یوسف نادری
استادیار و عضو هیات علمی دانشگاه آزاد اسلامی واحد آستارا
[ 1 ] - بررسی اثر متقابل ژنوتیپ و محیط با جانهی داده ژنومی شبیه سازی شده با استفاده از مدل های حیوانی مختلف
هدف از این تحقیق ارزیابی مدلهای تک-صفتی و چند-صفتی در سناریوهای مختلف ژنومی با در نظر گرفتن جانهی جهت برآورد صحت پیشبینی ژنومی و تشخیص وجود اثر متقابل ژنوتیپ و محیط (G × E) بود. داده‌های ژنومی با تعداد متفاوت جایگاههای صفات کمی (90 و 900) و سطوح مختلف عدم تعادل پیوستگی (کم و زیادLD = ) برای تراکم K50 شبیهسازی شدند. سپس به‌طور تصادفی 90 درصد نشانگرها حذف و در مرحله بعد این نشانگرها از طریق ن...
[ 2 ] - ارزیابی عملکرد روش‌هایBoosting و بیز A در چالش‌های مختلف معماری ژنومی صفات گسسته و پیوسته
سابقه و هدف: گزینش ژنومی چالشی امید بخش برای کشف رموز ژنتیکی صفات کمی و کیفی به منظور بهبود رشد ژنتیکی و صحت پیش بینی ژنومی در اصلاح دام می‌باشد .در این پژوهش، عملکرد روش‌های Boosting و بیز A در برآورد ارزش‌های اصلاحی ژنومی صفات آستانهای دودویی و پیوسته در تراکم مختلف نشانگری با استفاده از معماری‌های مختلف ژنومی مورد بررسی قرار گرفت. مواد و روش‌ها: داده‌های ژنومی از طریق نرم افزار QMSim با ...
[ 3 ] - اثر طرح های آمیزشی در پیشرفت ژنتیکی و افزایش میانگین همخونی: مطالعه ای مبتنی بر شبیه سازی
هدف از این مطالعه بررسی پیشرفت ژنتیکی، افزایش میانگین همخونی و پیشبینی صحت ارزیابی تحت طرحهای آمیزشی مختلف با استفاده از شبیهسازی بود. دو وراثتپذیری مختلف (1/0 و 5/0) و پنج طرح آمیزشی شامل آمیزش تصادفی (rnd)، آمیزش براساس حداقل همخونی (minf)، آمیزش براساس حداکثر همخونی (maxf)، آمیزش جور شده مثبت براساس فنوتیپ (phen) و آمیزش جور شده مثبت براساس ارزش اصلاحی پیشبینیشده (ebv) در نظر گرفته شد...
[ 4 ] - تاثیر نرخ شیوع بیماری در جمعیت مرجع بر عملکرد روش های جنگل تصادفی و بیز آستانه ای A
هدف از تحقیق حاضر، بررسی نقش نرخ شیوع بیماری در جمعیت مرجع و معماری‌های مختلف ژنومی بر عملکرد روش جنگل تصادفی و بیز A در صفات آستانهای بود. بدین منظور، جمعیت‌های ژنومی برای سطوح متفاوت وراثتپذیری (05/0 و 25/0)، سطوح مختلف LD (پایین و بالا) و تعداد متفاوت جایگاههای صفات کمی (150 و 600) بر روی 30 کروموزم شبیهسازی شدند. جهت ایجاد فنوتیپ دودویی با نسبت‌های مختلف شیوع بیماری، ابتدا برای 5 درصد ح...
[ 5 ] - ارزیابی ژنومی روش ماشین بردار پشتیبانی و روش‌های رایج پیشبینی ژنومی در بروز متفاوت فنوتیپ آستانهای مطالعه شبیهسازی
سابقه و هدف: بسیاری از صفات برجسته در دام‌های اهلی شامل: مقاومت به بیمارها و سختی زایش مشمول یک توزیع طبقه بندی از فنوتیپ هستند. این صفات به علت اهمیت در آسایش حیوان و گرایشات انسانی به تولیدات با کیفیت بالا و سالم از اهمیت ویژه‌ای در اصلاح دام برخوردار می‌باشند. بنابراین شناسایی و تشخیص واریانت های ژنتیکی موثر بر صفات آستانهای اعم از مقاومت به بیماری یکی از اهداف اصلی در ژنتیک حیوانی است....
نویسندگان همکار