در این پژوهش با استفاده از روش تابع گرین تعادلی در مدل اختلاف محدود، ابتدا رسانندگی مولکول پلی¬استیلن در اتصال به الکترودهای نیمه نامحدود سه بعدی، در غیاب برهمکنش الکترون- الکترون، به صورت تحلیلی به دست می¬آید. در ادامه با تعمیم روش بالا، رسانندگی الکترونی مولکول پلی¬تیئوفن )در غیاب برهمکنش الکترون- الکترون( بررسی و نیز به صورت تحلیلی بدست می¬آید. سپس ارتباط ریاضی برهمکنش الکترون- الکترون در م...

زمینه و هدف: دینامیک مولکولی، روشی برای شبیه سازی رفتار ترمودینامیکی مواد در سه فاز جامد، مایع و گاز با استفاده از نیرو، سرعت و مکان ذرات می باشد. دربین این عوامل، مهمترین عامل، نیرو است. در شبیه سازی دینامیک مولکولی کلاسیک، نیرو از پتانسیل کلاسیک به دست می آید. پتانسیل کلاسیکی، تابعی از مکان اتم ها یا هسته هاست و به موقعیت الکترون ها در اتم ها وابسته نیست. هدف از این کار، مطالعه و مقایسه ی انر...

مولکول پروتئین زنجیره خطی از اسید آمینه ها است. پیش بینی برهم کنش های پروتئین-پروتئین یک مسئله مهم در بیوانفورماتیک و سیستم های زیستی به حساب می آید. در حقیقت استخراج برهم کنش های میان پروتئین ها برای ساختن شبکه های برهم کنشی پروتئینی ضروری می باشد. این شبکه ها نقش مهمی در شناخت اکثر فرایندهای زیستی دارند. در سال های اخیر، از روش های آزمایشگاهی با توان عملیاتی بالا برای کشف برهم کنش های پروتئین...

پیشرفت­های اخیر در زمینه ابزارها و استخراج داده­ها، امکان مطالعه تاثیر تنش­های مختلف را بر متابولیسم اولیه و ثانویه گیاه به­وجود آورده است. مطالعه مکانیسم­های بیماریزایی و شناسائی مسیرهای متابولیکی مرتبط با بیماریزائی در گیاه، تغییرات در پروفیل متابولیکی بخش قطبی حاصل از برهمکنش سازگار قارچ Leptosphaeria maculans (فرم غیرجنسی Phoma lingam) (جدایه گرگان) و کلزا رقم حساس هایولا ...

برهم کنش ضعیف بین مولکول ها و اتم ها نقش مهمی را در پدیده های فیزیکی و شیمیایی ایفا می کند. امروزه با گسترش کامپیوترها، امکان محاسبه پتانسیل های بین مولکولی دقیق از محاسبات ساختار الکترونی آغازین امکان پذیر است. در این کار تحقیقاتی از نظریه اختلال تعدیل یافته تقارنی ( sapt ) برای محاسبه انرژی های برهم کنش بین دو مونومر n2 و he استفاده می شود و محاسبات با استفاده از نرم افزار sapt2008 انجام می...

با استفاده از نرم افزار گوسین و در سطح محاسباتی (mp2/6-311++g(2d,2p) ساختار های ممکن برای برهم کنش های پیـــوند هیدروژنی و ســـایر برهم کنش های بین مولکولی با تغییــــر موقعیت های مولکول های اتیلن و هیدروژن فلورید نسبت به مولکول فسفین اکسید مورد بررسی قرار گرفت. با توجه به نتایج به دست آمده افزایش تعداد پیوندهای هیدروژنی و متناسب با آن افزایش اندازه کمپلکس ها باعث افزایش پایداری کمپلکس ها شده ...