در دهه‏ های اخیر مدل‏ های متابولیکی به ابزار مهمی در مطالعه شبکه‏‏ های متابولیکی تبدیل شده است. زایموموناس موبیلیس باکتری گرم منفی، بی ‏هوازی اختیاری و قادر به تولید اتانول از منابع کربنی مانند گلوکز، فروکتوز و ساکاروز است. در این پژوهش، مدل متابولیکی مقیاس ژنوم شامل 757 واکنش، 691 متابولیت و 434 ژن برای باکتری زایموموناس موبیلیس (atcc 10988) ساخته شد. به منظور تأیید صحت نتایج مدل، نتایج مقادیر...

ساختار داده ابزاری برای ذخیره و بازیابی بوده و به طور کلی، روش منطقی و ریاضی یک سازماندهی خاص از داده ها نامیده می شود. کشف توالی های مختلف ژنوم و پروتئین در جانداران مختلف نیاز به نمایه سازی آن و نوع ساختار داده متناسب، در جهت بازیابی سریعتر را افزایش داده است. ساختارهای داده رشته ای در طول سال های اخیر پرکاربردترین ساختارهای داده نمایه سازی ژنوم بوده است. به لحاظ روش پژوهش این مقاله حاضر مرور...

بیوانفورماتیک، مطالعات مجموعه گستره ی ژنوم، ژن، اسنیپ، مولدهای کمین فصلی

سرطان دهانه رحم شایع ترین نوع سرطان موثر بر زنان در کشورهای در حال توسعه می باشد که توسط عفونت با ویروس پاپیلومای انسانی(hpv) ایجاد می شود. بیش از 50? از سرطان های دهانه رحم در سراسر جهان به hpv16 نسبت داده شده است. l1پروتئین عمده کپسید و l2 پروتئین جزئی کپسید hpv است. پروتئینl1 قادر است به صورت خود به خودی به ذرات شبه ویروسی (vlp) فاقد dna ژنومی مونتاژ شود. در حال حاضر امیدوار کننده ترین واکسن...

گیاه کلزا (brassica napus l.) به عنوان یکی از مهمترین گیاهان روغنی بوده و سطح زیرکشت کلزا در سال های اخیر در حال افزایش است. آهن یکی از عناصر کم مصرف ضروری و کم تحرک برای گیاهان است. این عنصر بخشی از گروه کاتالیزوری بسیاری از آنزیم های اکسیداسیون واحیا بوده و برای سنتز کلروفیل مورد نیاز می باشد. تأمین آهن مورد نیاز این گیاه در مزارع رو به گسترش یکی از ضرورت های آتی بشمار می رود. مطالعه مکانیسم ...

سابقه و هدف : پروتئین های lea اولین بار در گندم و پنبه به عنوان پروتئین های تجمعی در اواخر دوره جنینی شناسایی و مطرح شدند. بیشتر دسته بندی های عمومی ژن های lea به وسیله استنباط از ساختار دمین های پروتئینی یا ویژگی های شیمیایی بدست می آید. روش های بیو انفورماتیکی روش های مفیدی برای مطالعه ژنوم در شرایط خارج آزمایشگاهی می باشند. مواد و روشها : در این تحقیق جهت مطالعه ژن wdhn13 پروتئین های lea درگ...

nestrenconia sp.strain.f یک جنس نمک دوست از خانواده micrococcacae است که ژنوم آن غنی از cg است. توسط نرم افزار rast ژنوم باکتری را بررسی کردیم. این بررسی نشان داد که ژنوم باکتری حاوی ژن endo-1,4-beta-xylanase است. پروتئین های اندو 1و4 بتا زایلاناز ( ec 3.2.1.8) آنزیم های هیدرولاز هستند که پیوند های 1-4 گلیکوزیدیک را در مولکول زایلان از ترکیب همی سلولوز می شکند.مطالعات دینامیک مولکولی مشخص کرد ک...

تکنولوژی انتقال ژن به کلروپلاست های گیاهان، یک روش ارزشمند و در حال توسعه در مهندسی ژنتیک است این امر به دلایل مختلفی مانند سطح بالای بیان پروتئین، امکان بیان اپرونی، نبود اثرات خاموشی ژن، پلیوتروپی، اثرات موضعی و شرایط خاص ایمنی زیستی و غیره می باشد. ناقلین کلروپلاستی برای هر گونه گیاهی، حالت اختصاصی دارند و این به خاطر ورود ترانس ژن، در پدیده نوترکیبی همتا ست. وقوع این پدیده به واسطه حضور توا...

به منظور درک بهتر از فرایند اهلی سازی بز سانان بویژه گونه ی بز در زاگرس مرکزی و دره سیمره، استخراج دی ان ای از بقایای جانوری تپه چیا سبز که یک محوطه ی نوسنگی بی سفال در زاگرس مرکزی می باشد، با هدف مقایسه ی ژنتیکی میان بز دوره ی نوسنگی با بز امروزی انجام گرفته است. هدف اصلی این تحقیق شناسایی هپلوتیپ های وحشی و اهلی در فازهای مختلف استقراری می باشد تا بدین ترتیب بتوان بومی بودن یا نبودن این گونه ...

سابقه و هدف: تب مالت یک بیماری مشترک بین انسان و حیوانات مختلف است که توسط گونههای بروسلا ایجاد میشود. اگرچه این بیماری بهندرت کشنده میباشد، اما در صورت عدم تشخیص سریع و مناسب، در همه گیریها و استفاده عمدی در جنگهای بیولوژیک، صدمات شدیدی به تسهیلات مراقبت پزشکی وارد میکند. با توجه به محدودیتهایی مثل زمان طولانی، دقت پایین، حساسیت کم و نتایج مثبت و منفی کاذب در روشهای تشخیص سنتی بروسلاها، هدف از...