نام پژوهشگر: محمد علی ابراهیمی

تجزیه مولکولی پسته با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1389
  شیرین کلاهی زنوزی   محمد علی ابراهیمی

پسته گیاهی است دو پایه ، خزان پذیر از خانواده anacardiaceae و دارای 11 گونه می باشد . ازبین این گونه ها فقط pistacia vera l. یا پسته اهلی دارای میوه هایی به اندازه کافی درشت است و ارزش اقتصادی دارد. پسته (p vera l. ) بعنوان یکی از مهمترین محصولات باغی و سومین کالای صادراتی ایران از اهمیت تجاری و اقتصادی ویژه ای برخوردار است. در این پژوهش 16 نشانگر ssr از رقم اکبری با استفاده از روش فیاسکو جداسازی و تعیین مشخصات شده و از این نشانگرها برای مطالعات مولکولی بر روی 45 رقم از مهمترین ارقام تجاری ایران استفاده شده است. 12 نشانگر پلی مورفیسم خوبی روی جمعیت نشان دادند. تعداد کل آلل ها در جمعیت 32 آلل بدست آمد. دامنه تعداد آلل بین 2-4 با میانگین75/2 بود. با استفاده از فراوانی آللی، محتوای اطلاعاتی چند شکل (pic) برای هر نشانگر، به طور جداگانه محاسبه گردیدکه از 19/0 تا 56/0 ( با میانگین 35/0) متغییر بود. برای گروه بندی نمونه های موجود از روش تجزیه خوشه ای upgma استفاده شد که نمونه ها را در4 گروه قرار داد. نتایج این تحقیق نشان داد نشانگرهای ریزماهواره جدید قابلیت کاربرد در مطالعات مرتبط با ساختار جمعیت و تنوع ژنتیکی پسته را دارا می باشندو تنوع ژنتیکی کمی بین نمونه های مورد آزمایش مشاهده شد.

بررسی ارتباط سطح سرمی سلنیوم وآنزیم گلوتاتیون پراکسیدازو ویتامینe با بیماری عروق کرونری بر اساس آنژیوگرافی در بیماران کاندیدای آنژیوگرافی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم پایه 1387
  فهیمه غفوری قریب   مجید غیور مبرهن

هدف: بررسی ارتباط سطح سرمی سلنیوم وآنزیم گلوتاتیون پراکسیدازو ویتامینe با بیماری عروق کرونری بر اساس آنژیوگرافی در بیماران کاندیدای آنژیوگرافی. در این مطالعه سه گروه مورد مطالعه بودند: بیماران قلبی و عروقی تحت آنژیوگرافی (99 مرد، 59 زن)، افراد سالم تحت آنژیوگرافی (31 مرد، 30 زن) و افراد سالم (گروه کنترل). روش کار: میزان ویتامینe توسط hplc، سلنیوم بوسیله جذب اتمی، آنزیم گلوتاتیون پراکسیداز و تعادل اکسیدان و آنتی اکسیدان در سرم این افراد نیز توسط اسپکتروفتومتر و الایزا ریدر تعیین شد. نتایج: در بررسی ویتامین e پس از انجام آزمون t بین 50 فرد با سابقهchd (میانگین ویتامین e ?g/ml77/3±23/4) و 43 فرد بدون سابقه chd ( میانگین ویتامین?g/ml e 85/4±51/5) ، از نظر آماری اختلاف معنی داری بین دو گروه مشاهده گردیدp<.014)). از میان 205 نمونه سلنیوم اندازه گیری شده،آزمون آنالیز واریانس یکطرفه از نظر آماری اختلاف معنی داری بین سه گروه نشان نداد. در بررسی آنزیم گلوتاتیون پراکسیداز، آزمون آنالیز واریانس یک طرفه از نظر آماری اختلاف معنی داری را بین سه گروه مطالعه نشان داد (p<.001 و f=26) . بطوریکه مقدار آنزیم گلوتاتیون پراکسیداز در گروه بیمار کمتر از گروه شاهد بود. در ضمن با بررسی تعادل اکسیدان و آنتی اکسیدان مشخص گردید که مقادیر اکسیدانهای بیماران بسیار بیشتر از گروه شاهد بود وآزمون آنالیز واریانس یک طرفه نیز از نظر آماری اختلاف معنی داری را بین سه گروه مطالعه نشان داد (p<.001 و f=36.687). بحث و نتیجه گیری در مطالعه حاضرکاهش واضح سلنو آنزیم گلوتاتیون پراکسیداز در افراد آن‍‍ژیوگرافی شده قابل تامل است. از طرفی تغییر در سطح سلنو آنزیم گلوتاتیون پراکسیداز می تواند به عنوان فاکتورهای پیش آگهی جدیدی در زمینه بیماریهای قلبی و عروقی مطرح باشد. همچنین با توجه به عدم تغییر معنادار سطح سلنیوم در افراد تحت مطالعه اینطور به نظر می رسد که بر خلاف برخی از گزارشات، تغییر سطوح سلنیوم به تنهایی داده قابل اعتمادی در رابطه با بیماریهای قلبی و عروقی نباشد. در بررسی مشاهده افزایش معنادار تعادل اکسیدان و آنتی اکسیدان در دوگروه بیماران در مقایسه با گروه نرمال، روشی جدید، ارزان و سریع و قابل دسترس برای بررسی تعادل آنتی اکسیدان به اکسیدان ارائه شده که به تائید متخصصین امر نیز رسیده است و می تواند جهت بررسیهای کلینیکی در مورد تخمین استرس اکسیداتیو به کار رود.

بررسی بیان اینترفرون آلفا 2b در سیستم بیانی باکتری اشرشیاکلی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1389
  نهضت عبدالرسولی   محمد رعایایی اردکانی

اینترفرون ها وسیله دفاعی بدن علیه ویروس ها می باشند که به سرعت در بدن تولید شده، سلولهای اطراف را به تولید پروتئین هائی که تکثیر ویروس را مهار، یا پاسخ ایمنی و رشد سلولی را کنترل می کنند، تحریک می کنند. در این پژوهش، ژن اینترفرون آلفاb2 پس از تکثیر با آغازگرهای اختصاصی در ناقل بیانی (+)pet-26b تحت کنترل پروموتور t7 و پپتید نشانه پریپلاسمی pelb و با استفاده از آنزیم های برشی ncoi و xhoi کلون گردید. سازه تهیه شده به باکتری اشرشیاکلی سویه bl21(de3) منتقل گردید. همسانه سازی ژن اینترفرون آلفا در ناقل بیانیpet26b(+) با استفاده از colony pcr، هضم آنزیمی و تعیین توالی، تأیید شد. سپس بیان ژن اینترفرون آلفا با استفاده از آنالیز بلات نقطه ای در زمانهای مختلف پس از القاء با iptg مورد بررسی قرار گرفت. . همچنین امکان هدایت پروتئین اینترفرون آلفای تولید شده به فضای پریپلاسمی باکتری، 15 ساعت پس از القاء موردبررسی قرار گرفت. با استفاده از این روش مشخص شد که اینترفرون آلفاb2 در سیستم بیانی باکتری تولید شده و وارد فضای پری پلاسمی باکتری شده است.

ارزیابی ومقایسه پروتئین های ذخیره ای دانه در برخی از گونه های کلکسیون آژیلوپس ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1389
  پونه قربانی   محمد علی ابراهیمی

تنوع ژنتیکی پایه واساس اصلاح گیاهان محسوب شده که گزینش وبهبود گیاهان با صفات وخصوصیات مطلوب را ممکن می سازد. با توجه به اهمیت پروئتین های ذخیره ای دانه (hmw)دربرنامه های بهنژادی گندم نان مطالعه تنوع ژنتیکی برای این پروتئین ها در میان خویشاوندان گندم از اهمیت ویژه ای برخوردارند .در این بررسی تنوع ژنتیکی برای پروتئین های ذخیره ای دانه در میان 105 نمونه از گونه های ae.columnaris, ، ae.crassa،ae.cylindrica ، ae.kotschyi، ae.neglecta ،ae.triuncialis ، ae.umbellulataa ، ae.speltoides و ae.tauschii طبق روش ژل اکریلامید سدیم دو دسیل سولفات (sds-page) مورد بررسی قرار گرفت. در مجموع22 بند پروتئینی در غالب24 طرح مختلف در میان نمونه ها مشاهده شد. بیشترین تنوع در گونهae.neglecta، با شاخص 12/0 و کمترین تنوع در گونه ae.cylindrica، با شاخص 03/0 مشاهده گردید. در میان استانهای مبدا نمونه ها، استانهای تهران وآذر بایجان شرقی با شاخص 13/0 بیشترین تنوع واستان لرستان با شاخص 06/0 از تنوع کمتری برخوردار بودند. در گروهبندی نمونه ها با استفاده از روش upgma گونه ها و همچنین استانهای مورد بررسی به سه گروه تقسیم شدند. بیشترین فاصله ژنتیکی بین گونه ae.crassa وae.triuncialis و کمترین فاصله ژنتیکی میان گونه ae.umbellulataو ae.neglecta و مشاهده شد. همچنین در میان استانهای مبدا نمونه ها استانهای لرستان و سمنان بیشترین فاصله و استانهای باختران و ایلام کمترین فاصله را از یکدیگر نشان دادند.

بررسی تثبیت نیتروژن سویه های باکتری ریزوبیوم نخود و عدس شهرستان های جنوبی استان آذربایجان غربی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1389
  صدیقه عضدی   علیرضا عیوضی

تثبیت نیتروژن مولکولی در فرایند همزیستی گیاه با باکتری می تواند نیاز گیاه را به این عنصر مرتفع نموده و جایگزین کودهای شیمیائی نیتروژن دار شود. در این تحقیق توانائی تثبیت نیتروژن سویه های ریزوبیوم جمع آوری شده از پنج شهرستان استان آذربایجان غربی به نام های پیرانشهر، مهاباد، شاهین دژ، تکاب و میاندوآب در همزیستی با دو گیاه نخود و عدس تحت شرایط بهینه رشد و تنش خشکی مورد بررسی قرار گرفت. ریزوبیوم های اختصاصی تکثیر شده از نمونه های جمع آوری شده جهت مایه کوبی گیاهچه های چهار روزه از عدس محلی و نخود آرمان در شرایط کنترل شده بکار گرفته شدند. گیاهچه ها در قالب طرح کاملاً تصادفی و در داخل گلدان های پلاستیکی حاوی پرلیت ضدعفونی شده که روزانه با محلول هوگلند فاقد نیتروژن آبیاری می شدند تحت دو نوع شرایط بهینه رشد و شرایط تنش خشکی کشت شدند. نتایج تجزیه واریانس مرکب نشان داد سویه های ریزوبیوم تکاب منجر به تثبیت نیتروژن بیشتری شدند. ضرایب همبستگی صفات نشان داد میزان نیتروژن تثبیت شده با صفات تعداد گره، وزن گره، وزن خشک ریشه و وزن خشک کل همبستگی مثبت و معنی داری در عدس و نخود دارد. تجزیه کلاستر سویه های باکتری مناطق مختلف استان برای هر گیاه به طور مجزا با روش حداقل واریانس ward باعث گروه بندی سویه های نخود پیرانشهر و میاندوآب و تکاب با هم و شاهین دژ و مهاباد هم با هم در یک گروه شد. همچنین سویه های ریزوبیوم عدس مربوط به پیرانشهر در گروه مجزا از سایر سویه های دیگر شهرستانها قرار گرفت. در تجزیه به مولفه های اصلی در نخود و عدس شهرستان های تکاب و شاهین دژ بیشترین مقادیر دو مولفه اصلی را به خود اختصاص دادند.

جداسازی آسپرژیلوس های مولد آفلاتوکسین از خاک باغات پسته و شناسایی و طبقه بندی آنها با استفاده از روش های ملکولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1389
  مژده جمالی   محمد علی ابراهیمی

در تحقیق حاضر، تعداد 100 نمونه خاک باغات پسته از 4 منطقه جغرافیایی مختلف در شهر دامغان از نظر حضور قارچ های مولد آفلاتوکسین از دسته فلاوی مورد ارزیابی قرار گرفتند. نمونه های خاک با استفاده از روش های استاندارد آماده سازی و در محیط های کشت جداسازی شامل دی کلران رزبنگال کلرامفنیکل آگار (drbc) و آسپرژیلوس فلاووس و پارازیتیکوس آگار (afpa) کشت داده شدند. کلنی های سبز- زرد بر روی drbc و پشت نارنجی برروی afpa از طریق پاساژ برروی محیط سابورو دکستروز آگار واجد کلرامفنیکل (sc) خالص سازی شده و از طریق بررسی ویژگی های مورفولوژی ماکروسکوپی و میکروسکوپی در سطح گونه شناسایی گردیدند. توانایی تولید آفلاتوکسین ایزوله ها با استفاده از روش کشت در نوک سمپلر (tip culture method) در محیط عصاره مخمر- سوکروز (yes) مورد ارزیابی قرار گرفت. محیط های کشت ایزوله ها پس از اتمام دوره 4 روزه انکوباسیون در دمای 28 درجه سانتی گراد جداسازی گردید و تولید آفلاتوکسین از طریق نمونه گذاری بر روی ژل سیلیکا به روش کروماتوگرافی لایه نازک (tlc) مورد ارزیابی کیفی قرار گرفت. تعداد 24 ایزوله منتخب در محیط yes در ارلن کشت داده شده و میزان تولید آفلاتوکسین در آنها با استفاده از روش کروماتوگرافی مایع با کارایی بالا (hplc) مورد سنجش قرار گرفت. تنوع ژنتیکی و طبقه بندی ایزوله های منتخب با استفاده از روش آنالیزdna چند شکل تکثیر شده تصادفی (rapd) بر روی نمونه های dna ژنومی مورد ارزیابی قرار گرفت. بر اساس نتایج بدست آمده، تعداد 193 ایزوله از دسته فلاوی از خاک جداسازی شدند که همگی با توجه به ویژگی های مورفولوژیک و الگوی تولید آفلاتوکسین تحت عنوان آسپرژیلوس فلاووس شناسایی شدند. از میان 193 ایزوله آسپرژیلوس فلاووس، 114 ایزوله (07/59 درصد) مولد آفلاتوکسین بودند که در این میان، 104 ایزوله قادر به تولید آفلاتوکسین b1و 10 ایزوله قادر به تولید آفلاتوکسین b1 و b2 بودند. میزان تولید آفلاتوکسین b1 توسط 24 ایزوله منتخب آسپرژیلوس فلاووس در محدوده 25/1 تا 56/321 میکروگرم به ازای هر گرم وزن خشک قارچ گزارش گردید. بر اساس آنالیز rapd میزان قرابت ایزوله های آسپرژیلوس فلاووس جداسازی شده از نمونه های خاک با سویه استاندارد آسپرژیلوس فلاووس cmi 102566 بین 42 تا 87 درصد، با سویه استاندارد آسپرژیلوس فلاووس cmi 93803 بین 42 تا 86 درصد و با سویه استاندارد آسپرژیلوس فلاووس nrrl 3537 بین 11 تا 18 درصد بود. در مجموع نتایج به دست آمده در تحقیق حاضر نشان داد که آسپرژیلوس های مولد آفلاتوکسین متعلق به دسته فلاوی در نمونه های خاک باغات پسته ایران حضور دارند و می توانند از طریق جریان هوا در محیط پراکنده شده و محصولات کشاورزی و فرآورده های غذایی را در مراحل مختلف آلوده سازند. بدین این ترتیب ضرورت انجام تحقیقات گسترده در خصوص یافتن روش های مناسب برای مهار تولید آفلاتوکسین در قارچ مولد و ایجاد واریته های مقاوم گیاهی در مقابل آلودگی به این قارچ ها در آینده اجتناب ناپذیر خواهد بود. همچنین با توجه به کارآمدی روش های مولکولی در شناسایی و طبقه بندی قارچ ها و نقش اجتناب ناپذیر آسپرژیلوس های مولد آفلاتوکسین در بهداشت عمومی، تحقیقات مولکولی آینده بر روی بررسی بیان ژن های مسیر بیوسنتز آفلاتوکسین به منظور تفریق قارچ های مولد آفلاتوکسین از غیر مولد متمرکز خواهد بود.

ارزیابی اثر فیتوتوکسین های میکروبی روی دوگونه علف هرز خردل وحشی و بارهنگ آبی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - پژوهشکده بیوتکنولوژی 1389
  فاطمه شاکری   علی محمد لطیفی

یکی از مهمترین چالش های محصولات کشاورزی، علف های هرز می باشند. بسته به نوع محصول و نوع علف هرز، شیوه های مبارزه متفاوت بوده و به تبع آن در کشور های مختلف اثرات زیان بار اقتصادی متفاوتی را از خود نشان می دهند. در این راستا روش های کنترل بیولوژیک از کارآمدی بالایی برخوردار بوده و مورد توجه ویژه قرار گرفته اند. در این مطالعه که با هدف استفاده از بیوهربیساید های قارچی برای کنترل بیولوژیک علف هرز خردل وحشی انجام گرفت ما موفق به جداسازی 846 سویه قارچی از خاک و گیاهان آلوده دولپه ای مناطق مختلف کشور شدیم. سویه های قارچی خالص شده برای بررسی توانایی تولید فیتوتوکسین های نکروز دهنده گیاهان دولپه ای مورد نظر، در محیط چاپکس داکس بهمراه کازآمینو اسید دردمای 28 درجه بمدت 10 روز انکوبه شدند. از این میان تنها 50 جدایه قارچی مهار 70% یا بیشتر علف هرز خردل وحشی را در مقایسه با کنترل نشان دادند. سپس محلول رویی سویه های منتخب مرحله اول بروش سولفات آمونیوم تغلیظ گردیده و پس از محلول سازی با بافر مناسب بروی علف هرز تست گردید براساس قدرت تاثیر گذاری، زمان مورد نیاز برای تاثیرگذاری، نوع تاثیرگذاری برروی خردل وحشی، نهایتا سویه irlm,lc34 مولد فیتوتوکسین پروتئینی با قابلیت کنترل و تخریب موثر خردل وحشی انتخاب شد که بر پایه صفات مورفولوژیکی و ژنتیکی 18s rdna مورد شناسایی فراتر قرار گرفت. پس از تعیین غلظت پروتئین محلول رویی بروش برادفورد با sds- page آن را مورد ارزیابی قرار داده و باند 25 کیلودالتونی مشاهده شد که در بیشتر مقالات نیز باند پروتئینی 25 کیلودالتونی باعث نکروزدهندگی گیاه می شود. در نهایت فیتوتوکسین پروتئینی تولید شده با استفاده از سیستم fplc تخلیص گردید.نتایج ارزیابی های به عمل آمده نشان دهنده اثرات تخریبی شدید فیتوتوکسین به صورت ایجاد نکروز شدید بود به طوری که در مراحل مختلف رشد منجر به مرگ سلولی گیاه هدف گردید. یکی از ویژگی های بارز این نوع فیتوتوکسین اثر تخریبی انتخابی بر روی علف های هرز دولپه ای و عدم اثر منفی بر روی انواع گیاهان تک لپه ای مثل گندم، جو، برنج می باشد. با توجه به اینکه گیاه خردل وحشی به عنوان یکی از مهمترین علف های هرز در مزارع کشت گندم می باشد لذا استفاده از فیتوتوکسین مذکور می تواند گام موثری در جهت کنترل این نوع علف هرز تلقی گردد. لازم به ذکر است که به علت عدم پایداری طولانی مدت فیتوتوکسین ها در شرایط محیطی خاک، استفاده از آنها هیچ گونه مخاطره جدی زیست محیطی را به دنبال نخواهد داشت

مطالعه و استخراج آلفا یک آنتی تریپسین از دانه های سویا ولیما و بررسی برخی خواص فیزیکوشیمیایی آنها با یکدیگر.
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1389
  محمدرضا اوتادی   محمد علی ابراهیمی

پروتئین مهارکننده تریپسین به میزان قابل توجهی در دانه های سویا و لیما وجود دارد، و مقاومت بالایی در برابر حرارت و مواد شیمیایی از خود نشان می دهد. روش های متعددی مانند کروماتوگرافی غربالی و کروماتوگرافی جذبی و الکتروفورز برای جداسازی این پروتئین مورد استفاده قرار گرفته است. همچنین از مواد متفاوتی نظیر سولفات آمونیوم و اتانول جهت استخراج پروتئین مهارکننده تریپسین موجود در سویا و لیما نیز استفاده شده است. جایگاه اصلی سنتز مهار کننده تریپسین در اکثر حیوانات کبد می باشد. محدود کننده های پروتئینی در گیاهان، بیشتر در گلوم ها وجود دارند. مهار کننده تریپسین دانه سویا(sbti) اولین بار درسال1945 توسط (کونیتز)بصورت کریستاله تهیه گردید ، که البته این مهار کننده یکی از انواع متعدد مهار کننده های موجود در دانه سویا می باشد. مهار کننده تریپسین دانه لیما (lbti)اولین بار درسال 1953 توسط (لوئیس و فرگوسن ) بعنوان مهار کننده پلاسمین و در سال 1969 توسط فینی به عنوان مهار کننده تریپسین مطرح گردید ، در دانه لیما بین 4 تا 6 مهار کننده شناسایی گردیده است. در این مطالعه ابتدا دانه های سویا و لیما درآب هیدراته شد، سپس توسط هموژنایزر ، هموژنه گردید. در مرحله بعد جهت حذف چربی از اتانول استفاده شد، سپس ph آن جهت حذف پروتئین های ذخیره ای توسط اسید کلریدریک به 8/4 رسانده شد. . پس از سانتریفیوژ ، محلول روئی جدا و در دو مرحله برش 40 و 70 درصد اشباع سولفات آمونیوم ، مهار کننده تریپسین راسب گردید، سپس رسوب حاصله در آب دیونیزه حل و دیالیز شد. دو مرحله ژل فیلتراسیون و افینیتی کروماتوگرافی نیز جهت تخلیص بیشتر این پروتئین انجام گرفت . نتایج حاصل از این مطالعه نشان داد که با استفاده از روش های ذکر شده می توان از هر کیلو گرم دانه سویا و لیما به ترتیب برابر با 10 میلی گرم aat با فعالیت ویژ u/mg 987000 و1/0 میلی گرم aat با فعالیت ویژه u/mg 7500000 به دست آورد. همچنین این نتایج نشان می دهد که yield overall مربوط به دانه سویا و لیما به ترتیب 20 و 1 بوده است. نتایج حاصل نشان می دهد که وزن ملکولی aat موجود در دانه های سویا و لیما به ترتیب برابر با 20 و 5/8 کیلو دالتون بوده است. نتایج حاصل از مطالعات سینتیکی نشان می دهد که این پروتئین به صورت غیر رقابتی سبب مهار تریپسین می گردد، لذا می توان حدس زد که ki آن برابر با km آنزیم تریپسین می باشد . انجام تیمارهای حرارتی در زمان های مختلف نشان می دهد که مهار کننده پروتئاز موجود در هر دو نمونه با الگویی متفاوت، مقاومت بالایی را در برابر حرارت از خود نشان می دهند.

بررسی کمی بیان ژن های کاندیدای مقاومت به بیماری سپتوریوز برگی در گندم (triticum aestivum)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1389
  لاله کریمی فرساد   محمد علی ابراهیمی

بیماری لکه برگی سپتوریوز) graminicola mycosphaerella) یکی از مخرب ترین بیماری های گندم در جهان می باشد. به منظور بررسی کمی بیان ژنهای کاندیدای مقاومت به بیماری سپتوریوز برگی در گندم (triticum aestivum) والدین حساس فلات و متحمل فرونتانا در قالب طرح بلوک های کامل تصادفی با سه تکرار و پنج تیمار زمانی(0-3-6-12و24 ساعت پس از آلودگی) در شرایط کنترل شده مورد ارزیابی قرار گرفتند. نتایج ارزیابی های کمی بیان 5 ژن کاندیدای تحمل با استفاده ازreal-time pcr نشان داد که بیان ژن pathogenesis-related protein pr-1 در 12 ساعت پس از آلودگی در والد متحمل فرونتانا افزایش می یابد. نتایج اولیه این تحقیق نشان دهنده موثر بودن این ژن در ایجاد مقاومت به بیماری سپتوریوز برگی در گندم می باشد که ضروری است در تحقیقات آینده مورد بررسی کامل تر قرار گیرد.

بــررسـی روشهای تولید پینه تغییر یافته در راستای تولید گیاه مقاوم لیمو ترش به جاروک لیمو ترش
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1389
  هوروش جوان   محمد علی ابراهیمی

لیمو ترش یکی از مهمترین محصولات باغبانی در جنوب کشور ایران است که در سطحی در حدود 42000 هکتار کشت می گردد. بیماری جاروک لیمو ترش یکی از خطرناکترین بیماریهای قرنطینه ای است که تولید و توسعه این محصول را در دو دهه اخیر کاهش داده است. در راستای دست یابی به ژنوتیپی مقاوم به عامل این بیماری ، در این پــژوهش، روش تـولید کـالوس تغییر یافته ( شیمر ) در محل پیوند بین دانهال لیمو ترش و نارنج مورد بررسی قرار گرفت. بذر نارنج و لیمو ترش درشرایط سترون درون شیشه ای ( in vitro ) در محیط کشت ms ونیز در شرایط برون شیشه ای ( in vivo ) در خاک و در گلخانه پرورش داده شد. در زمانیکه دانهال ها بطول 7-10 سانتیمتر رسیدند ، هم در شرایط درون شیشه ای و هم در شرایط برون شیشه ای از مـحـل بالای لپه (epicotyl) روی دو دانهــال بـرش زده شد. گـیـاهـان پـیـونـدی در شرایط درون شیشه ای و نیز در شرایط گلخانه نگهداری شدند. بهترین رشد و بــیـشـتــریــن میزان تولید کالوس در محل پـیوند در محیط کشت ms بـــا ترکیبی از هورمونهای bap (2.5 میلی گرم در لیتر ) و kn ( 2.5 میلی گرم در لیتر ) مشاهده گردید. این کـالـوسها ، مقدمه ای برای رسیدن به کالوسهای تغییر یافته با ژنوتیپ مقاوم به بیماری جاروک لیمو ترش خواهد بود.

بهینه سازی بهره گیری استخراج اسید آلژینیک از جلبک قهوهای سارگاسوم پلی کیستوم
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم پایه 1389
  سالومه زندیه   محمد حسین فتوکیان

استخراج اسید آلژینیک ار جلبک قهوه ای سارگاسوم پلی کیستوم sargassum polycystum c.agardh برای عملکرد بالا و نسبت بالای m/g (کیفیت و خلوص آلژینات استخراجی) با 5 روش استخراجی ( اسیدیو حرارت بالا (خیسانده)و حرارت بالا ( شاهد) و حرارت معمولی (اتاق) و خنثی) از جلببک های رشد یافته و پرورش یافته در 3 مکان ( بوشهر و چابهار و بندر عباس) انجام گرفت. هدف از اجرای این تحقحق بررسی تاثیر روش های مختلف استخراج اسید آلژینیک در جلبک قهوهای سارگاسوم پلی کیستوم بر مقدار و کیفیت ماده تولیدی میباشد. نتلیج این تحقیق نشان داد که انتخاب روش مناسب استخراج اسید آلژینیک نقش تعیین کنندهای در میزان کیفیت ماده استخراجی دارد. این روش ها با یکدیگر متفاوت بوده و هر کدام دارای تاثیر جداگانه ای بر مقدار عملکرد و نسبت m/g میباشد.این نتایج نشان داد که مکان رشد و فعالیت زیستی جلبکهای قهوهای نیز نقش تعیین کنندهای در مقدار اسید آلژینیک استخراج شده و نسبت m/g دارد. نتایج این تحقیق نشان داد آلژینات بدست آمده در روش استخراج حرارت بالا ( خیسانده) از نظر نسبت m/g قوی تر ارزیابی گردید.( نتایج در هر 3 مکان یکسان بود). این نتایج نشان داد ککه استخراج به روش حرارت معمولی(اتاق) در بندر عباس بهترین روش استخراج و بهترین مکان برداشت جلبکو برای عملکرد اسید آلژینیک میباشد. و بین این دو صفت همبستگی منفی و معنی داری وجود دارد.

کلونینگ و سکانس نمودن ژن مربوط به پروتئینesat-6 از مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در پلاسمید یوکاریوتیک pegfp-n1 محمد صادق کوشا
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1389
  محمد صادق کوشا   مجید تبیانیان

سل یکی از معضلات بهداشتی و پزشکی جامعه بشری است، که از سالیان دور تا کنون باعث خسارات جانی و مالی فراوانی برای نسل بشر شده است.و علی رغم تمام تلاشهای صورت گرفته برای مقابله با این بیماری هنوز ان را به عنوان یکی از مهمترین علل مرگ و میر در دنیا می دانند که سالیانه 2 میلیون نفر را در دنیا به کام مرگ می فرستد. یکی از مهمترین پروتئینهای ایمنی زا در مایکوباکتریوم توبرکلوزیسesat-6است،که یک پلی پپتید9.8kdaاست که بوسیله سلولهای tشناخته می شود.و باعث القای پاسخ های ایمنی سلولی قوی می شود،و در نتیجه میزان زیادی ifn-?تولید می کند.این انتی ژن در سویه های واکسینال مایکوباکتریم و جود ندارد و تنها در انواع مایکوباکتریوم پاتوژنی وجود دارد. به نظر می رسد که ما می توانیم با اتصال پروتئین esat-6 به یک حامل مناسب مانند pegfp-n1 سبب توانمندی بیشتر در تولید لاین سلولی مقاوم شویم. این پژوهش برای کلون کردن و سکانس نمودن، پروتئینی به نام esat-6 از مایکوباکتریوم توبرکلوزیس ، به داخل یک وکتور بیانی یوکاریوتی به نام pegfp-n1 صورت گرفته است.شناسائی این ژن از راه کلون کردن و تثبیت آن با pcr،آنالیز محدود کننده و توالی یابی این ژن می تواند پایه گذارتولید نوعیstable cell line(لاین سلولی مقاوم)در آینده نزد یک باشد. که در مطالعات مربوط به بررسی پاسخ های ایمنی پروتئین فوق می توان از ان استفاده نمود. در این مطالعه، ما پس از کلون نمودن ژن مربوط به esat-6، از مایکوباکتریوم توبر کلوزیس در یک وکتور یوکاریوتی به نامpegfp-n1، در اینده پلاسمید نوترکیب حاصله را بر روی رده سلولct26 یک رده سلولی توموری مربوط به موشbalb/cاست، بااستفاده از لیپوفکتامین 2000، بیان می کنیم. و سپس درجهت مطالعه پاسخهای ایمنی زایی لاین سلولی ct-26ترانسفورم شده درموشهای آزمایشگاهی سعی می کنیم.

بررسی تنوع ژنتیکی برای صفات مورفولوژیکی و سیتوژنتیکی در میان چند گونه آژیلوپس ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1390
  مقداد توکلی   شاهین واعظی

جنس آژیلوپس(aegilops spp.) یکی از خویشاوندان وحشی گندم نان می باشد و پراکنش وسیعی در خاور میانه و غرب آسیا دارد که ایران بخش وسیعی از این منطقه را در بر می گیرد. 225 نمونه از گونه های شناسایی نشده این جنس که در بانک ژن گیاهی ملی ایران نگهداری میشوند، در این پروژه مورد شناسایی و ارزیابی قرار گرفتند. ارزیابی صفات مورفولوژیکی تمام نمونه های جمع آوری شده طبق دستورالعمل موسسه بین المللی ذخایر ژنتیکی انجام شد. به علاوه 103 نمونه از همه گونه ها به منظور تخمین سطوح پلوئیدی به وسیله فلوسیتومتری استفاده شد. مطالعه پراکنش جغرافیایی نشان داد که این گونه ها پراکنش وسیعی در شمال، شمال غرب و غرب ایران دارند. اما پراکنش کمتری در مناطق جنوبی و شرقی مشاهده شد. نمونه های استان های مختلف از لحاظ مورفولوژیکی تفاوت معنی داری با یکدیگر داشتند. بیشترین تنوع مورفولوژیکی مربوط به نمونه های جمع آوری شده از گونه ae. tauschii بود. آنالیز همبستگی ها نشان داد که صفات مربوط به سنبله و ساقه دارای بیشترین ضرایب همبستگی با یکدیگر هستند. تجزیه خوشه ای برای صفات مورفولوژیکی، استان ها را به شش گروه تقسیم کرد. استان هایی که در گروه یک و دو قرار گرفتند به طور قابل ملاحظه ای از مناطق شمالی و غربی کشور بودند. در حالی که نمونه هایی که از مرکز و شرق ایران بودند در سایر گروه ها قرار گرفتند. گروه آخر نیز متعلق به استانهای جنوبی بود. نتیجه تجزیه کلاستر نشان داد که رابطه معناداری بین پراکنش جغرافیایی و تنوع مورفولوژیکی وجود دارد. در آزمایشات فلوسیتومتری نیز شدت فلوئورسنس نمونه-های مورد ارزیابی در مقایسه با شدت فلوئورسنس نمونه های شاهد که گندم هگزاپلوئید و جو دیپلوئید بودند به عنوان معیار تعیین سطح پلوئیدی گونه ها مورد استفاده قرار گرفت. در تمامی آزمایشات، سطح پلوئیدی مورد انتظار برای گونه های دیپلوئید و تتراپلوئید مشاهده شد، جز یکی از نمونه های گونه ae. crassa که سطح پلوئیدی آن در این تحقیق هگزاپلوئید بود. مطالعات سیتوژنتیکی نیز نشان داد که این گونه علاوه بر سیتوتیپ تتراپلوئید(2n=4x=28)، دارای سیتوتیپ هگزاپلوئید(2n=6x=42) نیز می-باشد. همچنین مطالعات سیتوژنتیکی نشان داد که بین طول کل کروموزوم ها و داده های فلوسیتومتری رابطه وجود دارد.

تعیین محیط کشت مناسب برای پر آوری و ریشه زایی در گیاهچه های رز رقم ماراسیا
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1390
  محمد ایلیا نعمت پور   سیروس ودادی

رز یکی از گیاهان زینتی و تجاری مهم در جهان محسوب می گردد. رقم ماراسیا نیز به عنوان یک رقم تجاری در بخش باغبانی مطرح می باشد. آمارها نشان می دهد هلند سالانه میلیونها گل رز بـه کشورهای دیگر صادر می کند که نقش مهمی در اقتصاد این کشور دارد؛ کشور ما نیز با توجه به داشتن شرایط آب و هوای مناسب، می تواند گامهای موثری در راستای تولید داخلی و صادرات این محصول بردارد. از محدودیت های این رقم برای ارائه به بازار جهت فروش، تکثیر سریع و عاری از بیماری بودن گیاهچه می باشد. استفاده از تکنیک کشت بافت می تواند کمک موثری به بخش تولید در سطح انبوه در مدت زمان کمتر باشد. قابلیت کشت در هر زمان و موقعیت جغرافیـایی، یکنواختی از نظر ژنتیکی، همزمانی گـل دهی و آسان شدن برداشت و عاری بودن از هـرگونه بیماری از مهمترین ویژگی های رزهای تولید شده به روش کشت بافت است. این کار بصورت طرح کاملا تصادفی در آزمایشگاه پژوهشکده کشاورزی هسته ای کرج انجام شد که برای تعیین بهترین محیط کشت پرآوری، از هورمونهای بنزیل امینو پورین (bap) و کاینتین (kinetin )و جهت ریشه زایی از غلظتهای مختلفibaو naa استفاده گردید. برای پرآوری خصوصیات میزان زنده مانی، تعداد پاجوش، میزان کالوز دهی و وزن تر و خشک و جهت ریشه زایی تعداد ریشه، طول ریشه و وزن تر و خشک اندازه گیری شد. نتایج این تحقیق نشان داد محیط ms حاوی 4 میلی گرم در لیتر bap و محیطms حاوی iba با غلظت 0.1 میلی گرم در لیتر بهترین محیط بترتیب برای پرآوری و ریشه زایی می باشد.

تولیذ آنتی بادی پلی کلونال علیه قارچ polymyxa betae
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده علوم پایه 1389
  مرضیه بصیرت   محمد رضا صفرنژاد

بیماری ریشه گنایی چغندر قند (ریزومونیا)، یکی از مهمترین بیماری های ویروسی در چغندر قند می باشد. عـامـل این بیماری ویــروس زردی نکروتیک رگبـرگ چغنـدر قنــد است. قارچ polymyxa betae در ریشه گیاهان آلوده به صورت پارازیت اجباری رشد می کند و به عنوان تنها ناقل طبیعی این ویروس شناخته شده است. شناسائی گیاهان آلوده به قارچ عمدتا بر اساس مشاهده مستقیم اسپور های استراحتی درون بافت ریشه گیاه می باشد. علی رغم سهولت اجرای این روش در شناسائی گیاهان آلوده، انجام مطالعات تکمیلی و کمی جهت مقایسه گیاهان مختلف از نظر میزان آلودگی همواره با مشکلاتی همراه بوده است. در این خصوص روش های مولکولی، از قبیل real time-pcr، و یا روش های سرولوژیکی مانند das-elisa، می تواند مورد استفاده قرار گیرد. با وجود سهولت و قابلیت بالای استفاده از روش های سرولوژیکی در شناسائی بیمارگر های گیاهی، تهیه آنتی بادی های اختصاصی با کارآیی بالا همواره از مهمترین موانع در استفاده از آن بوده است. در این تحقیق تولید آنتی بادی های اختصاصی علیه قارچ p. betae جهت استفاده درآزمون تشخیصی الیزا صورت پذیرفته است. برای شناسائی و انجام مراحل ایمنی زائی از پروتئین gst که در تمام حالات رویشی قارچ موجود است، استفاده گردیده است. بدین منظور ژن gst اختصاصی p. betae با استفاده از آغازگرهای اختصاصی جداسازی و در پلاسمید ptz57r/t همسانه سازی شد و تعیین توالی انجام گرفت. جهت تولید پروتئین gst نوترکیب، ژن مورد نظر در پلاسمید بیانی pet28a همسانه سازی گردید و در باکتری bl21-de3 بیان شد. خالص سازی پروتئین در شرایط طبیعی با روش کروماتوگرافی تمایلی انجام گرفت. پروتئین نو ترکیب جهت تولید آنتی بادی چند همسانه ای به خرگوش تزریق شد. خالص سازی و جداسازی ایمنوگلوبولین ها از سرم خون خرگوش با استفاده از ستون پروتئین a انجام گرفت .آنتی بادی های خالص سازی شده با آلکالین فسفاتاز نشان دار گردیدند. نتایج حاصله از آزمون سرولوژیکی الیزا اختصاصی بودن آنتی بادی های تولیدی را علیه قارچ p. betae تایید نمودند

بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های مختلف گل راعی hypericum perforatum) )بوسیله نشانگر مولکولی aflp
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1390
  لیلا رضایی   حسنعلی نقدی بادی

هوفاریقول یکی از گیاهان مهم دارویی ، ایران است. که برای درمان افسردگی ملایم تا متوسط و همچنین میگرن می باشد و ترکیبات موثر اصلی آن هیپرفورین و هیپریسین می باشد این تحقیق به منظور بررسی تنوع ژنتیکی بین اکوتیپ های هوفاریقون جمع آوری شده از مناطق مختلف کشور که در پژوهشکده گیاهان دارویی جهاد دانشگاهی کشت شده بودند ، صورت گرفت. در این بررسی dna از برگ ها استخراج شده و با استفاده از 12 ترکیب آغازگری aflp تنوع ژنتیکی مورد بررسی قرار گرفت. نتایج : در مجموع 225 آلل قابل نمره دهی مشاهده شد که 97 درصد چند شکل بودند و تعداد آلل برای هر آغازگر از 8 تا 48 مشاهده شد. میزان تشابه ژنتیکی بین ژنوتیپ ها از 29/0 تا 89/0 متغیر بود. کمترین تشابه بین ژنوتیپ 9 که متعلق به منطقه (نهاوند) و ژنوتیپ 12 (عاشقلو به وانیال) مشاهده شد. بیشترین تشابه نیز بین ژنوتیپ های 6 (نور) و 7 (الموت 45 کیلومتری قزوین) مشاهده شد. تجزیه کلاستر مشخص کرد که تنوع ژنتیکی بالایی بین اکوتیپ های هوفاریقون وجود دارد و همچنین معلوم شد که بین تنوع مولکولی و پراکنش جغرافیایی ارتباطی وجود ندارد.وجود تنوع ژنتیکی تایید کننده این مطلب می باشد که اختلافات فیتوشیمیایی نمونه ها نه تنها به واسطه اثر محیطی نمی باشد ، بلکه توسط عوامل ژنتیکی هم کنترل می شوند و این نتایج در مدیریت ژرم پلاسم هوفاریقون می تواند مفید باشد.

بررسی تنوع ژنتیکی جدایه های bipolaris oryzae با استفاده از نشانگر issr
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1390
  سید مرتضی مدرس وامقی   ناصر صفایی

لکه قهوه ای یکی از مهمترین بیماریهای خسارت زای برنج در جهان و ایران می باشد. عامل بیماری، قارچ cochliobolus sativus، با فرم غیر جنسی bipolaris oryzae می باشد. به منظور بررسی تنوع ‍‍‍‍ژنتیکی عامل بیماری در استان گیلان 20جدایه از گروه بیماری شناسی گیاهی دانشگاه تربیت مدرس دریافت شد. جدایه ها روی محیط عصاره ی سیب زمینی آگار (pda) تجدید کشت شدند و پس از تهیه بیومس، dna استخراج شد. تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگر issr با پنج آغازگر issr2، issr10، stag3،lmb-a وpcms برای کلیه جدایه ها بررسی شد. نتایج تجزیه و تحلیل الگوهای باندی حاصل از مجموع پنج آغازگر issr در سطح تشابه 70 درصد، جدایه ها را به پنج گروه تفکیک نمود. گروه بندی مناسبی از لحاظ منطقه جغرافیایی با استفاده از این نشانگر صورت نگرفت. نتایج بر اساس این نشانگر نشان داد که این قارچ دارای تنوع ژنتیکی بالایی در استان گیلان می باشد. همچنین، 80 لوکوس (معادل %82) چند شکل بودند و بیشترین چند شکلی توسط آغازگر lmb-a (24 لوکوس) حاصل گردید، این مطلب تایید کننده تنوع ژنتیکی بالا در این قارچ در استان گیلان می باشد. بیشترین محتوای اطلاعات چند شکلی (pic) بدست آمده، مربوط به آغازگر stag3 معادل 36/0 بود، که نشان دهنده بیشترین باند ایجاد شده توسط این آغازگر می باشد. بیشترین شاخص نشانگری (mi) مربوط به آغازگر lmb-a (27/7 mi=) و بعد از آن issr10 (65/3 mi=) می باشد. این مطلب نشان دهنده آن است که از این معیار می توان در تخمین چند شکلی، همچنین یک معیار کلی برای پیشگویی کارایی این نشانگرها در ژرم پلاسم این قارچ و قارچ های دیگر استفاده نمود. میزان همبستگی بین ماتریس های تشابه حاصل از مجموع داده های issr، نشان می دهد که دندروگرام های حاصل از پنج آغازگر با یکدیگر تطابق داشته و برازش در سطح بسیار خوبی قرار گرفته است. تجزیه به مختصات اصلی براساس ماتریس تشابه نشان دهنده عدم همبستگی بین آغازگرهای issr می باشد و مفهوم ژنومی این عدم همبستگی پراکنده بودن (توزیع یکنواخت) فواصل قابل تکثیر بین جایگاه های ریزماهواره در سراسر ژنوم می باشد. با توجه به این مطلب آغازگرهایی که مقدار شاخص نشانگری بالاتری را به خود اختصاص داده اند، می توانند برای مطالعه جدایه های ایرانی قارچ bipolaris oryzae در سطح وسیع استفاده گردند. پیشنهاد می شود از این آغازگرها در جدایه های بیشتری از این قارچ از مناطق جغرافیایی مختلف استفاده شود تا ساختار ژننتیکی این بیمارگر در جمعیت های ایرانی آن مشخص گردد. کلمات کلیدی: لکه قهوه ای برنج، تنوع ‍‍‍ژنتیکی، نشانگر مولکولی، issr

جداسازی تعدادی از عوامل بیوکنترلی خاک های استان آذربایجان شرقی با استفاده از روش های مولکولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1390
  پیوند صمیمی فر   علی رضا دهناد

باکتری های استرپتومایسس قادر به تولید انواع مختلف آنزیم های کیتیناز می باشند که در این میان کیتیناز های دو خانواده 18 و 19 مد نظر می باشند. جداسازی ژن کیتیناز خانواده 19 به عنوان نشانگر برای فعالیت ضد قارچی باکتری های مطلوب انتخاب و تستی آنتاگونیستی انجام شد.با استفاده از همسانه سازی و توالی یابی ژن 16srdna شناسایی و وجود ژن کیتیناز با همسانه سازی این ژن اثبات شد.

خالص سازی جزیی آنزیم آلفامانوزیداز از گیاه سویاواثر مهارکنندگی kcn و nan3 و یونهای دو ظرفیتی کبالت، نیکل، مس و روی بر فعالیت آن در شرایط in vitro
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده علوم کشاورزی 1390
  کمال الدین اشرف مدرس   محمد علی ابراهیمی

آلفا مانوزیدازها آنزیم هایی هستند که در کاتابولیسم و دگرگونی زنجیره های قندی دارای مانوز بالا از الیگوساکاریدهای موجود در گلیکوپروتئین ها نقش بسیار مهمی را ایفا می کنند. این موضوع در موجودات مختلف و همچنین در صنعت دارای اهمیت می باشد. با توجه به اهمیت آنزیم آلفا مانوزیداز، در این پروژه اقدام به خالص سازی جزیی آن از سویا کرده و اثر مهارکننـدگیkcn ، nan3 ویونهای دوظرفیتی کبالت ، نیکل ، مس و روی را برفعالیت آن درشرایط in vitro بررسی و همچنین ویژگی ها و مشخصات سینتیکی آنزیم را تعیین نمودیم. آنزیم آلفا مانوزیداز طی چندین مرحله و با استفاده ازسانتریفیوژ نمودن پی درپی، رسوب با بوتانل، استن و سولفات آمونیوم(80-30%) با استفاده از سرم فیزیولوژی به طور جزیی خالص گردید. سپس با استفاده ازکیسه دیالیز و بعد از آن ستون کروماتوگرافی با ژل سفادکس100 - g مبادرت به استخراج هر چه بیشتر آن نمودیم. در حین کار در دو مرحله متوالی از استخراج، میزان پروتئین محاسبه گردید که نشان دهنده سیر نزولی آن از مرحله ای به مرحله بعد بود. در ادامه فراکشن حاوی آنزیم را با استفاده از ژل پلی اکریل آمید ، الکتروفورز نمودیم و پس از رنگ آمیزی ژل به دو روش کوماسی بلو و نیترات نقره با مشاهده باندها به یکی از اهداف این پروژه (خالص سازی جزیی آنزیم) دست یافتیم. سپس خصوصیات سینتیکی آنزیم و تاثیر مهارکنندگی ترکیبات شیمیایی مورد نظر بر فعالیت آن مورد بررسی قرارگرفت. دمای مناسب آنزیم 50 درجه سانتیگراد، ph مناسب 2/5، فعالیت مخصوص u/mg 614/. وkm آنزیم 50 بدست آمد. یون دو ظرفیتی مس بیشترین اثر مهار کنندگی را داشت که با افزایش غلظت اثر مهارکنندگی آن افزایش یافت، در مقایسه یون دو ظرفیتی روی بیشترین اثر فعال کنندگی را داشت که با افزایش غلظت اثر فعال کنندگی آن کاهش یافت. واژگان کلیدی لوبیای سویا ، خالص سازی ، آلفا مانوزیداز ، کروماتوگرافی ، الکتروفورز ژل پلی اکریل آمید ، یونهای دو ظرفیتی

مطالعه تاثیر پرتو گاما در افزایش آنزیم های کیتیناز و گلوکاناز در قارچ تریکودرمای جهش یافته با استفاده از نشانگر مولکولیsts
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1390
  رضا مرادی   محمد علی ابراهیمی

چکیده قارچ trichoderma در بین عوامل کنترل بیولوژیک بیش از همه قارچ ها مورد مطالعه قرار گرفته و به عنوان عامل بیوکنترل کاربرد داشه است. تولید آنزیم های تجزیه کننده دیواره سلولی، آنتی بیوتیک ها و سایرفاکتورها از جمله عواملی هستند که در زمان حمله پاتوژن در قارچ تریکودرما القا شده و به نظر می رسد که مستقیما در مکانیسم کنترل بیولوژیک این قارچ مشارکت دارند.آنزیم های کیتیناز و گلوکانازی که توسط گونه ها مختلف تریکودرما ترشح می شوند به دلیل فعالیت تجزیه کنندگی و ممانعت کنندگی تقریبا همه قارچ های پاتوژن گیاهی بیشتر مورد توجه قرار دارند. اما یکی از عوامل محدود کننده کاربرد گونه های تریکودرما به عنوان قارچ کش های بیولوژیک میزان تاثیر نسبتا پایین ترکیبات بیولوژیک در شرایط مزرعه ای (در مقایسه با سموم شیمیایی) می باشد. بنابراین دستکاری ژنتیکی با استفاده از عوامل جهش زا بر روی عوامل کنترل کننده بیولوژیک می تواند راهگشای بدست آوردن محصولات کنترل بیولوژیک ارتقا یافته باشد. در این تحقیق اثر بازدارندگی دزهای مختلف اشعه گاما بر جوانه زنی اسپور قارچ trichoderma harzianum و تاثیر آن در خصوصیات مورفولوژیکی و آنتاگونیستی موتانت های حاصل در کنترل قارچ بیمارگر rhizoctonia solani بررسی شد. برای این منظور سوسپانسیون اسپور تریکودرما در معرض دزهای 0، 50، 150، 200، 250، 300، 350، 400، 450 گری اشعه گاما در مرکز تحقیقات کشاورزی، پزشکی و صنعتی هسته ای کرج قرار گرفت. برای بررسی تاثیر اشعه گاما بر رشد ریسه، قارچ تریکودرما با دزهای 0، 400، 800، 1200، 1600، 2000، 2500 گری پرتوتابی شد. نتایج حاصل نشان داد که پرتوتابی در محدوده دز450 گری به طور کامل مانع جوانه زنی اسپور قارچ می شود و دز 250 گری به عنوان دامنه دز اپتیمم برای القای جهش در تریکودرما انتخاب شد. همچنین پرتو گاما باعث تنوع در خصوصیات مورفولوژیکی قارچ تریکودرما از جمله شکل، رنگ، اسپوردهی و سرعت رشد ریسه شد. نشانگر مولکولی sts (جایگاه نشانمند در توالی) توالی های کوتاهی هستند که به آسانی با واکنش زنجیره ای پلیمراز تکثیر می شوند (عمدتا قطعاتی به طول 200 تا 500 جفت باز) که قابلیت تکثیر با آغازگرهای اختصاصی را در همه توالی های ژنومی موجود دارا می باشند. در این مطالعه، dnaی ژنومی استخراج شده از کلیه جدایه های جهش یافته هر دو گونه t. harzianum و t. viridae را با استفاده از آغازگرهای اختصاصی که بر اساس توالی ژن های کیتیناز و گلوکاناز قارچ تریکودرما در بانک اطلاعات جهانی ژنوم ثبت شده طراحی شده بودند، تکثیرشد. بر اساس نتایج بدست آمده تفاوت هایی در الگوی باند های حاصل از تکثیر در جدایه های جهش یافته در مقایسه با جدایه های والد (وحشی) مشاهده گردید. نتایج آزمون آنتاگونیستی نشان داد پتانسیل کنترل کنندگی جدایه های جهش یافته در مقایسه با جدایه مادری (شاهد) در برابر قارچ پاتوژن r.solani به طور معنی داری افزایش یافته است. بر اساس نتایج این بررسی، با استفاده از روش القای موتاسیون با پرتو تابی گاما توانایی کنترل بیولوژیکی در قارچ تریکودرما به صورت کاملا معنی داری افزایش پیدا می کند. بر اساس نتایج این بررسی، با استفاده از روش القای موتاسیون با پرتو تابی گاما توانایی کنترل بیولوژیکی در قارچ تریکودرما به صورت کاملا معنی داری افزایش پیدا می کند و نشانگر مولکولی sts می تواند به عنوان یک نشانگر مولکولی مناسب بروز جهش در ژنهای مذکور در جدایه های جهش یافته را نشان دهد. انجام مطالعات بیشتر بر روی توالی های جهش یافته ژن های کیتیناز و گلوکاناز و توالی یابی آنها ضروری می باشد.

بررسی باززایی و خاصیت ضد سرطانی گوجه فرنگی در رقم چری، کشت شده در ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1390
  محمدرضا صفایی محمدابادی   ماندانا بهبهانی

گوجه فرنگی چری با نام علمی lycopersicon esculentum از خانواده solanacee می باشد. گوجه فرنگی به علت دارا بودن متابولیت های ثانویه نظیر فلاونوئید ها و پلی فنول ها بسیار مورد توجه قرار گرفته است. یکی از این متابولیت های ثانویه لیکوپن می باشد که جلوگیری کننده از برخی سرطانها مانند سرطان سینه بعنوان شایع ترین سرطان بعد از سرطانهای پوست می باشد. تکثیر گوجه فرنگی چری از طریق روش های سنتی با مشکلاتی مانند قیمت بالای بذر و تنها توانایی استفاده از بذر های f1 که پس از آن پس روی و کاهش محسوس تولید اتفاق می افتد، همراه می باشد. برای غلبه بر این مشکلات و صرفه جویی در زمان و تولید گیاهان عاری از بیماری از کشت بافت آن استفاده کردیم. آزمایش بصورت فاکتوریل با طرح پایه کاملاً تصادفی در سه تکرار انجام شد. در این تحقیق برای تولید کالوس از ریزنمونه های برگی استفاده شد. بیشترین وزن کالوس در محیط ms حاوی 5/1 میلی گرم بر لیتر 2,4,d و 1 میلی گرم bap بدست آمد. . نتایج حاصل نشان داد که محیط حاوی 5/1 میلی گرم بر لیتر ga3 بهترین محیط برای پرآوری است. بیشترین طول و درصد ریشه زایی در محیط حاوی یک میلی گرم بر لیتر naa به بدست آمد. به منظور بررسی خاصیت ضد سرطانی اندامها(برگ،ساقه، ریشه، دمگل،پوست،گوشت و بذر) و کالوس های حاصل از گوجه فرنگی چری در محلول متانول(قطبی) حل شده و سپس عصاره-گیری شدند. عصاره های حاصل جهت بررسی اثرات ضد سرطانی بر روی سلولهای نرمال کلیه جنین انسان (hek) و سلول-های سرطان سینه mda)) مورد مطالعه قرار گرفتند. بر طبق نتایج حاصل پوست میوه مسن بیشترین و کالوس تاریکی کمترین اثر کشندگی و سمیت را بر روی لاین سلول سرطانی سینه داشت.

تعیین مناسب ترین محیط کشت و شرایط ریز ازدیادی گیاه دارویی چریش(aazadirachta indica a.juss)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1390
  سحر پورمنافی   محمد علی ابراهیمی

چکیده درخت چریش یا نیم درختی همشه سبز متعلق به خانواده meliaceae است. چریش بومی شبه قاره هند می باشد و تاکنون در نواحی گرمسیری و نیمه گرمسیری آفریقا، آمریکا و بسیاری از بخشهای آسیا گسترش یافته است.این گیاه دارای خواص دارویی و غیردارویی زیادی است که به آن گیاه چند منظوره گفته می شود. روشهای استفاده شده برای ریز ازدیادی چریش استفاده ازریزنمونه گیاهان بالغ و نهال بذری جوان می باشد. تحقیقات شامل استقرار ریزنمونه های ضدعفونی شده، شاخه زایی و رشد در شرایط درون شیشه، بالاخره ریشه زایی و استقرار در خاک بود. در این تحقیق جوانه جانبی و یا جوانه انتهایی از شاخه های جوان مورد استفاده قرار گرفت. درضدعفونی قطعات گیاهی استفاده از کلرید جیوه به غلظت 15/0 درصد به مدت 11 دقیقه بهترین نتیجه حاصل شد. محیط کشت استفاده شده برای شاخه زایی یا ریشه زایی محیط کشت ms به اضافه هورمون های bap، iba و naa بود. در این تحقیق در اثر کاربرد محیط کشت ms همراه با ساکارز 3درصد و آگار 75/0 درصد نتایج بسیار مطلوبی حاصل شد و گیاهچه های حاصله در این محیط به خوبی رشد نمودند. در این محیط برای رشد طولی از bap به مقدار 1/0 میلی گرم در لیتر استفاده شد. شرایط اتاق رشد در این مرحله شامل 16 ساعت روشنایی(2500 تا3000 لوکس نور)، 8 ساعت تاریکی، درجه حرارت اتاق 24 تا 25 درجه سانتی گراد و رطوبت هوا 45 درصد تنظیم شد. بعد از 4 هفته گیاهچه ها به محیط شاخه زایی انتقال داده شدند و هر 28 روز یک بار واکشت انجام شد. در مرحله شاخه زایی نیز از محیط ms استفاده شد. تیمارهای هورمونی شامل bap در سه تیمار 1/0، 5/0 و 9/0 میلی گرم در لیتر و iba 5/0 و 1 میلی گرم در لیتر و naa با غلظت 1 میلی گرم در لیتر بود که در قالب یک طرح کاملاً تصادفی با 8 تکرار تجزیه واریانس انجام شد و سپس با آزمون دانکن میانگین ها در سطح 5% مقایسه گردید. نتایج به دست آمده نشان داد بهترین شاخه زایی با استفاده از bap با غلظت 9/0 میلی گرم در لیتر به دست می آید.در این تیمار میانگین شاخه زایی 143/9 بوده که در سطح 5% معنی دار شد. در مرحله ریشه زایی بهترین تیمار شامل naa با غلظت 1/0 میلی گرم در لیتر، و تیامین 6/1 میلی گرم در لیتر همراه با تاریکی به مدت 7 روز بود درجه حرارت در این مرحله 25 درجه سانتی گراد تنظیم شد و در این محیط کشت 80% موفقیت حاصل شد. در مرحله انتقال گیاهچه ها به خاک از ترکیب پیت 40% و ماسه 60% استفاده شد. در مراحل اولیه انتقال به خاک رطوبت محیط در حدود 90% بود و به تدرج کاهش یافت تا گیاهان به شرایط طبیعی سازگار شوند.

انگشت نگاری بخشی از ژرم پلاسم برنج با استفاده از نشانگر aflp
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم پایه 1391
  میثم علیزاده   قربانعلی نعمت زاده

در این پژوهش به منظور ارزیابی و انگشت نگاری بخشی از ژرم پلاسم برنج کشور که شامل 28 رقم محلی و 19 رقم خارجی می باشد، از نشانگر مولکولی aflp استفاده گردید. با استفاده از 20 ترکیب آغازگری تعداد 1274 نوار (باند) بدست آمد، که تعداد 764 نوار (60%) چند شکلی نشان دادند. از بین آغازگرهای مورد استفاده، ترکیب آغازگری e-ttg , m-cat با 107 نوار بیشترین تعداد نوار و ترکیب آغازگری e-agg , m-ctgبا 34 نوار کمترین تعداد نوار را تولید کردند. مقدار متوسط محتوای اطلاعات چند شکلی (pic) برای تمامی آغازگرها برابر با 0.656 بدست آمد. همچنین متوسط شاخص نشانگر مقدار عددی 37.3 را نشان داد. بهترین ترکیب آغازگری برای تفکیک بهتر نمونه های برنج ترکیب آغازگری e-gtg , m-cct با شاخص نشانگر 49 تشخیص داده شد. تجزیه و تحلیل کلاستر بر مبنای ضریب تشابه دایس حداکثر تشابه را بین ارقام ایتالیایی ribe و roma با مقدار 0.97 و حداقل تشابه را بین jasmine85 و سنگ جو با مقدار 0.4180 نشان داد. مقدار متوسط ماتریس تشابه دایس 0.68 بود. به منظور خوشه بندی از الگوریتم upgma و ضریب تشابه دایس استفاده شد. بر این اساس 47 نمونه برنج به چهار گروه دسته بندی شد، که هر کدام از گروه ها به ترتیب 13/2 ، 9/31، 67/27 و 3/38درصد از ژنوتیپ ها را شامل شدند. این خوشه بندی به وضوح ارقام داخلی و خارجی و حد واسط را از هم جدا نمود. نشانگر aflp توانست اثر انگشت منحصر به فردی را برای تمامی ارقام ایجاد کند. به طوری که با ترکیب سه نشانگر e-agg, m-ctg و e-caa , m-cac و e-ttg , m-cat می توان کلیه این ارقام را تعیین مشخصه نمود. با توجه به شناسایی گروه های هتروتیک، از نتایج حاصل از این تحقیق می توان در برنامه های اصلاحی جهت تولید ارقام هیبرید و امید بخش استفاده نمود.

بررسی اثر غلظت های کومارین و جاسمونیک اسید روی مینی تیوبر های دو رقم سیب زمینی اگریا و ساوالان در منطقه سراب
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1390
  حسنعلی عابدین زاده   فرشاد ابراهیم پور

مطالعه ی حاضر بمنظور تعیین اثرات محلول پاشی کومارین و جاسمونیک اسید روی غده زایی دو رقم سیب زمینی اگریا و ساوالان به صورت فاکتوریل بر پایه طرح بلوک های کامل تصادفی در سه تکرار طی سال زراعی 90 در شهرستان سراب، آذربایجان شرقی اجرا شد. سه فاکتورآزمایش شامل رقم، کومارین و جاسمونیک اسید بودند فاکتور رقم در دو سطح (اگریا و ساوالان)، فاکتور کومارین در چهار سطح (0 ، 20 ،40 و 60 میلی گرم در لیتر) و فاکتور جاسمونیک اسید نیز در چهار سطح (0، 5/0 ، 1 و 5/1 میکرو مول) مورد مطالعه قرار گرفتند. نتایج نشان دادند که صفات مورد مطالعه شامل تعداد و وزن غده های کوچکتر از 35، بین 55-35 و بزرگتر از 55 میلی متر، تعداد و وزن غده در بوته و عملکرد به طور معنی داری تحت تأثیر تیمارها قرار گرفتند.اثر ارقام مورد مطالعه برای تمامی صفات مورد مطالعه معنی دارشد. اثر کومارین در کلیه صفات مورد مطالعه بجز وزن غده های بزرگتر از 55 میلی متر تفاوت معنی داری داشت. اثر متقابل رقم و کومارین در تمامی صفات بجز تعداد غده های بزرگتر از 55 میلی متر ، وزن غده های کوچکتر از 35 میلی متر، وزن غده های بزرگتر از 55 میلی متر و عملکرد تفاوت معنی دار نشان داد. اثر جاسمونیک اسید روی کلیه صفات بجز صفت وزن غده های کوچکتر از 35 میلی متر و وزن غده های بزرگتر از 55 میلی متر ونیز اثر متقابل رقم و جاسمونیک روی همه صفات بجز صفت وزن غده های بزرگتر از 55 میلی متر معنی دار بود. اثر متقابل کومارین و جاسمونیک اسید روی همه صفات و اثر متقابل سه گانه رقم، کومارین و جاسمونیک اسید روی کلیه صفات بجز صفت وزن غده های بزرگتر از 55 میلی متر تفاوت معنی دار داشت که بیشترین تعداد غده در بوته به تیمار 60 میلی گرم در لیتر کومارین بدون کاربرد جاسمونیک اسید در رقم ساوالان اختصاص داشت و بیشترین مقدار عملکرد را رقم اگریا با تیمار 60 میلی گرم در لیتر کومارین با کاربرد 1 میکرومولار جاسمونیک اسید نشان داد. نتایج حاکی از آن است که مصرف کومارین و جاسمونیک اسید در دو رقم تاثیر متفاوتی داشته و اثرات معنی داری نشان دادند، بنظر می رسد کاربرد 60 میلی گرم در لیتر کومارین بدون کاربرد جاسمونیک اسید در رقم ساوالان و کاربرد نیم میکرومولار جاسمونیک اسید بدون کاربرد کومارین در رقم اگریا باعث افزایش عملکرد غده های اندازه بذری گردد. کلید واژه ها : محلول پاشی، کومارین، جاسمونیک، ارقام سیب زمینی، اگریا، ساوالان، عملکرد.

شناسایی نشانگر های مولکولی پیوسته با ژنهای تحمل به تنش سرما در کلونهای موتانت زردآلو با استفاده از تکنیک مولکولی sts
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  مریم نژادحسن پاکدل   محمد طاهر حلاجیان

افزایش مقاومت به سرما مهمترین موضوع اصلاحی زردآلو می باشد. این پژوهش به منظور بررسی تحمل به تنش سرما، در نمونه های موتانت زردآلو به همراه رقم والدی آنها ( رقم شاهرودی) به عنوان شاهد و رقم تقریبا متحمل (جهانگیری) و چندین رقم نیمه متحمل و حساس دیگر با استفاده از تکنیک مولکولی مبتنی بر جایگاه نشانمند در توالی ( sts ) انجام پذیرفت.dna از نمونه های برگ استخراج گردید.از دو جفت آغازگر اختصاصی برای بررسی چند شکلی ژنهای کنترل کننده صفت تحمل به سرما در زردآلو استفاده شد. آزمون pcr در سطح جمعیت انجام پذیرفت. سپس فرآورده های تکثیری بر روی ژل آگارز 5/1 درصد آشکار سازی شدند. نتایج ژل الکتروفورز و pcr تحقیقات مولکولی زالونسکایته و همکاران (2008) نتایج تحقیقات ما را تائید نمود. اندازه آللی جفت آغازگراول ( cor47x1r1 وcor47x1f1) از 230 تا 1182 جفت باز متغیر بود، این جفت آغازگر 6 نوع باند در جمعیت تکثیر کرد. این جفت آغازگر تنها در سه کلون موتانت ( m60-5 ، m60-15 وm40-11 ) آللی با اندازه 295 جفت باز ایجاد نمود که احتمال می رود این باند با ژن تحمل به سرما پیوسته باشد. همچنین جفت آغازگردوم ( cor47x2r1وcor47x2f1) نیز از مقاله زالونسکایته و همکاران (2008) برگرفته شد. این جفت آغازگر چند شکلی خوبی بین ارقام حساس و متحمل وکلون های موتانت نشان داد و به نظر می رسد نشانگر مناسبی برای ارزیابی صفت تحمل به سرما در زردآلو باشد. این جفت آغازگر آلل های چند شکلی را در رقم تقریبا متحمل جهانگیری تکثیر کرد. در این رقم آلل هایی با طول های 250، 350،632و 1167 جفت باز مشاهده شدند. در مقایسه با ارقام نیمه متحمل و حساس و کلون های موتانت دو آلل به طول های 632و 1167 جفت باز با صفت تحمل به سرما پیوسته بودند. همچنین این جفت آغازگر در کلون موتانت (m40-11 ) 4 آلل تکثیر کرد. در این کلون علاوه بر دو آلل به طول های 250و350 جفت باز دو آلل دیگر به طول های 396 و530 جفت باز تکثیر کرد که با صفت تحمل به سرما پیوسته بودند. همچنین این جفت آغازگر در کلون های موتانت m50-6 ، m50-4 و m50-2 علاو ه بر دو آلل با طول های 250و350 جفت باز آلل های دیگری با طول های 589 ، 465 و 667 جفت باز تکثیر کرد که با صفت تحمل به سرما پیوسته بودند.

انتقال ژن به دونالیلا سالینا با روش آگروباکتریوم تومه فاسینس
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1391
  فرهاد یحیی بیگی   حمیده افقی

امروزه کاربرد ریزجلبک ها بعنوان غذا، مکمل های غذایی، مواد دارویی و مواد شیمیایی خالص در حال افزایش است. ریزجلبک ها شامل طیف وسیعی از ارگانیسم های یوکاریوت و پروکاریوت هستند که نقش بسیار مهمی در سنتز طیف گسترده ای از تولیدات طبیعی را بازی می کنند. به خاطر رشد سریع و کم هزینه بودن نسبت به سایر سیستم های بیان گیاهان تراریخت، ریزجلبکها کارخانجات سلولی مفیدی هستند که تولیدات با ارزشی نظیر ترکیبات شیمیایی و محصولات نوترکیب را فراهم می کنند.سیستم آگروباکتریوم اولین سیستم تراریختی موفق در گیاهان بود که موانع موجود در مهندسی ژنتیک گیاهی را کاهش داد. تاکنون روشهای مختلف انتقال ژن در گیاهان صورت گرفته اما بهینه سازی انتقال ژن در مورد ریزجلبک دونالیلا سالینا با روش آگروباکتریوم تومه فاسینس برای اولین بار در ایران صورت می گیرد. در این تحقیق کشت 5 گونه دونالیلا سالینا مربوط به نقاط مختلف ایران صورت گرفت و گونه جداشده از دریاچه قم بعنوان نمونه انتخاب شد.با کمک سویه آگروباکتریوم تومه فاسینس gv3850 که دارای پلاسمید pcambia 3301 است دونالیلا سالینای دریاچه نمک قم با روش هم کشتی با باکتری آگروباکتریوم تراریخت شد. با استفاده از آزمون pcr و آزمون هیستوشیمیایی gus حضور ژن bar و gus مورد ارزیابی و تایید قرار گرفت.

ارزیابی تطبیقی صفات فیزیو- مورفولوژیک ژنوتیپ های پنبه(gossypium hirsutum l.) در شرایط عادی و تنش شوری
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1391
  نازنین سادات سید محمود برقانی   غلامحسین حسینی

شوری یکی از مهمترین عوامل کاهش عملکرد بسیاری از گیاهان زراعی می باشد با این وجود بین گیاهان زراعی و حتی بین گونه های گیاهی از لحاظ تحمل به شوری تنوع وجود دارد، بنابراین شناخت مکانیسمهای تحمل به شوری در این گیاه به نژادگران را در اصلاح ژنوتیپهای مقاوم به شوری کمک خواهد کرد و امکان کشت گیاه در اراضی شور فراهم می شود. بدین منظور آزمایشی به صورت بلوک کاملاً تصادفیrcbd در3 تکرار در شرایط معمولی و شور با 6 تیمار والد متنوع پنبه (ارقام گونه های هیرستوم b-557،siokra-324 ، delinter،sindose-80 ،bulgare-539 و باربادنس termez-14 ) در گلخانه مرکز تحقیقات کشاورزی و منابع طبیعی استان تهران در شهرستان ورامین در بستر شن شسته سکوی زهکش دار گلخانه کشت و به موازات تغذیه با محلول هوگلند معمولی به عنوان محیط رشد طبیعی، بمنظور ایجاد محیط شور به تدریج میزان نمک طعام (nacl ) به محلول هوگلند جهت تغذیه بستر شنی گیاهچه های پنبه اضافه گردید تا درجه شوری بستر به dsm-1 24 برسد. سپس تجزیه مرکب داده های صفات مورد مطالعه در دو شرایط معنی دار گردید. صفات مورد ارزیابی شامل: ارتفاع گیاه، طول ریشه، وزن خشک ساقه، وزن تر ساقه، میزان یونهای سدیم، پتاسیم و کلسیم می باشد. و همچنین شاخصهای شدت تحمل به شوری، شدت تنش، شاخص مقاومت و میانگین هندسی تولید، که در آنالیز صفات مورد بررسی و در طبقه بندی کلاستر با استفاده از روش تجزیه به مولفه های اصلی ماتریس همبستگی صفات، ژنوتیپهای sindose-80 و siokra-324 را در طبقه ارقام مقاوم به شوری قرار داد.

شناسایی نشانگرهای ssr پیوسته با ژن های مسئول تحمل به تنش خشکی در لاین های موتانت برنج
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  میترا جامی الاحمدی   محمد طاهر حلاجیان

شناسایی نشانگرهای ssr پیوسته با ژن های تحمل به خشکی در لاین های موتانت برنج برنج (oryza sativa) منبع اصلی غذای بیش از یک سوم جمعیت جهان است و پس از گندم دومین غله مهم در دنیاست. نواحی اصلی کشت برنج در ایران(مازندران، گیلان) هر ساله با مشکل تنش خشکی به ویژه در اواخر مرحله گلدهی مواجهند. از این رو ایجاد ارقام متحمل به خشکی و کارا در استفاده از آب ضروری به نظر می رسد. از تکنیک موتاسیون (پرتوتابی با اشعه گاما) جهت تأمین تنوع مورد نیاز استفاده شد. استفاده از روشهای سنتی برای شناسایی ارقام متحمل به خشکی به صرف زمان و هزینه زیاد نیازمند است ولی با ایجاد نشانگرهای مولکولی پیوسته با ژن می توان زمان لازم برای فرایند اصلاح را کاهش داد. به این منظور در این تحقیق جهت شناسایی نشانگرهای پیوسته با ژن های مسئول تحمل به خشکی در لاین های موتانت، از 11 جفت آغازگر ssr استفاده شد.در آنالیز مولکولی ارقام شاهد و لاین های موتانت، از 11 جفت آغازگر، شش جفت آغازگرrm470 ،rm205،rm201،rm328،rm303 و rm215 آلل های چندشکل احتمالی مرتبط با ژن های تحمل به تنش خشکی را ایجاد کردند و تعداد 10 آلل چندشکل مرتبط با تحمل به خشکی شناسایی گردید.بر اساس دندروگرام داده های مولکولی حاصل از آغازگرهای اختصاصی ssr استفاده شده در این تحقیق ، نمونه های مورد مطالعه به 12 گروه تقسیم شدند.

تعیین مناسب ترین محیط کشت و شرایط ریزازدیادی گیاه دارویی چریش ( azadirachta indica a. juss. )
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم پایه 1390
  سحر پورمنافی   محمد علی ابراهیمی

درخت چریش یا نیم درختی همشه سبز متعلق به خانواده meliaceae است. چریش بومی شبه قاره هند می باشد و تاکنون در نواحی گرمسیری و نیمه گرمسیری آفریقا، آمریکا و بسیاری از بخشهای آسیا گسترش یافته است.این گیاه دارای خواص دارویی و غیردارویی زیادی است که به آن گیاه چند منظوره گفته می شود. روشهای استفاده شده برای ریز ازدیادی چریش استفاده ازریزنمونه گیاهان بالغ و نهال بذری جوان می باشد. تحقیقات شامل استقرار ریزنمونه های ضدعفونی شده، شاخه زایی و رشد در شرایط درون شیشه، بالاخره ریشه زایی و استقرار در خاک بود. در این تحقیق جوانه جانبی و یا جوانه انتهایی از شاخه های جوان مورد استفاده قرار گرفت. درضدعفونی قطعات گیاهی استفاده از کلرید جیوه به غلظت 15/0 درصد به مدت 11 دقیقه بهترین نتیجه حاصل شد. محیط کشت استفاده شده برای شاخه زایی یا ریشه زایی محیط کشت ms به اضافه هورمون های bap، iba و naa بود. در این تحقیق در اثر کاربرد محیط کشت ms همراه با ساکارز 3درصد و آگار 75/0 درصد نتایج بسیار مطلوبی حاصل شد و گیاهچه های حاصله در این محیط به خوبی رشد نمودند. در این محیط برای رشد طولی از bap به مقدار 1/0 میلی گرم در لیتر استفاده شد. شرایط اتاق رشد در این مرحله شامل 16 ساعت روشنایی(2500 تا3000 لوکس نور)، 8 ساعت تاریکی، درجه حرارت اتاق 24 تا 25 درجه سانتی گراد و رطوبت هوا 45 درصد تنظیم شد. بعد از 4 هفته گیاهچه ها به محیط شاخه زایی انتقال داده شدند و هر 28 روز یک بار واکشت انجام شد. در مرحله شاخه زایی نیز از محیط ms استفاده شد. تیمارهای هورمونی شامل bap در سه تیمار 1/0، 5/0 و 9/0 میلی گرم در لیتر و iba 5/0 و 1 میلی گرم در لیتر و naa با غلظت 1 میلی گرم در لیتر بود که در قالب یک طرح کاملاً تصادفی با 8 تکرار تجزیه واریانس انجام شد و سپس با آزمون دانکن میانگین ها در سطح 5% مقایسه گردید. نتایج به دست آمده نشان داد بهترین شاخه زایی با استفاده از bap با غلظت 9/0 میلی گرم در لیتر به دست می آید.در این تیمار میانگین شاخه زایی 143/9 بوده که در سطح 5% معنی دار شد. در مرحله ریشه زایی بهترین تیمار شامل naa با غلظت 1/0 میلی گرم در لیتر، و تیامین 6/1 میلی گرم در لیتر همراه با تاریکی به مدت 7 روز بود درجه حرارت در این مرحله 25 درجه سانتی گراد تنظیم شد و در این محیط کشت 80% موفقیت حاصل شد. در مرحله انتقال گیاهچه ها به خاک از ترکیب پیت 40% و ماسه 60% استفاده شد. در مراحل اولیه انتقال به خاک رطوبت محیط در حدود 90% بود و به تدرج کاهش یافت تا گیاهان به شرایط طبیعی سازگار شوند.

ارزیابی روابط خویشاوندی برخی ژنوتیپ های بومی شمال ایران با برخی از ارقام تجاری گلابی آسیایی ( pyrus pyrifolia nakai.) با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  رعنا معاضدی   محمد طاهر حلاجیان

گلابی آسیایی pyrus pyrifolia nakai از شرق آسیا منشأ گرفته است و عمدتاً در کشورهای جنوب شرقی آسیا کشت و کار می شود. گلابی های آسیایی دارای ویژگی های مهم از جمله میوه شیرین، ترد، آبدار، بافت کمتر سنگی و ماندگاری بالا در انبار نسبت به انواع گلابی اروپایی هستند. همچنین این ارقام از پتانسیل بالایی برای تولید میوه برخوردار هستند و امروزه مورد توجه تولیدکنندگان و مصرف کنندگان در سراسر دنیا قرار گرفته است. از جنگل های شرق گیلان (چابکسر) ژنوتیپ هایی یافت شده است که از نظر خصوصیات مورفولوژیک بسیار شبیه به گلابی آسیایی هستند. به علاوه در این ژنوتیپ ها صفات مهم و با ارزش زراعی از جمله اندازه ی درشت و کیفیت بالای میوه ملاحظه می شود. در این پژوهش برای ارزیابی روابط خویشاوندی این ژنوتیپ ها با ارقام تجارتی گلابی آسیایی (ks6, ks7, ks8, ks9, ks10, ks11, ks12, ks13, ks14)، از 11 نشانگر ریزماهواره استفاده شد. این نشانگرها در 19 ژنوتیپ مورد مطالعه جمعاً 56 آلل تولید کردند که به طور میانگین برای هر مکان ریزماهواره 5 آلل به دست آمد. کمترین و بیشترین تعداد آلل مشاهده شده به ترتیب 2 و 10 عدد بود. تجزیه خوشه ای به روش upgma، 19 ژنوتیپ مورد مطالعه را در سه گروه قرار داد. گروه اول شامل ژنوتیپ های 111 چابکسر، 24 چابکسر، قاسم نژاد، حاجی صادقی، حاجی مرادی، حاجی علیپور، حاجی بابایی، گروه دوم شامل ارقام تجارتی ks و گروه سوم شامل ژنوتیپ های سبز، آبی و ریز بود. بر اساس نمودار درختی ترسیم شده، گروه اول و دوم به عنوان گلابی های آسیایی و گروه سوم به عنوان هیبریدی از گلابی آسیایی و اروپایی شناخته شدند. نتایج حاصل از تحقیق حاضر می تواند تا حدودی نشان دهنده حضور گلابی آسیایی و یا خویشاوندان بسیار نزدیک آن در شمال ایران باشد و با توجه به یافته های حاصل لازم است اقدامات جدی برای حفاظت و ثبت ذخایر ژنتیکی با ارزش گلابی شمال ایران صورت گیرد.

بررسی تنوع ژنتیکی جو با استفاده از نشانگرهای ریز ماهواره و تجزیه ارتباط برای صفات وابسته به تحمل به تنش خشکی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1391
  وحیده گوگردچی   محمد علی ابراهیمی

بررسی تنوع ژنتیکی با استفاده از نشانگرهای مولکولی از گام های اولیه و مهم در برنامه های اصلاحی جو می باشد. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی70 لاین جو با استفاده از 68 جفت آغازگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت و 58 آغازگر الگوی نواری واضح و قابل امتیازدهی تولید کردند. در مجموع، 203 آلل چندشکل شناسایی گردید. تعداد آلل های چندشکل مشاهده شده از 2 تا 15 با میانگین آلل 08/4 به ازای هر جایگاه ژنی متغیر بود. میزان محتوای اطلاعات چندشکلی نیز بین 13/0 و 81/0 با میانگین 46/0 متغیر بود. لاین های جو مورد مطالعه با استفاده از تجزیه خوشه ای به 3 گروه و 6 زیرگروه تقسیم شدند که با نتایج حاصل از تجزیه به مولفه های هماهنگ اصلی همخوانی داشت. تجزیه واریانس مولکولی، نشان داد که اختلاف معنی داری بین زیرگروه ها وجود دارد. این اختلاف و نتایج گروه بندی لاین ها بر اساس دو روش ذکر شده را تایید کرد. بعلاوه، مقادیر شاخص تنوع ژنتیکی اطلاعات شانون، هتروزیگوتی مورد انتظار و درصد چندشکلی محاسبه شده در زیرگروه ها با یکدیگر مطابقت داشتند. براساس فاصله ژنتیکی نی، میانگین ماتریس فاصله و شباهت به ترتیب 108/0 و 898/0 بود. در این پژوهش، نشانگرهای ssr ارقام مورد مطالعه را به خوبی از یکدیگر تفکیک کنند. تجزیه ارتباط بین 5 صفت وابسته به تحمل به خشکی شامل روز تا خوشه دهی، روز تا پرشدن دانه، روز تا رسیدگی فیزیولوژیک، وزن هزار دانه، عملکرد با نشانگرهای ریزماهواره انجام شد و 38 نشانگر مثبت شناسایی گردید. همچنین، در تجزیه های تکمیلی مشخص گردید که هیچکدام از این نشانگرها، نشانگر مثبت کاذب (fpm) نبودند. شناسایی نشانگرهای مثبت می توانند شناسایی ارقام جو مقاوم به خشکی را تسهیل کرده و موجب صرفه جویی در وقت، هزینه و نیروی انسانی گردند.

آنالیز مولکولی بیواکوتیپ های گیاه دارویی درمنه با قابلیت تولید آرتمیزینین متفاوت با استفاده از نشانگر مولکولی اختصاصی sts
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده علوم کشاورزی 1390
  سحر توکلی محمدی   محمد طاهر حلاجیان

آرتمیزیا با نام علمی artemisia annua گیاهی علفی، معطر و یک ساله است که حاوی ماده دارویی آرتمیزینین می باشد. این دارو ضد مالاریا، ضد تب و ضد سلول های سرطانی است. گیاه آرتمیزیا به طور وسیعی در نواحی معتدل وجود دارد. به دلیل پایین بودن مقدار ماده آرتمیزینین در این گیاه، عدم موفقیت در ساخت شیمیایی این ماده و تأثیر ناچیز روش های اصلاحی رایج گیاهی، امروزه شناسایی بیواکوتیپ های با قابلیت تولید آرتمیزینین بالا با استفاده از نشانگرهای مولکولی اختصاصی، به استخراج بیشتر آرتمیزینین و ایجاد جمعیت گیاهی با محتوای آرتمیزینین بالا کمک می کند. بدین منظور، آنالیز و شناسایی 17 بیواکوتیپ درمنه با قابلیت تولید آرتمیزینین متفاوت با استفاده از تکنیک مولکولی sts انجام شد. پس از استخراج dna به روش دویل و همکاران، عملیات تکثیر با 11 جفت آغازگر اختصاصی مربوطه توسط pcr انجام و سپس فرآورده های تکثیر، روی ژل آگارز 5/1 درصد بارگزاری شدند. نهایتا، بیواکوتیپی که دارای توالی نوکلئوتیدی مکمل آغازگرهای ژن های مورد بررسی و حاوی بالاترین مقدار آرتمیزینین بود، شناسایی گردید. باندها با استفاده از فنوگرام خویشاوندی ژنتیکی حاصل از آنالیز کلاستر و نرم افزار ntsys مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفتند. نتایج نشان داد که جفت آغازگرهای aldh1، dbr2، amds و hmgr تنها در بیواکوتیپ های دارای آرتمیزینین بالا ایجاد باند نمودند. بیواکوتیپ 260 و 316 پس از انجام pcr تقریبا در تمامی ژن های مسیر بیوسنتزی آرتمیزینین، باندی را تکثیر نمودند که بیانگر منحصر به فرد بودن این دو بیواکوتیپ در بین بیواکوتیپ های مورد بررسی بود. با توجه به داده های مولکولی و hplc، می توان دریافت که بیواکوتیپ شماره 260 و 316 گزینه ای مناسب جهت کشت این گیاه در راستای تولید تجاری ماده دارویی آرتمیزینین می باشد.

شناسایی نهال های نوسلار و بذری پرتقال با استفاده از تکنیک مولکولی ssr
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده علوم کشاورزی 1390
  کتایون دباغ   محمد طاهر حلاجیان

بیش تر گونه های جنس citrus و برخی جنس های نزدیک در این خانواده تولید جنین نوسلار می کنند. دانهال های نوسلار مشابه والد مادری هستند. وجود چنین جنین هایی در کنار جنین حاصل از لقاح، منجر به پدیده چندجنینی می شود که هم زمان دو یا چند جنین در یک بذر توسعه می یابند. جنین نوسلار مانع بزرگی در اصلاح مرکبات محسوب می شود، هرچند با هدف ایجاد یکنواختی ژنتیکی در تولید پایه، ارزشمند و مفید است. استفاده از نشانگرهای ملکولی در بررسی های ژنتیکی ژنوتیپ ها و ژرم پلاسم در مرکبات برای تشخیص دانهال های حاصل از لقاح از دانهال های نوسلار ابزاری مهم تلقی می شوند. در این مطالعه نمونه های برگی 11 رقم مختلف مرکبات جمع آوری و پس از کاشت بذور این ارقام، از دانهال های ایجاد شده نیز نمونه برگی تهیه گردید. پس از استخراج dna از نمونه ها، pcr با 8 جفت آغازگر ریزماهواره ای انجام شد. محصولات تکثیر شده با استفاده از ژل پلی اکریلامید الکتروفورز شدند. نتایج نشان داد که 8 جفت آغازگر برای صفت نوسلار یا بذری بودن نهال ها در 9 رقم، چندشکلی نشان دادند. تعداد کل آلل ها در جمعیت 45 آلل و دامنه تعداد آلل بین 3-10 با میانگین 62/5 بود. 35 آلل برای صفت نوسلار یا بذری بودن چند شکل بودند. از بین آغازگرهای چندشکل، آغازگر taa41 بیش ترین تعداد آلل(10) و آغازگرهای taa27 و taa1 کم ترین تعداد آلل(3) را در ارقام مورد مطالعه نشان دادند. اهداف این رساله ایجاد نشانگرهای ریزماهواره مرتبط با نوسلار یا بذری بودن در مرکبات و استفاده از آنها برای تشخیص دانهال های بذری از نوسلار در برنامه اصلاح مرکبات می باشد.

مقایسه تنوع نشانگرهای مولکولی صفت اولین سن جستجوگری در زنبورهای عسل کارگر ایرانی با طول عمر کم و زیاد
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  زهرا طهماسبی   رحیم عصفوری

این تحقیق با هدف تعیین پلی مورفیسم جایگاه های ژنی کنترل کننده صفت اولین سن جستجوگری زنبورهای عسل ایرانی انجام گرفت.مراحل انجام تحقیق به طور خلاصه شامل موارد زیر می باشد: 1- انتخاب کلنی های با تولیدعسل بالا و طول عمر زیاد ونیز کلنی های با تولید عسل پائین و طول عمر کم از نسل دهم کلنی های طرح جامع زنبورعسل ایران. 2- ارزیابی طول عمر زنبورهای کارگر کلنی های با تولید عسل بالا و نیز کلنی های با تولید عسل پائین از طریق اندازه گیری نیمه عمر آن ها در انکوباتور با درجه حرارت 34 درجه سانتیگراد و رطوبت نسبی 50 درصد. 3- پرورش ملکه از کلنی با طول عمر کم- تولید کم.4- پرورش نر از کلنی با تولید عسل بالا - طول عمر زیاد. 5- تلقیح مصنوعی ملکه های فوق با نرهای مذکوربرای تاسیس نسل اول.6- شماره گذاری زنبورهای یکروزه.7- ارزیابی اولین سن جستجوگری در زنبورهای یکروزه.8- استخراج دی.ان.ای از زنبورهای مذکور.9- مراحل هضم آنزیمی و ای.اف.ال.پی. 10- امتیاز دهی از روی باندهای حاصل. 11- تحلیل داده های صفر ویک توسط نرم افزار جین الکس. 12- تعیین پلی مورفیسم جایگاه های ژن کنترل کننده صفت اولین سن جستجوگری. به طور کلی بیشترین مقدارشاخص شانون مربوط به جایگاهe3m2- 1 در جمعیت کم تولید و همچنین جایگاهe3m3- 4 در جمعیت پر تولید می باشد ، بنابراین این دو جایگاه بیشترین چند شکلی را نشان می دهند. کمترین مقدار شاخص شانون مربوط به جایگاه e6m3- 5 است ، بنابراین کمترین میزان چند شکلی در بین تمامی جایگاه ها مربوط به این جایگاه می باشد. کلید واژه: زنبورعسل- پلی مورفیسم- ای.اف.ال.پی. - اولین سن جستجوگری

تولید پروتئین نوترکیب lin28
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1390
  لیدا حبیبی رضایی   قاسم حسینی

امروزه فناوری تولید پروتئین های نوترکیب جهت تولید پروتئین های به لحاظ بیولوژیک ارزشمند در مقیاس زیاد و قابل تخلیص به کار می رود. عملکرد پروتئین lin 28، به عنوان یک فاکتور رونویسی نقش مهمی در پرتوانی سلول های بنیادی و زمان بندی تکامل دارد. تولید این پروتئین با هدف کاربرد آن در دانش سلول های بنیادی، هدف این مطالعه قرار گرفت. در این تحقیق در ابتدا ژن پروتئین lin 28 انسانی از سلول های بنیادی جنینی جداسازی شد. در ادامه با استفاده از سیستم همسانه سازی gatewayدر وکتور بیانی pdest 17همسانه سازی شد. جهت ایجاد قابلیت ورود به سلول برای پروتئین نوترکیب حاصل، hiv tat tagبه توالی این ژن اضافه شد. وکتورنوترکیب حاوی ژن مورد نظر وارد باکتری escherichia coli سویه rosetta (de3) گردید و پروتئین نوترکیب در این باکتری بیان و تخلیص شد. این پروتئین با داشتن نشان هیستیدین با استفاده از کروماتوگرافی تمایلی تخلیص گردید. پروتئین تخلیص شده، تعیین غلظت و به دو صورت محلول و لیوفیلیزه برای استفاده آماده گردید. نتایج نشانگر تولید موفقیت آمیز پروتئین نوترکیب lin 28 انسانی در مقیاس محدود بود. کلمات کلیدی: پروتئین نوترکیب، lin28، ips

بررسی کشت این ویتروی rhus coriaria
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - پژوهشکده بیوتکنولوژی 1390
  بهروز پورداد   محمد علی ابراهیمی

تکنیک این‎ویترو در چند دهه اخیر، موضوع تحقیقات گسترده‎ای بوده است بویژه برای گیاهانی که رشد و تکثیر طبیعی آنها مشکل می‎باشد. سماق متعلق به خانواده آناکاردیاسه (تیره پسته) و گونه خودروی جنس رهوس در ایران است. قوه نامیه بذر سماق بسیار کم بوده و در طبیعت بصورت پاجوش تکثیر می‎گردد. در این تحقیق بهترین محیط باززایی و ریشه‎زایی در شرایط این‎ویترو مورد بررسی قرار گرفت. ریزنمونه‎های جوانه شاخه‎های گیاه سماق بعد از سترون‎‎سازی به محیط کالوس‎زایی منتقل شدند. کالوس‎زایی با استفاده از محیط ms با ترکیب هورمون‎های مختلف iaa ba , bap , tdz ,iba مورد بررسی قرار گرفت. نتایج نشان داد که حداکثر کالوس‎زایی و باززایی روی ترکیب هورمونی 5/0 میلی‎گرم در لیتر iaa و یک میلی‎گرم در لیتر ba بدست می‎آید و کمترین کالوس‎زایی و باززایی در غلظت 1/0 میلی‎گرم در لیتر iaa و 5/1 میلی‎گرم در لیتر ba رخ داد که به‎ترتیب 60% و صفر درصد بودند. جهت تعیین بهترین محیط ریشه‎زایی با ترکیب هورمونی مناسب از محیط ms بصورت کامل، نصف و یک‎چهارم به‎همراه هورمونهای naa , iba , iaa و بدون هورمون استفاده شد که تفاوت معنی‎داری در ریشه‎زایی مشاهده گردید، بطوریکه بیشترین ریشه‎زایی در محیط ms کامل با غلظت 1 میلی‎گرم در لیتر iba و کمترین ریشه‎زایی در محیط نصف ms با غلظت 8 میلی‎گرم در لیتر iaa رخ داد که به ترتیب 5/44% و 66/2% بودند. بهترین محیط تیمارزایی جهت انتقال به محیط ریشه‎زایی، محیط تیمارزایی با غلظت 5/0 میلی‎گرم در لیتر iaa و یک میلی‎گرم در لیتر ba بود. تفاوت معنی‎داری در غلظت یک میلی‎گرم در لیتر و 5 میلی‎گرم درلیتر iba در تعداد ریشه و طول آن مشاهده شد. در غلظت 5 میلی‎گرم درلیتر iba افزایش تعداد ریشه و کاهش طول ریشه رخ داد که افزایش تعداد ریشه 6/3 عدد بود. همچنین آزمایشی جهت بررسی اثر استفاده از محیط جامد و مایع انجام شد و تفاوت معنی‎داری مشاهده گردید، و بیشترین ریشه زایی در محیط جامد به‎میزان 83/44% انجام شد.

القای پرآوری شاخساره و ریشه زایی در محیط این ویترو به منظور ریزازدیادی juniperus polycarpos c.koch
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی 1391
  رویا سادات رضوی   حسن عسکری

ارس یا سرو کوهی با نام علمی juniperus.polycarpos یکی از چهارگانه سوزنی برگان بومی ایران است در ارتفاعات بالای 2500 متری بین صخره ها می روید. اکثر این درختان جهت ادامه حیات با مشکل درصد بالای پوکی بذر، کاهش قوه نامیه و پوسته محکم روبرو بوده که از جمله موانع زادآوری طبیعی در ارسستان ها می باشد. به همین دلیل در این پروژه جهت رویاندن بذر ارس روشی ابداع گردیده است که می تواند باعث رویش بذوری که با چنین مشکلی روبرو هستند گردد. در این آزمایش از محلول های محرک رشد در 6 تیمار و هر تیمار در 3 تکرار انجام شد که بهترین نتیجه با تیمار محلول های محرک رشد آب اکسیژنه (1%)، دی متیل سولفوکسید و جیبرلیک اسید (01/0%) به دست آمد. همچنین در آزمایشگاه های کشت بافت برای ضد عفونی نمونه های مورد استفاده از محلول های ضد عفونی کننده کلرور جیوه و یا قارچ کش بنومیل به طور معمول استفاده می گردد که علاوه بر اینکه برای انسان مضر بوده و سرطان زا می باشند از طرفی برای سلامتی محیط زیست مضر بوده و همچنین بر روی رشد گیاه نوعی عامل بازدارنده محسوب می گردند به همین دلیل در پروژه دوم، از محلول های ضد عفونی کننده ای استفاده گردیده که نه تنها برای انسان خطری ندارند و نیز برای سلامتی محیط زیست بلکه به عنوان عوامل محرک رشد گیاه نیز محسوب می گردد. این آزمایش در 9 تیمار و هر تیمار در 3 تکرار صورت گرفت که بهترین محلول های ضد عفونی کننده کاربردی بدین ترتیب بدست آمد: هیپوکلریت سدیم، الکل 76 درجه + پوویدون آیوداین (1%)، دی متیل سولفوکسید، جیبرلیک اسید (01/0%)، آب اکسیژنه (1%). همچنین درپروژه سوم، مقایسه میزان رشد و افزایش شاخساره و ریشه زایی سرشاخه های ابتدایی و انتهایی دو پایه نر و ماده j.polycarpos در دو فصل رویشی زمستان و تابستان مورد بررسی قرار گرفت. از آنجا که تکثیر رویشی گیاهان به دلیل آسان و راحت تر بودن تکثیر، گزینش و نگهداری کلون ها، کوتاه کردن زمان رشد زایشی، کنترل مراحل رشد و ریخت شناسی نسبت به تکثیر زایشی گیاهان مزیت دارد، از طرفی طولانی بودن زمان گرده افشانی و عمل باروری (لقاح)، پوکی بذر، دو پایه و بندرت تک پایه بودن، همزمان نبودن انتشار گرده و باز شدن تخمک، طولانی بودن دوره خواب بذر، تکثیر زایشی ارس دشوار است، همچنین کشت جنین یا لپه بسیار پر هزینه است. در تکثیر جنسی، ژنتیک صد درصد وابسته به پایه مادری است. زیرگونه های با فنوتیپ خوابیده مثل j.sabina و j.communis به دلیل تولید ریشه نابجا خود به خود قادر به تکثیر غیرجنسی است. با توجه به موارد ذکر شده تکثیر غیرجنسی گونه ارس j.polycarpos با فنوتیپ ایستاده به روش کشت بافت می تواند روشی مناسب باشد. نتایج حاصل از این پروژه بدین ترتیب می باشد: بیشترین افزایش شاخساره با هورمون ba با غلظت های 10 و 25 میلی گرم بر لیتر به تنهایی و به صورت ترکیب با هورمون های naa وiba به غلظت های 5 ،1، 5/0 میلی گیرم بر لیتر بود. کمترین شاخه زایی با هورمون ba به تنهایی و به صورت ترکیب به غلظت 5 میلی گرم بر لیتر بود. ترکیبba با2,4-d کمترین میزان تاثیر را داشت. غلظت 5 میلی گرم بر لیتر naa و به صورت ترکیب با هورمون های iba بیشترین ریشه زایی، iba کمترین میزان ریشه را تولید کرد و 2,4-d کمترین تاثیر را نشان داد. شاخه زایی در سر شاخه های ابتدایی پایه نر نسبت به سرشاخه های ابتدایی پایه ماده بیشتر مشاهده گردید. افزایش شاخه از لحاظ طول و تعداد، در سرشاخه های ابتدایی پایه نر نسبت به سرشاخه های انتهایی آن بهتر و بیشتر ایجاد گردید. ریشه زایی در سر شاخه های انتهایی پایه ماده نسبت به سر شاخه های انتهایی پایه نر بیشتر مشاهده گردید. افزایش ریشه از لحاظ طول و تعداد، در سر شاخه های انتهایی پایه ماده نسبت به سر شاخه های ابتدایی آن بهتر و بیشتر ایجاد گردید. زمان نمونه گیری ریزنمونه ها در دو فصل رویشی تابستان و زمستان (دیماه و مرداد ماه) در القای ریشه زایی تاثیر چندانی نداشت . القای ریشه زایی در دو فصل نسبتا یکسان بود. اما در القای شاخه زایی، زمان نمونه گیری در مرداد ماه نتایج مناسب تری بدست آمد.

ارزیابی اثر فیتوتوکسین های میکروبی روی دو گونه علف هرز تاج خروس و سلمک
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  رعنا نصیری   علی محمد لطیفی

در زمینه کشاورزی، علف های هرز به عنوان یک معضل جدی تلقی می شوند. به منظورمهار و یا کاهش رشد و گسترش علف های هرز، امروزه از روش کنترل بیولوژیکی، استفاده می شود. در این تحقیق، به منظور کنترل زیستی علف های هرز، علف های هرز تاج خروس و سلمک انتخاب شده و در شرایط آزمایشگاهی (در محیط کشت ms و(b5 و شرایط گلخانه ای کشت داده شدند. 9 گونه قارچی توانمند در تولید فیتوتوکسین انتخاب و کشت داده شدند. از بین 9 سویه قارچی که از مناطق مختلف ایران گردآوری، شده بودند، سویه sprd بر روی گیاه سلمک (ch-a) و سویهqap1 بر روی گیاه تاج خروس am-r)) بهترین تاثیر را از خود نشان داده و باعث پژمردگی و نکروزگی و در نهایت باعث مرگ گیاه شدند. قارچهای مزبور در محیط چاپکس داکس مایع با 1% گاز آمینو اسید در دمای0c 28 و با دور rpm 150 به مدت 10 روز و با ph6 کشت داده شدند. در این محیط نیترات سدیم به عنوان منبع نیتروژن و ساکارز به عنوان منبع کربن به کار برده شد. ml2 سوپرناتانت با 20 لاندا توئین بر روی سلمک و تاج خروس اسپری شد. از بین 9 سویه، محلول رویی اثربخش ترین سویه ها یعنیsprd و qap1 مورد سنجش پروتئین قرار گرفتند و محلول رویی بر اساس روشهای برادفورد، نانودراپ، تغلیظ پروتئین با استفاده از سولفات آمونیوم و دیالیز و بالاخره sds-page بررسی شد. نتیجه حاکی از این بود که فیتوتوکسین حاصل ازsprd غیر پروتئینی می باشد، اما فیتوتوکسین حاصل از qap1 پروتئینی می باشد.

بررسی تعداد و تنوع برخی باکتری های بیماری زا در کشت های نیمه انبوه ریز جلبک اسپیرولینا در دوره های زمانی مختلف کشت در جزیره قشم
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  سکینه نجفی   محمد علی ابراهیمی

برای این که از ریز جلبک اسپیرولینای به دست آمده در جزیره قشم در تولید غذای سالم استفاده شود نیاز به بررسی میکروبیولوژی محصول وجود دارد که باکتری های بیماری زای برخی از اعضای خانواده آنتروباکتریاسه شامل : جنس های اشریشیاکلی ، کلبسیلا ، انتروباکتر آئروجنز و سیترو باکتر ( اعضای گروه کلی فرم ) ، شیگلا ، سالمونلا و کلاستریدیوم پرفرینجنس مورد تجزیه و تحلیل میکروبیولوژی واقع شده است . ml 50 اسپیرولینا را از 5 حوضچه پرورش اسپیرولینا که به طور تصادفی از جامعه آماری 20 حوضچه ای در دو ماه شهریور و آذر برداشت کرده ایم در محیط کشت های باکتری که به طور تجاری تهیه شده و در مزارع اسپیرولینا شهر مالاگا در جنوب اسپانیا نیز استفاده شده است ؛ کشت می دهیم که برای سنجش میزان کلی باکتری ها از محیط نوترینت آگار ، برای شناسایی وجود تمامی کلی فرم ها از محیط سبز درخشان لاکتوز براث ( bgbl ) و برای تأیید وجود یا عدم وجود کلی فرم و شناسایی کلنی های مربوطه از levine-embآگار ، شناسایی کلاستریدیوم پرفریجنس از محیط sps آگار و برای شناسایی باکتری سالمونلا از محیط کشت غنی کننده ی سالمونلا براث - راپاپورت استفاده کرده تا سالمونلا در صورت وجود ، غنی سازی شود و برای تشخیص مثبت بودن باکتری سالمونلا در این محیط از نوترینت آگار و levine-embآگار بهره گرفته شده است . روش های آزمایشگاهی مطابق با روش های کتاب های باکتری شناسی است . جواب کلیه آزمایش های صورت گرفته برای این باکتری های بیماری زا ، منفی بود که نشان دهنده عدم وجود آن ها در کشت های ریز جلبک اسپیرولینا است .

بررسی اثر اسید سالسیلیک روی کاهش بیماری زائی ویروس x در دو رقم سیب زمینی مارفونا و آگریا
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  فاطمه سادات حسینی   غلامرضا بلالی

چکیده در این تحقیق اثر سالیسیلیک اسید به منظور کاهش بیماری زایی ویروس x سیب زمینی بر روی میزان کلروفیل a و سطح برگ و سایر صفات رویشی دو رقم سیب زمینی (آگریا و مارفونا) در شرایط گلخانه ای بررسی گردید. گیاهچه هائی که عاری از عوامل بیماریزا بودند تکثیر شده و گیاهچه های رشد کرده به گلدان ها با خاک مناسب و استریل منتقل گردیدند. گیاهچه ها با غلظت های صفر (شاهد)، 2/0، 5/0، 1 و 2 میلی مولار سالیسیلیک اسید مورد تیمار قرار گرفتند. عصاره فعال برگ تنباکوی رقم تامسون آلوده به ویروس x سیب زمینی برای آلوده سازی گیاهان سیب زمینی به کار رفت. علائم آلودگی ویروس x سیب زمینی بر روی برگ های گیاهان آلوده نسبت به گیاهان شاهد در دو رقم آگریا و مارفونا خیلی مشهود نبود ولی بر روی برگ گیاهان تنباکو آلوده با لبه های کنگره ای آن شناخته می شد. همچنین نتایج نشان داد که تیمار سالسیلیک اسید با غلظت 5/0 تا 1 میلی مولار باعث کاهش 26 درصد خسارات ناشی از ویروسx سیب زمینی می گردد. علاوه براین به نظر می رسد که رقم مارفونا نسبت به رقم آگریا از مقاومت بیشتری نسبت به ویروس x سیب زمینی برخوردار باشد. واژهای کلیدی: سیب زمینی، سالیسیلیک اسید، ویروس x

طراحی ساختاری آنالوگ های پایدار آلیسین و بررسی میانکنش آن با آنزیم گلوتاتیون s- ترانسفراز و آنزیم های گروه سیتوکروم p450
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  نداسادات واقفی نژاد   مصطفی قادری زفره ای

سیر با نام علمی allium sativa گیاهی از راسته مارچوبه ای ها (asparagales) است .ترکیبات عمده حاوی سولفور در سیر سالم، سولفوکسیدهای ?-گلوتامیل-s-آلیل-l-سیستئین و s-آلیل-l-سیستئین است که از طریق واکنش های آنزیمی در هنگام برش یا خرد شدن سیر به تیوسولفینات ها تبدیل می شوند. تحقیقات علمی اخیر نشان داده اند که ترکیبات موجود درallium خطر ابتلا به بیماری های قلبی-عروقی و دیابت را کاسته و همچنین در تحریک سیستم ایمنی، محافظت در برابر عفونت ها، مقابله با پیری و سرطان موثر است. براساس مطالعات مختلف اعتقاد عمومی بر این است که ترکیبات سولفوره آلی سیر سبب ایجاد نوسان در فعالیت گلوتاتیون-s-ترانسفراز و سیتوکروم p450 می شوند. آلیسین ترکیبی ناپایدار است که به سرعت به منو، دی، تری و پلی سولفیدها، اکسید سولفور و سایر ترکیبات مانند آجون تبدیل می شود. به علت این ساختار ناپایدار گروه های جدید آلیل تیو طراحی شده اند. به منظور دستیابی به ترکیبات مشابه آلیسین با خاصیت پایداری و ضد سرطانی به شبیه سازی مولکولی و محاسبه ی انرژی داکینگ لیگاند با آنزیم های ستوکروم 450p و آنزیم gst از محیط مجازی استفاده شد. در این مطالعه از پایگاه های بیوانفورماتیک pdb(بانک اطلاعاتی پروتئین)، zinc و نرم افزارهای chembiooffice ultra ، autodock vina ، autodock4/2 ، arguslab4/0 استفاده شد. مولکول هایی با شباهت ??-??% نسبت به ترکیبات سولفوره آلی سیر، با مختصات سه بعدی از سایت zinc که یکی از پایگاه های اطلاعات برای آزمایش مجازی است، دریافت شدند. سپس کتابخانه ی مجازی باحدود ???? مولکول ایجاد شد و انرژی پیوند آن ها با 5 آنزیم مورد نظر توسط نرم افزارهای autodock vina ، autodock4/2 محاسبه و همچنین انرژی داکینگ مولکولی ترکیبات سولفوره آلی سیر با 5 آنزیم مورد نظر با سه نرم افزار autodock vina ، autodock4/2 ، arguslab4/0 محاسبه و نتایج از نظر مراحل کار، مقدار انرژی و مدت زمان اجرای داکینگ با هم مقایسه گردید. با توجه به نتایج به دست آمده، نزدیک بودن مقدار انرژی پیوند آلیسین و همچنین سایر ترکیبات سولفوره آلی سیر با هر یک از 5 آنزیم نشان می دهد که این ترکیبات روی هر 5 آنزیم اثرگذار است. ترکیبات شبه آلیسینی آروماتیک که دارای حلقه آروماتیک شش ضلعی با یک زنجیره جانبی گوگرددار هستند دارای حداکثر انرژی پیوند می باشند. ترکیبات دارای ازت (n) و اکسیژن (o) نیز دارای انرژی پیوند بالاتری نیز هستند که احتمالا به علت افزایش پیوند هیدروژنی این لیگاندها با مولکول گیرنده می باشد.

برسی تنوع ژنتیکی توتونهای شرقی ایران با استفاده از نشانگرهssr
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده علوم کشاورزی 1391
  داریوش احمدی   رضا درویش زاده

توتونهای شرقی ٍتجزیه خوشه ای تنوع ژنتیکیٍٍٍٍ ٍنشانگره ssr

بررسی تولید اسانس و ترکیبات فنولیک در سه ژنوتیپ از گونه نعناع سبز(mentha spicata) از طریق تحریک با قارچ میکوریز آربسکولار
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  سمانه باقری   محمد علی ابراهیمی

نعناع سبز (mentha spicata l.) گیاهی دارویی، یکی از 25 گونه جنس منتا و متعلق به خانواده لامیاسه است. این گیاه به دلیل دارا بودن روغن فرار و محصول شاخ و برگ آن از لحاظ تجاری محصولی مهم محسوب می شود. متابولیت های ثانویه موجود در این گیاه شامل ترکیبات آروماتیک (روغن فرار و سایر ترپنوئیدها) و آلیفاتیک (فنولیک ها) می باشد. امروزه استفاده از قارچ های میکوریز آربسکولار به عنوان کودهای زیستی، جهت افزایش تجمع متابولیت های ثانویه در گیاهان گسترش یافته است. در این تحقیق، مطالعه دو گونه از قارچ مایکوریز آربسکولار glomus etunicatum و g. mosseae برای تعیین اثرات تلقیح بر میزان رشد و تجمع متابولیت های ثانویه سه ژنوتیپ از نعناع سبز (اصفهان، کرمانشاه و یزد) صورت گرفت. جهت انجام تلقیح از 20 گرم مایه تلقیح هر دو گونه قارچی استفاده و پس از گذشت یک دوره رشد سه ماهه، میزان رشد، جذب عناصر غذایی و انباشتگی متابولیت های ثانویه بررسی شد. نتایج حاکی از آن بود که قارچ های میکوریز در تلقیح با گیاهان نعناع سبز منجر به بهبود رشد (وزن تر، خشک و طول اندام هوایی)، افزایش جذب عناصر غذایی (فسفر، سدیم، پتاسیم، روی و منگنز)، تجمع متابولیت های ثانویه (ترکیبات فنولیک کل، آنتوسیانین و اسانس) و افزایش فعالیت آنزیم فنیل آلانین آمونیا لیاز شده است. افزایش غلظت ترکیبات فنولیک کل و اسانس در این گیاهان به واسطه بهبود وضعیت تغذیه (افزایش جذب عناصر غذایی فسفر، سدیم، پتاسیم، روی و منگنز) در آن ها است. همچنین ارتباط بسیار بالایی میان میزان کلروفیل و بیوماس اندام هوایی با میزان اسانس گیاهچه های هر سه ژنوتیپ مشاهده شد، که نشان دهنده رابطه میان میزان فتوسنتز که متابولیسم اولیه گیاه است و تولید اسانس در نتیجه متابولیسم ثانویه، می باشد. مطابق نتایج این مطالعه استفاده از قارچ های میکوریز آربسکولار به عنوان یک مکمل در جهت بهبود رشد و افزایش متابولیت های ثانویه در گیاهان دارویی مانند نعناع جایگاه مهمی را دارا می باشد

بررسی میزان منتول و ارتباط فیلوژنتیکی آن در برخی گونه‏ های خانواده نعناعیان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1391
  حامد میرزایی   محمد علی ابراهیمی

خانواده نعناع(lamiaceae) این خانواده دارای 200 جنس و 3300 ‏گونه است و معمولأ دارای اسانس می باشند. از آنجا که منتول یکی از اساسی ترین اسانس ها در خانواده نعناعیان می باشد تعیین میزان منتول و روابط فیلوژنتیکی بین گونه ‏های موجود می تواند به نحوی در افزایش تولید آن موثر باشد. . در این تحقیق میزان اسانس و منتول گونه‏های mentha canadensis، mentha piperita، mentha spicata ، salvia sclareaاندازه گیری شد و با استفاده از توالی‏های ژن منتول دهیدروژناز موجود در بانک ‏های اطلاعاتی درخت فیلوژنتیکی آن ترسیم شد. میزان اسانس و منتول در گونه mentha spicata بیشترین مقدار و در salvia sclarea کمترین مقدار بود. ترسم درخت ژنتیکی از کل توالی ‏های منتول دهیدروژناز موجود در بانک ‏های اطلاعاتی که شامل گونه ‏های مورد مطالعه نیز بود دو گروه را به نمایش گذاشت. گروه اول شامل 4 گونه مورد بررسی بود که این نیز خود به سه گروه تقسیم شده است. و گروه دوم شامل گونه ‏های جنس micromaria بود. تجزیه فیلوژنتیکی نشان داد میزان محتوی اسانس و منتول در ارتباط با توالی ژنی می باشد و دارای رابطه ی فیلوژنتیکی می باشد. دو گونه ی mentha spicata و mentha piperita که در یک گروه در دندروگرام قرار گرفتند دارای بیشترین میزان محتوی منتول و اسانس می باشند و گونه ی salvia که در یک گروه جدا و در فاصله ی دورتر قرار دارد دارای کمترین میزان محتوی منتول و اسانس بود. بنابراین روابط فیلوژنتیکی موجود در بین گونه ها می تواند در میزان محتوی اسانس و منتول اثر گذار باشد.

شناسایی ژن های مقاومت به زنگ سیاه گندم در گندم های بومی گیلان موجود در بانک ژن گیاهی ملی ایران
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  بهاره خادمیان   احمد عباسی مقدم

چکیده گندم مهم ترین محصول کشاورزی ایران است و زنگ سیاه گندم با عامل پوکسینیا گرامینیس ، از خطرناک ترین بیماری های گندم محسوب می شود. این بیماری با استفاده از ژن مقاومت sr31 سالیان متمادی کنترل می شد تا سال 1378 که نژاد جدیدی از آن با نام ug99 در اوگاندا شناسایی شد و برای ژنsr31 بیماری زایی داشت و محصول جهانی گندم را مورد تهدید قرار داد. ظهور ug99 در یمن و ایران گزارش شده است. بنابراین یافتن منابع مقاومت نسبت به این بیماری و به خصوص نژاد ug99 ضروری است. در این تحقیق 50 نمونه ژنتیکی گندم بومی استان گیلان موجود در کلکسیون گندم بانک ژن گیاهی ملی ایران دریافت گردید و مقاومت آن ها نسبت به زنگ سیاه گندم مورد ارزیابی قرار گرفت. بدین منظور جدایه ای از قارچ زنگ سیاه از واحد پاتولوژی بخش غلات موسسه تحقیقات، اصلاح و تهیه نهال و بذر دریافت شد و پس از خالص سازی، تکثیر و استفاده شد. جدایه مذکور که از دشت آزادگان جمع آوری شده بود به دلیل قدرت بیماری زایی بروی sr31 مشابه نژادug99 انتخاب شد. نمونه های ژنتیکی بومی، همراه با رقم بولانی به عنوان شاهد حساس و 45 ایزولاین افتراقی دریافتی از ایکاردا، در گلخانه کشت گردیدند. گیاهچه های هفت روزه ارقام و لاین-های مورد آزمایش با سوسپانسیون یوردیوسپورهای زنگ سیاه درمرحله برگ اول درگلخانه مایه زنی مصنوعی شد و در اتاقی تاریک با بیش از 80% رطوبت نسبی، دمای ?c 18 برای 16 ساعت نگهداری شدند. سپس گیاهچه ها به گلخانه با دمای ?c25-20 و 16 ساعت روشنایی منتقل شدند. پس از 14 روز تیپ آلودگی گیاهچه ها بر اساس روش مک اینتاش و همکاران، 1995 با مختصر تغییرات یادداشت برداری شدند. تیپ های آلودگی0 - 2 مقاوم و 3 - 4 حساس گزارش شدند. مشخص شد که جدایه مورد بررسی بر روی ژن های sr22, sr25, sr36 بیماری زا نبود. نمونه های ژنتیکی بر اساس تیپ آلودگی، به سه گروه مقاوم، نیمه مقاوم و حساس تقسیم شدند. در گروه مقاوم 9 نمونه ژنتیکی قرار گرفت. رقم شاهد (بولانی) از همه حساس تر بود. از برگ های تازه و سالم 14 نمونه ژنتیکی که کمترین تیپ آلودگی را نشان دادند، استخراجdna صورت گرفت و ژن های مقاومت sr22 ، sr25 ، sr36 وsr39 با استفاده از نشانگرهای مولکولی اختصاصی در آن ها ردیابی شد. حضور ژن مقاومت sr22 در 7 ژنوتیپ، ژن sr25 در 8 ژنوتیپ، ژن sr36در 6 ژنوتیپ و ژن sr39 در 3 ژنوتیپ تایید شد. از این نمونه های ژنتیکی مقاوم می توان در مقابله با همه گیری زنگ سیاه گندم در برنامه های اصلاح ارقام استفاده نمود. کلمات کلیدی: زنگ سیاه گندم، نمونه های ژنتیکی گندم بومی استان گیلان، بانک ژن گیاهی ملی ایران، ژن های مقاومت sr22، sr25، sr36 و sr39، نشانگرهای مولکولی ssr.

غربالگری و جداسازی پروتئاز باکتریایی گرمادوست بعنوان مکمل تغذیه دام و طیور
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  مصطفی امیری بهرامی   ارسطو بدویی دلفارد

چکیده پروتئازها پرمصرف ترین آنزیم های صنعتی می باشند که حدود 60 درصد از فروش بازار جهانی آنزیم را به خود اختصاص داده و دارای کاربردهای متنوعی در صنایع غذایی، دارویی، شوینده ها و موارد دیگر می باشند. در این تحقیق از چشمه آب گرم نمونه برداری شد و باکتری های مولد پروتئاز روی محیط اختصاصی (skm)کشت داده شد و غرباگری گردید. در حضور سوبسترای کازیین نیز تحت مطالعات آنزیمی قرار گرفت. نتایج حاصل از تطبیق و درخت فیلوژنتیکی نشان دادند که گونه فوق به گونه bacillus niacini نزدیک می باشد. مطالعات آنزیمی نشان داد که این آنزیم در گستره دمایی90-20 درجه سانتی گراد فعالیت پروتئازی دارد که بیشترین آن در دمای °c 60 گزارش می شود. بیشترین فعالیت پروتئازی نیز در محدوده ph های 8-9 و بیشترین پایداری در 9ph گزارش می شود. نتایج خاطر نشان می سازد که فعالیت پروتئازی در حضور حلال های آلی متانول، تولوئن و dmf بیش از نمونه کنترل فاقد حلال است. در حضور سایر حلال ها نیز میزان فعالیت آنزیمی باقی مانده بیش از 60 درصد می باشد. قابلیت های گرما دوست بودن، فعالیت در ph های قلیایی و پایداری در حضور حلال های آلی این پروتئاز اهمیت قابل توجهی برای استفاده در صنایع مختلف را داراست.

تولید کالوس از گونه بومی onosma ایران و بررسی عوامل فیزیکی و شیمیایی موثر بر رشد کالوس
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  سمانه باقری   فروغ سنجریان

گونه ی onosma dasytrichum گیاه دارویی مهم متعلق به خانواده ی گل گاوزبان است. علاوه بر خواصّ درمانیِ وسیعی که برای جنس onosma برشمرده شده است (از جمله، داروی التیام بخش بافت های زخمی و سوختگی ها)، این گیاه منبع متابولیت های ثانویه نظیر ترکیبات آنتی اکسیدان، ضدّالتهاب، ضدّ میکروبی و ترکیباتی دیگر نظیر شیکونین و روغن های فرّار است که در صنایع دارویی، آرایشی و بهداشتی قابل استفاده است. از اهداف این تحقیق، نخست بهینه سازی کشت بافت گونه onosma dasytrichum می باشد. از آن جا که تکنیک کشت بافت پیش زمینه بسیاری از کارهای مهم مانند کشت تعلیقی، مطالعات بیوسنتزی و بیوشیمیایی، مهندسی متابولیک، استحصال و بهبود گیاهان تراریخت و ... می باشد، راه اندازی و بهینه سازی کشت بافت به منظور رسیدن به حداکثر توده زیستی از گیاهان وحشی که مصارف دارویی و صنعتی دارند، حائز اهمیت است. هدف دیگر، بررسی حفظ ثبات ژنتیکی در محیط کشت درون شیشه ای این گیاه و تلاش برای القای تولید رنگدانه ی شیکونین توسط سلول ها و تأثیر عوامل مختلف بر میزان تولید این ماده می باشد. در این تحقیق، تیمارهای مختلفی، مانند تیمارهای هورمونی ]2 نوع(d-2،4 و -t2،4،5) هرکدام 3 دوز (2/0 و 5/0 و1 میلی گرم در لیتر)[، غلظت منبع کربنی ]4 مقدار(30 و 40 و 50 و 60 گرم در لیتر)[، تیمار محیط کشت ]6 نوع(ms ، ls ، mg-5 ، m9 ، white ، b5)[ و تیمار فیزیکی (حضور و عدم حضور نور) بررسی گردید. از طرح آماری فاکتوریل، برای انجام آزمایش ها استفاده و نتایج به دست آمده با نرم افزار spss و برنامه ی anova، تجزیه آماری شده و میانگین های صفت مورد بررسی، با آزمون دانکن در سطح احتمال 05/0p? مقایسه گردید. نتیجه ی حاصل بدین ترتیب بود که محیط کشت mg-5 با میزان ساکارز 50 گرم در لیتر با تیمار هورمونی d-2،4 به میزان 2/0 و kin به مقدار 15/2 میلی گرم در لیتر بوده که در شرایط تاریکی بالاترین رشد را در کالوس های گونه ی تحت بررسی نشان داد. در کشت تعلیقی، محیط کشت ms حاوی هورمون های d-2،4و kin به ترتیب و به میزان 2/0 و 15/2 میلی گرم در لیتر و با ساکارز 40 گرم در لیتر توصیه می شود.

بررسی امکان باززایی گیاه گوجه فرنگی (lycopersicon esculentum mill.) با استفاده از تکنیک کشت بافت گیاهی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1392
  زهرا خلیلی   محمود اطرشی

گیاه گوجه فرنگی با نام علمی lycopersicon esculentum miller. گیاهی علفی یک ساله متعلق به خانواده سیب زمینی می باشد که با میانگین تولید بیش از 6.8 میلیون تن در سال 2011 به عنوان یک گیاه مهم از نظر اقتصادی و بعد از گندم، دومین محصول کشاورزی ایران می باشد. این گیاه به صورت بسیار گسترده به عنوان سبزی تازه یا چاشنی و در صنایع غذایی، دارویی، آرایشی و صنعتی بکار می رود. ارزش غذایی گوجه فرنگی بسیار بالا بوده و سرشار از ویتامین های مختلف (a، c و e) و مواد معدنی است. گوجه فرنگی دارای انواع آنتی اکسیدان-های طبیعی و چند نوع رنگدانه از خانواده کارتنوئیدها از جمله بتاکاروتن است. لیکوپن، کارتنوئید اصلی گوجه فرنگی بوده و 78 تا 93 درصد کارتنوئید گوجه فرنگی را تشکیل می دهد. اهمیت و ضرورت کشت بافت رقم های مختلف گوجه فرنگی به دلیل ویژگی های منحصر به فرد این گونه برای سایر فعالیت های دست ورزی ژنتیکی از جمله تولید واکسن خوراکی می باشد. ریز ازدیادی در شرایط آزمایشگاهی مبنای مهندسی ژنتیک به شمار می آید. علاوه بر این، از آنجا که روش تکثیر این گیاه از طریق بذر بوده و تکثیر گوجه فرنگی در ایران از طریق کاشت بذور وارداتی با قیمت بالا و محدودیت های متفاوت، صورت می گیرد؛ ضرورت استفاده از تکنیک کشت بافت به عنوان روشی سریع و زود بازده و غیر وابسته به ژنوتیپ، به منظور تولید و تکثیر این گیاه افزایش می یابد. تحقیق حاضر با هدف بهینه سازی ریزازدیادی گوجه فرنگی از طریق تکنیک کشت بافت و به صورت 4 آزمایش فاکتوریل مجزا با طرح کامل تصادفی و چهار تکرار در سه مرحله به اجرا درآمد. مرحله اول: در باززایی مستقیم ترکیبات هورمونی بدست آمده از سه نوع سایتوکینین bap، kin و zea در ترکیب با دو نوع اکسین naa و iaa و ریزنمونه های هیپوکوتیل، کوتیلدون و برگ استفاده شد. مرحله دوم: در مرحله ساقه دار کردن جوانه ها، ریزنمونه ها درون شیشه مربایی حاوی 30 میلی گرم محیط واکشت شدند. مرحله سوم: در خصوص بررسی تأثیر تیمارهای هورمونی بر ریشه زایی، ساقه های حاصل از باززایی، ساقه های بدون ریشه به محیط های حاوی تیمارهای ریشه زایی حاوی غلظت های مختلف iaa و iba انتقال پیدا کردند. نتایج نشان داد که سایتوکینین kin و اکسین naa هیچ گونه اثر مثبتی بر القای باززایی ندارند، در حالی که ترکیب سایتوکینین bap با اکسین iaa تأثیر چشمگیری بر القای باززایی و مرحله طویل سازی ساقه ها دارند. سایتوکینین zea نیز تأثیر مثبتی بر باززایی گذاشته است. از میان سه ریزنمونه، برگ بهترین ریزنمونه جهت القای باززایی می باشد. ساقه ها به همه ی تیمارهای ریشه زایی پاسخ مثبت دادند. گیاهچه های حاصل با موفقیت با شرایط محیطی سازگار شده و به گلخانه منتقل گردیدند. نتایج تحقیق حاضر نشان داد که همسو با نتایج دیگر محققان، برای تکثیر بهینه گیاه گوجه فرنگی، باززایی مستقیم متدی کارآمد و با سرعت عمل بالاتر و درجه اطمینان بالا می باشد.

بررسی پروفایل پروتئینی و فعالیت آنزیم های کیتیناز و گلوکاناز در جدایه های جهش یافته قارچ trichoderma .harzianum با استفاده از اشعه گاما به منظور افزایش کنترل بیولوژیک قارچ rhizoctonia solani
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1392
  مهسا ذبیحی طاری   محمد علی ابراهیمی

قارچ تریکودرما به عنوان یک عامل کنترل بیولوژیک موفق قادرند دامنه وسیعی از قارچ های پاتوژن گیاهی از جمله قارچ rhizoctonia solani (مهمترین عامل خسارت زا بر روی سبزی وصیفی) را کنترل نمایند. بالاترین میزان تولید آنزیم های تجزیه کننده دیواره (کیتیناز و گلوکاناز) که در فرآیند مایکوپارازیتسم قارچهای بیمارگر گیاهی موثرند در بین میکروارگانیسم ها به جنس تریکودرما تعلق دارد، لذا پتانسیل بیوکنترلی جدایه هایی که توانایی تولید این آنزیم ها در آنها بیشتر است بالاتر خواهد بود. کاربرد روش های مهندسی ژنتیک و ایجاد موتاسیون مستقیم در ژنوم trichoderma harzianum وtrichoderma viride (تولاس،1865) به منظور افزایش پتانسیل آنتاگونیستی این قارچ ازطریق افزایش فعالیت کیتینازها و گلوکانازها دارای مزیت هایی می باشد. در این مطالعه القای جهش در دو گونه t.harzianum وt. viride با دز 250 گری اشعه گاما در پژوهشکده تحقیقات کشاورزی و پزشکی هسته ای کرج مورد ارزیابی قرار گرفت. از بین ده جدایه جهش یافته منتخب t. harzianum تنها در دو جدایه میزان تولید آنزیم کیتیناز در مقایسه با شاهد (وحشی) کاهش نشان داد(جهش منفی) و 80% جهش ها تاثیر مثبت داشتند. در گونه t. viride در 81/81% جدایه ها ایجاد جهش در اثر پرتوتابی با اشعه گاما منجر به افزایش فعالیت کیتینازی آنها شده است و در 09/9% جدایه ها تفاوت معنی داری در قدرت تولید آنزیم مشاهده نشده است و تنها در 19/18% جمعیت موتانت حاصل فعالیت کیتینازی کاهش یافته که جهش نامطلوب به شمار می رود. ارزیابی فعالیت آنزیم گلوکاناز نشان داد که در جدایه های جهش یافته گونه t. harzianum چهار جدایه به میزان 40% دارای جهش مثبت بوده و شش جدایه به میزان 60% دارای جهش منفی بوده است و در جدایه های جهش یافته t. viride نه جدایه به میزان 81/81% دارای جهش مثبت و دو جدایه به میزان 19/18 دارای جهش منفی بوده اند. آزمون های کشت متقابل نشان دادند که هفت جدایه از گونه t. harzianum و ده جدایه از گونهt. viride از نظر آماری توانایی کنترل بیشتری در مقابل. solani. r نسبت به جدایه وحشی داشتنه اند. افزایش تولید آنزیمهای تجزیه کننده دیواره سلولی از طریق القای موتاسیون با اشعه گاما می تواند منجر به افزایش پتانسیل آنتاگونیستی در اکثر جدایه ها شود و این موضوع تئوری مطالعه پروفایل پروتئینی این جدایه های جهش یافته را تقویت نموده است. با افزایش قدرت آنتاگونیستی علیه r. solani سایر جدایه های جهش یافته که میزان بالاتری از تولید آنزیم را نشان نداده اند احتمالا واجد جهش هایی در سایر مکانیسم های بیوکنترلی می باشند.

بررسی سیتوژنتیکی چهار گونه مریم گلی salvia macrosiphon, s. mirzayanii, s. sclarea, s. officinalis
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1392
  سمانه مرتضوی   محمد علی ابراهیمی

این پژوهش به منظور شناخت تنوع ژنتیکی 12 جمعیت متعلق به 4 گونه گیاه دارویی salvia (مریم گلی) با استفاده از بررسی کروموزم های سلول های مریستمی نوک ریشه بذور با روش استو-فریک-هماتوکسیلین صورت گرفت. عدد کروموزومی جمعیت های هرگونه ثابت و گونه salvia officinalis 14=x2=n2، گونه های، s. macrosiphon mirzayanii s. دارای 20=x2=n2 و گونه salvia sclarea دارای 20= x2=n2 بودند. به منظور تعیین تقارن کاریوتیپی، شاخص ask%، شاخص syi%، اختلاف دامنه طول نسبی drl%، درصد شکل کلی کروموزم tf% ، شاخص تقارن s%، شاخص پراکندگی di تعیین گردید. به طور کلی 12 جمعیت از نظر دسته بندی stebbins در دو کلاس a2 و b2 قرار گرفتند. دو جمعیت گونه s. officinalis و جمعیت های ساری و قزوین گونه s. sclarea، جمعیت های سروستان و بستک گونه s. mirzayanii در گروه a2 قرار گرفتند. چهار جمعیت s. macrosiphon، جمعیت کمهر s. sclarea ، جمعیت بندرعباس s. mirzayanii در گروه b2 قرار داشتند. گروه b2 نامتقارن ترین کاریوتیپ را داشت. تجزیه واریانس داده های مرفولوژی کروموزم های 12 جمعیت 4 گونه جنس salvia مورد مطالعه-tl, l, s, ar, s/l, ci, %rl) ) در قالب طرح کاملاَ تصادفی انجام شد. از لحاظ صفات مورد بررسی جمعیت های گونه s. sclarea با جمعیت های گونه s. macrosiphon اختلاف معنی داری ( در سطح 1%) داشتند. که حاکی از وجود تنوع در اندازه و تقارن کروموزم ها در جمعیت های مورد بررسی است. در نتایج حاصل از تجزیه به مولفه های اصلی طول بازوی کوتاه و طول کل کروموزوم در عامل اول بیشترین نقش را داشتند. از نظر همبستگی بین خصوصیات کروموزمی، بیشترین میزان همبستگی بین طول کل کروموزم و بازوی بلند وجود داشت.. با استفاده از داده های کروموزمی تجزیه خوشه ای داده های کروموزمی به روش upgma انجام گردید و بر این اساس 12 جمعیت مورد مطالعه در 4 گروه قرار گرفتند. دو جمعیت کازرون و سپیدان گونه s. macrosiphon با داشتن کمترین فاصله ، دارای بیشترین شباهت بودند.

گزینش فنوتیپی و ژنوتیپی ارقام برنج متحمل به شوری با استفاده از صفات فیزیولوژیک و نشانگرهای مولکولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم کشاورزی 1392
  محمد اسدی عبدالملکی   سید کمال کاظمی تبار

به هر عاملی (بیماری، آفت، خاک، تغییرات آب و هوایی و غیره) که باعث جلوگیری از بیان کامل پتانسیل ژنتیکی یک یا تعدادی صفت در گیاه شود، تنش اطلاق می شود. شوری، نوعی تنش غیرزنده می باشد و به مفهوم وجود غلظت زیاد املاحی است که مانع از رشد گیاه می شوند. به منظور ارزیابی واکنش ژنوتیپ های مختلف برنج به تنش شوری آزمایشی به صورت فاکتوریل در قالب طرح کاملاً تصادفی با دو عامل شوری (در سه سطح 0 و 6 و 12 دسی زیمنس بر متر) و رقم (در 30 سطح) در سه تکرار انجام گردید. نتایج تجزیه واریانس نشان داد که تفاوت بین ارقام و غلظت های شوری برای صفات طول ریشه چه، طول ساقه چه، نسبت طول ریشه چه به ساقه چه، درصد جوانه زنی، طول ریشه ، طول ساقه، وزن خشک ریشه، وزن خشک ساقه و زیست توده بسیار معنی دار می باشد. همچنین اثر متقابل رقم و شوری برای همه صفات بجز طول ریشه در سطح یک درصد معنی دار گردید. مقایسه میانگین ها بر اساس صفت اندازه گیری شده زیست توده، نشان داد که ارقام pokkali (mg 88/60)، طارم دیلمانی (mg 55/59)، نعمت (mg 66/54) و کوهسار (mg 55/53) دارای بالاترین میانگین و ارقام r9(mg 55/24)، ir29 (mg 27)، r2 (mg 22/29) و پویا (mg 55/29) دارای کمترین میانگین می باشند. همچنین ارزیابی ارقام از نظر تحمل به شوری با استفاده از شاخص های میانگین حسابی (mp)، تحمل (tol)، حساسیت به تنش (ssi)، میانگین هندسی (gmp)، شاخص تحمل به تنش (sti)، میانگین هم ساز صفت در دو محیط (hm)، شاخص عملکرد (yi) و شاخص پایداری عملکرد (ysi) بررسی شدند. نتایج حاصل از تحلیل همبستگی بین شاخص های مقاومت با زیست توده در شرایط بدون تنش و تنش حاکی از همبستگی بالای شاخص های hm، gmp، sti، mp و yi با زیست توده در شرایط تنش و بدون تنش بودند. بر اساس شاخص تحمل تنش میانگین هندسی بهره وری (gmp) در شوری کم (ds/m 6) ارقام طارم محلی، طارم دیلمانی، پرتو، نعمت، کوهسار و pokkali نسبت به سایر ارقام دارای قدرت تحمل بالاتری بوده و در شوری زیاد (ds/m 12) ارقام نعمت، کوهسار و pokkali جزء ارقام متحمل طبقه بندی شدند. بر اساس کد ژنوتیپی در شوری زیاد (ds/m 12) pokkali، کوهسار و نعمت گروه ارقام متحمل و براساس کد ژنوتیپی در شوری کم (ds/m 6) ir29، ir50، r2، فجر، کادوس و شیرودی گروه ارقام حساس را تشکیل دادند. از میان 5 نشانگر مورد بررسی، نشانگر rm8094 بیش ترین میزان آماره محتوی اطلاعات چندشکلی را به خود اختصاص داد و به عنوان بهترین نشانگر برای ارزیابی تنوع ژنتیکی نشانگرها در ناحیه saltol شناسایی شد و بیشترین میزان هتروزیگوتی مربوط به نشانگر rm10793 و بیش ترین میزان الل مربوط به ریزماهواره های rm10793 و rm8094 با 6 الل بود.

جداسازی و شناسایی جدایه های بومی قارچ m.anisopliae توسط روش های مورفولوژیکی و بررسی ژن های pr1a, chi1و chi3
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1392
  مریم طالبی گرکانی   حسن سلیمی

نتایج : با استفاده از روش های مورفولوژیکی 18 جدایه از قارچ متاریزیوم جداسازی شد. این جدایه ها برای مراحل بعدی تحقیق در محیط pda کشت داده و نگهداری شدند. پس از بررسی نتایج pcr مشخص شد که تمامی سویه های بومی دارای این سه ژن اصلی می باشند.اما تعدادی از سویه ها مخصوصا m4 قدرت بیماریزایی بالاتری نسبت به بقیه سویه ها داشتند به نظر می رسد که بیان موثر این ژن ها دراین سویه ها باعث ایجاد قدرت بیماریزایی بالاتری نسبت به بقیه سویه قارچ متاریزیوم آنیزوپلیه یکی از عوامل بیماری زای آفت های گیاهی مختلف مانند شته ها، ملخ ها، سوسک و ... می باشد. از آن جائیکه کاربرد روزافزون مصرف سموم شیمیایی باعث ایجاد نسل های مقاوم آفت ها و عوارض زیست محیطی می شود, استفاده از یک عامل بیوکنترل زیستی بسیار لازم به نظر می رسد. مواد و روش ها : نمونه ها از مناطق جغرافیایی متنوع جمع آوری شدند. برای جداسازی قارچ های مورد نظر از شته ها و حشرات آلوده به قارچ و نیز از خاک ریزوسفر نمونه گیری شد. از نمونه ها سوسپانسیون تهیه و در محیط کشت عمومی قارچ یعنی pda کشت داده شد. سپس از روش های پورپلیت (pour plate), کشت به صورت پخش کردن در سطح محیط(spread), کشت مستقیم و کشت خاک (soil culture) برای جداسازی متاریزیوم آنیزوپلیه استفاده شد. شناسایی اولیه بر اساس ویژگی های مورفولوژیکی کلنی ها از جمله شکل و رنگ آن ها انجام شد. جهت بررسی وجود ژن های chi1، chi3 و pr1a با استفاده از پرایمرهای طراحی شده توسط نرم افزار primer3 بر روی dna استخراج شده از قارچ های جدا شده pcr انجام شد. وجود یا عدم وجود توسط الکتروفورز محصولات pcr و سپس مشاهده باندهای اختصاصی در uv transilluminator ارزیابی شد. ها می باشد. کلید واژه : کنترل بیولوژیک، متاریزیوم آنیزوپلیه، ژن های chi1، chi3 و pr1a

جداسازی و تشخیص مولکولی کمپیلوباکترکولای از لاشه طیور و تعیین mbc عصاره نعناع و سیر با استفاده از pcr
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1391
  فاطمه رحیمی   مهدی فاضلی

کمپیلوباکترکولای به عنوان عامل اصلی آنتریت باکتریایی در تمام دنیا شناخته شده است.که مسبب اکثر عفونت های انسانی ناشی از کمپیلوباکترها به ویژه اسهال می باشد.بیماری در انسان متعاقب مصرف آب و مواد غذایی به ویژه گوشت ماکیان رخ می دهد.تشخیص باکتریولوژیک این باکتری با دشواری زیادی از قبیل طولانی بودن انکوباسیون و محدودیت تست های افتراقی همراه است و استفادهاز روش های دیگر تشخیصی مانندpcr امروزه مورد توجه قرار گرفته است. در این مطالعه میزان آلودگی گوشت ماکیان در تعدادی از واحدهای مرغداری گوشتی شهرستان شیراز به این باکتری با دو روش کشت و pcr مطالعه شد. همچنین پس از جمع آوری گیاه نعناع و سیراز زمین های کشاورزی اطراف شهرستان شیراز و استخراج عصاره آن با دستگاه های تبخیر کننده چرخان و لئوفیلایزر میزان mic آن بر روی باکتری کمپیلوباکتر کولای با دو روش کشت و pcr بررسی شد. نمونه های جمع آوری شده پس از غنی سازی در محیط tsb brothبا استفاده از پرایمرهای اختصاصی کمپیلوباکتر کولای مورد آزمون pcr قرار گرفت.علاوه بر این از محیط tsb broth، به صورت مستقیم بر روی محیط کمپیلوباکترسلکتیوآگارحاوی آنتی بیوتیک های آمفوتریسین b، ریفامپسین،تری متوپریم , ونکومایسین و سفتریاکسون کشت خطی داده شد.که در کل 56 درصد نمونه هاآلودگی به کمپیلوباکترکولای داشتند. سپس میزان mic و mbc عصاره گیاه نعناع و سیراستخراج شده با روش کشت و آزمون pcr بررسی گردید وmicو mbcعصارهگیاه نعناع به ترتیبgmlµ400وgmlµ800 گیاه سیر به ترتیب gmlµ125و gmlµ250 تعیین شد. همچنین خواص ضد میکروبی آندر ارتباط با عصاره تشخیص داده شد. واژگان کلیدی: کمپیلوباکترکولای، mic و mbc، نعناع و سیر، pcr

جداسازی و شناسایی باکتریوفاژهای کنترل کننده ی عامل بیماری شانکر مرکبات
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1392
  محمد جواد شیریچیان   سید مهدی علوی

زانتوموناس باکتری گرم منفی و عامل بیماریی شانکر مرکبات است. سوزاندن درختان، استفاده از سموم شیمیایی و اعمال قوانین قرنطینه ای از روش های کنترل این بیماری است. استفاده بیش از حد سموم، آثار سو بر سلامت و اکوسیستم ها به همراه خواهد داشت و از طرف دیگر امحا درختان هزینه ی هنگفت مالی و زمانی را بر باغداران برای احیا مجدد تحمیل خواهد نمود. روش های کنترل بیولوژیک و در این بین بهره مندی از باکتریوفاژها (ویروس های باکتری خوار) راهکار مناسب دیگری است که نه تنها فشار انتخابی بر طبیعت برای شکل گیری جدایه ها و سویه های جدید را تحمیل نمی نماید بلکه ممکن است با هزینه ی بسیار کم در کنترل و ریشه کنی بیماری های باکتریایی منجمله شانکر مرکبات نقش داشته باشد. در این تحقیق برای اولین بار در ایران باکتریوفاژها از برگ جدا و سپس اثر کنترلی آن ها بر روی باکتری زانتوموناس مشاهده گردید.

بررسی باز زایی گیاهان هاپلوئید در کلزا از طریق جنین زایی میکروسپور
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1392
  علیرضا قدسی نصیرآبادی   مهران عنایتی‏‎‎‏ شریعت پناهی

در این پژوهش با استفاده از دو هیبرید کلزایbrassica napus (hyola 401 ، hyola 420 ) و دو رقم تجاری nk octans, و nk karibic سعی شده است پروتکل باززایی جنین های بدست آمده از کشت میکروسپور توسعه یافته و بهترین گزینه مورد آزمایش در این راستا معرفی گردد. برای جنین زایی، میکروسپورها در محیط nln-13 حاوی 13 درصد ساکاروز کشت شدند، و جنین-های بدست آمده برای تست باززایی مناسب در محیط های پایه مختلف شامل b5 و ms با مقادیر متنوع کربوهیدرات و تنظیم کننده رشدی کشت شده، سپس یک دوره سرمای ?4 به مدت 10 روز در شرایط تاریکی تحمل کرده، بعد به فیتوترون با دمای ?25 منتقل شدند. به منظور افزایش سطح پلوئیدی طوقه و ریشه های گیاهچه های هاپلویید حاصل از جنین های نرمال در محلول کلشی سین (g/l4/3) به مدت 5/1 ساعت قرار گرفتند. با توجه به آزمایشات صورت گرفته مشخص شد اثرات انفرادی ژنوتیپ و محیط و همچنین اثرات متقابل آنها معنی دار بوده است. ژنوتیپ hyola 401 پاسخ پذیرترین و ژنوتیپ nk karibic سخت پاسخ ده ترین در بین ژنوتیپ ها بودند. بهترین محیط برای باززایی و غلبه بر جنین زایی ثانویه انتقال جنین های لپه ای شکل به محیط ga31/0% + ساکارز 2 % + ms(1/2macro) تعیین شد. با بهینه سازی صورت گرفته، در ژنوتیپ های hyola 401 ، hyola 420 و nk octans افزایش راندمان تولید گیاهان نرمال هاپلوئید معنی دار شد. کلمات کلیدی : کلزا، میکروسپور، جنین زایی، باززایی.

بررسی تنوع ژنتیکی لاین های امید بخش جو دیم دو ردیفه و شش ردیفه با استفاده از نشانگر مولکولی ssr
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1392
  بهناز طالبی   احمد اسماعیلی

چکیده در این آزمایش تنوع ژنتیکی 20 ژنوتیپ جو دیم با استفاده از 14 جفت نشانگر ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. پس از استخراج dna ژنومی و انجام واکنش زنجیره ای پلیمراز، آغازگرها در مجموع 266 باند چند شکل تولید نمودند که متوسط تعداد باند چند شکل به ازای هر آغازگر 19 بود. میانگین picبرای کل آغازگرها 6/0 به دست آمد و بیشترین میزان اطلاعات چند شکلی (pic) مربوط به آغازگرهای hvm60 و hvm20 به ترتیب با مقادیر 88/0 و 73/0 و کمترین مقدار آن مربوط به آغازگر bmac0032 با مقدار 32/0 بود. با محاسبه ضریب تشابه جاکارد، ارزش های تشابه بین ژنوتیپ ها دامنه ای از 3/0 تا 96/0 را داشتند. بیشترین تشابه ژنتیکی مربوط به ژنوتیپ های شماره 6 (رقم زراعی ایذه) و شماره 5 (لاین امید بخش) با 96/0 بود و کمترین تشابه مربوط به ژنوتیپ های شماره 13 (پوشینه دار و دو ردیفه) و شماره 10 (پوشینه دار و شش ردیفه) با 3/0 بود. در این پژوهش دندروگرام حاصل از تجزیه خوشه ای به روش upgma و با استفاده از نرم افزار ntsys استفاده شد. با ترسیم خط برش در فاصله 75/0، ژنوتیپ های مورد مطالعه در 5 گروه اصلی قرار گرفتند. نتایج گروه بندی حاصل از تجزیه مختصات اصلی نسبتا با گروه بندی تجزیه خوشه ای مطابقت داشت. تفکیک بر اساس داده های مولکولیssr تا حدودی توانست ژنوتیپ های دو و شش ردیفه و همچنین ژنوتیپ های پوشینه دار و بدون پوشینه را از هم تفکیک نماید. همچنین وجود چند والد مشابه در شجره برخی ژنوتیپها (مثل 3و 12 و یا 14 و 18) نیز در این گروه بندی تأثیر قابل توجهی داشت. در مجموع نتایج مطالعه ما بر روی جو دیم با آغازگرهای ssr، نشان داد که این آغازگرها در گیاه جو کارایی بالایی دارند و نشانگرهای مورد استفاده توانستند تمامی ژنوتیپ ها را به خوبی از هم جدا کنند. واژگان کلیدی: جو دیم، پوشینه، اطلاعات چندشکلی، نشانگر ملکولی ریزماهواره

بررسی تنوع ژنتیکی ایزوله های مختلف قارچ خوراکی دکمه ای سفید با استفاده از تکنیک cdna-aflp
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1392
  محبوبه هاشمی نیا   محمد فارسی

افزایش روز افزون جمعیت و نیاز به مواد غذایی متنوع و جدید با کیفیت غذایی بالا سبب شده تا تولید محصولاتی که دارای پروتئین و املاح مناسبی هستند و امکان افزایش تولید آنها در کشور وجود دارد، مورد توجه بیشتری قرار بگیرند. قارچ های خوراکی یکی از ارزشمندترین و ارزان ترین منابع سرشار پروتئینی محسوب می شوند و در جهان از اهمیت فراوانی برخوردار می باشند. قارچ خوراکی دکمه ای سفید agaricus bisporus یکی از قارچ های رشته ای با اهمیت اقتصادی بالاست. تولید بهینه و رسیدن به کیفیت بالای این قارچ نیاز به تحقیقات گسترده در زمینه شناخت ساختار ژنتیکی و اصلاح این گونه را در پی دارد. در این مطالعه، از نشانگر aflp برای انگشت نگاری ژنتیکی به حقوق مالکیت معنوی آنها کاربرد داشته باشد. با استفاده از 4 ترکیب آغازگری (msei/ecori)، 263 باند قابل امتیازدهی ایجاد شد. شباهت ژنتیکی جفت نمونه ها بین 42% تا 93% متغیر بود و دندوگرام ترسیم شده با استفاده از روش upgma و نرم افزار jmp4 و ntsys، سه گروه اصلی را بین 19 نژاد قارچ دکمه ای مشخص کرد. سرعت رشد ایزوله های مورد مطالعه در مراحل مختلف رشدی شامل سرعت رشد شعاعی پرگنه در محیط کشت جامد، سرعت پرکردن اسپاون، سرعت پرکردن کمپوست و خاک پوششی و در نهایت میزان عملکرد با یکدیگر مقایسه گردید و جدول همبستگی آنها به منظور پیدا کردن رابطه معنی دار بین این صفات رسم شد. در نهایت رابطه معنی داری با ضریب همبستگی 99% بین سرعت رشد در محیط کشت جامد و سرعت رشد در اسپاون و نیز رابطه معنی داری با ضریب 90% بین سرعت رشد در محیط کشت جامد وعملکرد بدست آمد. در بعضی موارد مشاهده شد ایزوله هایی با اسامی تجاری یکسان مشخصات ژنتیکی و میزان عملکرد متفاوتی را نشان دادند و بالعکس.

جداسازی اجزاء پروتئینی آرتمیا اورمیانا و بررسی اثرات ممانعت ازپیری این عوامل در سلولهای فیبروبلاست انسانی در محیط کشت سلولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1393
  ندا واصلی حق   محمد علی ابراهیمی

تغییر در ساختار پروتئین در طول پیری مسئول دگرگونی مرفولوژی و تغییر ساختار پوست به صورت ایجاد چروک، از دست دادن خاصیت ارتجاعی و خشکی می شود.استرس ، اشعه ماورای بنفش یکی از عواملی که بر کلاژن ، الاستین و ملانوسیت اثر گذاشته و باعث ایجاد چروک ، لکه هایی بر روی پوست و خشکی آن می شود. تحقیق در مورد عوامل ممانعت کننده از پیری سلولی گزینه جالب توجهی برای استفاده در صنایع بهداشتی آرایشی در بیوتکنولوژی است. آرتمیا خرچنگ دریایی متعلق به آب های شوربوده و بیشترین توانایی تحمل استرس را در بین موجودات چند سلولی دارا است. آرتمیا به شرایط سخت آب مانند کاهش فشار اکسیژن و دماهای بالا مقاوم است. ناپلوئی (آرتمیای تازه از تخم در آمده) به علت خصوصیات تغذیه ای مواد غذایی مناسبی برای محیط های آبی فراهم آورده و هم چنین در ایران به طور سنتی موارد مصرف دارویی دارد. مشخص شده که عصاره این جاندار حاوی دی گوانوزید تترا فسفات می باشد که جاندار از آن به عنوان منبع تولید انرژی استفاده می کند . این ترکیب یک ماده بیولوژیک فعال است که سبب تحریک متابولیسم سلولهای پوستی و افزایش تکثیر سلولهای اپیدرم می گردد. از آنجائیکه آرتمیا اورمیانا گونه غالب موجود در دریاچه ارومیه است و بررسی اولیه نشان می دهد که تاکنون مطالعه ای در زمینه اثرات ضد پیری آرتمیا بر روی سلولهای پوست انجام نگرفته است و با توجه به مصرف روز افزون عصاره آرتمیا در لوازم بهداشتی آرایشی بخصوص محصولات ضد پیری سلولی و جوان کننده پوست، بررسی عوامل مولکولی موجود در عصاره آرتمیا اورمیانا بومی ایران بر روی سلولهای فیبروبلاست در سطح آزمایشگاه ضروری به نظر می رسد. سلولهای فیبروبلاست سلولهای چسبنده ای هستند که در محیط کشت dmem با ?? ? fbs رشد می کنند. در این تحقیق آرتمیا در دمای c ?28و8 ph= در آب دریای مصنوعی درحال بهم خوردن برای مدت ?? ساعت انکوبه و hatch گردید. عصاره گیری از ناپلوئی ها با روش سونیکاسیون انجام و عصاره آرتمیا استخراج شد. خالص سازی عصاره خام آرتمیا با ستون کروماتوگرافی تعویض یونی با رزین de52 سفارز انجام گردید. سپس سلولهای فیبروبلاست با رقت های متفاوتی از اجزا بدست آمده از کروماتوگرافی و عصاره خام آرتمیا تیمار گردیدند. تست های انجام شده نشان داد که به ترتیب اجزاء 5و7و6 بدست آمده از ستون کروماتوگرافی اثر افزایشی بر روی رشد(تستmttو brdu)، اثر افزایشی بر روی سنتز کلاژن (تست rt-pcr)و ضد پیری(x-gal) داشته به طوری که جزء 5 جدا شده از ستون بیشترین افزایش سپس اجزاء7و6 بیشترین اثر و دیگر اجزاء(2و3و4) اثر کاهشی بر روی رشد داشته اند

جلوگیری از بیان ژن هایtnfalfa-il-1beta-cox2-inos-وتولید pge2-no توسط عصاره سر شاخه های گلدار پونه سای گربه ای
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی 1393
  مهدی موسویان   حسین مقصودی

عصاره گیاه با استفاده از روش اولتراسونیک تهیه وسلولهای کندروبلاست با استفاده از کلاژنازتحت شرایط استریل وتاثیر انتی بیوتیکها از غضروف مفصل متاکارپال گوساله جداسازی شد.سلولهای adheranse با استفاده از انزیم تریپسینجداسازی با تکنیک تریپان بلو شمارش وبا استفاده از تکنیک تعیین lc50 دز موثر وغیرکشنده نپتا کاتاریا مشخص گردید.برای سلولهای مونوسیت/ماکروفاژ کشت تکثیر شده در شرایط 37 درجه %co5ورطوبت %90 در انکوباتور شرایط مشابه بالا خهت سلول های nonadheranseانجام شدجدا سازی rna با استفاده از کیت سینازن انجام و با استفاده از اسپکتروفتومتری و گسترش در زل آگارز میزان ان اندازه گیری و با استفاده از ریل تایم rt_pcr و پرایمر های طراحی شده میزان تولید mrna هر یک از سایتوکینهای التهابی tnf_alfaوil_1betaوinosو cox2 درسلولهای کندروسیت مورد بررسی قرار گرفت و میزان کاهش تولید pge2 در مونوسیت ماکروفازها با استفاده از تکنیک الایزا مورد بررسی قرار گرفت و میزان تولید no در مونوسیت/ماکروفازها مورد بررسی قرار گرفت و مشخص شد میزان بیان زن و تولید در سلوهای تحریک شده با لیپو پلی ساکارید به عنوان مدلی از استئو ارتریت و سلولهای تحریک شده با لیپو پلی ساکارید و تیمار شده با عصاره نپتا کاتاریا مورد بررسی قرار گرفت به منظور دفع الودگی قبل از مرحله ریل تایم با استفاده از کیت فرنتاز و آنزیم dnase سعی بر خالص سازی pcr prudoct شد

هیدرولیز آنزیمی تفاله چغندر قند با استفاده از موتانت های trichoderma reesi و بررسی امکان کاربرد آن برای تولید سوخت زیستی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1392
  ماندانا صفائی   محمد علی ابراهیمی

تریکودرماریسی یکی از کارآمدترین میکروارگانیسم ها در تولید آنزیم سلولاز می باشد. هدف از این مطالعه دستیابی به موتانت برتر تریکودرماریسی از طریق ایجاد موتاسیون توسط پرتو های گاما می باشد. در این تحقیق برای افزایش پتانسیل تولید آنزیم سلولاز قارچ تریکو درماریسی ptcc 5142 اسپور قارچ با غلظت 1×106 spore/ml مورد تابش پرتو گاما با دوز 250 گری قرار گرفت. پس از انتخاب 21 جهش یافته از روش تخمیر، برای تولید آنزیم سلولاز استفاده گردید. برای سنجش آنزیم سلولاز و پکتیناز از آویسل ،کربوکسی متیل سلولوز ،کاغذ فیلتر شماره 1، سلوبیوز، ساکارز و پکتین استفاده گردید. برای تعیین وزن مولکولی آنزیم های سلولازی از روش sds-page استفاده گردید. بالاترین آنزیم سلولاز در جدایه یt.r m5 اندازه گیری گردید و به عنوان بهترین جدایه در ساکاریفیکاسیون تفاله چغندرقند برای دستیابی به سوخت زیستی انتخاب شد. سوخت زیستی توجهات زیادی را در حل بحران انرژی به خود جلب کرده است. در این تحقیق میزان الکل تولیدی توسط دو مخمر کلایورومایسس مارکسیانوس ( ptcc 5795) و ساکارومایسس سرویزیه مورد ارزیابی قرار گرفت. روش تخمیر غوطه ور برای تولید الکل و پروتئین تک سلولی مورد استفاده قرار گرفت. مخمر ساکارومایسس سرویزیه 6/19% بیواتانل و 4/12% پروتین در تیمار با t.r m5 تولید کرد که 56/1 برابر افزایش میزان تولید بیواتانل از خود نشان داد. کلایورومایسس مارکسیانوس 59/15% بیواتانل و 12/12% پروتئین، با تیمار t.r m5 و 45/11% بیواتانل و 4/16% پروتئین با تیمار تریکودرماریسی پس از گذشت 72 ساعت در دمای 35 درجه سانتیگراد با دور همزدن (rpm) 180 ، تولید کرد. ایجاد جهش با پرتو گاما بر روی t. reesei (ptcc 5142) سبب بهبود تولید سلولاز و پکتیناز و بیواتانل شده است.

مهندسی ژنتیک ریزجلبک بمنظور تولید واکسن هپاتیت b
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده علوم کشاورزی 1392
  محمد علیمردانی   غلامرضا صالحی جوزانی

امروزه تولید فراورده های دارویی به صورت نوترکیب در سیستم های یوکاریوتیک از اهمیت به سزایی برخوردار گردیده است. ریز جلبک های سبز به عنوان کوچک ترین واحد های یوکاریوتیک که قابلیت فتوسنتز دارند و در محیط های کشت ساده رشد می کنند، برای کشاورزی مولکولی قابل استفاده می باشند. دراین تحقیق قابلیت استفاده از ریز جلبک های دونالیلا و کلورلا برای تولید و بیان آنتی ژن سطحی ویروس هپاتیت b مورد بررسی قرار می گیرد. برای این منظور از سازه بیانی گیاهی pcambia3300، که حاوی ناحیه کد کننده زیرواحد کوچک آنتی ژن سطحی ویروس هپاتیت b با پروموتور پرقدرت 35s ویروس موزاییک کلم و ژن غربالگر bar است، استفاده گردید. انتقال ژن به ریزجلبک با استفاده از روشهای همزدن با ذرات شیشه، بمباران با تفنگ ژنی و همکشتی با اگروباکتریوم صورت پذیرفت. جلبک های تراریخته بر روی محیط انتخابی حاوی علفکش باستا قرار داده شدند و پس از تکثیر سلول های تراریخته مقاوم به علف کش آزمون های تکمیلی مولکولی صورت پذیرفت. نتایج بررسی تراریزش به کمک آزمون واکنش زنجیره ای پلیمراز، حاکی از حضور ژن آنتی ژن سطحی ویروس هپاتیت b در ریزجلبک بود.

تعیین نقشه ارتباطی صفات وابسته به عملکرد در زردآلو به کمک نشانگرهای مولکولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده علوم کشاورزی 1392
  گلناز فلکی مقدم   مهرشاد زین العابدینی

امروزه زردآلو (prunus armeniaca linnaeus syn. armeniaca vulgaris lammarck) بصورت تجاری در سراسر جهان کشت می شود. بیشترین سطح تولید زردآلو در نواحی مدیترانه ای و خاورمیانه به ویژه ایران متمرکز شده است. همه گونه های خویشاوند زردآلو دیپلوئید (16=n2) بوده، اما در میان آنها برخی از موتانت های تتراپلوئید نیز یافت شده است. هدف از این مطالعه، تعیین نقشه ارتباطی بین نشانگرهای مولکولی و مکانهای ژنی کمی صفات وابسته به عملکرد در زردآلو با استفاده از روش نقشه یابی ارتباطی و بررسی کارآیی این روش در تهیه نقشه ژنتیکی زردآلو می باشد. در این مطالعه از 347 ژنوتیپ مختلف زردآلو جمع آوری شده از کلکسیون های موجود در موسسات تحقیقاتی تبریز و جمهوری چک و 40 نشانگر ریزماهواره نشاندار با فلورسنت برای بررسی تنوع ژنتیکی، ساختار جمعیت استفاده شده است. از این تعداد ژنوتیپ، 55 ژنوتیپ زردآلو که اطلاعات صفات مرفولوژیک برای آن ها موجود بود در نقشه یابی ارتباطی مورد بررسی قرار گرفتند. در مجموع 216 آلل چندشکلی نشان دادند. میانگین تعداد آلل در هر مکان 2/8 و میانگین آلل موثر 4/4 بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار و ظرفیت اطلاعات چندشکلی به ترتیب 74/0 و 70/0 بود. در مقابل میانگین هتروزیگوسیتی مشاهده شده 80/0 بود. بررسی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت، 6 گروه مشخص را شناسایی نمودند که با توزیع جغرافیایی نمونه های مورد بررسی مطابقت نشان داد. نتایج نقشه یابی ارتباطی در این تحقیق نشان داد، 24 نشانگر ریزماهواره با 46 صفت مورفولوژیک دارای ارتباط و پیوستگی بودند و میزان عدم تعادل لینکاژی 02/0 بدست آمد.

کاربرد نشانگرهای ریزماهواره در شناسایی کلکسیون های پایه و آنالیزهای فضایی و غیر فضایی انار (punica granatum) با استفاده نشانگرهای مولکولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1392
  شهلا درویشی   مهرشاد زین العابدینی

انار(punica granatum l.) گیاه بومی ایران است که به دلیل اهمیت اقتصادی، زینتی و دارویی کشت و کار می شود. اگرچه این گیاه یکی از مهمترین محصولات باغبانی کشورمان محسوب می شود، اما تا کنون بررسی دقیقی پیرامون توصیف ذخایر ژنتیکی و ژرم پلاسم آن انجام نشده است. ارزیابی تنوع ژنتیکی یکی از ارکان اصلی توصیف و بکارگیری ژرم پلاسم می باشد. در این مطالعه، تنوع ژنتیکی 738 نمونه انار با منشا جغرافیایی متفاوت از ایران با استفاده از نشانگرهای ریزماهواره مورد ارزیابی قرار گرفت. با استفاده از 12 نشانگر چند شکل ریزماهواره (ssr)، تعداد 43 آلل با میانگین 59/3 آلل در هر مکان ژنی و متوسط اطلاعات چندشکلی 458/0 را شناسایی کردیم. علاوه بر ارزیابی پارامترهای تنوع ژنتیکی، آزمون اختصاص بایسین و تجزیه و تحلیل شبکه فیلوژنتیک بمنظور ارزیابی ساختار جمعیت مورد استفاده قرار گرفت. نتایج این تحقیق نشان می دهد که ارزیابی تنوع ژنتیکی و ساختار جمعیت در کلکسیون پایه انار می تواند برای استفاده کارامد از ژرم پلاسم و تعیین نقشه ارتباطی مفید باشد. علاوه براین، نشانگرهای ریزماهواره می توانند در گزینش ژنوتیپ های منحصر به فرد و ایجاد کلکسیون هسته موثر باشند. نتایج این تحقیق می تواند در درک بهتر ماهیت ژنتیکی افراد، تعیین روابط ژنتیکی، و منشا جغرافیایی ژرم پلاسم انار مفید بوده و در حفاظت و بکارگیری این ذخایر ژنتیکی نقش موثری ایفا کند. کلمات کلیدی: انار، نشانگر ریز ماهواره (ssr)، کلکسیون هسته، آنالیز فضایی

ساخت کاست rnai برای زیر واحد امگا گلیادین در گندم
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده علوم کشاورزی 1393
  مهدی آذری آنپار   بهرام باغبان کهنه روز

امگاگلیادین ها 5 تا 10 درصد از پروتئین های آرد گندم را شامل می شوند. مشخصه بارزی که در ژن های امگا گلیادین وجود دارد و می‎ توان بهآن اشاره داشت وجود توالی های تکراری و فاقد اینترون می باشد. حدود 80 درصد از بیماری آنافیلاکسی ورزشی ناشی از گلیادین های گندم می باشد. همچنین گلیادین ها باعث بیماری های سلیاک و اسکلروزیس متعدد نیز می شوند. تنها راه درمان این بیماری ها رژیم غذایی فاقد گلوتن می باشد. بدلیل طاقت فرسا بودن این شیوه درمان، به نظر می رسد یکی از بهترین روش ها ممانعت از تولید امگا گلیادین با استفاده از تکنیک rnai باشد. گام نخست در این راه ساخت کاست های اختصاصی امگا گلیادین می باشد. در این پژوهش ابتدا به جداسازی قطعات مورد نیاز ژنی امگا گلیادین اقدام و سپس ساخت سازه پلاسمیدی حاوی دو قطعه سنس و آنتی سنس از ژن امگا گلیادین در پلاسمید ptg19-t انجام گرفت. در ابتدا توالی نوکلئوتیدی ژن امگا گلیادین با شماره دسترسی kf412579 به کمک نرم افزارهای blastn ، clustalw برای همردیفی و انتخاب بهترین ناحیه مورد استفاده قرار گرفت. در طراحی پرایمر اختصاصی برای تکثیر ناحیه انتخاب شده از نرم افزارهایprimr3 و oligo7 استفاده شد. پس از pcr و جداسازی قطعه ژنی امگا گلیادین و خالص سازی آن از ژل آگارز در پلاسمید ptg19-t همسانه سازی شد. بعد از تعیین توالی یابی و صحت 99 درصدی از ژن کلون شده شرایط برای ساخت پرایمر اختصاصی قطعه کوچک نیز فراهم شد. قطعه کوچک که همان آنتی سنس هم گفته می شود در اتصال دوباره به پلاسمید ptg19-t درست در جایگاه قطعه بزرگ ولی برعکس آن همسانه سازی شد تا شرایط برای ساخت rnai که ویژگی دو رشته ای شدن mrna بعد از رونویسی و از بین بردن ژن امگا گلیادین با پروتئین های موجود در سلول را دارد مهیا شد.

بررسی بیان ژن های p5cs و badh در سطوح مختلف تنش شوری و aba در دو رقم گندم زراعی با استفاده از qrt – pcr
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1393
  رضا متین   علی نیازی

گیاهان در طول دوره ی زندگی خود با توجه به پراکنش جغرافیایی و زمان رشد با تنشهای محیطی فراوانی مواجه می شوند که این تنش ها گاه به میزان 60 – 70 درصدباعث کاهش عملکرد آنها می گردد. تنش نتیجه روند غیر عادی فرایند های فیزیولوژیک می باشد که از تاثیر ترکیبی از عوامل زیستی و غیر زیستی حاصل میشودتنش شوری از جمله مهمترین عوامل کاهش کمی و کیفی محصول در کشت گندم محسوب می گردد. در سال های اخیر در راستای مقابله با تنش ها به ویژه تنش شوری، توجه محققین کشاورزی به شناخت ژن های مقاومت در گیاهان و شناخت سازو کار عمل این ژن ها معطوف گشته است. دسته ی بسیار مهمی از ژن ها که در فرآیند ایجاد مقاومت نسبت به تنش های زیستی و غیر زیستی در گیاهان نقش اساسی ایفا می کنند، ژن های سازنده ی عوامل موثر در کاهش شدت تنش می باشند. در این پژوهش دو ژن مهم از اعضای خانواده های مهم ژنی pscs و badh در گندم زراعی در شرایط تنش شوری مورد بررسی قرار گرفته است. در این پژوهش پژوهش انجام شده شامل بررسی بیان این ژن در ساعات مختلف نمونه گیری پس از تنش، در سطوح مختلف تنش شوری و در ژنوتیپ های حساس ( الموت) و مقاوم ( ماهوتی ) گندم زراعی با روش rt-pcr می باشد...به منظور بررسی تاثیر تنش شوری بر روی میزان بیان ژن های badh و p5cs گیاه گندم مورد تنش شوری قرار گرفت، بعد از اعمال تنش شوری از گیاهان نمونه برداری شده و بعد از استخراج rna و سنتز cdna و نیز انجام آزمایش real time pcr به منظور بررسی اثر تنش شوری بر روی میزان بیان ژن ها انجام پذیرفت. نتایج حاصله نشانده آن است که ژن های مورد بررسی نقش کلیدی در ایجاد مقاومت به تنش شوری در گیاه گندم را دارا هستند.

آنالیز عملکرد sp-mf، یک پروموتر مصنوعی القاشونده توسط پاتوژن ها با استفاده از روش اگرواینجکشن در گیاه توتون
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1393
  مرجان بحرآبادی   فرهاد شکوهی فر

کنترل دقیق بیان تراژن به هدف افزایش مقاومت به بیماریها یکی از چالشهای مهم مهندسی ژنتیک گیاهی می باشد. با توجه به نقش پیشبر در تنظیم بیان ژن، انتخاب پیشبر مناسب در برنامه های اصلاحی تولید ارقام مقاوم از اهمیت زیادی برخوردار است. در میان پیشبرهای گیاهی، پیشبرهای القا پذیر با بیمارگر که ژن خود را تنها در واکنش به حمله بیمارگر بیان می کنند، مورد توجه بیشتری قرار گرفته اند. با این حال بسیاری از این پیشبرها، سطوحی از بیان پایه را نشان می دهند که کاربرد آنها را برای اهداف بیوتکنولوژیک نامناسب می سازد. با توجه به ویژگیهای یک پیشبر مناسب القاپذیر با بیمارگر و فقدان این ویژگیها در پیشبرهای طبیعی، امروزه از استراتژیهای طراحی و ساخت پیشبرهای مصنوعی استفاده می شود. در ساختار این پیشبرها از عناصر تنظیمی سیس و توالی های حداقل پیشبری به هدف افزایش بیان و قدرت ژن در پاسخ به عوامل القاکننده و کاهش بیان پایه استفاده می گردد. عملکرد پیشبرهای مصنوعی القا پذیر با بیمارگر به روشهای مختلف مورد ارزیابی قرار می گیرد. در این مطالعه به هدف آنالیز پیشبر مصنوعی و القا پذیر sp-dd (متشکل از دو نسخه از عنصر تنظیمی سیس d box)، از روش بیان موقت مبتنی بر اگروباکتریوم استفاده شد. با در نظر گرفتن برهمکنش میزبان گیاهی و سویه اگروباکتریوم، شرایط بیان موقت بهینه سازی شد. همچنین بیان درونزاد ژن gus در گونه های گیاهی مختلف ارزیابی شد. عملکرد پیشبر القایی sp-dd با اگرواینجکشن آن به گیاه میزبان، تعیین بیان پایه، پاسخ آن به مسیر دفاعی سالیسیلیک اسید و تاثیر تنشهای محیطی سرما، گرما و اشعه ماورا بنفش بررسی شد. نتایج این مطالعه نشان دهنده وجود برهمکنش مناسب گیاه توتون گونه بنتامیانا با سویه gv3101 اگروباکتریوم و همچنین عدم وجود بیان درونزاد ژن gus در گیاه فوق بود. همچنین آنالیز پیشبر مزبور بیانگر پاسخگویی آن به هورمون پیام رسان دفاعی سالیسیلیک اسید به صورت موضعی و سیستمیک بود. القا پذیری این پیشبر با افزایش زمان از 2 ساعت تا 24 ساعت از اعمال تیمار سالیسیلیک اسید افزایش یافت. پیشبر فوق در پاسخ به تنشهای گرما و سرما حساسیت اندکی نشان داد ولی تنش اشعه ماورا بنفش بر القا آن بی¬اثر بود. بر اساس نتایج بدست آمده با توجه به حساسیت پیشبر مصنوعی sp-dd نسبت به مسیر پیام رسانی سالیسیلیک اسید، انتظار می رود این پیشبر نسبت به بیمارگرهای بیوتروف نیز واکنش القایی بالایی نشان دهد.

بررسی تنوع ژنتیکی موتانت های قارچ تریکودرمای جهش یافته با اشعه گاما با استفاده از نشانگرهای مولکولی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1393
  هدی اصل فلاح   سمیرا شهبازی

به منظور القای جهش ژنتیکی در دو گونه t. viride و t.harzianum سوسپانسیون اسپور هر یک از آنها در معرض دزهای 0 تا 450 گری اشعه گاما در دستگاه گاما سل قرار گرفت. آزمون کشت متقابل نشان داد که، تمام جدایه¬های جهش یافته t. viride از لحاظ آماری (p>0.05) قدرت آنتاگونیستی بالاتری نسبت به جدایه مادری در مقابل fusarium solani دارند. تنها 20% از موتانت¬های t.harzianum قدرت آنتاگونیستی بالاتری نسبت به جدایه مادری داشتند (p>0.05). برای مطالعه اثرات اشعه گاما بر روی جدایه¬های جهش یافته گونه¬های تریکودرما استفاده شد. پنج آغازگر rapd (opa09 opa10, opa11, opa14, opa 16) انتخاب شدند. نتایج حاصل از مارکر rapd با استفاده از این آغازگرها در سطح تشابه 84% ، موتانت¬های t. viride را به ترتیب به 12، 16، 14، 20 و 19 گروه تقسیم کرد. بررسی ارتباط پروفیل rapd جدایه های جهش یافته از t.viride، با توانایی آنتاگونیستی آن ها علیه fusarium solani نشان داد که دندروگرام حاصل از جدایه ها و گروه بندی آنها بر اساس آنتاگونیستی علیه این بیمارگر موتانت های این گونه را به گروه های مختلفی تقسیم می کنند که منطبق نیستند. دندروگرام حاصل از پنج آغازگر از آغازگر های rapd با استفاده از روش upgma و ضریب تشابه jaccard در سطح تشابه 84 درصد جدایه ها را به سه گروه تقسیم کرد که در آن جدایه های جهش یافته 9th و 17th در یک گروه، بقیه جدایه های جهش یافته در گروه دیگر و جدایه مادری از هر دو گروه جهش یافته جدا می شود. بر اساس نتایج این نشانگرهای مولکولی مبتنی بر) pcr (rapd ، بین جدایه مادری و جدایه¬های جهش یافته تفاوت ژنومی وجود دارد و وجود تفاوت معنی دار از نظر خواص آنتاگونیستی ناشی از تفاوت ژنتیکی می باشد که در اثر القای جهش به وجود آمده است. به غیر از جدایه های 9 th و 17th بین جدایه¬های دیگر از نظر آنتاگونیستی تفاوت وجود داشت اما نشانگر مورد مطالعه نتوانست آن ها را از هم متمایز کند.

غربال گری باکتری های متحمل به علف کش گلیفوسیت از خاک برخی از باغات ایران به منظور جداسازی ژن ۵-انول پیروویل شیکیمات-۳-فسفات سنتاز epsps
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1393
  هادی قادری تبار   علی هاتف سلمانیان

اصطلاح علف هرز به هر گونه گیاهی که ناخواسته بوده و به طور مهاجم رشد کرده و گسترده می شود، اطلاق می¬گردد. از بین روش¬های مرسوم در کنترل علف¬های هرز، به نظر می¬رسد به کارگیری علف¬کش¬های وسیع¬الطیف، به دلیل کمک به حفظ خاک و صرفه جویی اقتصادی بهترین روش می¬باشند و از بین علف¬کش¬ها، آنهایی که با ممانعت از ساخت اسیدآمینه¬ها از تولید پروتئین جلوگیری می¬کنند مناسب¬ترند که از میان آنها می¬توان به گلیفوسیت با نام علمی (ان- فسفونومتیل گلیسین) اشاره کرد اما تاثیر منفی علف¬کش بر روی گیاه هدف، استفاده از آن را مشکل¬ساز نموده است؛ لذا استفاده از روش¬های کلاسیک و مبتنی بر مهندسی ژنتیک برای مقاوم نمودن گیاه به علف-کش ضروری است. گلیفوسیت از طریق ممانعت از عملکرد آنزیم epsps(5- انول پیرویل شیکیمات-3- فسفات سنتاز) در مسیر شیکیمات مانع تولید اسیدآمینه¬های آروماتیک می¬گردد. این آنزیم با ترکیب فسفو انول پیروات(pep) و شیکیمات تری فسفات (s3p) در مسیر شیکیمات، و با انتقال بخش انول پیروویل pep به s3p، تولید 5- انول پیروویل شیکیمات-3- ¬فسفات (epsp) و یک فسفات (pi) می¬نماید و در آخر مسیر، اسیدآمینه¬های آروماتیک تریپتوفان، فنیل¬آلانین و تیروزین ساخته می¬شود. به نظر می¬رسد همپوشانی زیادی بین جایگاه اتصال pep و گلیفوسیت در ساختمان آنزیم وجود دارد و گلیفوسیت برای اتصال به آنزیم با pep و نه باs3p رقابت می¬کند و مانع تولید اسیدآمینه¬های آروماتیک می¬گردد. در تحقیق حاضر با توجه به تحقیقات قبلی مربوط به جداسازی 34 باکتری از خاک¬های باغات مناطق مختلف ایران با سابقه استفاده از این علف¬کش که قادر به رشد در محیط حاوی 3 میلی¬مولار گلیفوسیت بوده و غربال شده¬اند، لذا در این تحقیق پس از غربال¬گری باکتری¬ها در حضور غلظت¬های بالای گلیفوسیت، 4 باکتری از مقاوم¬ترین آنها انتخاب و با انجام روش¬های بیوشیمیایی و مولکولی مانند بررسی 16s rrna، جنس باکتری¬ها شناسایی گردید. به دنبال آن پس از همردیفی ژن¬های epsps از باکتری های گزارش شده¬ مشابه در ncbi، با طراحی آغازگر از مناطق حفاظت شده¬ آنها، ژن epspsباکتری¬های مورد نظر جدا گردید.

قیام علیه حاکم در فقه مذاهب اسلامی با تاکید بر جریان بیداری اسلامی
thesis سایر - دانشکده علوم حدیث 1393
  محمد علی ابراهیمی   محمد رضا ضمیری

از جمله موضوعات مهم در عصر حاضر و فقه سیاسی شیعه و سنی، موضوع بیداری اسلامی و جنبش های اسلامی ضد استبدادی و روش برخورد حاکمان و رهبران دینی با این قیام ها می باشد. اثر حاضر به روش توصیفی – تحلیلی به بیان قیام علیه حاکم(جائر و عادل) در قالب نظرات و دیدگاه های مختلف پرداخته است و در مجموع به این نتیجه رسیده ایم که قیام علیه حاکم جور نه تنها جایز است بلکه نوعی تکلیف است و از باب امر به معروف و نهی از منکر ، لازم است به اعمال خلاف قانون و دین آن ها اعتراض نمود ، ولی اهل سنت چنین قیامی را جایز ندانسته و اطاعت از هر امیر و حاکم مسلمان ولو ظالم و جائر را واجب می دانند . در فقه شیعه ، همه علما با توجه به قیام امام حسین ? در مقابل ظلم و بیداد یزید و انحرافات ایجادی او در دین اسلام ، این امر مهم را نه تنها تأیید ؛که حتی آنرا واجب نیز می شمارند. اما در فقه سیاسی اهل سنت با توجه به شرایط زمانی آنها و لزوم حمایت حکومت ها و والیان آنها از این مذاهب و نیز، نیاز حاکمان ظالم از تأیید اعمال وحشیانه و ظالمانه خود ، از سوی عالمان دینی، همیشه قیام علیه اینگونه حاکمان مردود بوده و از سوی عالمان دینی مذاهب و فرق اهل سنت نهی شده است.

تخلیص نوکلئوپروتئین ویروس h9n2 آنفلوانزای پرندگان
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1394
  سیده سعیده حسینی   محمد علی ابراهیمی

بیماری آنفلوانزای پرندگان سالانه خسارت اقتصادی فراوانی به صنعت طیور در سراسر دنیا وارد می کند. آنفلوانزای پرندگان بیماری بسیار واگیرداری است که موجب بروز علایم در سیستم های تنفسی، گوارشی و اعصاب در طیف وسیعی از پرندگان می گردد و قابل انتقال به پستانداران از جمله انسان می باشد. ویروس آنفلوانزا، ویروسی پلی مورفیک از خانواده ارتومیکسوویروس ها است و این ویروس با ژنوم rna تک رشته ای، دارای 8 نوع پروتئین ساختاری و 2 نوع پروتئین غیر ساختاری بوده و نوکلئوپروتئین (np) از پروتئین های ساختاری و داخلی ویروس می باشد. این تحقیق به منظور معرفی روش ساده و کاربردی و سریع جهت جداسازی نوکلئوپروتئین ویروس آنفلوانزای پرندگان صورت پذیرفت. پروتئین خالص شده را می توان به منظور تهیه آنتی سرم اختصاصی نوکلئوپروتئین استفاده نمود. به این منظور ابتدا ویروس آنفلوانزای پرندگان n_2 h_9 جداشده از مایع الانتوئیک تخم مرغهای جنین دار 10 روزه را سانترفیوژ و با استفاده از پلی اتیلن گلیکول 6000 و با وزن حجمی 10% و گرادیانت سوکوروز در شیب 60-30 درصد ویروس تخلیص گردید. با استفاده از دستگاه preparative electrophoresis(prepcell 491) پروتئین های ویروس آنفلوانزا جداسازی و به صورت فراکسیونهایی تهیه شد. میزان جذب پروتئین فراکسیون ها با دستگاه اسپکتوفوتومتر در nm280 مشخص شده و فراکسیونهای دارای جذب، لیوفریزه گردید و سپس آنالیز پروتئین با sds-page و رنگ آمیزی نیترات نقره مشخص نمود که نمونه هایی بدست آمده موردنظر حاوی نوکلئوپروتئین خالص بوده و عاری از سایر پروتئینهای ویروس است. نتایچ بررسی فراکسیونهای لیوفریزه شده حاوی نوکلئوپروتئین روی ژل اگار عدم حضور rna ژنوم ویروس همراه با نوکلئوپروتئین و خلوص بالای نوکلئوپروتئین را نشان داد.

جلوگیری از بیان ژنهای tnf-?، il-1?، cox-2 و inos و تولید pge2 و no در کندروسیت های مفصلی و مونوسیت/ ماکروفاژها توسط عصاره سرشاخه های گلدار پونه کوهی (origanum vulgare)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1393
  زهره یوسفی   حسین مقصودی

در این مطالعه برای ارزیابی اثرات ضد التهابی گیاه پونه کوهی (origanum vulgare) بر روی بیومارکرهایی که در جریان بیماریهای اوستئوآرتریت مهم هستند از سلولهای مونوسیت/ ماکروفاژ و سلولهای کندروسیت به عنوان مدلی شبیه به سلولهای غضروف و مونوسیت/ ماکروفاژ انسانی مبتلا به اوستئوآرتریت استفاده گردید. بدین منظور این سلول ها به منظور افزایش سطح سایتوکین ها به وسیله لیپوپلی ساکارید (lps) تیمار شدند و مقدار بیان ژن cox-2 و inos و tnf-? و il- 1? در سلولهای تحریک شده مورد بررسی قرار گرفت.

جلوگیری از بیان ژنهای tnf-?، il-1?، cox-2 و inos و تولید pge2 و no در کندروسیت های مفصلی و مونوسیت/ ماکروفاژها توسط عصاره شاه بلوط هندی(aesculus hippocastanum)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان تهران - دانشکده کشاورزی 1393
  رویا قاسمی راد   حسین مقصودی

در این مطالعه برای ارزیابی اثرات ضد التهابی گیاه شاه بلوط هندی((aesculus hippocastanum بر روی بیومارکرهایی که در جریان بیماریهای اوستئوآرتریت مهم هستند از سلولهای مونوسیت/ ماکروفاژ و سلولهای کندروسیت به عنوان مدلی شبیه به سلولهای غضروف و مونوسیت / ماکروفاژ انسانی مبتلا به اوستئوآرتریت استفاده گردید. بدین منظور این سلول ها به منظور افزایش سطح سایتوکین ها به وسیله لیپو پلی ساکارید (lps) تیمار شدند. ابتداعصاره الکلی گیاه شاه بلوط هندی(aesculus hippocastanum) با روش تولید امواج فرا صوت (اولترا سونیک) تهیه شد.و سلول های مورد نیاز از بافت غضروفی مفصل متا کارپ اندام حرکتی جلویی گوساله هلشتاین 8 ماهه کاملاً سالم و مونوسیت ها از انیستیتو پاستور تهیه شدند. سپس سلول های مورد مطالعه در شرایط مطلوب نگهداری و کشت داده شد.پس از تکثیر سلولی میزان lc50 را تعیین نموده و تزریق lps انجام شد و پس از گذشت زمان لازم نمونه ها جهت جداسازی rna آماده شدند. به کمک روش rt-pcr و پس از آن با روش pcr از cdna بدست آمده مقادیر بیشتری بدست آورده و با استفاده از آغازگرهای اختصاصی سایتوکین ها با روش real time – pcr به بررسی میزان بیان ژن آنها پرداخته شد.

کلونینگ توالی کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1393
  بنت الهدی قویدل   فرهاد شکوهی فر

چکیده فارسی ویروس موزائیک توتون (tmv) ، یکی از مهمترین عوامل بیماریزا در سراسر دنیا است که بیش از 200 گونه گیاهی را آلوده می نماید. هر یک از اجزای مختلف ژنوم دارای نقش مهمی در ساختار ژنوم ویروس می باشد، از جمله پروتئین حرکتی که در حرکت سلول به سلول در tmv موثراست و پروتئین پوششی که نقش مهمی در پایداری و انتقال ویروس ایفا میکند. درایران در خصوص تعیین توالی کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون تا کنون اقدامی صورت نگرفته است. لذا تعیین توالی ویروس و مطالعه تفاوت های جدایه های موجود در کشور با اطلاعات موجود در منابع از جمله اقدامات اولیه و ضروری جهت انجام مطالعات مولکولی روی این ویروس است، بنابراین با هدف بررسی توالی ژن کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی در جدایه گزارش شده از ایران و مقایسه توالی تعیین ترادف شده با جدایه های مختلف در بانک ژن ncbi مطالعه حاضر انجام شد. توالی ژن کدکننده این پروتئین ها در جدایه های مناطق مختلف دنیا گزارش شده است. استخراج rna ژنومی ویروس از برگ گیاهان توتون آلوده بدست آمد و با استفاده از پرایمر psh60-r1 مرحله ساخت cdna انجام شد. با استفاده از آغازگرهای اختصاصی psh63-f و psh60-r1 منطقه کدکننده پروتئین حرکتی و پروتئین پوششی تکثیر و بصورت دو جهته توالی یابی شد. همردیفی توالی بدست آمده با توالی مشابه از نژادهای مختلف انجام شد و درخت خویشاوندی رسم گردید. نتایج نشان داد جدایه گزارش شده از ایران با نژاد tmv-u1 قرابت بالائی دارد. از بین 799 جایگاه در سطح نوکلئوتید برای پروتئین حرکتی 6 جهش در مقایسه با نژاد tmv-u1 مشاهده و در مجموع 266 اسید آمینه 2 جهش دیده شد. آنالیزهای انجام شده براساس توالی نوکلئوتیدی کد کننده ناحیه پروتئین پوششی ویروس در مقایسه با نژاد tmv-u1 2 جهش در سطح نوکلئوتید را نشان داد. در توالی های بالادست و بینابین دو ژن کدکننده پروتئین پوششی و حرکتی نیز جهش هایی مشاهده شد. جهش در این مناطق به دلیل نقش تنظیمی در بیان ژن حائز اهمیت است.

تولید نوترکیب و خالص سازی یک نوع ال- آسپاراژیناز جدید در اشریشیاکلی
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه پیام نور - دانشگاه پیام نور استان البرز - دانشکده کشاورزی 1394
  نسیم واحدیان جواهری   مسعود توحیدفر

آنزیم ال-آسپاراژیناز به شکل موثری در درمان بیماری لوسمی لنفوبلاستیک حاد و سلول های توموری و همچنین در صنایع غذایی برای کاهش سطح اکریل آمید به کار می رود. بیماری لوسمی لنفوبلاستیک حاد یکی از بدخیمی های بسیار شایع در جهان و ایران به ویژه در کودکان است و در طول سی سال گذشته با استفاده از آنزیم های ال- آسپاراژیناز که به صورت تجاری ازe.coli و erwinia cherysanthemi تهیه می شود، قابل درمان است. آنزیم ال- آسپاراژیناز واکنش تبدیل ال- آسپاراژین که یک اسید آمینه غیر ضروری است را به ال- آسپارتیک اسید و آمونیاک کاتالیز می کند و بدین ترتیب این اسید آمینه، که برای رشد بی رویه سلول های سرطانی ضروری است را از دسترس آن ها خارج می کند

گراف مقسوم علیه صفر یک مشبکه نسبت به یک ایده آل
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه نیشابور - دانشکده ریاضی 1394
  محمد علی ابراهیمی   مژگان افخمی گلی

در این پایان نامه، گراف مقسوم علیه صفر را بر روی یک مشبکه تعریف می کنیم و به مطالعه خواص این گراف می پردازیم. همچنین گراف مقسوم علیه صفر نیم مشبکه ی تقاطعی و نیم مشبکه ی تقاطعی صحیح را بررسی می کنیم. نیز گراف های دو بخشی کامل شاخه دار و مشبکه های متناظر با آن ها را شناسایی می کنیم. به علاوه، گراف مقسوم علیه صفر مشبکه نسبت به یک ایده آل آن را بررسی می نماییم و خواصی نظیر عدد رنگی و عدد خوشه ای این گراف را مطالعه می کنیم.

طرح بهینه اختلاط دوغاب و تعیین فشار تزریق مناسب در تونل های حفر شده بوسیله tbm در محیط های خشک (مطالعه موردی: تونل های متروی شیراز)
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه شهید باهنر کرمان 1388
  حجت اله معصومی فشانی   محمد علی ابراهیمی

در هنگام حفر به کمک روش های تونلسازی مکانیزه و بعد از نصب سیستم نگهداری، بین سطح خارجی نگهداری نصب شده و محیط حفاری شده یک فضای خالی بوجود می آید که می بایست جهت جلوگیری از ریزش خاک و سنگ به درون این فضا و ایجاد نشست سطحی در اثر این ریزش، بوسیله ماده مناسبی پر شود. پر کردن این فضای خالی حلقوی تحت عنوان عملیات backfilling یاد می شود که معمولاً با استفاده از دوغاب های تهیه شده از سیمان، ماسه، آب و ...، انجام می شود. لذا می بایست مخلوطی جهت تزریق انتخاب شود که هم دارای قابلیت پمپاژ خوبی باشد و با توجه به شرایط محیط حفاری علاوه بر خاصیت پرکنندگی دارای مقاومت لازم نیز بوده و حتی در شرایط نمناک قدرت آب بند کنندگی لازم را جهت جلوگیری از نفوذ آب به درون تونل و یا سینه کار داشته باشد. با توجه به اینکه تونل های قطار شهری شیراز در آینده ای نزدیک در محیط خشک حفر می شود و نیازی به خاصیت آب بندکنندگی دوغاب نمی باشد، در این تحقیق سعی شده است تا با توجه به آزمایشات به عمل آمده طرح اختلاطی مناسبی برای این محیط ارائه شود. لذا با توجه به آزمایشات به عمل آمده دو طرح اختلاط مجزا ارائه شد. از طرفی عملیات تزریق می بایست تحت فشار مناسبی صورت گیرد به گونه ای که نه چنان کم باشد که باعث ریزش خاک به درون این فضای خالی و در نهایت بروز نشست سطحی شود و نه چنان زیاد باشد که سبب ایجاد شکست هیدرولیکی در خاک اطراف، بالازدگی سطح و یا آسیب به نگهداری نصب شده گردد. در این تحقیق با استفاده از نرم افزار plaxis 3d tunnel، با بررسی تأثیر فشار تزریق بر میزان نشست ایجاد شده، فشاری برابر با 150 کیلو پاسکال جهت تزریق پرکننده به درون فضای خالی به دست آمد.