Giti Emtiazi

Department of Biology, Faculty of Sciences, University of Isfahan, Isfahan, Iran

[ 1 ] - Preparation of protein-loaded PLGA-PVP blend nanoparticles by nanoprecipitation method: entrapment, Initial burst and drug release kinetic studies

Objective(s):Despite of wide range applications of polymeric nanoparticles in protein delivery, there are some problems for the ﬁeld of protein entrapment, initial burst and controlled release profile. Materials and Methods: In this study, we investigated the influence of some changes in PLGA nanoparticles formulation to improve the initial and controlled release profile. Selected parameters ...

[ 2 ] - The conversion of nitrate in water to diatomic nitrogen gas by immobilized Pseudomonas stutzeri on vermiculite

Denitrification is a reduction of nitrate by heterotrophic and autotrophic bacteria that may ultimately produce molecular nitrogen (N2) through a series of intermediate nitrogen compounds.Vermiculite is a hydrous phyllosilicate mineral (Mg, Fe+2,Fe+3)3[(Al,Si)4O10](OH)2·4H2O with several layers for bacterial immobilization. The goal of this study was removal of nitrate from water with vermiculi...

[ 3 ] - Using Excess Biomass Sludge Acclimated in Side Stream Partial Nitrification to Evaluation Partial Nitrification and Abrupt Cold Shock Effect in main stream

In this study biomass acclimation in a side stream partial nitrification sequencing batch reactor (SBR) was performed under optimum conditions (T 30ºC, SRT 9± 1 days and hydraulic retention time (HRT) 1.2 day). Excess sludge for solids retention time (SRT) regulation was added to another batch reactor (main stream) which performed under different conditions for partial nitrification evaluation ...

[ 4 ] - Comparative modelling of 3D-structure of Geobacter sp. M21 (a metal reducing bacteria) Mn-Fe superoxide dismutase and its binding properties with bisphenol-A, aminotriazole and ethylene-diurea

Superoxide dismutase play important roles in iron-respiratory bacteria such as Geobacteraceae as an antioxidant defense, and probably an effective enzyme of electron transfer network. Regarding the application of iron-respiratory bacteria in environmental biotechnology particularly biodegradation and bioremediation, understanding the mechanism of inhibition/induction of superoxide dismutase by ...

[ 5 ] - شناسایی و خالص‌سازی همولیزین گروهی از باسیلوس‌ها به روش زایموگرافی

زمینه و اهداف: همولیزین یک پروتئین خارج سلولی است که توسط بسیاری از باکتری های بیماریزا و غیر بیماری زا ترشح می شود. سطح فعالیت همولیزین غشای پلاسمایی گلبول های قرمز خون می باشد. در این مطالعه استخراج همولیزین از سویه های باسیلوس تولید کننده آن، تعیین وزن مولکولی و بررسی خصوصیات عملکردی این آنزیم مورد بررسی قرار گرفته شده است. مواد و روش کار: باسیلوسهای تولیدکنندهی همولیزین شناسایی شدند، سپس...

[ 6 ] - گوگردزدایی از تیوفن توسط باکتری Pseudomonas stutzeri SEE-1

حذف گوگرد از ترکیبات تیوفنی یکی از مسائل مهم در پالایشگاه ها و کنترل آلودگی های زیست محیطی محسوب می شود. یک سویه باکتریایی غنی شده در خاک حاوی MTBE قادر به گوگردزدایی از ترکیب تیوفن می باشد که با آنالیز فیلوژنتیکی انجام شده بر اساس توالی ژن 16S rRNA، این سویه به عنوان Pseudomonas stutzeri شناسایی شد. آزمایش های گوگردزدایی با سلول های فعال بدون رشد این باکتری در حضور ترکیب گوگرددار مدل تیوفن و د...

[ 7 ] - مقایسه روش‌های FTIR و تحلیل توالی ژن 16S rDNA در شناسایی و رده‌بندی باکتری‌های متیلوتروف

تحلیل توالی 16S rDNA اگر چه روشی نسبتاً دقیق و قابل اعتماد برای شناسایی و تاکسونومی باکتری‌هاست اما فرآیندی وقت‌گیر و پُر هزینه است. به همین دلیل یافتن راه‌های جایگزین همواره مورد توجه پژوهشگران بوده است. یکی از روش‌های مطرح FTIR (Fourier Transform Infrared) است که روشی فیزیکو-شیمیایی است مبتنی بر اندازه‌گیری لرزش پیوندهای مولکولی یک ترکیب که به وسیله فرکانس مناسبی از پرتو مادون قرمز تحریک شده‌ان...

[ 8 ] - شناسایی میکروسکوپی باکتری‌های رشته‌ای غالب حجیم‌کننده لجن در زلال‌کننده‌های واحد بازیافت آب پالایشگاه نفت اصفهان با روش اسلاید پنهان

بالکینگ (یا حجیم‌ شدن لجن)، شناور شدن توده‌های لجن، در اثر رشد بیش از اندازه باکتری‌‌های رشته‌ای و یا غیر‌رشته‌ای در فرآیند تصفیه پساب است که کاهش کیفیت فرآیند تصفیه و جریان خروجی را به دنبال دارد. با توجه به این که ازدیاد نوکاردیوفرم‌ها (Nocardioforms) و Beggiatoa به ترتیب نشانه وجود ترکیبات روغنی بالا و وجود گوگرد در سیستم است، با شناسایی باکتری‌های غالب بالکینگ‌کننده، می‌توان به عوامل ایجاد ...

[ 9 ] - شناسایی گونه‌های جدیدی از دی‌ازوتروف‌های اندوفیت همیار برنج و گندم با استفاده از آنالیز ژن 16S rDNA و FTIR

در این مطالعه شش جدایه اندوفیت، شامل سه جدایه از ریشه سه رقم برنج (جدایه‌های PxR1، PxR2 و StR1) و سه جدایه از ریشه سه رقم گندم (جدایه‌های PxW1، PxW2 و PxW3) جداسازی و با استفاده از آزمایش فنوتیپی، شامل طیف‌سنجی مادون قرمز تبدیل فوریه (FTIR) و همچنین، آنالیز ژنوتیپی نظیر PCR ژن 16S rDNA، تمام جدایه‌ها به غیر از جدایه StR1 Pseudoxanthomonas شناسایی شدند. مقایسه روش‌های یاد شده نشان داد که دو جدای...

[ 10 ] - بررسی ژن مقاومت به روی در سودوموناس استوتزری مقاوم به روی و نانوذرات اکسید روی جداسازی شده از خاک

سابقه و هدف: آلودگی محیط با فلزات سنگین سمی مشکل جهانی می‌‌باشد. میکروارگانیسم‌ها مکانیسم های مختلفی را به منظور کاهش غلظت درون سلولی فلزات و سایر آلوده‌کننده‌های سمی محیطی دارند. این مطالعه با هدف بررسی ژن مقاومت به روی در سودوموناس استوتزری مقاوم به روی و نانوذرات ‌اکسید روی جداسازی شده از خاک انجام شد. مواد و روش‌ها: این مطالعه بر روی سویه سودوموناس استوتزری جدا شده از خاک غنی شده با MTBE) ...

[ 11 ] - شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین همولیزین باسیلوس پامیلوس و داکینگ آن با کلسترول و پیشگویی تغییرات کنفورماسیونی این پروتئین در طراحی دارو با کمک بیوانفورماتیک

همولیزین یک پروتئین خارج سلولی است که توسط بسیاری از باکتری‌های بیماری‌زا و غیر بیماری‌زا ترشح می‌شود. سطح فعالیت آنها غشای‌پلاسمایی گلبول‌های قرمز خون می‌باشد. همولیزین جزء سموم وابسته به کلسترول می‌باشد یعنی کلسترول را به عنوان گیرنده بر روی سطح سلول‌های خونی شناسایی کرده و از طریق آن به سلول هدف متصل می‌شود. در این تحقیق ما بر روی همولیزین گونه‌ایی از باسیلوس به نام باسیلوس پامیلوس SAFR0032 ...

[ 12 ] - تولید گلوتامیک‌اسید و فولیک‌اسید در پروبیوتیک‌های هوازی و بی‌هوازی

مقدمه: گلوتامیک‌اسید یکی از مهم‌ترین آمینواسیدها از نظر کاربردهای صنعتی و تجاری است و تولید میکروبی آن از برخی باکتری‌ها گزارش شده است. با توجه به نقش باکتری‌های پروبیوتیک در ارتقای سلامتی انسان و تقاضای روزافزون کاربرد آنها در صنایع غذایی، در پژوهش حاضر تولید آمینواسیدهای گلوتامیک‌اسید و فولیک‌اسید با استفاده از باکتری‌های پروبیوتیک (بیفیدوباکتریوم، بیفیدوباکتریوم بیفیدوم و اسپرولاکتوباسیلوس) ...

[ 13 ] - تولید پلی‌هیدروکسی‌بوتیرات با استفاده از عصارۀ آنزیمی آزوسپریلوم‌برازیلنس در محیط عاری از سلول

مقدمه: پلی‌هیدروکسی‌آلکانوات‌ها (PHAS) پلیمرهای باکتریایی هستند که معمولاً به‌عنوان پلی‌استر ذخیره‌ای توسط طیف گسترده‌ای از میکروارگانیسم‌ها تحت شرایط عدم‌تعادل مواد غذایی ساخته می‌شوند و خواص مکانیکی پلی‌هیدروکسی‌آلکانوات‌ها آنها را جهت جایگزینی با پلاستیک‌های تولیدشده از مواد پتروشیمی مشابه مناسب ساخته است.؛اما برخلاف پلاستیک‌های رایج در طبیعت به‌طور کامل به CO2 و H2O تبدیل می‌شود. PHA می‌توان...

[ 14 ] - بررسی اثر سورفکتانت توئین 80 بر رشد و مصرف دی‌بنزو‌تیوفن توسط قارچ اگزوفیالا اسپینیفرا جداسازی شده از خاک آلوده به نفت

مقدمه: نفت یکی از مهم‏ترین منابع تولید انرژی است که حاوی انواعی از ترکیبات آلی گوگرددار است. در طول سوختن این ترکیبات اکسید گوگرد تولید شده و آلودگی اتمسفر و خاک را سبب می‌شود. دی‌بنزوتیوفن به عنوان یک مدل برای انجام آزمایش‌های گوگردزدایی زیستی به کار می‌رود، و سورفکتانت توئین 80 موجب افزایش حلالیت این ترکیب سمی شده و طی فرآیند گوگردزدایی زیستی به میزان بیشتری توسط میکروارگانیسم مصرف می‌‏شود.‏‏...

[ 15 ] - مطالعه‏ لایه‏ سطحی و پارا اسپورال ‏بادی ‏‏‏(‏‏‏MH14) ‏‏‏Bacillus thuringiensis Israelensis و پیش‏بینی پایدارسازی ‏‏‏(‏‏‏Cry4Ba) ‏‏‏با ایجاد جهش نقطه ‏ای بر اساس یافته‏ های بیوانفورماتیک

مقدمه: باسیلوس تورنجینسیس مهم‏ترین‏‏‏ عامل زیستی است که با تولید پارا اسپورال بادی، ‏‏‏نقش مهمی در مقابله با آفات کشاورزی دارد. ‏‏‏همچنین، لایه‏ سطحی تولید می‏کند که ساختاری کریستالی از جنس پروتئین یا گلیکوپروتئین است و کاربرد وسیعی در نانوبیوتکنولوژی دارد. ‏‏‏بنابراین، ‏‏‏مطالعه آن دارای اهمیت است‏‏. ‏‏‏ مواد و روش‏‏ها: در این مطالعه، پارا اسپورال بادی خالص‏سازی ‏‏‏شده، مخلوط کریستال/ اسپور ب...

[ 16 ] - تحریک کلونیزاسیون Azospirillum اندوفیت بدنبال تلقیح توأم با Cellulomonas uda ATCC 491

مقدمه: بسیاری از ریزو باکتری‏ها‏ی محرک رشد گیاه نظیر Azospirillum اگر با باکتری‏ها‏ی تولید کننده سلولاز قوی نظیر Cellulomonas همراه شوند، ممکن است میزان کلونیزاسیون آن‏ها افزایش یافته و در نتیجه باعث تحریک بیشتری در رشد گیاه میزبان شوند . مواد و روش‏‏ها: 6 جدایه اندوفیت Azospirillum از ریشه سه رقم برنج و سه رقم گندم و همچنین، یک جدایه از نوعی کود زیستی تجاری (شرکت زیست فناور سبز) بر اساس آز...

[ 17 ] - القا نانو حفره در هموگلوبین باکتریایی

مقدمه: تعداد زیادی از پروتئین‏های متصل شونده و انتقال دهنده اکسیژن در ارگانیسم‏های مختلف از جمله باکتری‏ها، پروتوزوآ و قارچ‏ها وجود دارد که همگی پروتئین‏های شبه هموگلوبین هستند. این پروتئین‏ها می‏توانند اکسیژن را با انواع مختلفی از مولکول‏ها از جمله NO2 ، CO2 و ترکیبات سولفیدی تبادل کنند. به علاوه آن‏ها می‏توانند موجب سمیت زدایی از مواد کلرینه مانند آنزیم‏های P450 و پراکسیدازها شوند و همچنین،...

[ 18 ] - بهینه‌سازی تولید پلی‌فسفات توسط باسیلوس مگاتریوم سویه G11

مقدمه: پلی فسفاتها ‏که دانههای ولوتین نیز نامیده میشوند،بسپارهای خطی از ارتوفسفاتهای اتصال یافته با پیوندهای پرانرژی فسفوانهیدریدی هستند که در باکتری‏ها، مخمرها، قارچ‏ها، گیاهان و جانوران مشاهده میشوند. این بسپار بهطور کامل ایمن و غیرسمی است و کاربردهای متعددی در صنایع غذایی و دارویی دارد. مواد و روش‏‏ها: در این تحقیق به علت اهمیت بالای این بسپارها در صنایع مختلف، چندین عامل مانند نوع م...

[ 19 ] - الگوی مایکولیک اسید در مایکوباکتریم تجزیه کننده تولوئن در حضور کلسترول

مقدمه: مایکولیک اسیدی که در دیوارهی سلولی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس حضور دارد، داری عوامل آنتیژنی است که میتوانند به عنوان نشانگرهایی برای ردیابی آنتیبادیهای بیماری فعال توبرکلوزیس استفاده شوند. ردیابی آنتیبادی توسط آنتیژنهای مایکولیک اسید حتی در عفونتهای همراه با بیماری ایدز میتواند بهکار گرفته شود. استفاده از مجموعهای از مایکولیک اسیدها ممکن است باعث واکنش متقاطع آنتیبادی با کلس...

[ 20 ] - تجزیه‏ زیستی ترکیبات مورد استفاده در صنایع پتروشیمی توسط باکتری تجزیه‏کننده‏ تولوئن حاوی سیتوکروم P450

مقدمه: با توجه به افزایش روزافزون آلاینده‌هایی نظیر هیدروکربنهای آروماتیک و مشکلات زیست محیطی ناشی از انتشار آن‏ها، تجزیهی زیستی و پاکسازی این ترکیبات سمی توسط میکروارگانیسم‌ها از اهمیت بسیار زیادی برخوردار است. تولوئن یکی از مواد اصلی موجود در صنایع پتروشیمی و از مواد آلوده کننده رایج محیط زیست است که آثار مخربی بر سلامتی انسان و سایر موجودات زنده دارد. مواد و روش‏‏ها: در این تحقیق، به منظ...

[ 21 ] - جداسازی، شناسایی مولکولی Alcanivorax dieselolei ‏از خلیج فارس و بررسی قابلیت تجزیه زیستی آن برای پاک‏سازی آلودگی نفتی

مقدمه: آلودگی نفتی در محیط‏‏ها‏ی دریایی، مسأله‏ای جهانی است. میکروب‏ها‏ی تجزیه کننده هیدروکربن دریایی اجباری اخیراً شرح داده شده اند. یک عضو اصلی از این خانواده Alcanivorax بوده که در محیط‏ها‏‏ی دریایی پس از دو هفته از نشت نفت غالب می‏شود. مواد و روش‏ها‏: در این تحقیق، ابتدا از مناطق آلوده به نفت در خلیج فارس نمونه برداری شد. باکتری‏ها‏ در محیط ONR7a غنی سازی شدند و کلنی‏ها‏ روی محیط مارین اگار ...

[ 22 ] - غربالگری و خالص‌سازی اختصاصی باکتری‌های تالاسواسپیرا و کروموهالوباکتر از لجن‌های نفتی از طریق کموتاکسی به نفت

مقدار زیادی ضایعات در حین جابجایی و پالایش نفت خام برجا می‌ماند که این ضایعات یک لجن نفتی غلیظ ایجاد می‌کنند که حاوی مقدار زیادی هیدروکربن‌های مشتق شده از نفت هستند. پاک‌سازی زیستی مواد نفتی فرآیند‌ی است که در طی آن میکروارگانیسم‌ها قادرند مواد نفتی را به عنوان تنها منبع کربن و انرژی استفاده کنند و آن را به موادی با سمیت کمتر و یا غیرسمی و بی‌خطر تبدیل کنند. در این مطالعه لجن نفتی از مناطق آلود...

[ 23 ] - Identification and characterization of pigmented photoreceptor-producing microorganisms using FTIR spectroscopy

The identification, differentiation and classification of microorganisms have been subjects of research for many years. Recently, Fourier transform infrared (FTIR) spectroscopy techniques have gained attention in the characterization and classification of microorganisms based on biochemical profiles and cell structure characteristics. In the present study, the characterization and differentiati...

[ 24 ] - تأثیر باکتری آمونیفیلوس اگزالاتیکوس DIM بر کاهش خطر هیپراگزالاریا ناشی از اگزالات آمونیوم در رت نژاد ویستار

مقدمه: بیماری سنگ کلیه یک مشکل جهانی است و ابتلاء به آن در سال های اخیر به طور قابل توجهی افزایش یافته است. هیپراگزالاریا یکی از مهم ترین فاکتورهای تشکیل سنگ های اگزالات کلسیمی است که توسط سطح بالای اگزالات در ادرار مشخص می گردد. حدود 80 درصد سنگ های کلیوی اگزالاتی هستند، یکی از راه های دفع این ماده از بدن انسان تجزیه توسط میکروارگانیسم های دستگاه گوارش، همانند اگزالوباکتر فورمیژنز، لاکت...

[ 25 ] - استفاده از باکتری آمونیفیلوس اگزالاتیکوس به عنوان پروبیوتیک در صنایع کنسروسازی اسفناج به منظور کاهش اگزالات

چکیده زمینه و هدف: حدود 75 درصد سنگ‌های ادراری از کلسیم اگزالات تشکیل می‌شوند. گونه اسفناج به عنوان یک گیاه حاوی اگزالات بالا شناسایی شده است. هدف این مطالعه بررسی استفاده از باکتری آمونیفیلوس اگزالاتیکوس به عنوان پروبیوتیک در صنایع کنسروسازی اسفناج به منظور کاهش اگزالات بود. روش بررسی: در این مطالعه تجربی سویه باکتری آمونیفیلوس اگزالاتیکوس به روش مولکولی شناسایی شد. بیومس باکتری تهیه شد ...

[ 26 ] - بررسی ژن مقاومت به روی در سودوموناس استوتزری مقاوم به روی و نانوذرات اکسید روی جداسازی شده از خاک

[ 27 ] - Study the effect of environmental factors and different carbon sources on dibenzothiophene desulfurization by Exophiala spinifera

It is necessary to reduce the amount of sulfur in fossil fuels due to direct impact of the quality of these fuels on the environment. In this research, a novel fungus strain of Exophiala spinifera, namely FM, was used to desulfurize dibenzothiophene (DBT) as a model cyclic sulfur compounds in oil and fossil fuels. HPLC analysis indicated that the fungus was capable of reducing 99% of DBT concen...

[ 28 ] - Production and partial purification of thermostable bacteriocins from Bacillus pumilus ZED17 and DFAR8 strains with antifungal activity

The bacteria which are members of the genus Bacillus are known to produce a wide variety of antimicrobial substances and bacteriocins. The main objective of this study was to investigate the effect of these bacteriocins on eukaryotic cells such as fungi, yeast and plant seeds. Several strains were screened for antifungal activities and identified by the means of polymerase chai...

[ 29 ] - Production and partial purification of thermostable bacteriocins from Bacillus pumilus ZED17 and DFAR8 strains with antifungal activity

[ 30 ] - پتانسیل شکارگری بدلوویبریو باکتریووروس علیه پاتوژن های جدا شده بالینی با مقاومت دارویی بسیار گسترده

بدلوویبریوها گروهی از باکتریهای شکارچی هستند که جهت رشد، سایر باکتریهای گرم-منفی را به عنوان طعمه مورد تهاجم قرار می دهند. ماهیت باکتری کشی بدلوویبریوها آنها را تبدیل به یکی از جایگزینهای امیدوارکننده برای آنتی بیوتیکهای رایج کرده است. در این مطالعه، جداسازی و شناسایی مولکولی بدلوویبریو باکتریووروس سویه SOIR-1 توصیف شد. الگوی مقاومت آنتی بیوتیکی برخی از جدایه های بالینی تعیین، و پتانسیل شکارگری...

[ 31 ] - Characterization of the first highly predatory Bdellovibrio bacteriovorus from Iran and its potential lytic activity against principal pathogenic Enterobacteriaceae

Objective(s): Bdellovibrio-and-like organisms (BALOs) are predatory prokaryotes that attack and kill other Gram-negative bacteria for growth and reproduction. This study describes the isolation, identification, biological properties, and bacteriolytic activity of the first Bdellovibrio bacteriovorus with a broad prey range from Iran.Materials and Meth...

[ 32 ] - Review on Biological Synthesis of Nano-Hydroxyapatite and Its Application in Nano-Medicine

Hydroxyapatite (HA) has many applications in medicine, dentistry, diagnosis, drug delivery systems, sewage treatment, bone remodeling, concentrating bacteria, covering implants, and antibacterial activity. Despite the numerous current applications of calcium phosphate compounds, particularly HA, their producing methods are being investigated to find the best processes. Several chemical and biol...

نویسندگان همکار

محمد ربانی خوراسگانی 2