سیتومگالو ویروس یکی از شایع ترین ویروس های بیماری زا در سراسر جهان است. در موارد عفونت مادرزادی منجر به اختلالات شدید عصبی و حتی مرگ جنین و در افراد با سرکوب ایمنی باعث بروز علائم بالینی شدیدی می شود. از میان تمامی استراتژی های واکسیناسیون، واکسن های بر پایه اپی توپ های شاخص ایمنی زا (epitope-based vaccine)، بهترین راهکار برای پیشگیری از ابتلا به این ویروس می باشند. در این مطالعه اپی توپ های شاخص از آنتی ژن های گلیکوپروتئین b و فسفوپروتئین 65 و 150 ویروس که بهترین محرک های ایمنی هومورال و سلولار می باشند، انتخاب گردید. با کمک الگوریتم های بیوانفورماتیکی، سازه ژنی طراحی و آنتی ژنیسیتی آن توسط نرم افزار vaxijen بررسی گردید. سایر نرم افزارها جهت سنجش پایداری mrna و نقشه یابی اپی توپ ها به کار برده شد و نهایتا سفارش سنتز ژن صورت گرفت. در ادامه قطعه ژنی در یک وکتور یوکاریوتی مناسب واکسن dna ساب کلون گردیده و با انتقال آن به لاین سلول یوکاریوتی مناسب و انجام تکنیک وسترن، بیان ترانس ژن در شرایط in vitro بررسی گردید. نتایج این مطالعه نشان می دهد وکتور نوترکیب، کاندید خوبی جهت ادامه مراحل و ارزیابی در مدل آزمایشگاهی می باشد.