کاربردهای نوین فناوری نانو، درک خواص ماده در ابعاد نانومتر را ضروری ساخته است. برای درک پدیده ذوب می توان از مطالعات پدیده شناختی سود جست. نانوخوشه ها به عنوان سیستمهایی که اثرهای سطحی در آن ها اهمیت دارد برای درک صحیح از شروع پدیده ذوب بیشتر مورد توجه قرار گرفته اند. شبیه سازیهای رایانه ای و روشهای عددی در کنار مطالعات آزمایشگاهی و نظری ، ابزاری مهم در بررسی خواص نانوخوشه هاست است و روش دینامی...

مولکول ‎dna‎ از دو رشته اسکلت قند-فسفات یکنواخت تشکیل شده که به صورت پادموازی قرار گرفته اند. در بین این دو رشته چهار باز نیتروژنی که با هم دو جفت یکتا را تشکیل می دهند وجود دارد. توالی این جفت بازها حامل اطلاعات وراثتی سلول است. نیاز به یافتن سطحی از مطالعه ی خصوصیات ‎dna‎ داریم که از طرفی در رژیم برهمکنش های ‎dna‎ با پروتئین ها باشد و از طرفی جهانی بودن کدهای ژنتیکی این مولکول را نادیده نگیرد...

آلفا1-آنتی تریپسین (?-1 antitrypsin, aat) یکی از اعضاء سوپر فامیلی سرپین ها و از مهار کننده های الاستاز نوتروفیل است.aat دارای ساختار دوم ویژه شامل سه صفجه بتا , نه آلفا هلیکس و لوپ مرکزی واکنشگر (rcl) می باشد. aat، پروتئازهای هدف را با تشکیل یک کمپلکس پایدار مهار می کند که در این حالت rcl برش یافته و درون ?-sheet a درج می شود که همراه با تغییر کانفورماسیون در aat می باشد. پلیمریزاسیون خود به خ...

در این کار ما از پنج زنجیره ی پلی اتیلن ترفتالات که هر زنجیره ی آن شامل 120 واحد مونومر می باشد استفاده کرده ایم و به روش دینامیک مولکولی در دماهای مختلف ازk 280 تا k600، ابتدا در شرایط nvt و سپس در شرایط npt آرایش های تعادلی از پلیمر را ایجاد کرده و در انتها با روش ذره آزمون widom، پتانسیل شیمیایی مخلوط پلی اتیلن ترفتالات و گازهای مختلف را بررسی نمودیم. زنجیر پلیمر قبلأ توسط اسلامی و مولر پلات...

امروزه با وجود پیشرفت های زیاد در درمان سرطان، به دلیل ایجاد سلول های سرطانی مقاوم به دارو های ضدسرطانی موجود علاقه زیادی به توسعه دارو های ضدسرطانی با مکانیسم عمل جدید وجود دارد. مطالعات نشان داده که بعضی از این پپتید های ضدمیکروبی کاتیونیک نسبت به سلول های باکتریایی سمی ولی نسبت به سلول های طبیعی پستانداران سمی نیستند و طیف وسیعی از فعالیت های سیتوتوکسیک نسبت به سلول های سرطانی نشان می دهند. ...

نتایج ما نشان داد که پتانسیل جند ذره ای توسعه یافته ما از پتانسیل های سه ذره ای گیوزمن و همکاران(2011)و ونگ و سادوس (2006) بهتر است

(شامل تعریف مسأله، سئوالات اصلی تحقیق، اهداف) نیمرساناها نقش بسیار مهمی در قطعات الکترونی ایفا می کنند. قطعاتی که بر اساس نیمرساناها کار می کنند زمینه ساخت ابزار مهم تکنولوژیکی از قبیل ترانزیستورها، دیود ها، سلول های فتوولتایی و آشکارساز ها را فراهم می آورند. در این بین نیمرساناهای اکسیدی به خاطر خواص الکتریکی بسیار متنوعی که نشان داده اند، مورد توجه قرار گرفته اند. با توجه به ارزان وساده تر ...

در این کار، جزئیات ساختار موضعی آب مایع به کمک توابع توزیع شعاعی (rdf) مکان- مکان، بین یک جفت اتم و پتانسیل نیروی میانگین (pmf) مشخص شد. خواص دینامیکی شامل میانگین مربع جابه جایی (msd) و ضریب خود نفوذی آب مایع در دماهای مختلف با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی محاسبه شدند. ضرایب خودنفوذی آب از شیب نمودارهای msd محاسبه شدند. نتایج حاصل در توافق خوبی با داده های تجربی متناظر بودند، هم چنین خ...

در مقاله حاضر خصوصیات مختلف محلول آب و یون های فلزی مانند سرعت یونها، نحوه آرایش مولکولهای آب حول یون فلزی و زمان شرکت مولکول های آب در لایه تشکیل شده حول یون فلزی به کمک شبیه سازی دینامیک مولکولی بررسی گردید. نتایج این تحقیق تشکیل یک آرایش پوسته مانند از مولکول های آب در اطراف یون های فلزی و تشکیل کمپلکس m(h2o) را نشان می دهد. تعداد مولکول های آب در این آرایش پوسته ای برای یونهای سرب، نیکل و ک...

در زمینه فناوری نانو، انتقال سیال در مجاری از اهمیت بالایی برخوردار است و با توجه به محدودیت های آزمایشگاهی در تحلیل رفتار جریان در مقیاس نانو از شبیه سازی-های عددی استفاده می شود. از این رو در این پژوهش با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی که یک روش دقیق برای سیستم های مولکولی بر مبنای قانون دوم نیوتن است برای بررسی رفتار جریان سیال آرگون در جریان کوئت پایدار درون نانوکانال های صاف و زبر مو...