بررسی بیوانفوماتیکی ژن مقاومت به سویه آسیایی باکتری عامل بیماری میوه سبز مرکبات در گیاه گریپ فروت

بیماری میوه سبز مرکبات از جمله مهم‌ترین بیماری‌های باکتریایی مرکبات در مناطق جنوبی کشور است. با توجه به ماهیت بیماری، استفاده از ارقام مقاوم مناسب‌ترین راه­کار در جهت مبارزه با این بیماری است. اخیرا، مطالعه جامع برهمکنش میزبان-پاتوژن و شناسایی ژن­های دخیل در این برهمکنش، نشان داد که در گریپ ­فروت متحمل به این بیماری، بیان یک ژن آنالوگ مقاومت متعلق به خانواده Nucleotide Binding Site- Leucien-Rich Repeats (NBS-LRR) افزایش می­یابد. در این تحقیق جداسازی ژن (NBS552) با آغازگرهای اختصاصی از گریپ­ فروت به روش PCR صورت گرفت و در پلاسمید pGEM-T همسانه ­سازی شد. آنالیز توالی­یابی نشان داد که چارچوب بازخوانی این ژن 171 جفت باز است و پروتئین با طول 57 اسید امینه را کد می­کند. نتایج بررسی­های بیوانفورماتیکی نشان داد که این ژن در بین گونه­ های گیاهی دارای توالی­های حفاظتی بالایی است و احتمالا ترشح پروتئین NBS552 در غشاء پلاسمایی و ترشح خارج سلولی آن ناچیز است. هدف این مطالعه  جداسازی  و همسانه سازی ژن NBS552 از ژنوم گیاه گریپ­ فروت  و تعیین مشخصات آن به  منظور استفاده کاربردی در گیاهان است.