نام پژوهشگر: پریسا بیگی اذر

آنالیز پروفایل nbs (nucleotide binding-site) ژنهای مقاومت به بیماری در ارقام مختلف زیتون
thesis وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه زنجان - دانشکده کشاورزی زنجان 1392
  پریسا بیگی اذر   محمدرضا عظیمی

به منظور مطالعه ژنهای مقاومت nbs-lrr و تنوع ژنتیکی آنها در بین ارقام بومی زیتون و همچنین مقایسه آن با ارقام خارجی، از تکنیک profiling nbs و آنالیزهای مولکولی استفاده شد. برای این منظور dna ژنومی تعداد 5 رقم خارجی و 5 رقم داخلی زیتون استخراج و با آنزیم های برشی alui و rsai هضم و با استفاده از 3 آغازگر دژنره( nbs2،nbs7،nbs5a) در دو مرحله تکثیر شدند و الگوی باندی حاصل از تکثیر انتخابی آنها در روی ژل متافور آگارز 2 درصد مورد بررسی قرار گرفت. تعداد کل باندهای تکثیرشده 660 باند بوده که از این تعداد حدود 51 باند بین ارقام پلی مورفیسم نشان داد. بیشترین باند پلی مورفیسم از ترکیب nbs2/alui و کمترین باند پلی مورفیسم نیز از ترکیب nbs5a/alui حاصل شد. نتایج حاصل از آنالیز واریانس ملکولی(amova) نشان داد که بخش اعظم تنوع ژنتیکی به تنوع درون گروهی (78 درصد) و بخشی نیز به تنوع میان گروهی (22درصد) اختصاص دارد. براساس نتایج آنالیز خوشه ای، ارقام ایرانی و خارجی در سه خوشه قرار گرفتند و ارقام ایرانی از ارقام خارجی متمایز شدند. نتایج حاصل از داده های مولکولی توصیفی نیز نشان داد که مارکرهای nbsقدرت تفکیک مناسبی برای تعیین الگوهای باندی مربوط به ژنهای مقاومت دارند. نتایج این بررسی نشان داد که تنوع قابل ملاحظه در بین ارقام زیتون در خصوص ژن های مقاومت گروه nbs-lrr وجود دارد که می توان از آنها در مدیریت بیماری های زیتون و کشاورزی پایدار استفاده کرد. کلمات کلیدی: زیتون، ژنهای مقاومت به بیماری (nbs-lrr)، تکنیک nbs profiling