مطالعات نشان داده است که بروز عفونت با گونه های کاندیدیایی، ارتباط زیادی با توانایی تشکیل بیوفیلم توسط این گونه ها دارد. هدف از این مطالعه مقایسه مولکولی و تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک ژن های عامل تشکیل بیوفیلم کاندیدیایی می باشد. در این مطالعه 7 جدایه به دست آمده از زنان مبتلا به عفونت واژینال از مراکز مختلف پزشکی تهران که در سال های 1390 و 1391 جدا و شناسایی شده بود، انتخاب گردید. استخراج dna ...

مقاومت میکروبی به آنتی بیوتیک ها نگرانی در حال افزایشی در میان متخصصان مراقبت از سلامت می باشد که آن ها را وادار به جستجو برای درمان های جایگزین می نماید. در سال های اخیر پپتیدهای ضد میکروبی توجه زیادی را به عنوان جایگزینی برای آنتی بیوتیک های سنتی به خود جلب نموده اند. پپتیدهای ضد میکروبی طیف گسترده ای از فعالیت را دارا می باشند و می توانند به عنوان داروهای ضد باکتریایی، ضد ویروسی، ضد قارچی و ...

چکیده تنش اکسیداتیو یک تنش ثانویه است، علامت ندارد و در پس زمینه همه تنش ها وجود دارد و مهمّترین تنش در دنیای بیولوژی گیاهی و جانوری است. مثلاً شوری یک تنش اولیه است که پس از اعمال در گیاه، منجر به تولید ros ها که همان تنش اکسیداتیو است، می شود. گیاهان مکانیسم های مهمّی را برای مقابله با آنها در خود توسعه داده اند. ros ها یا انواع اکسیژن های واکنشی ، به عنوان مواد جهش زا در واکنش ها عمل می کنند ...

بررسی و مطالعات صورت گرفته در زمینه کاربردهای کشف قوانین وابستگی در بیان ژن نشان می دهند که این عرصه نیازمند یک الگوریتم موازی کارا به منظور سرعت بخشیدن به فرآیند کشف چنین قوانینی از پایگاه داده های بیان ژن می باشد. روبرو شدن با حجم عظیم، در حال رشد و توزیع شده داده های زیستی، بیوانفورماتیک را نیازمند محاسبه و حافظه بیشتر و بیشتر کرده است. پردازش موازی برای این منظور طراحی شده است به طوریکه هزی...

با بهینه سازی دستگاه طیف سنج جرمی و توسعه پایگاه های اطلاعاتی و ابزار بیوانفورماتیک توام با ظهور نانوتکنولوژی در دهه 1990 میلادی، تحولی عظیم و شگرف در زیست شناسی ملکولی صورت گرفته و چشم اندازهای جدیدی در زیست شناسی ملکولی، پزشکی، کشاورزی، علوم محیط زیست، داروسازی و ... پیدا شد که مهمترین آن ها نگاه شبکه وار به کل سیستم زنده و حل مسائل زیستی در سطح کل سیستم به عنوان یک ماهیت به هم پیوسته متشکل ا...

مقدمه و هدف: به کارگیری روش های پروتئومیک و پیشرفت پژوهش های با توان بالای پروتئین ها زمینه ساز نیاز به روش های تازه در تحلیل های بیوانفورماتیک نتایج آزمایشگاهی-شده است. تحلیل خوشه ای، روش آماری مناسبی است که می تواند در تحلیل این گونه داده ها، استفاده شود. هدف از این پژوهش، ارزیابی کارایی روش خوشه بندی فازی در تحلیل پروتئین های مرتبط با سرطان های دستگاه گوارش بوده است.     مواد و روش ها: در ای...

هدف: ویروس هرپس سیمپلکس تیپ یک پس از آلوده کردن میزبان به‏صورت طبیعی در گانگلیون نورون تریژمینال به‏صورت خفته در می‏آید. در این وضعیت تنها رونوشتی که از ویروس در سلول قابل تشخیص است رونوشت وابسته به نهفتگی (lat) است که این رونوشت micrornaهایی را تولید می‏کند که قادر است مسیرهای پیام‏رسانی در سلول را دستخوش تغییر نماید. یکی از مسیرهای کلیدی پیام‏رسانی سلول مسیر فاکتور رشد تومور (tgf-β) است. در ا...

چکید ه   سابقه و هدف   یکی از اساسی ترین سلول های سیستم ایمنی که در بیماری مولتیپل اسکلروزیس( ms ) دخالت دارد، سلول th17 می باشد که در بسیاری دیگر از بیماری های خود ایمن نیز اثرگذار است. اخیراً از میکرو rna ها در درمان بسیاری از بیماری ها استفاده می شود. mirna ها دسته ای از rna های غیر کد شونده به طول 22 تا 25 نوکلئوتید هستند که نقش های تنظیمی اساسی در فرآیندهای مختلف سلولی دارند. در این مطالعه ...

یافتن بلندترین زیررشته مشترک چند رشته یک مساله شناخته شده است که در زمینه¬های گوناگون نظیر زیست¬شناسی و ژنومیک کاربردهای بسیار دارد. این مساله توسط محققان زیادی مطالعه شده است و پیچیدگی آن از جنبه¬های مختلف در طی سال¬ها بهبود یافته است. روش¬های مختلفی برای حل مسئله¬ی بلندترین زیررشته مشترک بین چندین رشته (mlcs) وجوددارد. روش¬های کلاسیک مبتنی بر روش¬های برنامه¬نویسی پویا از روش¬های ابتدایی حل مس...

پیدا کردن بزرگ ترین زیرتوالی مشترک بین چندین توالی یکی از مسائل np-hard با کاربردهای فراوان در اکثر زمینه ها ازجمله بیوانفورماتیک می باشد. افزایش روزافزون پیچیدگی و اندازه داده های مولکولی، نیازمند روش های کاربردی موثرتری برای توالی های با اندازه های متفاوت است. الگوریتم های موازی برای این گونه مسائل با داده های با اندازه بزرگ بسیار مهم هستند. در این پایان نامه روشی برای حل مسئله mlcs با استفاد...