دیفنسین‌های گیاهی، خانواده‌ای بزرگ از پپتیدهای ضد میکروبی غنی از سیستئین هستند. این پپتیدها، مولکول‌هایی با جرم مولکولی 5 تا 7 کیلودالتون و دارای هشت اسید آمینه سیستئین محافظت شده هستند که در ایجاد پیوندهای دی‌سولفیدی نقش دارند. در این پژوهش برخی اعضاء خانواده ژنی دیفنسین در ژنوتیپ‌های مختلف گیاه عدس جداسازی و بررسی شدند. ابتدا، تمام توالی‌های کد کننده‌ی ژن‌های دیفنسین گیاهان دو لپه‌ای از بانک ...

هدف از این پژوهش پویش ژنوم گوسفند برای شناسایی جایگاه‌های مؤثر بر قطر پشم در نژادهای بومی کشور بود. برای این منظور نمونه‌های خون 94 حیوان، شامل 47 رأس از نژاد ایرانی زل و 47 رأس از نژاد ایرانی لری‌بختیاری تهیه شد و پس از استخراج DNA، نمونه‌ها با استفاده از آرایه‌های Ovine 50k SNP Chip تعیین ژنوتیپ شدند. داده‌های حاصل به منظور بررسی کیفی آنالیز شدند. پس از این مراحل، در نهایت مجموع 48056 نشانگر ...

جلبک‌های قهوه‌ای (Adanson, 1763) padina به طور گسترده‌ای در مناطق ساحلی گرمسیری و معتدل و در مناطق بین جزر و مدی تا نواحی زیر جزر و مدی یافت می‌شوند. هدف از تحقیق حاضر، شناسایی جلبک‌های جنس پادینا در سواحل بندر لنگه خلیج فارس با استفاده از شواهد مورفولوژیکی و توالی‌های کلروپلاستی rbcL می‌باشد. شناسایی مورفولوژیک با استفاده از کلید شناسایی معتبر انجام شد. سپس استخراج DNA با استفاده از روش CTABبا...

اهداف این رساله، بررسی میزان خطای امپیوت و تاثیر آن بر قابلیت اعتماد ارزش اصلاحی ژنومی برآورد شده (gebv) حیوانات جمعیت آزمون، زمانی که ژنوتیپ های 6000 نشانگر snp به الگوی 50000 نشانگر با استفاده از نرم افزار fimpute امپیوت می شوند و همچنین بررسی تاثیر توسعه جمعیت مرجع بوسیله تعداد متفاوت ماده-ها با الگوهای تراکم نشانگری مختلف در جمعیت شبیه سازی شده یک نژاد کوچک گاو شیری (جرسی) بر قابلیت اعتماد ...

دوقلوزایی از صفات مهم اقتصادی در پرورش گوسفند می­باشند. صفات تولید­مثلی نه تنها در بین نژادهای مختلف گوسفند بلکه در بین گوسفندان یک نژاد نیز دارای تفاوت­های عمده می­باشند. در این تحقیق مطالعه الگوی عدم­تعادل لینکاژی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی با استفاده از 42416 نشانگر تک­نوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی مؤثر بر نرخ دو­قلوزایی در گوسفند بلوچی انجام شد. نمونه­های خون از 96 رأس گوسفند بلوچی همرا...

مقدمه: با افزایش تعداد باکتری هایی که توالی یابی می شوند، نیاز به بهره برداری از این داده ها نیز بیشتر می شود. استفاده از این اطلاعات ژنومی از طریق به کارگیری هم زمان علوم بیوانفورماتیک و باکتری شناسی امکان پذیر می باشد. مطالعه ی بیوانفورماتیک اندازه ی ژنوم باکتری های بیماری زا، تنوع قابل توجهی را نشان می دهد. فرضیات زیادی در مورد علت این تنوع و همچنین ارتباط اندازه ی ژنوم و فرایندهای اساسی باک...

چکیده زمینه و هدف: فسفولیپاز های ترشحی خارج سلولی عموما در هیدرولیز فسفولیپید های خارج سلولی و در نتیجه، تهیه ی منابع تغذیه ای کربن، نیتروژن و فسفات برای سلول دخالت داشته ولی فسفولیپازهای درون سلولی در کنترل اعمال متابولیکی سلول مؤثر بوده و نقش تنظیمی برای فعالیت بیولوژیکی سلول برعهده دارند. تولید فسفولیپاز ها در میکروارگانیسم های مختلف بیماری زا و مکانیسم اثر آن ها در بیماری زایی این میکروارگا...

جلبک های قهوه ای (adanson, 1763) padina به طور گسترده ای در مناطق ساحلی گرمسیری و معتدل و در مناطق بین جزر و مدی تا نواحی زیر جزر و مدی یافت می شوند. هدف از تحقیق حاضر، شناسایی جلبک های جنس پادینا در سواحل بندر لنگه خلیج فارس با استفاده از شواهد مورفولوژیکی و توالی های کلروپلاستی rbcl می باشد. شناسایی مورفولوژیک با استفاده از کلید شناسایی معتبر انجام شد. سپس استخراج dna با استفاده از روش ctabبا...

چکیده زمینه و هدف: سرطان معده یکی از شایع ترین بدخیمی ها می باشد و تشخیص زود هنگام می تواند در روش درمان مؤثر باشد. ناپایداری ژنومی و در نتیجه بروز تغییرات ژنی یک مرحله مولکولی و پاتوژنیک قاطع می باشد که در اوایل روند سرطان زایی معده رخ می دهد. ژن xrcc1 یکی از مهم ترین ژن های ترمیم dna می باشد. پروتئین xrcc1 نقش اساسی در مسیر ترمیم dna با برداشت باز ایفا می کند. پلی مورفیسم های ژن xrcc1 توانایی...

هدف از این تحقیق ارزیابی مدل­های تک-صفتی و چند-صفتی در سناریوهای مختلف ژنومی با در نظر گرفتن جانهی جهت برآورد صحت پیش­بینی ژنومی و تشخیص وجود اثر متقابل ژنوتیپ و محیط (G × E) بود. داده‌های ژنومی با تعداد متفاوت جایگاه­های صفات کمی (90 و 900) و سطوح مختلف عدم تعادل پیوستگی (کم و زیادLD = ) برای تراکم K50 شبیه‌سازی شدند. سپس به‌طور تصادفی 90 درصد نشانگرها حذف و در مرحله بعد این نشانگرها از طریق ن...