: در این تحقیق ما با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی،جذب مخلوط های مختلفی (کسرهای مولی مختلف)از آرگون وهلیم را برنانو خوشه های نقره،با شعاع های مختلف و در دماها وفشارهای متفاوت مورد بررسی قرار دادیم.در این کار ما از پتانسیل ساتن-چن برای توصیف برهمکنش های فلز-فلز وبرای سایربرهمکنش ها از پتانسیل لنارد جونز استفاده کرده ایم.به منظور ثابت نگه داشتن دما وفشاردر طول شبیه سازی از امکانات نرم افزا...

در این رساله به بررسی شبیه سازی سیالات محدود شده آب و متانول به صورت خالص و مخلوط آنها در بین لایه های گرافیتی پرداخته شده است. کلیه خواص مورد مطالعه در این پژوهش برای سامانه های محدود شده از قبیل پروفایل چگالی عرضی، تابع توزیع شعاعی جانبی، میانگین مربع جابجایی جانبی، تابع خود همبستگی سرعتی جانبی و همچنین تعداد و طول عمرپیوند هیدروژنی با استفاده از میانگین گیری نهایی نتایج حاصل از چندین اجرای م...

در این پایان نامه، با استفاده از تکنیک شبیه سازی دینامیک مولکولی (md) به مطالعه، استخراج و مقایسه خواص مکانیکی آلیاژهای pd-rh در دو حالت نانوسیم و بزرگ مقیاس، این فلزات پرداخته می شود. خواص مکانیکی این دو فلز، در حالتهای خالص و آلیاژی با درصدهای مختلف محاسبه شده است. پتانسیل مورد استفاده، پتانسیل ساتن چن می باشد. الگوریتم نوزه هوفر دما را ثابت نگه داشته و تعداد ذرات نیز با استفاده از شرایط مرزی...

با توجه اینکه ترکیبات دارویی ضدسرطان ذاتآ سمیت دارند و می توانند اثرات سوئی بر روی سلولهای سالم و غیر سرطانی داشته باشند، یافتن ترکیباتی که بتواند دارو را در محل مورد نظر آزاد کنند از اهمیت به سزایی برخوردار می باشد ، کربن نانو تیوب ها، ورقه های گرافنی رول شده ای هستند که دارای یک فضای داخلی می باشند که برای کپسوله کردن مواد بسیار مناسب است و خواص شیمیایی و قدرت مکانیکی این ترکیبات در بدن انسان...

هدف پایان نامه، مطالع? سایت های برهم کنش کنند? مابین دارو و نانوذرات پروتئینی است.همچنین بررسی احاطه کردن دارو توسط نانوذرات پروتئینی می باشد. این کار با بررسی فواصل و تعداد برخورد، پیوند هیدروژنی ما بین دارو و نانوذرات پروتئینی، امکان برهم کنش دارو با زنجیر جانبی آمینواسید نانوذرات پروتئینی می باشد. تصاویر هر یک از سیستم ها نیز در این پایان نامه آورده شده است.

rab23 یکی از پروتئینهای خانواده rab می باشد که مسوول تنظیم ادغام و اتصال غشاء ویزیکولها با اندامکهای سلولهای یوکاریوتی می باشد. این پروتئین یک تنظیم کننده منفی خودکار سلولی برای علامت دهی(signaling) hedgehog در مهره داران است. مسیر علامت دهی hedgehog در رشد اکثر ارگانها و بافتهای مهره داران نقش محوری داشته و ارتباط آن با نقایص مادرزادی و بسیاری از انواع تومورها مشخص شده است. بنابراین دخال...

در این پایان نامه روش های محاسباتی نظیر روش های abinitio ، dft و ... و روش شبیه سازی دینامیک مولکولی به طور مختصر مورد مطالعه قرار گرفته است . سپس به موضوع پارامتری کردن میدان های نیرو به عنوان اساس مهم شبیه سازی پرداخته شده است و یک نمونه پارامتری کردن پتانسیل لنارد – جونز برای مولکول co، به روش dft انجام شده است . سپس به معرفی نانو لوله های کربنی و نانو لوله های دوپه شده پرداخته شده است . در ...

رفتار برخورد ذرات ترد در مقیاس نانو یک موضوع بحث انگیز در روش های پاشش جدید نظیر پاشش ایروسول و پاشش سرد محسوب می شود. لذا در این پژوهش به کمک شبیه سازی به روش دینامیک مولکولی به بررسی این موضوع پرداخته شده است. برای این منظور ابتدا یک ماده ترد به کمک کاهش شعاع موثر در تابع پتانسیل لناردجونز به منظور ایجاد رفتاری ترد در ماده تعریف شد. پس از توصیف ماده ترد شبیه سازی رفتار برخورد ذرات به ازای مهم...

در این پایان نامه، به مطالعه ی سازوکار انتقال انتخابیِ نانو منفذهای غشای هسته با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی درشت دانه پرداخته شده است. کمپلکس های منفذ هسته گذرگاه های دوطرفه انتخابی بین هسته و سیتوپلاسم هستند. درحالیکه مولکول های کوچک (کوچکتر از ? نانومتر) آزادانه از میان این نانو منفذها انتشار می یابند، مولکول های بزرگ (بزرگتر از ? نانومتر تا ?? نانومتر) تنها با اتصال به گیرنده های ان...

بر اساس نتایج آزمایشات بارگذاری بر روی نانوتیوبهای کربنی و کامپوزیتهای آن، شکل پذیری و جذب انرژی قابل توجهی در ورای حد الاستیک در این نانوسازه ها دیده شده است. با توجه به محدودیتهای محاسباتی روشهای تحلیلی (نظیر دینامیک مولکولی و مکانیک کوانتومی) برای شبیه سازی این رفتار، در این مقاله از روش مدلسازی مکانیک محیط پیوسته در قالب روش اجزای محدود استفاده شده است. به این صورت که ابتدا چگونگی بروز رفتا...