سابقه و هدف: در این مطالعه به اثر اتصال یون فلزی روی بر تغییرات ساختاری و پایداری پروتئین آمیلوئید بتا، موثر در بروز بیماری آلزایمر در سطوح مولکولی پرداختیم. روش بررسی: این بررسی با کمک محاسبات شبیه سازی دینامیکی مولکولی و با استفاده از نرم افزار گرومکس نسخه 4.6.5 و میدان نیروی 03 Amber و مدل حلال آب SPC216 انجام گرفت. یافته‌ها: به کمک انحراف جذر مربع میانگین، صحت انجام شبیه سازی بررسی و ...

چکیده زمینه و هدف: فعالیت استیل کولین و آنزیم استیل کولین ترانسفراز در بیماری آلزایمر بررسی و مشخص شده است. از این جهت، نقص آنها می‌تواند باعث کاهش حافظه و یادگیری شود. میدان‌های نیرو، بر ساختار کولین استیل ترانسفراز تأثیر دارند. برای درک اثرات فضایی، برخی مطالعات کامپیوتری انجام شده است. مواد و روش‌ها: روش‌های شبیه سازی مونت کارلو ،دینامیک مولکولی و دینامیک لانگوین به‌وسیله‌ی میدان‌های نیروی...

این پایان¬نامه شامل دو قسمت است. درقسمت اول برهمکنش بین والاسیکلوویرهیدروکلرید با آلبومین سرم انسانی بررسی می¬گردد. به کمک طیف سنجی های جذبی در ناحیه مرئی-فرابنفش و فلوئورسانس مرسوم و به همراه شبیه سازی¬های دینامیک مولکولی و اتصال و همچنین معادلات وانت هوف و استرن-ولمر طبیعت برهمکنش بین والاسیکلوویرهیدروکلرید و آلبومین را آشکار می سازند. عامل ترمودینامیکی پیش برنده این برهمکنش از نوع آنتروپی بو...

مطالعات آزمایشگاهی نشان می دهد که نانولوله های کربنی می توانند با حمل مواد مختلف از درون غشاهای سلولی به عنوان ناقلان مولکولی عمل کنند. این کاربردها مربوط به توانایی نانولوله در انتقال یک سیال و بخصوص محلول های آبی در مقیاس نانو می باشد. به همین دلیل, مطالعه سامانه های آب-نانولوله در علوم و فناوری نانو همواره از اهمیت زیادی برخوردار بوده است. در نانوچنبره ها، علاوه بر انحنای موجود در نانولوله ه...

ویروس htlv-1 از خانواده رتروویروس ها می باشد و باعث ایجاد بیماری هایی نظیر لوسمی t-cell بزرگسالان (atl) ، تشنج گرمسیری فلج کننده (ham/tsp ) و اختلالات عصبی می گردد. پروتئین پروتئاز یکی از مهمترین آنزیم های ویروسی بشمار می رود و با مهار آن می توان از ادامه چرخه آلودگی این ویروس جلوگیری بعمل آورد. سری جدیدی از مهار کننده ها را ایجاد گردید و با استفاده از ابزارهای محاسباتی نحوه اتصال آن ها به پروت...

در سال های اخیر پایدار کردن ساختارهای g-quadruplex به عنوان یک هدف در درمان سرطان توجه زیادی را به خود جلب کرده است. مشتقات کوئینازولون (qd) از دسته لیگاندهایی هستند که جهت پایدار کردن این ساختارها طراحی و سنتز شده اند. درک ماهیت برهمکنش بین این  لیگاندها و ساختار g-quadruplex از اهمیت بسیار بالایی برخوردار است. جهت بررسی دقیق تر اینکه چگونه این برهمکنش ها با تغییر ساختار لیگاند تحت تأثیر قرار ...

سابقه و هدف : Charybdis hellerii گونه‌ی بسیار شناخته ‌شده‌ای در اقیانوس هند است. بررسی‌های مولکولی فراوانی بر روی این‌گونه در سایر نقاط دنیا انجام شده است. در ایران مطالعات مولکولی کمی بر روی خرچنگ‌ها صورت گرفته شده است، با این حال مطالعات ریخت‌شناسی بسیار جامع و مفیدی بر روی آنها انجام گرفته شده است. در تحقیق حاضر برای اولین بار در ایران به بررسی مولکولی جنس Charybdis گونه‌ی Charybdis hellerii...