امروزه آلودگی محیط زیست از مسائل مهمی است که جوامع مختلف با آن روبرو هستند . گاز های خروجی از دهانه دودکش های کارخانه ذوب سرچشمه حاوی مقدار زیادی ذرات ریز جامد به صورت معلق هستند که اغلب این ذرات حاوی ترکیبات فلز سنگین می باشند.آلاینده های هوا می توانند به طور مستقیم از طریق برگ ها یا غیرمستقیم از طریق اسیدی شدن خاک بر روی گیاهان تاثیر بگذارند. . آلودگی خاک ها به فلزات سنگین نیز یکی از نگرانی های زیست محیطی عصر حاضر به شمار می رود. عمومی ترین فلزات سنگین که در خاک های مناطق آلوده دیده می شوند به ترتیب شامل سرب، کروم، آرسنیک، روی، کادمیوم، مس و جیوه می باشند.امروزه شناسایی گیاهان مقاوم به آلودگی بسیار اهمیت دارد زیرا یکی از کاربرد های شناسایی این گیاهان کاشت آن ها در مکان های آلوده و صنعتی جهت پاک سازی محیط می باشد. در این مطالعه، از دو گونه ی کاج تهران و کاج سیاه کاشته شده در اطراف کارخانه مس سرچشمه به عنوان گیاهان منطقه آلوده نمونه برداری شد. همچنین باغ کنتوئیه (به فاصله 9 کیلومتری از کارخانه) به عنوان منطقه شاهد انتخاب و از گیاهان آن منطقه نیز نمونه برداری شد. گیاهان دو منطقه از نظر پارامتر های مختلفی نظیر رنگیزه های فتوسنتزی، ترکیبات فنلی، فلاونوئید ها، آنتوسیانین ها، تانن ها، پروتئین، لیگنین و فعالیت آنزیم هایی نظیر کاتالاز، آسکوربات پراکسیداز، گایاکول پراکسیداز، پلی فنل اکسیداز، فنیل آلانین آمونیا لیاز و کونیفریل الکل دهیدروژناز مورد بررسی و مقایسه قرار گرفتند. همچنین ساختار تشریحی برگ گیاهان مورد مطالعه قرار گرفت. با توجه به مقدار بالاتر فلزات سنگین در گیاه کاج سیاه و با توجه به بالاتر بودن فعالیت آنزیم های آسکوربات پراکسیداز، گایاکول پراکسیداز، پلی فنل اکسیداز و فنیل آلانین آمونیالیاز در کاج تهران و واکنش کمتر کاج سیاه می توان نتیجه گرفت که احتمالا کاج سیاه گونه ای مقاوم تر نسبت به کاج تهران است.