اینترفرون بتا نوترکیب انسانی به عنوان خط اول درمان بیماری مالتیپل اسکلروزیس (ms ) و همچنین درمان انواعی از سرطان ها و عفونت های ویروسی کاربرد دارد. با این وجود ایجاد تجمع پروتئینی که یک مشکل عمده در طی فرایند تولید، نگهداری و کاربرد داروهای زیستی می باشد، استفاده کلینیکی از اینترفرون بتا انسانی را با محدودیت هایی مواجه نموده است. مشخص گردیده که ساختارهای قندی متصل به گلیکوپروتئین ها در افزایش ح...

با توجه به افزایش پیدایش سلول های سرطانی مقاوم به عوامل شیمی درمانی مرسوم، طراحی و گسترش داروهای ضد سرطانی با مکانیسم عمل جدید یک نیاز مبرم در جهت تخریب سلول های سرطانی با حداقل سمیت و اثرات جانبی می باشد. در سال های اخیر پپتیدهای ضدمیکروبی (amps) به واسطه ی توانایی درمانیشان جهت تشکیل اساس عوامل درمانی جدید توجه بسیاری را جلب نموده اند. در این تحقیق ما در طی 3 بخش برهمکنش پپتید ضدمیکروبی سنتز ...

مایعات یونی یکی از زمینه های بسیار جذاب و به شدت در حال پیشرفت در شیمی فیزیک مدرن، تکونولوژی و مهندسی است. این ترکیبات به خاطر خواص منحصر به فردی که دارند بسیار مورد توجه قرار گرفته اند. به ویژه اینکه فشار بخار بسیار ناچیز و خصوصیات حلالیت منحصر به فرد این ترکیبات باعث می گردد تا کاربرد های زیادی در زمینه های پیل های سوختی، سیالات انتقال حرارت و صنعت نفت بیابند. این مواد دوستدار محیط زیست هستند...

روش دینامیک مولکولی یک روش شبیه سازی کامپیوتری است که با حل معادلات حرکت کلاسیک به مطالعه حرکت فیزیکی اتم ها و مولکول ها در یک سیستم n ذره ای می پردازد. در این تحقیق از روش مذکور جهت بررسی تغییر ساختاری یکی از پیوندهای حیاتی در بدن استفاده شده است. این پیوند مابین گیرنده های موجود بر سطح سلولهای دیواره عروقی (اندوتلیال) به نام پی سلکتین و لیگاند های متناظر آنها (psgl-1) که بر سطح لکوسیت (سلول س...

امروزه شبیه سازی های رایانه ای به عنوان ابزاری مناسب در کنار فعالیت های آزمایشگاهی کمک شایانی به فهم پدیده های فیزیکی می کند. به دلیل محدودیت های آزمایشگاهی در مقیاس میکرو و نانو، علم محاسباتی نانو به عنوان مکمل علوم آزمایشگاهی، محققان را در فهم پدیده های میکرو و نانو یاری می نماید. دینامیک مولکولی یکی از دقیق ترین شبیه سازی ها در مقیاس میکرو و نانو است که روز به روز استفاده از آن بیشتر می شود....

چکیده: شبیه سازی دینامیک مولکولی روشی کلاسیک برای محاسبه ویژگی های تعادلی و ترابردی دستگاه بس ذره ای است. افزایش نمایی قدرت رایانه ها و بهبود روز افزون روش های شبیه سازی باعث شده تا امروزه شبیه سازی دینامیک مولکولی از یک مدل آزمایشی فیزیک آماری به یک روش سودمند برای پیشگویی برخی از ویژگی های مواد تبدیل شود. در این پایان نامه تشکیل نانو خوشه های کربن بر روی سطح گرافین با استفاده از شبیه سازی د...

بر اساس نتایج آزمایشات بارگذاری بر روی نانوتیوبهای کربنی و کامپوزیتهای آن، شکل پذیری و جذب انرژی قابل توجهی در ورای حد الاستیک در این نانوسازه ها دیده شده است. با توجه به محدودیتهای محاسباتی روشهای تحلیلی (نظیر دینامیک مولکولی و مکانیک کوانتومی) برای شبیه سازی این رفتار، در این مقاله از روش مدلسازی مکانیک محیط پیوسته در قالب روش اجزای محدود استفاده شده است. به این صورت که ابتدا چگونگی بروز رفتا...

چکیده ندارد.

در این پایان نامه از شبیه سازی مولکولی دینامیک برای محاسبه خواص ساختاری، ترمودینامیکی، و دینامیکی مورد نیاز مدل های مولکولی ویسکوالاستیک (که غالباً با تکنیک های آزمایشگاهی به دست می آیند) استفاده شده است. با استفاده از این شیوه (ترکیب شبیه سازی مولکولی و تیوری)، کوپلیمر یک درمیان اتیلن-پروپیلن غیرگره خورده شبیه سازی شده و خواص ویسکوالاستیک خطی مذاب گره خورده آن پیش بینی و با نتایج آزمایشگاهی مقا...

ویروس htlv-1 از خانواده رتروویروس ها می باشد و باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl) ، تشنج گرمسیری فلج کننده (ham/tsp ) و اختلالات عصبی می گردد. پروتئین پروتئاز یکی از مهمترین آنزیم های ویروسی بشمار می رود و با مهار آن می توان از ادامه چرخه آلودگی این ویروس جلوگیری بعمل آورد. سری جدیدی از مهار کننده ها را ایجاد گردید و با استفاده از ابزارهای محاسباتی نحوه اتصال آن ها به پروت...