در این کار پژوهشی اطلاعات ساختاری (طول و زاویه پیوندها) و انرژی ساختار تعادلی و خواص الکتریکی(انرژی، شکل و گسترش فضایی اوربیتالهای مولکولی humo و lumo و بارهای الکتریکی جزئی روی اتمهای موجود در مولکولهای نانو الماس واره شامل: آدامانتان، آمانتادین، ممانتین و نیتروآدامانتان ) محاسبه شده اند. محاسبات ساختارهای الکترونی با استفاده از روش dft انجام شد و آنالیز بار با استفاده از دو روش مولیکن و تانسو...

یکی از روش های مفید برای بررسی جداسازی یون های آلینده ی آب روش شبیه سازی دینامیک مولکولی می باشد. در این پایان نامه شبیه سازی دینامیک مولکولی جداسازی یون های کلر و سسسدیم از آب با استفاده از نانو صفحات گرافنی انجام گرفته ونتایج نشان می دهند کسه حفسره هسای نسانومتری در صفحات گرافن را می توان به نحو مؤثری در جداسازی یون ها ازآب به کسار بسرد. بسا اسستفاده از شسبیه سازی دینامیک مولکولی عملکرد ج...

جهت گسترش کاربرد و فهم بهتر از مایعات یونی در زمینه های مختلف علمی و صنعتی، داده های خواص ترمودینامیکی مانند خواص حجمی آن ها چه به صورت خالص و چه در کنار سایر حلال ها از اهمیت فوق العاده ای برخوردار است. از سوی دیگر وجود تعداد بسیار زیاد مایعات یونی با ساختارهای متنوع سبب شده است که نتوان خواص ترمودینامیکی آن ها را به دلیل هزینه بالا و صرف زمان زیاد با روش های تجربی اندازه گیری نمود. لذا با است...

هیدرات های گازی دسته ای از ترکیبات میزبان جامد هستند که نقش مهمی در فرآیند های متعددی همچون ذخیره، انتقال و جدا سازی گاز، کاتالیزهای نا همگن و تصفیه آب دارند. این بلور ها در دمای بالاتر از نقطه انجماد آب و فشار بالا تشکیل می شود. برای محاسبه اختلاف انرژی آزاد روش های مختلفی وجود دارد: 1) اختلال 2) تدریجی 3) انتگرال گیری ترمودینامیکی، در این تحقیق، از روش انتگرال گیری ترمودینامیکی برای محاسبه اخ...

هدف از این تحقیق مطالعه بر هم کنش آلبومین سرم انسانی با داروهای پروپرانولول و آلپرازولام در غیاب و حضور دو فلاونوئید کوئرستین و تاکسیفولین و دی متیل متیل فسفونات در بافر فسفات ( (ph = 7.4به وسیله روش های مختلف طیف سنجی فلورسانس، فروسرخ ، مدل سازی مولکولی و شبیه سازی دینامیک مولکولی است.

در این پایان نامه ساختار محلول گابا در فاز آبی و آلی و برخی خواص ترمودینامیکی در محلول هایی با ‏غلظت های متفاوت از گابا در حلالهای آب و تری فلوئورواتانول بررسی شد. نتایج بخش اول بررسی ها به کمک ‏تحلیل توابع توزیع شعاعی، نشان داد گابا در فاز محلول به دلیل اثر کازموتروپیک منجر به افزایش پیوندهای ‏هیدروژنی و برهم کنش میان مولکول های آب می شود. اما، حضور گابا در تشکیل ساختارهای موضعی دیمری و ‏تریمر...

نحوه‎ی توزیعِ یون¬ها در اطراف ذره¬های کلوییدی و سطوح باردار در حضور آب، یکی از موضوعات چالش برانگیز در فیزیکِ ماده‎ی چگالِ نرم و زیست فیزیک می¬باشد. در این توزیع، سطحِ باردار با جذب یون‏های مخالف و دفع یون‏های موافق، ناحیه‏ای باردار پیرامونِ خود ایجاد می‏کند که دولایه‎ی الکتریکی (electrical double layer) نامیده‏ می‎شود. با وجود اهمیت این توزیع، هنوز نظریه¬ کاملی که پیچیدگی‎های متعدد این مسئله، مانند...

پیرازین آمید یکی از مهم ترین داروها برای کنترل مایکوباکتریوم توبرکلوزیس، عامل بیماری سل، است. ژن pnca آنزیم پیرازین آمیداز مایکو باکتریوم توبرکلوزیس را رمزدهی می نماید. این آنزیم مسئول تبدیل داروی پیرازین آمید به شکل فعالش یعنی پیرازینوئیک اسید است. علیرغم نقش این دارو در کوتاه سازی دوره ی درمان از نه ماه به شش ماه، ظهور سویه های مقاوم به پیرازین آمید مشکل مهم سلامت جهانی است. در این مطالعه دو ...

سابقه و هدف: مطالعه­ های آسیب شناختی، تشکیل پلاک های فیبری و توده های تجمع یافته پپتید آمیلوئید بتا (aβ) را یکی از دلایل بیماری آلزایمر پیشنهاد کرده اند. از آن­جا که این بیماری وابسته به ساختار فضایی پروتئین است در این مقاله به روش شبیه­ سازی دینامیک مولکولی مراحل آغازین تغییرهای کنفورماسیون دو مونومر از aβ، aβ (1-42) و aβ (1-40) مورد بررسی قرار می­گیرد. مواد و روش­ ها: ساختار nmr دو پپتید aβ (...

مقدمه: در این تحقیق عملکرد 3 نانوموتور بر روی 15 پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از طریق شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفت. روش: در این مطالعه 14 نوع موتانت و 1 نوع نرمال پپتید ترانس ممبرن پروتئین پیش ساز آمیلوئید بتا از پایگاه داده ncbi به دست آمده و سپس شبیه سازی با استفاده از نرم افزارdesigner ascalaph  انجام شد. 15 پپتید با ساختار های 3 بعدی پایدار سنتز شده، برای ورود به م...