در این تحقیق، صورتبندی های مدل تری پپتید 2hco-gly-l-leu-gly-nh، که درساختار پلی پپتید پروتئین الاستین می باشد، در اثر چرخش زوایای دووجهی زنجیر جانبی و زوایای پیچشی اسکلت، در فاز گازی مورد مطالعه قرار گرفته است. همه محاسبات با استفاده از برنامه گوسین 2003 و با بهره گیری از سطوح تئوری hf و b3lyp با سری پایه (d) g31-6 انجام شده است. این تحقیق شامل 3 بخش می شود: بخش اول: ابتدا طی دو مرحله ساختاره...

چکیده- سوختگی غلاف برنج که توسط قارچ rhizoctonia solani ایجاد میشودیکی ازمخرب ترین بیماری های برنج درسرتاسرجهان است. روش متداول مبارزه بااین بیماری استفاده ازقارچ کش هااست که مشکلات جدیدی درپی دارد. بنابراین آشنایی با مکانیسم های سلولی ومولکولی میانکنش ما بین پاتوژن ومیزبان درمدیریت بیماری وبه کارگیری روش های موثر کنترل بیماری ضروری می باشد. دراین تحقیق باا ستفاده ازابزار بیوانفورماتیک وrt-pcr ...

سابقه و هدف: انتقال dna خارجی با بازدهی بالا به داخل باکتری از مهمترین مراحل در زیست فناوری میکروبی می باشد. برای این منظور چند روش مرسوم است که در بین آن ها روش کلسیم کلراید سرد از جمله مهمترین و ارزان ترین روش ها جهت انتقال dna به درون سلول های باکتریایی گرم منفی مانند escherichia coli می باشد. به طور معمول بازدهی انتقال dna در این روش107- 105 کلونی برای یک میکروگرم از dna خارجی می باشد. با ت...

مقدمه: تعدادی از گونه های باکتریایی قادرند تا مولکول dna را از محیط اطرافشان در یافت نمایند؛ میزان این دریافت به شرایطی مانند بزرگی پلاسمید و نوع میزبان بستگی دارد. در مورد باکتری باسیلوس سوبتیلیس نیز این امکان البته با میزان انتقال بسیار پایینی وجود دارد. در حال حاضر روش مرسوم برای انتقال پلاسمید خارجی به درون باکتری باسیلوس سوبتیلیس استفاده از روش طبیعی در یک محیط کشت حداقل ( اسپیزیزن ) است. ...

مقدمه: تعدادی از گونه‌های باکتریایی قادرند تا مولکول DNA را از محیط اطرافشان در‌یافت نمایند؛ میزان این دریافت به شرایطی مانند بزرگی پلاسمید و نوع میزبان بستگی دارد. در مورد باکتری باسیلوس سوبتیلیس نیز این امکان البته با میزان انتقال بسیار پایینی وجود دارد. در حال حاضر روش مرسوم برای انتقال پلاسمید خارجی به درون باکتری باسیلوس سوبتیلیس استفاده از روش طبیعی در یک محیط کشت حداقل (اسپیزیزن) است. در...

زمینه و اهداف: سرطان پروستات از علل شایع مرگ و میر در مردان می باشد. مطالعات نشان داده است که پپتیدهای هدف گیری کننده ی سلولهای سرطان قابلیت استفاده به عنوان ابزارهای درمانی و تشخیصی را دارند. در سالهای اخیر کتابخانه های نمایش فاژی پپتیدی برای شناسایی پپتیدهای هدف گیری کننده ی سلولهای سرطانی مختلفی بکار گرفته شده اند. هدف از این تحقیق جداسازی پپتید های هدف گیری کننده ی سلولهای آدنوکارسینومای پر...

چکیده سیکلوتیدها پپتیدهای کوچک غنی از باندهای دی سولفید هستند که از گیاهان جدا شده اند و دارای طیف وسیعی از فعالیت های زیستی شامل فعالیت ضد میکروبی، ضد تومور، حشره کشی وAnti-HIV می باشند. با توجه به افزایش باکتری های مقاوم به دارو، جامعه ی جهانی در حال رویارویی با یک چالش جدی است و نیازی ضروری به ترکیبات جدید برای درمان بیماری ها احساس می شود. سیکلوتید ها به عنوان پپتیدهای کوچک، پتانسیل بالایی ...

هدف به‏دست آوردن آنتی‏بادی اختصاصی با ایمن‏سازی توسط پروتئین نوترکیب و خالص‏سازی به کمک پپتید مصنوعی به‏عنوان روشی جدید (مدل pripep). مواد و روش ها: آنتی‏ژن پروتئینی با همسانه‏سازی ژن کامل sry روی ناقل pet28a و بیان پروتئین نوترکیب آن در سویه bl21 باکتری اشریشیا کلی تولید شد. پپتیدی اختصاصی از این پروتئین نیز طراحی و پس از سنتز برای ساخت ستون خالص‏سازی استفاده شد. پروتئین نوترکیب در ادجوانت فرو...

سابقه و هدف: در این مطالعه به اثر اتصال یون فلزی روی بر تغییرات ساختاری و پایداری پروتئین آمیلوئید بتا، موثر در بروز بیماری آلزایمر در سطوح مولکولی پرداختیم. روش بررسی: این بررسی با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیکی مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس نسخه 4.6.5 و میدان نیروی 03 amber و مدل حلال آب spc216 انجام گرفت. یافته ها: به کمک انحراف جذر مربع میانگین، صحت انجام شبیه سازی بررسی و با کمک...