند، از اهمیت بالایی برخوردار است. مواد و روش‌ها: در این تحقیق سه روش استخراج RNA شامل: 1- زارعی...

فرآیند استخراج RNA از بافت­های سخت چوبی و به­طور خاص درختان خانواده مخروطیان به‎دلیل داشتن غلظت­های بالایی از ترکیبات فنولیک، پلی­ساکاریدها، متابولیت­های ثانویه و لیگنین، بسیار مشکل است و تا به‎حال هیچ­گونه کیت تجاری برای این منظور ساخته نشده است. در این مطالعه مشکلات فوق برطرف گردیده و روشی سریع، ساده و اقتصادی برای استخراج RNA از بافت ساقه گونه‌های Cedrus deodara و Abies grandis که هر دو از خ...

ویرمی بهاره کپور (SVC)، توسط ویروسی باRNA تک رشته ای منفی از خانواده رابدوویریده ایجاد می شود. ویروس SVCV عامل اصلی بیماری مسری ویرمی بهاره کپور در سرتاسر جهان بخصوص در ماهی کپور معمولی پراکنده است و در دیگر خانواده های ماهیان شامل اردک ماهیان ، کپور ماهیان دندانه دار ، خورشید ماهیان ، گربه ماهیان و آزاد ماهیان نیز سبب بیماری می گردد. در این مطالعه به منظور دستیابی به روشی مناسب برای استخر...

سابقه و هدف: جداسازی RNA از گیاهانی که دارای مقدار زیادی ترکیبات پلی‌ساکارید و پلی‌فنل می‌باشند به علت اتصال و رسوب این ترکیبات با RNA  مشکل است. بنابراین در این مطالعه 11 پروتکل مختلف استخراجRNA  از برگ‌های سیب  غنی از ترکیبات فنلی مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش ها: کیفیت و کمیت  RNAبا الکتروفورز ژل آگارز 1.2% و اسپکتروفتومتری نانودراپ در طول موج 230، 260 و 280 نانومتر تعیین شد و سنتز cDNA و...

زمینه و اهداف: استخراجrna با کمیت و کیفیت مناسب جهتreverse transcriptas pcr ، هیبریدیزاسیون در نورترن بلاتینگ و آنالیز بیان ژن با real time pcr از اهمیت بسیاری برخوردار است. در بیوفیلم استرپتوکوکوس موتانس پلی ساکارید های خارج سلولی محلول و غیر محلول تولید شده مانع استخراج rna می شوند. لذا، بدون کاربرد روش مناسب برای حذف این پلی ساکاریدها روش های مولکولی مبتنی بر rna برای این باکتری ها مقدور نیس...

ویرمی بهاره کپور (svc)، توسط ویروسی باrna تک رشته ای منفی از خانواده رابدوویریده ایجاد می شود. ویروس svcv عامل اصلی بیماری مسری ویرمی بهاره کپور در سرتاسر جهان بخصوص در ماهی کپور معمولی پراکنده است و در دیگر خانواده های ماهیان شامل اردک ماهیان ، کپور ماهیان دندانه دار ، خورشید ماهیان ، گربه ماهیان و آزاد ماهیان نیز سبب بیماری می گردد. در این مطالعه به منظور دستیابی به روشی مناسب برای استخراج rn...

بسیاری از عملکردهای rna به تعاملات بین rna و پروتئین ها وابسته است چنانکه درک مکانیزم مولکولی تعاملات rna و پروتئین یکی از مباحث اصلی در علم بیوانفورماتیک به شمار می رود. تعاملات پروتئین و rna نقش مهمی در گستره ی وسیعی از فرآیندهای مختلف سلولی از جمله پیوند و ساخت پروتئین، بیان ژن، پردازش rna، مکانیزم دفاع سلولی و تنظیم رونویسی در بیان ژن جهت مقابله با عوامل بیماری زا دارند. روش های آزمایشگاهی ...

برهم کنش دو مولکول rna در بسیاری از فرآیندهای زیستی مانند تنظیم بیان ژن، کنترل رشد و نمو سلولی نقش دارد. در این فرآیند، یک مولکول rna با ایجاد برهم کنش های پایدار با rna دیگر از ترجمه ی آن جلوگیری می کند. به همین دلیل الگوریتم-هایی جهت پیشگویی برهم کنش دو مولکول rna ایجاد شده اند. یکی از چالش های اکثر این الگوریتم ها، زمان محاسباتی بالای آنها است. در این پایان نامه سه الگوریتم جدید به نام های t...

هدف از انجام این تحقیق، ارزیابی نقش اجزای شیر در بازیافت ویروس‏های روده‏ای و استخراج rna آنها از شیر خام بود. بدین منظور چهار محلول مدل شیر خام از طریق افزودن لاکتوز، پروتئینهای آب پنیر، کازئین و چربی در نسبتهای مختلف ساخته شد. سپس به هر محلول مدل شیر خام از کلی فاژ ms2 در چندین غلظت تلقیح شد. نتایج نشان داد که بیشترین بازدارندگی بر بازیافت کلی فاژ و استخراج rna حاصل از آن متعلق به کازئین و پرو...