هدف: ویروس هرپس سیمپلکس تیپ یک پس از آلوده کردن میزبان به‏صورت طبیعی در گانگلیون نورون تریژمینال به‏صورت خفته در می‏آید. در این وضعیت تنها رونوشتی که از ویروس در سلول قابل تشخیص است رونوشت وابسته به نهفتگی (lat) است که این رونوشت micrornaهایی را تولید می‏کند که قادر است مسیرهای پیام‏رسانی در سلول را دستخوش تغییر نماید. یکی از مسیرهای کلیدی پیام‏رسانی سلول مسیر فاکتور رشد تومور (tgf-β) است. در ا...

چکید ه   سابقه و هدف   یکی از اساسی ترین سلول های سیستم ایمنی که در بیماری مولتیپل اسکلروزیس( ms ) دخالت دارد، سلول th17 می باشد که در بسیاری دیگر از بیماری های خود ایمن نیز اثرگذار است. اخیراً از میکرو rna ها در درمان بسیاری از بیماری ها استفاده می شود. mirna ها دسته ای از rna های غیر کد شونده به طول 22 تا 25 نوکلئوتید هستند که نقش های تنظیمی اساسی در فرآیندهای مختلف سلولی دارند. در این مطالعه ...

یافتن بلندترین زیررشته مشترک چند رشته یک مساله شناخته شده است که در زمینه¬های گوناگون نظیر زیست¬شناسی و ژنومیک کاربردهای بسیار دارد. این مساله توسط محققان زیادی مطالعه شده است و پیچیدگی آن از جنبه¬های مختلف در طی سال¬ها بهبود یافته است. روش¬های مختلفی برای حل مسئله¬ی بلندترین زیررشته مشترک بین چندین رشته (mlcs) وجوددارد. روش¬های کلاسیک مبتنی بر روش¬های برنامه¬نویسی پویا از روش¬های ابتدایی حل مس...

پیدا کردن بزرگ ترین زیرتوالی مشترک بین چندین توالی یکی از مسائل np-hard با کاربردهای فراوان در اکثر زمینه ها ازجمله بیوانفورماتیک می باشد. افزایش روزافزون پیچیدگی و اندازه داده های مولکولی، نیازمند روش های کاربردی موثرتری برای توالی های با اندازه های متفاوت است. الگوریتم های موازی برای این گونه مسائل با داده های با اندازه بزرگ بسیار مهم هستند. در این پایان نامه روشی برای حل مسئله mlcs با استفاد...

هدف از انجام این مطالعه توالی یابی و بررسی قسمتی از پروموتور ژن بتا کازئین و همچنین بررسی تفاوت های تک نوکلئوتیدی (snps) ممکن این توالی ژن در دوگونه شتر تک کوهانه و دو کوهانه ایران بود. تعداد 10 عدد نمونه خون شتر نر و ماده تک کوهانه از کشتارگاهی در مشهد، همچنین تعداد 5 عدد نمونه خون شتر های نر و ماده دو کوهانه از ایستگاه تحقیقات منابع طبیعی و امور دام استان اردبیل واقع در روستای جهاد آباد تهیه ...

برای مدل بندی پدیده هایی که با زاویه شناسایی می شوند توزیع های جهتی ابزارهای بسیار مفیدی هستند. اخیراً، استفاده از این توزیع ها در علوم متنوعی مثل زیست شناسی، نجوم، هواشناسی و بیوانفورماتیک بسیار مورد توجه قرار گرفت. بویژه در تحقیقات علوم زیستی نشان داده شد که دو زوج زاویه وجود دارند که تا حد دقیقی ساختار هندسی و فضایی کامل یک پروتئین را در فضای سه بعدی توصیف می کنند. برای تشریح احتمالاتی مقادیر...

مقدمه: یکی از روش‌های جدید کنترل عفونت‌های میکروبی استفاده از اولیگونوکلئوتیدهای آنتی‌سنس (مکمل) برای مهار ژن‌های ضروری است‌. هدف این مطالعه بررسی 4 توالی مکمل علیه ژن rpoD استافیلوکوکوس اورئوس و پی بردن به تطابق احتمالی در ژن‌های انسانی بود.  روش: نخست به بانک اطلاعاتی مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) مراجعه و ژن rpoD در استافیلوکوکوک اورئوس از آن استخراج و سپس توالی mRNA آن تولید گردید. سپ...

هشت ژنوم دیپلوئید شامل ژنوم‌های A، B، C، D، E، F، G و K در جنس گوسیپیوم Gossypium شناسایی شده اند. ژنوم A فقط به دو گونه herbaceum و arboreum پنبه های دنیای قدیم محدود شده است و این ژنوم از G. herbaceumبه گونه‌های دیگر انتقال پیدا کرده است. به منظور توالی یابی ژنوم کلروپلاست G. herbaceum (A1) و مقایسه آن با دو گونه G. hirsutum (AD1) و G. barbadense (AD2) توالی‌های ژنوم سه گونه از سایت مرکز مل...

مقدمه: یکی از روش‌های جدید کنترل عفونت‌های میکروبی استفاده از اولیگونوکلئوتیدهای آنتی‌سنس (مکمل) برای مهار ژن‌های ضروری است‌. هدف این مطالعه بررسی 4 توالی مکمل علیه ژن rpoD استافیلوکوکوس اورئوس و پی بردن به تطابق احتمالی در ژن‌های انسانی بود.  روش: نخست به بانک اطلاعاتی مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI) مراجعه و ژن rpoD در استافیلوکوکوک اورئوس از آن استخراج و سپس توالی mRNA آن تولید گردید. سپ...

ما در دنیایی زندگی می کنیم که در آن حدود یک و نیم میلیون موجود زنده شناخته شده است. برای هر یک از این موجودات می توان داده های زیادی را جمع آوری نمود که شامل داده های ژنومی ، ژن ها، نحوه بیان آنها، ساخت پروتئین ها وتوالی آنها و مانند آن می باشد. مجموعه این اطلاعات آن هم برای برخی از موجودات موضوع میلیون ها رکورد در انواعی از بانک های اطلاعاتی است. چگونگی بازیابی این اطلاعات و بهره برداری از آنه...