جهت بررسی کیفیت آب سد مهاباد و سرشاخه های اصلی آن، پارامترهای ph، eh، ec، tds، th، ta، دما، شوری و غلظت کاتیون ها و آنیون های اصلی آب و برخی از عناصر فلزی و سنگین اندازه گیری شد. برای این منظور تعداد 5 نمونه آب برای تجزیه شیمیایی کاتیون ها و آنیون های اصلی آب و 11 نمونه آب برای تجزیه برخی از عناصر فلزی و سنگین از محل ایستگاه های طراحی شده نمونه برداری شدند. بر اساس نتایج تجزیه های شیمیایی و مقایسه با مقادیر مجاز اشاره شده در استانداردهای بین المللی، غلظت کاتیون و آنیون های اصلی آب و مقادیر پارامترهای فیزیکوشیمیایی نمونه های آب محدوده مورد مطالعه در دامنه مقادیر مجاز تعیین شده قرار گرفتند. این بررسی ها همچنین نشان داده است که بیشتر نمونه-های آب سرشاخه های بالادست از نظر شرب تمامی نمونه های آب ایستگاه ها از نظر cd و در مواردی از نظر pb دارای آلودگی می باشند و بر اساس میزان سختی کیفیت تقریبا قابل قبول تا مناسبی دارند. بیشترین غلظت کل فلزات اندازه گیری شده در نمونه های آب محدوده مورد مطالعه مربوط به عناصر cd و pb با مقادیر به ترتیب ?g/l130 و ?g/l5/34 در ایستگاه kdt3 است که در مقایسه با استاندارد who به ترتیب 26 و 5/3 برابر حد مجاز می باشند. آلودگی cd و pb در ایستگاه kdt3 می تواند هم منشا انسان زاد (فاضلاب روستاهای بالادست) و هم زمین زاد (کانی سازی ) داشته باشد. علاوه بر این، کیفیت آب از نظر آبیاری در طبقه c2s1 (شوری پایین) و کیفیت مناسب برای مصارف کشاورزی واقع شده است. نمودار پایپر نیز نشان می دهد که نوع (تیپ) آب های منطقه از نوع بی کربناته – کلسیک است. استانداردهای بین المللی نشان می دهد که تمام نمونه های آب محدوده دارای مقادیر بالای سختی-کل و تمایل به رسوبگذاری کربنات کلسیم هستند در نتیجه این آب نیاز به نرم کردن قبل از مصرف دارند و نمونه های kbt6 و w7 خاصیت خورندگی نیز در مصارف صنعتی دارند. کیفیت آب آشامیدنی برای دام از نظر تمام عناصر مورد تجزیه به جز کادمیوم مناسب می باشند. براساس میزان ph و محتوای فلزی آب اکثر نمونه های آب برداشت شده در محدوده تقریبا خنثی با محتوای فلزی پایین واقع شده اند.