Hassan Mohabatkar
Department of Biotechnology, Faculty of Advanced Sciences and Technologies, University of Isfahan, Isfahan, Iran
[ 1 ] - Prediction of T-cell epitopes for designing a reverse vaccine against streptococcal bacteria
Streptococcal bacteria are among dangerous human pathogens with major prevalence worldwide. A good vaccine against streptococcal bacteria should have epitopes that confer protection from infection by different streptococcal bacteria types. we aimed was to recognize the most immunogenic and conserved epitopes of streptococcal bacteria, which could be a potential candidate for vaccine development...
[ 2 ] - Anticancer activity of cow, sheep, goat, mare, donkey and camel milks and their caseins and whey proteins and in silico comparison of the caseins
The present investigation was carried out to evaluate anticancer activity of cow, goat, sheep, mare, donkey and camel milks and their casein and whey proteins against MCF7 cell line. The structure-based properties of the casein proteins were also investigated, using bioinformatics tools to find explanation for their antitumor activities. The effect of different milks and their casein and whey p...
[ 3 ] - In silico comparison of Iranian HIV -1 envelop glycoprotein with five nearby countries
HIV-1 envelope (env) glycoprotein mediates an important role in entry of the virus into the susceptible target cells. As env glycoprotein of HIV-1 is highly variable in the different geographical regions, in the present study, different properties of this protein in Iran are compared with five nearby countries. The sequences of HIV-1 env glycoproteins of Iran, Afghanistan, Russia, Turkey, Pakis...
[ 4 ] - In silico prediction of anticancer peptides by TRAINER tool
Cancer is one of the causes of death in the world. Several treatment methods exist against cancer cells such as radiotherapy and chemotherapy. Since traditional methods have side effects on normal cells and are expensive, identification and developing a new method to cancer therapy is very important. Antimicrobial peptides, present in a wide variety of organisms, such as plants, amphibians and ...
[ 5 ] - بررسی قابلیت ضد باکتریایی و جهش زایی گونه های مختلف گیاه درمنه و اثر بخشی آن ها بر رشد و تکثیر لنفوسیت های انسانی
Background and purpose: Currently medicinal plants as immunomodulator or antimicrobial agents have gained interests in pharmaceutical researches. The aim of this study was to evaluate antibacterial activity, mutagenicity and proliferator effect of different parts of seven species of Artemisia genus on human lymphocyte cells of methanolic extracts. Materials and methods: In this experimental ...
[ 6 ] - شناسایی و خالص‌سازی همولیزین گروهی از باسیلوس‌ها به روش زایموگرافی
زمینه و اهداف: همولیزین یک پروتئین خارج سلولی است که توسط بسیاری از باکتری های بیماریزا و غیر بیماری زا ترشح می شود. سطح فعالیت همولیزین غشای پلاسمایی گلبول های قرمز خون می باشد. در این مطالعه استخراج همولیزین از سویه های باسیلوس تولید کننده آن، تعیین وزن مولکولی و بررسی خصوصیات عملکردی این آنزیم مورد بررسی قرار گرفته شده است. مواد و روش کار: باسیلوسهای تولیدکنندهی همولیزین شناسایی شدند، سپس...
[ 7 ] - شبیه سازی دینامیک مولکولی پروتئین همولیزین باسیلوس پامیلوس و داکینگ آن با کلسترول و پیشگویی تغییرات کنفورماسیونی این پروتئین در طراحی دارو با کمک بیوانفورماتیک
همولیزین یک پروتئین خارج سلولی است که توسط بسیاری از باکتری‌های بیماریزا و غیر بیماریزا ترشح می‌شود. سطح فعالیت آنها غشای‌پلاسمایی گلبول‌های قرمز خون می‌باشد. همولیزین جزء سموم وابسته به کلسترول می‌باشد یعنی کلسترول را به عنوان گیرنده بر روی سطح سلول‌های خونی شناسایی کرده و از طریق آن به سلول هدف متصل می‌شود. در این تحقیق ما بر روی همولیزین گونه‌ایی از باسیلوس به نام باسیلوس پامیلوس SAFR0032 ...
[ 8 ] - مطالعه ژن عامل رونویسی متصل‌شونده به عناصر پاسخ‌دهنده به تنش کم آبی در برخی ارقام گندم نان ایران
پروتئین عامل رونویسی متصل‌شونده به عناصر پاسخ‌دهنده به تنش کم آبی، یکی از عوامل مهم رونویسی است که در بسیاری از گیاهان نقش کلیدی را در تحمل‌پذیری به تنش‌های محیطی ایفا می‌کند و تنها ویژۀ عالم گیاهی است. تنش اسمزی از قبیل خشکی، شوری و سرما، یکی از مهم‌ترین تنش‌هاست. این پروتئین به عناصر پاسخ‌دهنده به تنش‌های اسمزی متصل شده، باعث بیان چندین ژن می‌شود که در نهایت با اعمال تغییرات بیوشیمیایی و فیزی...
[ 9 ] - A Novel Multi-Epitope Vaccine For Cross Protection Against Hepatitis C Virus (HCV): An Immunoinformatics Approach
Background: Hepatitis C virus (HCV) causes acute and chronic human hepatitis infections. Due to the high genetic diversity and high rates of mutations in the genetic material so far there is no approved vaccine against HCV. Materials and Methods: The aim of this study was to determination B and T cell conserved epitopes of E1 and E2 proteins from HCV and construction of a chimeric pepti...
[ 10 ] - Studying the effects of several heat-inactivated bacteria on colon and breast cancer cells
A great number of researches over the last years are allocated to know cancer reasons, prevention and treatment strategies. Bacterial infections are one of the promoting factors in cancer development. The present study was carried out to study effects of heat-killed bacteria on cancer cell lines MCF7 and HT-29. To this purpose, four bacterial strains including Salmonella typhi, Sta...
[ 11 ] - In silico analyzing the molecular interactions of plant-derived inhibitors against E6AP, p53, and c-Myc binding sites of HPV type 16 E6 oncoprotein
Human papillomaviruses (HPV) are a group of strong human carcinogen viruses considered to be the fourth leading cause of mortality among women in the world. HPV is the most important cause of cervical cancer, which is the second most common cancer in women living in low and middle-income countries. To date, there is no effective cure for an ongoing HPV infection; therefore, it is required to in...
نویسندگان همکار