نام پژوهشگر: محمد طهماسب

بررسی بیوشیمیایی و ژنتیکی پروتئین های ذخیره ای دانه با تاکید کیفیت ماکارونی دربرخی از گونه های تتراپلوئید گندم زراعی ایران
thesis دانشگاه تربیت معلم - تهران - دانشکده علوم پایه 1390
  وحیده جهانشاهی خضرلو   محمد طهماسب

چکیده گندم های تتراپلوئیدزراعی با ژنوم aabb بخشی از ژرم پلاسم گندم بومی کشور را تشکیل می دهند. گونه های , triticum isphahanicum heslot triticum turanicum jakubz.، triticum dicoccum (schrank) schübler از جمله گندم های تتراپلوئید زراعی کشور هستند که در سالیان گذشته به عنوان ارقام بومی کشت می شدند وهم اکنون زراعت آنها محدود شده است. در حالیکه این ارقام می توانند به عنوان منابع ژنی مفید برای بهبود ژنتیکی ارقام گندم ماکارونی که امروزه کشت می شوند، در نظر گرفته شوند. بنابراین مطالعه توانمندیهای آنها ضروری است و بررسی پروتئین های دخیره ای دانه در این گونه ها کمک موثری به شناخت وضعیت کیفیت ماکارونی در آنها خواهد بود .به منظور بررسی رابطه کیفیت ماکارونی با زیرواحدهای گلوتنین و گلیادین دانه، 11 نمونه از سه گونه تتراپلوئید زراعی انتخاب شد. پروتئین های گلیادین و گلوتنین دانه به کمک بافر مناسب استخراج و با دستگاه طیف سنج سنجش گردید. الکتروفورز پروتئین های گلیادین و گلوتنین به ترتیب به روش sds-page و acid-page صورت گرفت و در نهایت باندهای حاصل به منظور ارزیابی پلی مورفیسم و شناسایی آلل ها به کمک بذرهای استاندارد mexicali ، longdon و lira مورد مطالعه قرار گرفتند و جهت نشان دادن پلی مورفیسم dna ای مربوط به زیرواحدهای گلوتنینlmw ابتدا dna از دانه استخراج و سپس pcr ژن مربوط به زیرواحد lmw در جایگاه glu-b3، انجام گرفت. در نیمرخ الکتروفورزی پروتئین ها حضور lmw-2 و باند 45-? و 35-? گلیادین مشخص گردید و در بررسی پلی مورفیسم dna، قطعه 15/1 کیلوبازی در گونه های triticum dicoccum وtriticum isphahanicum تایید شد که نشان دهنده کیفیت مطلوب برای پخت ماکارونی در این گونه ها بود. در گونه ی t. turanicum حضور lmw-1 ، باند 42-? ، 38-35-33-? گلیادین در نیمرخ الکتروفورزی و حضور قطعه ی 12/1 کیلوبازی در الگوی pcr مشاهده شد که بیانگر کیفیت نامطلوب برای پخت ماکارونی در این گونه ها می باشد. این گونه ها همچنین از لحاظ سیتوژنتیکی نیز مورد مطالعه قرار گرفت که شمارش کروموزومی تتراپلوئید بودن (28 =n = 4x 2) این گونه ها را مورد تایید قرار داد.

بررسی ارتباط بین چندشکلی در ژن اینترلوکین 18 و ژن اوروکیناز با بیماری سنگ کلیه در استان تهران توسط روش as-pcr
thesis دانشگاه تربیت معلم - تهران - دانشکده علوم 1393
  ندا عصاری   عبدالحمید انگجی

زمینه : سنگ کلیه یک بیماری چند عاملی شایع در بین جوامع است. در بین کشورهای منطقه، ایران بالاترین آمار بین المللی شیوع سنگ کلیه را داراست . عوامل ژنتیکی و محیطی هر دو در بروز سنگ کلیه تاثیر گذارند. چندشکلی های تک نوکلئوتیدی به عنوان یکی از عوامل فیزیولوژیک موثر در بیماری سنگ کلیه شناخته شده اند. هدف این مطالعه بررسی ارتباط پلیمرفیسمrs 4065ژن اوروکینازو هم چنین پلیمرفیسم rs 548808ژن اینترلوکین ??با تشکیل سنگ کلیه در 70 نفر از بیماران استان تهران می باشد. روش کار : در این بررسی، دو گروه شامل 70 نفر با سابقه سنگ کلیه از نوع کلسیمی و 70 نفر سالم بعنوان گروه شاهد از بیمارستان بقیه الله (عج) تهران از لحاظ شیوع این دو پلیمرفیسم مورد بررسی قرار گرفتند . بررسی این چند شکلی در این تحقیق با روش (as-pcr) allele specific pcrانجام شد که نسبت به روش های قبلی شناساییsnp(single nucleotide polymorphism) ، روشی ساده ، سریع و کم هزینه می باشد.سپس داده ها با استفاده از نرم افزار spss (ver.16.0)مورد آنالیز قرار گرفتند . تست تعادل هاردی واینبرگ برای دو جمعیت بیمار وکنترل با استفاده از آزمون کای دو (کای اسکوار) انجام گردید . یافته ها :در مطالعه حاضر برای پلی-مورفیسماوروکینازفراوانی آلل tجهش یافته میان افراد نرمال 34% و میان افراد بیمار 41% بود.برای پلی مرفیسم ژن اینترلوکین 1? فراوانی آلل c (آلل بیمار) در میان افراد سالم 1?% و در میان افراد بیمار ?3% می باشد .تست تعادل هاردی واینبرگ برای هر دو پلیمرفیسم نشان دهنده ارتباط آلل بیماری زا با بیماری در جمعیت بیمار مورد بررسی بود .مقدار odd ratio برای پلیمرفیسم ژن اوروکیناز 7.? و برای ژن اینترلوکین ??، 4?.3 محاسبه شد . نتیجه گیری : بررسی های آماری نشان داد که بین چند شکلی ناحیه 3’utr ژن اوروکیناز و همچنین پلیمرفیسم +105a/c ژن اینترلوکین ?? با بیماری سنگ کلیه در بیماران مورد بررسی ارتباط معنی دار قابل توجهی وجود دارد (p-value<0.05) .

کلون کردن اپی توپ های خطی پیش بینی شده آنتی ژن تروپومیوزین اکینوکوکوس گرانولوزوس برای لنفوسیت های t در وکتور pegfp-n1 و بررسی بیان آن در رده ی سلولی cho
thesis دانشگاه تربیت معلم - تهران 1393
  مژگان احمدزاده   مجید اسمعیلی زاد

اکینوکوکوس گرانولوزوس انگلی است که آلودگی با مرحله لاروی آن سبب ایجاد بیماری هیداتیدوزیس در انسان و نشخوارکنندگان می شود؛ تاکنون نزدیک به ده ژنوتیپ از این انگل شناسایی شده است. کشور ایران جزء مناطق با شیوع بالا است، بر این اساس مقابله با این انگل از لحاظ بهداشت جامعه اهمیت خاصی دارد. آنتی ژن های متفاوتی در مراحل مختلف زندگی این انگل بیان می شود، که یکی از آنها تروپومیوزین است. مطالعات پیشین نشان داده که پروتئین نوترکیب ساخته شده بر پایه تروپومیوزین در میزبان اصلی ایمنی قابل توجهی ایجاد کرده است لذا این آنتی ژن می تواند بعنوان یک کاندید مناسب جهت ساخت dna واکسن مورد بررسی قرار گیرد. هدف از این پژوهش پیش بینی و کلون کردن توالی کد کننده اپی توپ های خطی آنتی ژن egtrp گونه اکینوکوکوس گرانولوزوس برای لنفوسیت های t در وکتور pegfp-n1 بود. در این پژوهش اپی توپ های تحریک کننده سیستم ایمنی سلولی میزبان با نرم افزار های بیوانفورماتیک شناسائی و بعد از بهینه سازی کدون ها توالی کد کننده آن سنتز شده و محصول pcr پس از هضم آنزیمی با آنزیم محدود کننده xhoi در وکتور pegfp-n1 کلون گردید، کلنی های مثبت بوسیله pcr colony انتخاب شدند. وکتور های نوترکیب بوسیله ی شوک الکتریکی به سلول های cho ترانسفورم شدند، و بیان پروتئین مورد نظر به صورت فیوژن با پروتئین سبز فلئورسنت توسط میکروسکوپ فلئورسنت مورد بررسی قرار گرفت

بررسی ارتباط بین چند شکلی در ژن گیرنده هورمون های استروژن و پرولاکتین با سقط مکرر جنین در جمعیت استان آذربایجان شرقی توسط روش as-pcr
thesis دانشگاه تربیت معلم - تهران - دانشکده زیست شناسی 1393
  سحر دارایی   سعید مروتی

شایع ترین عارضه در سه ماهه ی اول و دوم حاملگی سقط جنین است. مفهوم سقط جنین به ختم بارداری پیش از هفته بیستم اطلاق می شود. در این میان، زنانی که بیش از سه بار سقط جنین پی درپی را تجربه می کنند دچار سقط مکرر هستند. در سقط مکرر به عنوان یک بیماری چند عاملی مسائل متعددی از جمله اختلالات ساختمانی رحم، مشکلات هورمونی، اختلالات کروموزومی، سندرم تخمدان پلی کیستیک، بیماری های خود ایمنی و اختلالات همراه با افزایش انعقاد پذیری خون دخیل می باشند اما در بیش از 50 درصد موارد ، علتی برای سقط مکرر شناسایی نمی شود. چند شکلی های ژنتیکی می تواند یکی از دلایل سقط مکرر باشد. از جمله عوامل کاندیدی که در این تحقیق مورد بررسی قرار می گیرد چند شکلی ژن گیرنده استروژن نوع بتا و گیرنده پرولاکتین می باشد.

شناسایی وکلون کردن اپی توپ های خطی آنتی ژن p14-3-3 انگل اکینوکوکوس گرانولوزوس در وکتور pegfp-n1 و بررسی بیان آن در سلول های cho
thesis دانشگاه تربیت معلم - تهران 1393
  رقیه مصری   مجید اسمعیلی زاد

در این پروژه به منظور طراحی و ساخت یک dna واکسن موثر علیه کیست هیداتیک با حداقل ساختار ممکن و حداکثر قدرت تحریک ایمنی از توالی کدکننده اپی توپ های خطی آنتی ژن p14-3-3 که ایمونوژن تر می باشد و در اکثر مراحل زندگی انگل و سروتیپ های متعدد با ساختار حفاظت شده وجود داشته و واکسن نوترکیب آن نیز پاسخ ایمنی چشمگیری را علیه کیست هیداتیک نشان داده، جهت کلونینگ در وکتور بیانی pegfp-n1 به جای توالی کدکننده آنتی ژن موردنظر استفاده شد؛ که بررسی بیان آن در سلول های یوکاریوتی choحاکی از بیان پروتئین موردنظر به همراه پروتئین سبز فلورسنت در این سلول ها می باشد.

بررسی بیوشیمیایی پروتئین های دانه و پلی مورفیسم قطعات dna مربوط به برخی زیرواحدهای پروتئینی گندم های تتراپلوئید وحشی ایران
thesis دانشگاه تربیت معلم - تهران - دانشکده علوم 1388
  راضیه موحدی فاضل   اعظم سلیمی

چکیده ندارد.