فلوئور و نیترات از پارامترهای مهم کیفی منابع آب هستند که غلظت بالای آنها در برخی آبخوان ها می تواند تهدید جدی برای سلامت این منطقه باشد. فلورید یک عنصر کم مصرف ضروری در رژیم غذایی انسان است و در مقایسه با سایر عناصر شیمیایی، دامنه باریکی بین اثرات مفید و مضر آن وجود دارد. بر اساس گزارش یونیسف غلظت بالای فلورید در آب آشامیدنی یا آبهای زیرزمینی عامل اصلی شوع فلوروسیس در 27 کشور دنیاست (unisef,1999). ایران نیز یکی از این کشورهاست. وجود بیماری فلوروسیس در برخی از شهرها و روستاهای ایران نظیر برازجان، خورموج، ماکو، لار و موته در استان های بوشهر، آذربایجان غربی، فارس و اصفهان گزارش شده است (اصغری مقدم،1387). غلظت نیترات بطور طبیعی در آب زیرزمینی پایین است اما توسط منابع آلاینده انسانزاد می تواند به غلظت های بالا برسد (bgs,2004). نیترات باعث بروز بیماری متموگلوبینیما و سندروم در انسان؛ به ویژه در کودکان می شود. وجود غلظت های زیاد فلورید و نیترات در آبهای زیرزمینی علاوه بر اقلیم منطقه و عوامل زمین شناختی به عوامل انسانی نظیر فعالیت های برخی از صنایع و کاربرد کودهای فسفاته و نیتروزن دار در اراضی کشاورزی بستگی دارد.