مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با DNA استخراجشده توسکیت برای ردیابی ژنهایOPrL ،ExoA ، algDدر ایزولههای بالینی سودوموناس آئروژینوزا
نویسندگان
چکیده مقاله:
زمینه و هدف: سودوموناس آئروژینوزا، یکی از رایجترین عوامل عفونتهای بیمارستانی محسوب میشود. بیشتر آزمایشگاهها بهطور معمول برای شناسایی سودوموناس آئروژینوزا، از روش کشت و تستهای بیوشیمیایی مختلف استفاده میکنند که روشی وقتگیر بوده و در برخی موارد دارای نتایج مثبت و منفی کاذب میباشد. هدف از انجام این پژوهش مقایسه دو روش مولکولی PCR با استفاده از DNA استخراجشده با کیت و PCR با استفاده از کلنی مستقیم در تشخیص ایزولههای سودوموناس آئروژینوزا بود. روش بررسی: در این مطالعه توصیفی – تحلیلی، از 395 ایزوله بالینی مختلف، 85 ایزوله با تستهای بیوشیمیایی اولیه و کشت بر روی محیطهای اختصاصی سودوموناس آئروژینوزا تشخیص داده شدند. سپس با استفاده از ژنهای OPrL،ExoA ، algD با دو روش مولکولی PCR مستقیم و PCR با استفاده از DNA استخراجشده با کیت، مورد ارزیابی قرار گرفتند. یافتهها: از مجموع 85 ایزوله سودوموناس آئروژینوزا که به روش فنوتیپی، غربالگری شده بودند، 81 ایزوله به روش PCR با استفاده از DNA استخراجشده با کیت، حاوی ژنهای OPrL، ExoA، algD (با طول نوکلئوتیدهای 504، 396 و 526 جفت باز) و80 ایزوله نیز به روش PCR مستقیم، دارای ژنهای مذکور بودند. نتیجهگیری: نتایج این تحقیق نشان داد بدون استفاده از کیتهای استخراج میتوان به نتایج تشخیصی قابلقبول در شناسایی سودوموناس آئروزینوزا دست یافت. از طرفی، در نتایج بهدستآمده میتوان خطای روشهای تشخیصی فنوتیپی سودوموناس آئروژینوزا را مشاهده کرد.
منابع مشابه
مقایسه دو روش PCR مستقیم و PCR با استفاده از روش استخراج DNA در تعیین تیپهای مختلف کلستریدیوم پرفرینجنس
واکنش زنجیرهای پلیمراز (PCR) یک روش مناسب برای شناسایی عوامل بیماریزا محسوب میشود و جداسازی DNA اولین گام در این مسیر است. استخراج DNA یک مرحله وقتگیر در تحقیقات ژنتیک مولکولی به شمار میآید که در بعضی موارد از کل مراحل انجام PCR طولانیتر است. هدف از انجام این تحقیق، استفاده از PCR مستقیم (بدون استخراج DNA) جهت تعیین تیپهای مختلف باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس میباشد. در ای...
متن کاملمقایسه دو روش pcr مستقیم و pcr با استفاده از روش استخراج dna در تعیین تیپ های مختلف کلستریدیوم پرفرینجنس
واکنش زنجیره ای پلیمراز (pcr) یک روش مناسب برای شناسایی عوامل بیماری زا محسوب می شود و جداسازی dna اولین گام در این مسیر است. استخراج dna یک مرحله وقت گیر در تحقیقات ژنتیک مولکولی به شمار می آید که در بعضی موارد از کل مراحل انجام pcr طولانی تر است. هدف از انجام این تحقیق، استفاده از pcr مستقیم (بدون استخراج dna) جهت تعیین تیپ های مختلف باکتری کلستریدیوم پرفرینجنس می باشد. در این تحقیق pcr مس...
متن کاملتعیین الگوی فلاژلین (flic) سودوموناس آئروژینوزا در سویه های بالینی به روش pcr
مقدمه: سودوموناس آئروژینوزا اغلب پاتوژن شایع جدا شده از عفونت های سوختگی است که به دلیل پایداری بالا در محیط و مقاومت بالای آنتی بیوتیکی به صورت ذاتی و اکتسابی می باشد. با توجه به اهمیت فلاژل در پاتوژنز عفونت های سودوموناس آئروژینوزا امروزه استفاده از پلی کلونال آنتی بادی ضد فلاژلین برای درمان چنین عفونت هایی مورد توجه قرار گرفته است. شناسایی و تعیین تیپ فلاژلین ((flic و همچنین تعیین فراوانی تی...
15 صفحه اولبررسی فراوانی موتاسیون ژن PA3721 در سویه های سودوموناس آئروژینوزا تولیدکنندهESBL و فاقدESBL با روش PCR
مقدمه: بعضی از سویه های سودوموناس آئروژینوزا، بتالاکتامازهای طیف وسیع را تولید می کنند که باعث مقاومت به سفالوسپورین های طیف وسیع مانند سفو تاکسیم، سفتریاکسیون، سفتازیدیم و هم چنین مونوباکتام هایی از قبیل آزترونام می شوند. یکی از عوامل ایجادکننده مقاومت در برابر آنتی بیوتیک ها در سویه های سودوموناس آئروژینوزا افزایش بیان پمپ های تراوشی است، که از مهم ترین این پمپ ها می توان پمپ MexAB-OprM را نا...
متن کاملشناسایی ژن پیووردین Pyoverdine در جدایه های دامی و انسانی سودوموناس آئروژینوزا با روش Multiplex-PCR
Background and Aim: Pseudomonas aeruginosa is one of the most important factors in hospital infections, especially in patients with immune deficiency and Childhood diseases. The Virulence of bacteria are due to the presence of the Pyoverdine gene, which has many effects on the wild type of bacteria during the pathogenic pathway. Identification of different classes of PVD gene is necessary for t...
متن کاملطراحی پرایمرهای اختصاصی برای نشان دادن ژنهای exoA، oprL و algD برای تشخیص سریع سویههای سودوموناس آئروژینوزا در نمونههای بالینی
Background: The aim of this study was compared the efficacy of the designed primers and already published primers for detection of the exoA, oprL and algD genes by PCR assay for finding a rapid, accurate and highly sensitive and specific procedure to detect the Pseudomonas aeruginosa in the serious and fatal infections such as cystic fibrosis disease, burned individual.Methods: A total of 150...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 11 شماره 3
صفحات 11- 21
تاریخ انتشار 2017-05
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023