ارزیابی حساسیت سه پرایمر مختلف با استفاده از روش RFLP -PCR برای تمایز مولکولی مایکوباکتریوم‌های آتیپیک
نویسندگان
چکیده مقاله:
i Rapiddentification of atypical mycobacterium(Non-tuberculosis mycobacterium NTM) is important because of increase of these organisms infection in recent years. As phenotypic tests are time consuming and expensive, nowadays the molecular methods are widely used for rapid identification of mycobacterium spcies. The aim of this study was molecular differentiation of atypical mycobacteria using three primers in the PCR- RFLP method and evaluation of sensitivity of primers. Materials and Methods: This study was performed on 48 atypical mycobacterium specimens separated from pulmonary tuberculosis (PTB) patients who were indentified by phenotypic tests. Drug susceptibility testing was performed by proportional method, the fragments of the 16S-23S rRNA gene spacer and hsp65 gene were amplified by PCR method. Subsequently the amplicons were digested with enzymes namely AvaII,HphI, HpaII, BstEII and HaeIII and electrophoresed on 2% agarose gel. Results: A total of 48 isolates, 8 (16.6%) had multi-drug resistant (MDR-TB), 4 (8.3%) had susceptible and 36 (75%) had non MDR ( combined resistance). 13 (27%) were rapid growing and 73% were slow growing . By rate detection of hsp65 PCR-RFLP primer was higher than other primers. Conclusion: hsp65 PCR- RFLP method was more specific and exact for differentiation of non tuberculosis mycobacterium(NTM).
منابع مشابه
ارزیابی حساسیت سه پرایمر مختلف با استفاده از روش rflp -pcr برای تمایز مولکولی مایکوباکتریوم های آتیپیک
با افزایش عفونت های ناشی از مایکوباکتریوم های آتیپیک (non- tuberculosis mycobacterium ntm) در سال های اخیر، تشخیص سریع این دسته از اهمیت ویژه ای برخوردار است. از آنجایی که روش های فنوتیپی وقت گیر و پرهزینه هستند، امروزه از روش های مولکولی به طور وسیعی برای شناسایی و تمایز گونه های مختلف مایکوباکتریوم ها استفاده می شود. هدف ازاین مطالعه، تمایز مولکولی مایکوباکتریوم های آتیپیک با استفاده از سه پر...
متن کاملتشخیص سریع حساسیت به اتامبوتول در سویه‌های مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ایزوله شده از بیماران مسلول با روش مولکولی PCR-RFLP
Background & Aims : Eethambutol is a key drug to treatment of tuberculosis and resistance against it has been increasingly reported. In this study, Polymerase Chain Reaction -Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) method in rapid detection of tuberculoses mycobacterium strains against the ethambutol has been investigated. Materials & Methods : This study was conducted on 60 s...
متن کاملتعیین گونه‌ی فاسیولا با استفاده از روش PCR-RFLP
Background and Objective: Fascioliasis is an important zoonotic disease that causes several health problems and economical losses in different parts of Iran including Zanjan. Fasciola hepatica and F. gigantica are recognized as causative agents of the disease. The differential diagnosis between these two species is very important for planning and control of infection. This study was designed to...
متن کاملمقایسه مولکولی جمعیت‌هایی از Meloidogyne javanica و Meloidogyne incognita در ایران با روش PCR – RFLP
To carry out this study, total DNA was extracted from eggs and from second stage juveniles of several populations of Meloidogyne javanica and Meloidogyne incognita, using phenol / chloroform method. Following extraction, DNA was electrophoresed on 1% agarose gel to determine its quality and quantity. A specific primer pair (C2F3 / 1108 23 and 20 nucleotides, respectively) was used to discrimina...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
عنوان ژورنال
دوره 13 شماره None
صفحات 83- 91
تاریخ انتشار 2011-08
با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.
کلمات کلیدی برای این مقاله ارائه نشده است
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023