در این پژوهش یک روش pcr چندگانه به منظور شناسایی همزمان بروسلا ملی تنسیس، سالمونلا آبورتوس اویس، کلامیدوفیلا آبورتوس و کوکسیلا بورنتی که از عوامل مهم سقط جنین گوسفندان می باشند، طراحی گردید. برای این منظور پس از طراحی pcr چندگانه، تعداد 98 نمونه محتویات شیردان جنین های سقط شده از استان‎های اصفهان، چهارمحال و بختیاری و خراسان رضوی مورد آزمایش قرار گرفت. میزان آلودگی در نمونه های بررسی شده، 3/15 درصد بروسلا ملی تنسیس، 2/11 درصد سالمونلا آبورتوس اویس، 1/7 درصد کلامیدوفیلا آبورتوس و صفر درصد، کوکسیلا بورنتی بود. در کل نتایج این پژوهش نشان می دهد آزمون pcr چند گانه، دارای حساسیت و ویژگی بالایی در تشخیص های مولکولی می باشد. با این حال عامل سقط جنین حدود 64% از موارد، همچنان ناشناخته باقی ماند.