تمام صورت بندی های ممکن برای ترکیب 3- آمینو- 5-تیوکسو – پنت- 2- انال در سطوح b3lyp و mp2 با تابع پایه g**++311-6 به منظور تعیین ترتیب پایداری صورت بندی ها و امکان تشکیل پیوندهای هیدروژنی درون مولکولی مختلف بهینه شده اند. نتایج محاسبات نشان می دهد که صورت بندی های کتو- آمین- تیو(kat) از صورت بندی های انول- ایمین- تیو(eit) و کتو- ایمین- تیو(kit) نظیر آن پایدارترند. انرژی پیوند هیدروژنی برای همه سیستم ها با استفاده از روش rrm بدست آمده است؛ ترتیب کاهش نسبی انرژی های پیوند به صورت زیر می باشد: o-h….nimine >namine–h….sthio > namine–h….oketo > nimine–h….sthio > nimine–h….oketo> > nimine–h….ohydroxyl طبیعت پیوند هیدروژنی درون مولکولی در صورت بندی های مختلف3- آمینو- 5-تیوکسو – پنت- 2- انال به وسیله تئوری اتم ها در مولکول ها (aim) و نظریه اربیتال های طبیعی (nbo) تجزیه و تحلیل شد. در نهایت ارتباط قابل قبولی میان قدرت پیوند هیدروژنی و نتایج حاصل از آنالیزaim و nbo بدست آمد. برای تکمیل محاسبات تمامی محاسبات ساختاری برای ترکیب مورد مطالعه و صورت بندی های آن در فاز محلول انجام و تأثیر حلال بر روی پایداری صورت بندی های مختلف مشخص شد. همچنین برای یک واکنش انتقال پروتون، محاسباتی پیرامون حالت گذار انجام و ساختار حالت گذار بهینه گردید، سپس انرژی فعال سازی، فاکتور فرکانس، ثابت سرعت و پارامتر های ترمودینامیکی حالت گذار محاسبه گردید.