بررسی و بهبود خواص نانوکامپوزیت های پلیمری از جمله نفوذ گازها در این مواد و یا خاصیت انسدادی آنها در برابر عبور گاز مستلزم بررسی و شناسایی در سطح مولکولی است. انجام مطالعات آزمایشگاهی در این مقیاس علاوه بر لزوم صرف زمان زیاد، با هزینه های بالا و خطاهایی همراه است. روشهای شبیه سازی راهکارهای جایگزین مناسبی برای کاهش زمان و هزینه تولید هستند. در این پایان نامه، ابتدا اصول شبیه سازی دینامیک مولکول...

پلی اتیلن ترفتالات (pet) مهم ترین پلی استر است. این پلی مر به خاطر خواص مقاومتی بالا در مقایسه با دیگر پلی مرها (از قبیل پلی الفین ها، پلی کربنات ها، پلی استایرین ها و...) مورد توجه زیادی قرار گرفته است. پلی اتیلن ترفتالات در صنعت به دلیل کاربرد هایی از قبیل ساخت بطری های مورد استفاده در پر کردن نوشیدنی ها، بسته بندی غذا، فیبر ها، فیلم ها و ساخت بازو های برف پاکن شیشه جلو اتومبیل، سیستم های ترم...

شبیه سازی پپتیدهای ضدمیکروبی در محیط غشاء به خاطر اهمیت محیط دولایه لیپیدی در عمل این پپتیدها و همچنین مشکل بودن دست یابی به جزئیات مکانیسم عمل آنها با روش های دیگر بسیار مورد توجه می باشد. در این پایان نامه چگونگی برهمکنش پپتید ضدمیکروبی pis-1 و دو آنالوگ آن (pis-1 aa و pis-1 pg) با غشاء دو لایه دی پالمیتویل فسفاتیدیل کولین (dppc) با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی بررسی شد. نتایج شبیه سازی ها م...

پروتئین آلفا1- آنتی تریپسین عضو اصلی ابر خانواده مهار کننده های سرین پروتئاز ( سرپین) است. این پروتئین شامل 394 اسیدامینه است که از سه صفحه بتا و نه مارپیچ آلفا تشکیل شده است. نقش اصلی آن مهار فعالیت پروتئازها است. اطلاعات مربوط به ساختار این پروتئین از این جهت مهم است که می تواند زمینه ساز فهم علت عملکرد نادرست آنتی تریپسین و دیگر سرپین ها باشد. عوامل مختلف ژنتیکی و محیطی از قبیل دما و ph و دگ...

فتالوسیانین های فلزدار از دسته ی رنگ های آلی هستند که به دلیل ویژگی های ساختاری و سیستم الکترونی منحصر به فردی که دارند، کاربردهای فراوانی در پزشکی و صنعت دارند. در این پروژه از مشتق کبالت دار فتالوسیانین به دلیل دسترسی بهتر استفاده شد. اتصال این ترکیبات به مدل های شیمیایی ساده مانند مواد فعال سطحی به دلیل کاربرد در فرآیند های بیولوژی و فوتوشیمی مورد توجه خاصی بوده است. به همین منظور رفتار جذبی...

در این پایان نامه یک روش جالب برای ساخت نانولوله های کربنی معرفی و بررسی می شود. در این روش نانولوله های کربنی تک دیواره و چند دیواره از طریق خم شدن نانوروبان های گرافنی الگودهی شده روی لایه های گرافیت، به وسیله ی جذب سطحی اتم هیدروژن شکل می یابند. برای فرآیند جذب و لوله شدن از شبیه سازی دینامیک مولکولی به همراه الگوریتم ورله و پتانسیل ایریبو استفاده شده است که الگوریتم ورله رایج ترین روش برای ...

زمینه تحقیقاتی میکروشاره ها هر روزه در حال پیشرفت است و کاربردهای متنوعی در شیمی، بیوتکنولوژی، پزشکی و فیزیک دارد. این تکنولوژی به صورت گسترده در ساخت آزمایشگاه های میکرونی استفاده می شود که اندازه گیری های دقیق در آن ها بسیار مهم است. از جمله کاربردهای میکروکانالها در روش¬های دارو¬رسانی می باشد این روش ها نیز خود به چند دسته مختلف تقسیم می شوند از آن جمله می توان به روشهای electro-osmotic pump...

چشم انداز برنامه‏ نویسی سیستم‏ های مولکولی برای اجرای عملیات و قدرت پردازش موازی مولکول‏ های دی.ان.ای، محققان را به سوی طراحی مدارهای بیوشیمیایی ترکیبی جذب کرده است. از آنجاکه ساخت رایانه‏ ای با قدرت پردازش موازی خواسته‏ ی این تکنولوژی بوده است، رایانه مولکولی نقطه عطفی در این مسیر محسوب می‏ گردد. در این تحقیق ابتدا یکی از پیشرفته‏ ترین مدل ‏های موجود، تشریح شده است. سپس، با استفاده از این مدل ...

این پایان نامه شامل دو بخش است: بخش اول مربوط به بررسی تجربی حذف یک رنگ آزو (rb5) با استفاده از نانوذرات fe/pd و نانوصفحات گرافن است و در بخش دوم جذب rb5 روی نانوصفحه ی گرافن به صورت نظری با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی مورد بررسی قرار گرفته است. بخش اول آب یکی از مهم ترین اجزاء برای ادامه ی حیات است و به طور مستقیم با بهداشت عمومی، تولید انرژی و توسعه ی اقتصادی و صنعتی در ارتباط اس...

آدنوزین دآمیناز (3.5.4.4 ec)، یک متالو آنزیم حاوی یون روی است. این آنزیم یک نقش کلیدی را در متابولیسم پورین و هیدرولیز غیر قابل برگشت آدنوزین و 2-دئوکسی آدنوزین به نوکلئوزید های اینوزین و آمونیاک، بازی می کند. درک برهمکنش آدنوزین دآمیناز با مهارکننده هایش برای ایجاد و توسعه نسل های آینده عوامل دارویی ضروری است. شبیه سازی های رایانه ای می توانند این برهمکنش ها را نشان دهند. در بررسی اخیر برهمکنش...