از نقطه نظر کاربردهای بیولوژیکی و صنعتی، به علت کاربردهای وسیع آب به عنوان سیال عامل و سیال پایه در بسیاری از نانووسیله های صنعتی و پزشکی، به ویژه تجهیزات نانوپزشکی مثل نانوپمپ های پزشکی برای تزریق پیوسته داروها در رگها و بافتهای بدن، و توجه به این مورد که سیال پایه در بسیاری از داروهای تزریقی مایع، آب خالص میباشد، ضروری است که جریان و انتقال ملکولهای آب تحت شرایط فیزیکی مختلف درون نانوکانالهای مختلف بررسی شود. در این تحقیق به روش شبیه سازی دینامیک ملکولی به بررسی تاثیر بار الکتریکی و زبری دیواره بر روی جریان پواسل آب مایع درون نانوکانالهای با دیواره های مختلف صاف و زبر و در حالات مختلف ملکولهای آب با قطبیت و بدون قطبیت پرداخته می شود. پس از اجرای کدهای نوشته شده و استخراج نتایج، چنین نتیجه گیری شده است که وجود بار الکتریکی بر روی دیواره ها باعث تغییرات شدید پروفیلهای چگالی و سرعت، نسبت به حالت دیوار بی بار می شود. وجود زبری، سرعت سیال را در نزدیکی دیوار زبر به میزان زیادی کاهش می دهد و باعث کاهش سرعت متوسط و سرعت بیشینه سیال می شود و با افزایش پهنای زبری، تاثیر زبری بر هر دو پروفیل سرعت و چگالی زیاد می شود. افزایش ارتفاع زبری خیلی بیشتر از افزایش پهنای زبری، پروفیلهای چگالی و سرعت را دچار انحراف و کاهش می کند.