پیش بینی فعالیت ضدسرطانی مشتقات ۱و۸- نفتیریدین توسط روش الگوریتم ژنتیک-رگرسیون خطی چندگانه
نویسندگان
چکیده مقاله:
سابقه و هدف: این مطالعه به مقایسه مدل سازی QSAR فعالیت ضد سرطانی ترکیبات ۱و۴-دی هیدرو-۴-اکسو-۱-(۲-تیازولیل)-۱و۸-نفتیریدین و مشتقات آن با روش رگرسیون خطی چندگانه مرحله ای (S-MLR ) و روش الگوریتم ژنتیک-رگرسیون خطی چندگانه (GA-MLR) پرداخت. روش بررسی: مجموعه ای از ۱۰۰ ترکیب با فعالیت ضد سرطانی مشخص از مقاله معتبر بین المللی انتخاب شد و روش میدان نیروی آلینجر MM2 برای کمینه کردن انرژی مولکولها استفاده شد. ساختار هندسی مولکولها از طریق روش کوانتوم نیمه تجربی روش آوستین با استفاده از الگوریتم پلاک-ریبایر (Polak-Ribiere) با استفاده از نرم افزار موپک بهینه سازی شدند. تعداد زیادی از توصیفگرهای تئوری برای هر مولکول با استفاده از نرم افزار دراگون محاسبه شد. به منظور انتخاب بهترین دسته از توصیفگرها برای مدل سازی QSAR از دو روش انتخاب متغیر ترکیب الگوریتم ژنتیک-رگرسیون خطی چندگانه و رگرسیون خطی چندگانه مرحلهای استفاده شد. برای مدلسازی ابتدا نمونه برداری تصادفی دسته آموزش (۸۰ درصد از دادهها) ۲۰ بار به صورت تصادفی صورت گرفته و مولکولهای باقیمانده (۲۰ درصد باقیمانده از دادهها) به عنوان دسته پیشگویی برای اعتبارسنجی خارجی استفاده شدند. در میان نمونههای تصادفی، یکی از نمونهها با بالاترین Q2CV، Q2cal و Q2test به عنوان بهترین دسته یادگیری و آموزش انتخاب شد. با استفاده از این دسته یادگیری هر بار مدل به دو روش S-MLR و GA-MLR ایجاد شد. یافتهها: مدلهایQSAR به دست آمده با GA-MLR مجذور ضریب همبستگی اعتبارسنجی بزرگتری نسبت به روشS-MLR داشتند. نتیجه گیری: نتایج این مقایسه نشان میدهد که میتوان با استفاده از مدل حاصل، فعالیت ترکیبات ضد سرطانی مشابه را پیشگویی کرد. واژگان کلیدی: مدلسازی QSAR، فعالیت ضدسرطان، انتخاب متغیر، GA-MLR، Stepwise-MLR.
منابع مشابه
کاربرد الگوریتم ژنتیک به همراه رگرسیون خطی چند گانه برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها
مطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها، با استفاده از توصیف کننده های ساختاری و روش رگرسیون خطی چند گانه توسعه داده شده است. توصیف کننده های مولکولی با استفاده از الگوریتم ژنتیک انتخاب شدند. سپس یک مدل ساده، قوی، قابل تفسیر و با خطای کم و ضریب همبستگی بالا ساخته شد. نتایج نشان می دهد که تکنیک های خطی مانند رگرسیون خطی چند گانه که با یک روش انتخاب متغیر من...
متن کاملکاربرد الگوریتم ژنتیک به همراه رگرسیون خطی چند گانه برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها
مطالعه ارتباط کمی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت دارویی مشتقات پیرازول ها، با استفاده از توصیف کننده های ساختاری و روش رگرسیون خطی چند گانه توسعه داده شده است. توصیف کننده های مولکولی با استفاده از الگوریتم ژنتیک انتخاب شدند. سپس یک مدل ساده، قوی، قابل تفسیر و با خطای کم و ضریب همبستگی بالا ساخته شد. نتایج نشان می دهد که تکنیک های خطی مانند رگرسیون خطی چند گانه که با یک روش انتخاب متغیر من...
متن کاملمطالعه ارتباط کمّی ساختار- فعالیت برای پیش بینی فعالیت مهارکنندگی PIM مشتقهای تری آزولوپیریدین با استفاده از الگوریتم ژنتیک ـ برازش خطی چندگانه
مطالعه ارتباط کمی ساختار ـ فعالیت (QSAR) برای مدل سازی و پیش بینی فعالیت مهارکنندگی PIM،39 ترکیب از مشتق های تری آزولوپیریدین به کار گرفته شد. نخست پس از رسم و بهینه سازی ساختار ترکیب ها و محاسبه توصیف کننده ها، مجموعه داده ها به صورت تصادفی به دو مجموعه آموزش و آزمون تقسیم شد. در انتخاب مهمترین توصیف کننده ها روش گام به گام (SW)<e...
متن کاملپیش بینی Log P (ضریب توزیع آب اکتانل) آفت کش ها به کمک روش رگرسیون خطی چندگانه
آفت کش ها از مهمترین آلایندههای محیط می باشند و انتقال آنها از محیط زیست به داخل بدن موجود زنده و رسیدن به سطحی بالاتر ازحد طبیعی آن یکی از مهمترین نگرانیهای محیط زیستی می باشد. آفتکشها به علت کاربردهای مختلف در زمینه بیوشـیمی و محیط زیست و کـشاورزی مورد توجه بسیاری قرار گرفتهاند. برای شناخت آفتکشها باید خصوصیات فیزیکی و شیمیایی آنها به خصوص میزان سمیت آنها را مور...
متن کاملروش های خطی و غیرخطی ارتباط کمی ساختار- فعالیت جهت پیش بینی فعالیت دارویی برخی از مشتقات آمینواسیدها
این پژوهش به پیش بینی فعالیت دارویی 38 مشتق آمینواسید به عنوان بازدارنده های هیستون دی استیلاز (hdac) جهت درمان سرطان و برخی از بیماری ها اختصاص دارد. آنزیم های hdac موجب تسریع روند حذف گروه های استیل از باقیمانده های لیزین از پروتیین های شامل هیستون (histone) می شوند. پس از محاسبه ی توصیف کننده های مولکولی مستقل، با استفاده از روش مرحله ای انتخاب متغیر و گزینش 4 توصیف کننده، جهت مدل سازی از رگ...
متن کاملپیش بینی متغیرهای اقلیمی توسط مدل چندگانه خطی sdsm در دوره آینده برپایه سناریو a۲
در چند دهه گذشته افزایش دمای زمین موجب بر هم خوردن تعادل اقلیمی کره زمین شده و تغییرات اقلیمی گسترده ای در بیشتر سطح کره زمین ایجاد شده است که از آن به عنوان تغییر اقلیم یاد می شود. هدف از این پژوهش، پیش بینی تغییرات اقلیمی توسط مدل ریزمقیاس نمایی آماری sdsm در دوره آینده برپایه سناریو a2 میباشد. داده های روزانه بارش، دمای کمینه و دمای بیشینه ایستگاه سینوپتیک کرمانشاه، برای دو دوره 2015-2040 ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 28 شماره 3
صفحات 181- 194
تاریخ انتشار 2018-09
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023