نوکلئیک اسیدهای جدا شده توسط روش الکتروفورز ژل آگارز به طور معمول درون شبکه متخلخل ژل با رنگ آمیزی توسط اتیدیوم برومید و سپس پرتودهی با اشعه ماورای بنفش شناسایی می شوند. اتیدیوم برومید یک ماده سمی و موتاژن است که می تواند باعث ایجاد آسیب ژنتیکی شود. باقی مانده این ماده پس از انجام آزمایشات، به همراه مواد زاید وارد چرخه زیست محیطی می شود. به دلیل مصرف بسیار بالای این ماده در سال های اخیر یافتن ماده ای مناسب به عنوان جایگزین، بسیار ضروری است. در این تحقیق به بررسی مواد به کار گرفته شده در رنگ آمیزی نوکلئیک اسیدها و مطالعه ترکیباتی که به طور موثر با dna واکنش می دهند پرداخته شده است.