زمینه و اهداف: سالمونلا انتریکا سرووار تیفی موریوم یکی از علل شایع مسمومیت‌های غذایی در انسان می‌باشد. با توجه به این‌که انتخاب مارکرهای مناسب یکی از چالش‌های اصلی روش‌های تشخیصی ارائه‌شده برای این پاتوژن می‌باشد، در مطالعه حاضر، با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی، مارکرهای ژنتیکی این سرووار به‌عنوان اهداف تشخیصی مناسب غربال گردید. در فاز دوم کار، ساختار و عملکرد پروتئین‌های کد شده به‌وسیله ...

سیب‌زمینی، چهارمین گیاه ارزشمند در تغذیه بشر است. غده سیب‌زمینی علاوه ‌بر کربوهیدرات‌ها، دارای ویتامین‌ها و ریزمغذی‌های مهمی برای تأمین سلامت بشر است. طی مراحل نموی غده سیب‌زمینی، تغییرات متعدد مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی و مولکولی رخ می‌دهند. مطالعه این اتفاق‌ها از منظر مولکولی، برای به‌نژادی ارزش غذایی و بهبود عملکرد سیب‌زمینی بسیار مهم است. روش‌های توالی‌یابی نوین، داده‌های ژنتیکی فراوان و سودم...

در یوکاریوت‌ها DNA ژنومی در ترکیب با پروتئین‌های هیستونی کروماتین را ایجاد می‌کند. چپرون‌های هیستونی از طریق تغییر دسترسی به DNA بر میزان رونویسی ژن‌ها تأثیر می‌گذارند. بر خلاف مخمر و جانوران، در مورد چپرون‌های هیستونی گیاهی اطلاعات کمی وجود دارد. در این رابطه، خانواده nucleosome assembly protein (NAP) در تمام یوکاریوت‌ها حفاظت شده بوده و جزء جدایی ناپذیر در پایداری، حفظ و پویایی کرماتین یوکاری...

زمینه و اهداف: توانایی تشخیص مناطق آنتی ژنی در پروتئین ها از جمله عوامل مهم برای درمان می باشد. هدف از این مطالعه پیشگویی مناطق آنتی ژنی در دو توالی پروتئینی als1 (agglutinin like sequence) و hwp1 (hyphal wall protein sequences) در جدایه های کاندیدا آلبیکنس عامل عفونت واژینالی با تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیکی می باشد. مواد و روش کار: در این بررسی 7 جدایه از زنان مبتلا به عفونت واژینال که طی سال ...

شناسایی ژن های میکرو آر ان ای از اهمیت ویژه ای برخوردار است. توسعه روش های محاسباتی و متعاقبا صرفه جویی در هزینه و زمان پژوهش های آزمایشگاهی، تاثیر بسزایی در افزایش سرعت و دقت شناسایی آنها دارد. با توجه به اینکه زمان کمی از شناخت میکرو آر ان ای ها می گذرد، در ابتدا روند پژوهش ها کند بود، اما به مرور با شکل گیری پایگاه های اطلاعاتی بیولوژیکی و درک اهمیت آنها دانشمندان به مطالعات گسترده در این زم...

آگالاکسی یک بیماری مسری در نشخوارکنندگان کوچک است که توسط باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه ایجاد می شود. پروتئین p40 از مهم ترین آنتی ژن های سطحی در باکتری مایکوپلاسما آگالاکتیه است، که می توان از آن به منظور طراحی واکسن نوترکیب استفاده کرد. هدف از مطالعه حاضر به دست آوردن ویژگی های بیوانفورماتیک آنتی ژن p40 بود. به همین منظور، طیف گسترده ای از نرم افزارهای آنلاین به منظور پیش بینی b و tcell اپی تو...

زمینه و اهداف: ساب تایپ h5n1 ویروس انفلوآنزا، که با قدرت کشندگی بالا می باشد، در سال های اخیر باعث تلفات زیادی در منطقه آسیا و به ویژه در کشورهای آسیای شرقی و خاور میانه شده است. هدف این مطالعه تعیین فیلوژنتیک ویروس انفلوآنزا a، ساب تایپ h5n1 ، در همسایگان ایران طی سال های 2006-2003 بود. روش بررسی: از الگوریتم های بیوانفورماتیکی همترازی سکانس ها استفاده شد. سکانس های ژنی و پروتئینی ژن هماگلوتین...

زمینه و هدف: به دلیل توان بالای عفونت‏زایی و مقاومت‏های دارویی گزارش شده در ویروس hiv-1 طی سال‏های اخیر، پژوهش‏های زیادی در خصوص کشف و معرفی داروهای ضد ویروس hiv-1 انجام شده است. نتایج بررسی‏های متعدد نشان داده است که داروها و ترکیبات مهارکننده پروتئاز که سهم عمده‏ای از آنها را مشتقات گیاهی به ویژه ترپنوئیدها تشکیل می‏دهند، در کنترل عفونت ناشی از ویروس hiv-1 بسیار موثر می‏باشند. هدف از این پژوه...

سل (tb )، شایع‏ترین عامل مرگ و میر ناشی از بیماری‏های عفونی در جهان است. هراس از پخش سوش‏های مقاوم به دارو و کاهش گزینه‏های درمانی موثر، نیاز به ایجاد داروهای ضدسل کارآمد و جدید را تقویت می‏کند. در این میان محصولات طبیعی بخاطر تنوع شیمیایی متحیر کننده‏ای که دارند، منابع حیاتی برای تولید آنتی‏بیوتیک‏های جدید محسوب می‏شوند. گیاهان یکی از این منابع طبیعی هستند که به دلیل ماهیت طبیعی خود و وجود همو...

زمینه و هدف: توکسین کلستریدیوم تتانی یا تتانواسپاسمین عامل بیماری مهلک کزاز است. امروزه از توکسوئید آن به عنوان واکسن استفاده می شود. تتانواسپاسمین شامل سه زنجیره L، HN و HC می باشد. زنجیره HC بخش اتصال دهنده و ایمونوژنیک آن است و به عنوان کاندیدای واکسن مطرح می باشد. هدف از این مطالعه، طراحی و تهیه ژن صناعی زنجیره HC تتانواسپاسمین، بیان و بهینه سازی آن و تخلیص پروتئین نوترکیب حاصل از آن به عنو...