باکتری عامل شانکر یکی از مهمترین بیماریهای درختان میوه هسته دار در جهان و کشور ما است که بوسیله دو پاتوار pseudomonas syringae pv. syringae (pss) و p. syringae pv. morsprunorum (psm) ایجاد می شود. بدین منظور طی بررسی دو ساله (1386-1387) از باغات هسته دار استان خراسان رضوی از بافت های دارای علائم شانکر و لکه برگی نمونه برداری انجام گرفت. سپس 35 جدایه بر اساس آزمون های مورفولوژیکی، فیزیولوژیکی، بیوشیمیایی، الگوی پروتئین کل سلولی و انجام واکنش زنجیره ای پلیمراز با پرایمر اختصاصی d21 و d22مورد بررسی قرار گرفتند. این باکتری ها گرم منفی، قادر به تولید رنگدانه فلورسنت، فوق حساسیت روی توتون و لوان مثبت ولی در واکنش اکسیداز، آرژنین دی هیدرولاز و لهانیدن ورقه های سیب زمینی منفی بودند. در آزمون های کاتالاز، هیدرولیز اسکولین، ژلاتین، و کازئین، تحمل نمک5% ، تولید هسته یخ و سرینگومایسین مثبت بودند. ولی آزمون های هیدرولیز نشاسته، توئین 80، و رشد در دمای 4 و 41 درجه سانتیگراد و احیای نیترات منفی بودند. همچنین قادر به استفاده از گلوکز، ال-آرابینوز، دی- سوربیتول، اینوزیتول، رافینوز، مانیتول، فروکتوز، مالتوز، مانوز، سوکروز، گالاکتوز، اریترول و سلوبیوز بودند. ولی نتوانستند از دی تارتارات، ال تارتارات، لاکتوز، تری هالوز، ال رامنوز، آدونیتول استفاده کنند. به جز جدایه های pzm7، هیدرولیز اسکولین برای بقیه جدایه ها مثبت بود. همچنین جدایه ها قادر به استفاده از اینولین، گلیسین، تریپتوفان، سلوبیوز، دی تارتارات و ال تارتارات نبودند. ایزوله pzm7 برای تست هیدرولیز اسکولین منفی بود. بر اساس آزمون های فوق عامل بیماری شانکر در استان خراسان رضوی pss و جدایه هایی بینابین pss و psm تشخیص داده شد. آزمون بیماریزایی روی شاخه و برگ هلو و زردآلو انجام گردید و بعد از مدت 3 تا 5 روز علائم نکروز و شانکر مشاهده گردید. تنوع ژنتیکی جدایه ها با روش واکنش زنجیره ای پلیمراز و آغازگرهای eric و box بررسی شد. بر اساس درخت فیلوژنی ترسیم شده جدایه ها نشان داد باکتری عامل شانکر در استان دارای یک جمعیت هتروژن می باشد.