چکیده : استفاده ازروشهای تئوری و محاسبات کامپیوتری درآنالیز صورت بندی ملکولها تاریخچه طولانی دارد. دراین پروژه با استفاده ازروشهای محاسباتی به بررسی کونفورماسیونهای مشتقات پیریدین دی کربوکسیلیک اسید می پردازیم. ابتدا ساختار ترکیبات را با استفاده ازروش am1 بهینه کردیم و بعد با استفاده از روش های b3lypوhf محاسبات را ادامه دادیم ودر تمام محاسبات از مجموعه پایه g*311-6استفاده شده است. محاسبات فرک...

در این پایان نامه با استفاده از روشهای نظری تابعی چگالی (dft) و خوشه جفت شده (ccsd(t)) مسیرهای ممکن برای واکنشch4 با rh2+ با چندگانگی اسپینی 2، 4 و 6 مورد بررسی قرار گرفته است. پژوهش های انجام شده، روش های محاسباتی از جمله روشهای به کار رفته در این پژوهش و برخی نکات وابسته به آنها و چگونگی بدست آوردن ساختارهای حالت گذار با استفاده از روشrelaxed surface scan شرح داده شده اند. برای محاسبات بهینه ...

چکیده در این پروژه مجموعه ای از ترکیبات دی نیتروزو مانند دی نیتروزوآمین، دی نیتروزومتان، دی تیونیتروزآمین، دی تیونیتروزمتان به منظور بررسی اثر هترواتم n برنظم پیکربندی و صورتبندی، پیوند هیدروژنی درون مولکولی وعدم استقرار الکترونی بصورت نظری مورد مطالعه قرار گرفتند. تمام هم صورت های ممکن آنها در روش های b3lyp و mp2 و با تابع پایه6-311++g(d,p) بهینه شده اند. سپس محاسبه فرکانس در سطوح نظری ذکر ش...

با استفاده از نرم افزار گوسین و در سطح محاسباتی (mp2/6-311++g(2d,2p) ساختار های ممکن برای برهم کنش های پیـــوند هیدروژنی و ســـایر برهم کنش های بین مولکولی با تغییــــر موقعیت های مولکول های اتیلن و هیدروژن فلورید نسبت به مولکول فسفین اکسید مورد بررسی قرار گرفت. با توجه به نتایج به دست آمده افزایش تعداد پیوندهای هیدروژنی و متناسب با آن افزایش اندازه کمپلکس ها باعث افزایش پایداری کمپلکس ها شده ...

مقدارهای پتانسیل اکسایش / کاهش مولکول های بنزو کینون، هیدرو کینون، بنزن و هر یک از این مولکول ها با استخلاف های مختلف (h,f,cl,me,cn,…) در ترازهای گوناگون محاسبه و با مقدارهای تجربی مقایسه و بررسی گردیدند. داده های پتانسیل اکسایش/کاهش مولکول های بنزو کینون، هیدرو کینون نشان می دهد که تراز محاسباتی m062x/6-311g** نزدیک ترین داده را به مقدار تجربی دارا هستند. از سوی دیگر داده های پتانسیل اکسایش/کا...

چکیده در حال حاضر به خوبی ثابت شده است که خواص ذرّات در حدّ نانو از خواص همان ذرات در مقیاس بزرگتر کاملاً متفاوت است. گرافن ها و نانو صفحات نیز از این امر جدا نیستند. با توجّه به افزایش علاقه درباره یِ این صفحات، مطالعات مولکولی با روش شبیه سازی دینامیک مولکولی انجام گرفته است. اهمیّت ترکیبات دارویِ دوکسوروبیسین، در درمان سرطان، ما را بر آن داشت تا چگونگی برهمکنش این دارو با صفحه یِ گرافن را مورد بر...

دیده پخش یک ذره براونی در حضور موانع یا ماکرومولکول های محلول در حلال در طبیعت مصادیق فراوانی دارد. حضور موانع یا ماکرومولکول هایی که دینامیک بسیار کندی نسبت به ذره براونی مورد نظر دارد، باعث می شود بخش هایی از فضا، از دسترس ذره خارج شود. در این حالت گفته می شود، دینامیک ذره از مدل گشت تصادفی محدود شده پیروی می کند. گشت تصادفی محدود شده، در دهه های گذشته بسیار مورد مطالعه قرار گرفته است. یک...

ما در این مقاله با استفاده از یک مدل بستگی قوی و روش ماتریس انتقال، اثر تغییر طول مولکول و قدرت پیوندگاه مولکول- نانو لوله کربن ( cnt ) را بر گسیل الکترون از سیستم cnt / مولکول منفرد/ cnt به صورت عددی بررسی می کنیم. با پلی استیلن در فاز ترانس ( trans -pa ) به عنوان مولکول، خواص رسانندگی سیستم را در چارچوب روش لانداور ( landauer ) مطالعه می کنیم. محاسبات ما نشان می دهند که در این ساختارها، رسانن...

تکنیک های مولکولی مانند واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) روش تشخیصی سریع و قابل اعتماد برای شناسایی پاتوژن های میکروبی می باشند. در دهه¬های اخیر در پی درمان آنتی¬بیوتیکی، سودوموناس آئروژینوزا به عنوان یکی از مهم¬ترین پاتوژن بیمارستانی شناسایی شده است که باعث عفونت¬های حاد و مزمن در افراد بستری در بیمارستان می¬شود. بسیاری از روش های تشخیصی بر اساس pcr برای شناسایی سودوموناس آئروژینوزا توسعه یافته ا...