نتایج جستجو برای: blastn
تعداد نتایج: 414 فیلتر نتایج به سال:
For identification of genes responsible for varietal differences in flowering time and leaf morphological traits, we constructed a linkage map of Brassica rapa DNA markers including 170 EST-based markers, 12 SSR markers, and 59 BAC sequence-based markers, of which 151 are single nucleotide polymorphism (SNP) markers. By BLASTN, 223 markers were shown to have homologous regions in Arabidopsis th...
The pacific white shrimp, Litopenaeus vannamei, is a popular species in aquaculture. Abdominal muscle accounts for 90% of shrimp flesh. Its growth and related genes, particularly the regulatory genes, is not well known. A cDNA library of shrimp juvenile abdominal muscle was established by PCR-based SMART™ cDNA technology. Library size was 5.0 × 106 pfu (plaque-forming unit) independent clones p...
Chalcone synthase (CHS) is a plant-specific enzyme that synthesises naringenin chalcone, an essential precursor of the flavonoid biosynthetic pathway. Naringenin and kaempferol are two flavonoids that have been demonstrated to inhibit the proliferation of HeLa cells. To study chalcone synthase gene regulation in Melastoma decemfidum, we developed a high-yield total RNA isolation method to assem...
Sugarcane is a species of tall grass with high biomass and sucrose production, the world’s largest crop by production quantity. Its evolutionary environment adaptation anthropogenic breeding response have resulted in complex autopolyploid genome. Few efforts been reported literature to document this organism’s gene co-expression annotation, and, when available, use different identifiers that ca...
miRNA ها یک رده از RNA های تنظیم کننده کوچک درون هسته ای و غیرکدکننده پروتئینی که متشکل از حدود 17-22 نوکلئوتید می باشند. miRNA ها بیان ژن را پس از رونویسی از طریق تجزیه mRNA یا مهار ترجمه انها کنترل کرده و نقش های متنوعی را در فرایند های بیولوژیکی و متابولیکی در گیاهان و جانوران بازی می کنند. روش های متعددی برای شناسایی miRNA ها موجود می باشد که یکی از ساده ترین و کم هزینه ترین انها ، روش شناس...
مقدمه: اندوفیت‌ها ریزجاندارانی هستند که بدون هیچ‌گونه نشانۀ آشکاری در بافت‌های داخلی گیاهان ساکن میشوند. مطالعۀ حاضر با هدف شناسایی و جداسازی قارچ‌های اندوفیت لوبیا چشم‌بلبلی (Vigna unguiculata (L.) Walp.) در استان خوزستان انجام شد. مواد و روشها: در سال 1395، هشت نمونۀ گیاهی سالم از مناطق مهم زیرکشت لوبیا چشم‌بلبلی در شمال استان خوزستان جمع‌آوری شدند. قطعه‌های کوچکی از ریشه، ساقه، برگ و غلاف...
توالی نوکلئوتیدی و پروتئینی و روابط فیلوژنتیکی بین ژنهای کد کنندة هفت آنزیم سیتو‌کرمP450 متعلق به قارچ بیمارگر حشرات Beauveria bassiana جدایة ATCC90517 موجود در بانک ژن مورد ارزیابی قرار گرفت. براساس نتایج BLASTN، بیشترین میزان شباهت هفت توالی مورد بررسی با ژنهای B. bassiana جدایة ARSEF (84-100درصد) و سپس قارچ‌های Cordyceps militaris و Isaria fumosorosea (76-89 درصد) مشاهده شد که مطابق ...
Our current taxonomic perspective on Entamoeba is largely based on small-subunit ribosomal RNA genes (SSU rDNA) from Entamoeba species identified in vertebrate hosts with minor exceptions such as E. moshkovskii from sewage water and E. marina from marine sediment. Other Entamoeba species have also been morphologically identified and described from non-vertebrate species such as insects; however...
Environmental high-throughput sequencing (envHTS) is a very powerful tool, which in protistan ecology is predominantly used for the exploration of diversity and its geographic and local patterns. We here used a pyrosequenced V4-SSU rDNA data set from a solar saltern pond as test case to exploit such massive protistan amplicon data sets beyond this descriptive purpose. Therefore, we combined a S...
Human saliva is clinically informative of both oral and general health. Since next generation shotgun sequencing (NGS) is now widely used to identify and quantify bacteria, we investigated the bacterial flora of saliva microbiomes of two healthy volunteers and five datasets from the Human Microbiome Project, along with a control dataset containing short NGS reads from bacterial species represen...
نمودار تعداد نتایج جستجو در هر سال
با کلیک روی نمودار نتایج را به سال انتشار فیلتر کنید