برای بررسی انرژی برهم کنش بین مولکولی سامانه co-o2 محاسبات با روش همبستگی ,ump2 ,romp2 b3lyp و qcisd با استفاده از مجموعه های همبستگی سازگار دانینگ، cc-pvdz و cc-pvtzو همچنین تکمیل شده دو مجموعه، با افزایش توابع پخش aug-cc-pvdz و aug-cc-pvtzو مجموعه پایه 6-311+g و تکمیل شده مجموعه با افزایش توابع نفوذی 6-311+g*انجام گرفته است. با هر یک از روش ها و مجموعه های پایه ذکر شده، شش حالت مختلف و 36...

برای بررسی انرژی برهم کنش بین مولکولی سامانه no-no محاسبات با روش همبستگی ump2،b3lyp و qsisd(t) با استفاده از مجموعه های همبستگی سازگار دانینگ، cc-pvdz و cc-pvtz و همچنین تکمیل شده دو مجموعه، با افزایش توابع پخش aug-cc-pvdz وaug-cc-pvtz و مجموعه پایه6-311+g و تکمیل شده مجموعه با افزایش توابع نفوذی 6-311+g* انجام گرفته است. با هر یک از روش‎ها و مجموعه های پایه ذکر شده، چهار حالت مختلف و 37 مقد...

در این رساله، فعالیت داروها بر اساس ساختار پروتئین هدف و برهمکنش داروها با آن و سپس محاسبه توصیف کننده های دارو و ساخت یک مدل ریاضی بین فعالیت دارو و توصیف کننده ها (qsar) پیش بینی شد. در این رابطه ساختار سه بعدی پروتئین مورد نیاز بود. در مواردی که ساختار کریستالی پروتئین موجود نبود جهت پیش بینی ساختار سه بعدی آن از روش مدل سازی همسانی(homology modeling) استفاده شد. شبیه سازی دینامیک مولکولی سا...

در این مقاله با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی (کد لمپس)، فرآیند ذوب پریلین در دو هنگرد npt و nvtبه دو روش مختلف مورد بررسی قرار گرفته است. پتانسیل برهم کنشی انتخاب شده در این مقاله آر- ای2 بود. پس از اجرای شبیه سازی ها، انرژی پتانسیل و پارامتر نظم سیستم برحسب تابعی از دما در محدوده k600 - k500 محاسبه شده اند. نتایج نشان می دهند که برای بررسی فرآیند ذوب سیستم هنگرد npt مناسب تر و نتایج حا...

در اثر برهمکنش باریکه پرانرژی با ماده، فرایند برانگیختگی و یونیزاسیون اتم ها و بدنبال آن فلورسانس پرتو ایکس مشخصه ایجاد می شود. در برهم کنش باریکه مولکولی پرانرژی با ماده، پدیده های منحصربفرد اثر همسایگی و انفجار کولنی مشاهده شده است. در این پروژه پژوهشی برای مطالعه برهمکنش باریکه مولکولی با ماده، بهره اشعه ایکس مشخصه برهم کنش ناشی از باریکه مولکولی 2h+ با باریکه اتمی +h مقایسه شده است. باریکه ...

محاسبات نظری تابعی چگالی (dft) مربوط به 19 آرایش ممکن جذب فسژن بر روی نانولوله آلومینیوم نیترید گزارش شده¬است. این محاسبات برای تمامی آرایش های مذکور در سطح b3lyp/6-31g* و در فاز گاز انجام گردیده است. فرکانس¬های ارتعاشی نوسانگر هماهنگ نیز در همین سطح به منظور تأیید ماهیّت نقاط ایستا و همچنین برای تصحیح انرژی نقطه صفر (zpve) تخمین زده شده¬اند. نظریّه اتم¬ها در مولکول¬های بادر برای بررسی نقاط بحران...

شبیه سازی دینامیک مولکولی روشی مناسب برای مدلسازی میکروسکوپی در مقیاس اتمی و مولکولی فراهم می کند. در این پایان نامه با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی، کشش سطحی نانوذرات نمکی nh4cl محاسبه شده است. برای محاسبه کشش سطحی از روش جدیدی استفاده شده است. در این روش، با استفاده از انرژی جذب سیستم nh4cl در تماس با آب در قطرهای مختلف نانوذره، می توان drh را در rhهای مختلف به دست آورد. در واقع نم پذ...

این پایان نامه به ارتباط کمی بین ساختار و فعالیت (qsar) و نحوه اتصال ترکیبات به وسیله مکانیک کوانتوم و مولکولار داکینگ با روش های آماری جهت پیش بینی مقادیر cc50 برخی از داروهای ضد سل توسط روش رگرسیون خطی چندگانه مورد مطالعه قرار گرفت. پس از رسم ساختار داروهای ضد سل توسط نرم افزار hyperchem و بهینه کردن آنها با روش mm+، توصیف کننده های مولکولی توسط نرم افزار dragon محاسبه گردیدند. توصیف کننده ها...

مقدمه: هدف از مطالعه ی حاضر، بررسی تاثیر تعاملی محدودیت کالری و ورزش هوازی بر سطوح ایزومرهای آدیپونکتین در سرم و بافت­های چربی حفره ی شکمی موش های نر چاق بود. مواد و روش­ها: در این مطالعه، آماری از 48 سر موش صحرایی نر نژاد ویستار استفاده شد. نمونه­برداری خون و بافت چربی در هفته­های اول، 18 و 28 صورت گرفت. پس از نمونه­برداری پایه که در آن (8 سر کشته شدند)، 40 سر موش باقی مانده به طور تصادفی به گ...

در این پژوهش ساختار مولکولی و انرژی پیوند هیدروژنی درون مولکولی 26 صورت بندی 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) در سطوح محاسباتی b3lyp و mp2 با تابع پایه 6-311++g** و سطح g2mp2 به منظور تعیین مرتبه ی پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوند هیدروژنی درون-مولکولی مختلف بهینه شده است. نتایج محاسبات در فاز گاز و آب نشان می دهد که صورت بندی های 3-آمینو-پروپن سلنال(aps) این ترکیب پایدارتر از بقیه هستند. ای...