در حال حاضر روشهای شبیه سازی به ابزارهای قدرتمندی در تمام زمینه های علوم تبدیل شده اند. این روشها در مقایسه با روشهای مرسوم نظری و تجربی، راه سومی برای مطالعات می باشند که توانائی های بیشتری نسبت به روشهای تجربی در به بوته آزمایش گذاشتن نظریه های پیشرفته نسبت به روشهای آنالیتیک دارند و از آنها در پروسه هایی می توان استفاده کرد که با روشهای تجربی غیرقابل دسترس هستند. از میان روشهای متعدد شبیه سا...

پپتید¬های حلقوی یک دسته رایج از ترکیبات¬اند که مشخصات ساختاری و بیولوژیکی ویژه دارند. این ترکیبات عملکرد¬های متفاوتی در اندام¬های زنده دارند. اغلب این ترکیبات از نظر بیولوژیکی فعال هستند. پپتید¬های حلقوی، با توجه به پیکربندی¬های منحصربه فرد خود به طور گسترده به عنوان مولکول¬های مدل برای پپتید¬های بزرگ تر در شیمی، بیوشیمی و شیمی دارویی استفاده می-شوند. ساختار این مولکول¬ها نشان دهنده عملکردشان ا...

بیماری آلزایمر، بدلیل پلاکهای آمیلوئیدی تشکیل شده از تجمع پپتیدهای آمیلوئید بتا به صورت فیبریل و همچنین عدم تعادل در غلظت یونهای فلزی موجود در مغز ایجاد می شود. پلاکها در شکاف سیناپسی تشکیل می شوند و این مکان به طور غیرطبیعی، حاوی غلظت های بسیار بالایی ازپپتید آمیلوئید بتا، یون های فلزی آهن و مس می باشد. شلاته کردن یون های فلزی به عنوان یک روش درمانی در درمان بیماری آلزایمر پیشنهاد شده است. در ...

سیکلوتیدها خانواده بزرگی از پپتیدهای گیاهی با فعالیت زیستی و ویژگی های ساختاری متمایز هستند، که در خانواده های گیاهیrubiacea، cucurbitaceae و violacea بیان می شوند. غلظت نسبتا بالای سیکلوتید در بافت گیاهی و حضور ایزوفرم های متعدد در یک گیاه به تناسب تفاوت های فصلی و منطقه ای پیشنهاد می کند که سیکلوتیدها در گیاه نقش دفاعی دارند. سیکلوتیدها به دلیل فعالیت های زیستی متعدد از جمله ضد ویروس، ضد قارچ...

سیکلوتیدها پروتئین هایی بسیار پایدار و مشتق شده از گیاهان هستند که با داشتن پتانسیل پایداری بالا در داروسازی و با داشتن فعالیت های زیستی در کشاورزی به کار می روند. سیکلوتیدها یک خانواده ی بزرگ از پروتئین های کوچک هستند که دارای 30 اسید آمینه و یک موتیف ساختاری به نام cyclic cystine knot (cck) می باشند . وجود این موتیف سبب مقاومت و پایداری استثنایی سیکلوتیدها به حرارت، مواد شیمیایی و آنزیم ها شد...

پپتیدهای ضد باکتریایی رده ای از مولکول هایی هستند که با مورد هدف قرار دادن غشاهای سلولی، موجب مرگ میکروارگانیسم می شوند و برخلاف آنتی بیوتک های مرسوم به ندرت در باکتری ها مقاومت دارویی ایجاد می کنند. این دسته از ضد باکتری های نو ظهور، مدت زیادی است که توجه بسیاری از آزمایشگاه های تحقیقاتی را در سراسر جهان به خود جلب کرده است. در حال حاضر، بیش از پانصد پپتید ضد باکتری با منشأ طبیعی در پایگاه ها...

هدف: در سال‏های اخیر توجه ویژه‏ای به کتابخانه‏های نمایش فاژی به‏عنوان ابزارهایی برای شناسایی و جداسازی مولکول‏های دارویی (با خواص تشخیصی و درمانی) شده‏است. کتابخانه‏های پپتیدی یکی از مهم‏ترین و پرکاربردترین انواع کتابخانه‏های نمایش فاژی هستند. هدف از انجام پژوهش حاضر غربالگری کتابخانه نمایش فاژی پپتیدی ph.d.tm-7 از طریق فرآیند بیوپنینگ برای شناسایی لیگاندهای پپتیدی متصل شونده به سلول‏های sw480 ...

بیماری آلزایمر (ad) و انحطاط نورون ها در این بیماری، به دلیل وجود رسوبات گسترده ای از پپتیدهای آمیلوئید بتا در مغز می باشد که جزء مهم این رسوبات پپتید آمیلوئید بتا 40 و 42 هستند. یکی از فرضیات مربوط به چگونگی ابتلا به بیماری آلزایمر فرضیه ی آسیب اکسایشی می باشد. تجمع پپتیدهای آمیلوئید بتا سبب تولید گونه های فعال اکسیژن تحریک واکنش های التهابی و مرگ برنامه ریزی شده ی سلولی می شود. در این مطالعه ...